MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanocella paludicola SANAE chromosome

Total Repeats: 51977

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013665	GAG	2	6	243279	243284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	282162912
4502	NC_013665	ATAA	2	8	243345	243352	75 %	25 %	0 %	0 %	282162912
4503	NC_013665	TTA	2	6	243362	243367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	282162912
4504	NC_013665	GAC	2	6	243391	243396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162912
4505	NC_013665	CAT	2	6	243402	243407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162912
4506	NC_013665	CGAT	2	8	243428	243435	25 %	25 %	25 %	25 %	282162912
4507	NC_013665	CGCC	2	8	243509	243516	0 %	0 %	25 %	75 %	282162912
4508	NC_013665	GGCG	2	8	243524	243531	0 %	0 %	75 %	25 %	282162912
4509	NC_013665	GAT	2	6	243723	243728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162912
4510	NC_013665	AGA	2	6	243875	243880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	282162912
4511	NC_013665	A	6	6	243894	243899	100 %	0 %	0 %	0 %	282162912
4512	NC_013665	A	7	7	243936	243942	100 %	0 %	0 %	0 %	282162912
4513	NC_013665	TTAA	2	8	243943	243950	50 %	50 %	0 %	0 %	282162912
4514	NC_013665	GTA	2	6	243961	243966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162912
4515	NC_013665	ACT	2	6	243967	243972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162912
4516	NC_013665	CAG	2	6	243996	244001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162912
4517	NC_013665	TAA	2	6	244043	244048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	282162912
4518	NC_013665	CAG	2	6	244090	244095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162912
4519	NC_013665	A	8	8	244107	244114	100 %	0 %	0 %	0 %	282162912
4520	NC_013665	T	6	6	244208	244213	0 %	100 %	0 %	0 %	282162913
4521	NC_013665	T	6	6	244247	244252	0 %	100 %	0 %	0 %	282162913
4522	NC_013665	TCAA	2	8	244271	244278	50 %	25 %	0 %	25 %	282162913
4523	NC_013665	TGGC	2	8	244308	244315	0 %	25 %	50 %	25 %	282162913
4524	NC_013665	AAT	2	6	244356	244361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	282162913
4525	NC_013665	GCT	2	6	244371	244376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162913
4526	NC_013665	AT	3	6	244394	244399	50 %	50 %	0 %	0 %	282162913
4527	NC_013665	T	6	6	244433	244438	0 %	100 %	0 %	0 %	282162913
4528	NC_013665	GGCA	2	8	244481	244488	25 %	0 %	50 %	25 %	282162913
4529	NC_013665	GAA	2	6	244507	244512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	282162913
4530	NC_013665	TA	3	6	244587	244592	50 %	50 %	0 %	0 %	282162913
4531	NC_013665	ATA	2	6	244594	244599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	282162913
4532	NC_013665	TCG	2	6	244698	244703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162913
4533	NC_013665	TTG	2	6	244718	244723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	282162913
4534	NC_013665	TAA	3	9	244756	244764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	282162913
4535	NC_013665	ATT	2	6	244876	244881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	282162913
4536	NC_013665	CGT	2	6	244921	244926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162913
4537	NC_013665	T	6	6	244928	244933	0 %	100 %	0 %	0 %	282162913
4538	NC_013665	TCCA	2	8	245093	245100	25 %	25 %	0 %	50 %	282162913
4539	NC_013665	ATG	2	6	245126	245131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162913
4540	NC_013665	GC	3	6	245151	245156	0 %	0 %	50 %	50 %	282162913
4541	NC_013665	GTAT	2	8	245195	245202	25 %	50 %	25 %	0 %	282162913
4542	NC_013665	AGG	2	6	245237	245242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	282162913
4543	NC_013665	ATT	2	6	245269	245274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	282162913
4544	NC_013665	T	6	6	245397	245402	0 %	100 %	0 %	0 %	282162914
4545	NC_013665	A	7	7	245458	245464	100 %	0 %	0 %	0 %	282162914
4546	NC_013665	TCT	2	6	245666	245671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162914
4547	NC_013665	CGT	2	6	245727	245732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162914
4548	NC_013665	TCG	2	6	245783	245788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162914
4549	NC_013665	A	6	6	245795	245800	100 %	0 %	0 %	0 %	282162914
4550	NC_013665	TTG	2	6	245822	245827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	282162914
4551	NC_013665	ACG	2	6	245945	245950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162914
4552	NC_013665	GGA	2	6	246003	246008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	282162914
4553	NC_013665	TAT	2	6	246034	246039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	282162914
4554	NC_013665	CAA	2	6	246052	246057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	282162914
4555	NC_013665	CGG	2	6	246104	246109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162914
4556	NC_013665	T	6	6	246164	246169	0 %	100 %	0 %	0 %	282162914
4557	NC_013665	AATT	2	8	246223	246230	50 %	50 %	0 %	0 %	282162914
4558	NC_013665	ATT	2	6	246262	246267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	282162914
4559	NC_013665	TAG	2	6	246268	246273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162914
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4561	NC_013665	CATT	2	8	246444	246451	25 %	50 %	0 %	25 %	282162914
4562	NC_013665	TCC	2	6	246476	246481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162914
4563	NC_013665	TCA	2	6	246500	246505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162914
4564	NC_013665	ACA	2	6	246544	246549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	282162914
4565	NC_013665	TAG	2	6	246651	246656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162914
4566	NC_013665	AAT	3	9	246716	246724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	282162914
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4568	NC_013665	TTTTA	2	10	246814	246823	20 %	80 %	0 %	0 %	282162914
4569	NC_013665	AT	3	6	246839	246844	50 %	50 %	0 %	0 %	282162914
4570	NC_013665	CCG	2	6	246858	246863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162914
4571	NC_013665	TTA	2	6	246878	246883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	282162914
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4573	NC_013665	GATA	2	8	246985	246992	50 %	25 %	25 %	0 %	282162914
4574	NC_013665	T	6	6	247004	247009	0 %	100 %	0 %	0 %	282162914
4575	NC_013665	TTC	2	6	247091	247096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162914
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4588	NC_013665	TCCA	2	8	247662	247669	25 %	25 %	0 %	50 %	282162914
4589	NC_013665	A	6	6	247669	247674	100 %	0 %	0 %	0 %	282162914
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4606	NC_013665	CAC	2	6	248917	248922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	282162915
4607	NC_013665	CTC	2	6	248932	248937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162915
4608	NC_013665	CCT	2	6	248982	248987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162916
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4610	NC_013665	AGTAA	2	10	249125	249134	60 %	20 %	20 %	0 %	282162916
4611	NC_013665	AG	3	6	249150	249155	50 %	0 %	50 %	0 %	282162916
4612	NC_013665	GGCA	2	8	249207	249214	25 %	0 %	50 %	25 %	282162916
4613	NC_013665	ATT	2	6	249247	249252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	282162916
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4617	NC_013665	GTAT	2	8	249462	249469	25 %	50 %	25 %	0 %	282162916
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4745	NC_013665	GGC	2	6	255589	255594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162922
4746	NC_013665	GGA	2	6	255654	255659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	282162922
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4749	NC_013665	GCC	2	6	255718	255723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162922
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4763	NC_013665	GC	3	6	256573	256578	0 %	0 %	50 %	50 %	282162923
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4982	NC_013665	GAA	2	6	269374	269379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	282162935
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