MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanocaldococcus vulcanius M7 chromosome

Total Repeats: 22192

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013407	TTA	2	6	754	759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402132
2	NC_013407	ATG	2	6	766	771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261402132
3	NC_013407	ATT	2	6	900	905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402132
4	NC_013407	TGA	2	6	995	1000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261402132
5	NC_013407	TAT	2	6	1001	1006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402132
6	NC_013407	ATT	2	6	1041	1046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402133
7	NC_013407	TCT	2	6	1074	1079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402133
8	NC_013407	TCT	2	6	1126	1131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402133
9	NC_013407	CTC	2	6	1243	1248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261402133
10	NC_013407	CCT	2	6	1354	1359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261402133
11	NC_013407	TAT	2	6	1404	1409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402133
12	NC_013407	TTA	2	6	1419	1424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402133
13	NC_013407	TTA	2	6	1455	1460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402133
14	NC_013407	ATT	2	6	1502	1507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402133
15	NC_013407	GTT	2	6	1600	1605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261402133
16	NC_013407	TAA	2	6	1651	1656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402133
17	NC_013407	TCC	2	6	1678	1683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261402133
18	NC_013407	AAT	2	6	1728	1733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402133
19	NC_013407	ACT	2	6	1748	1753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402133
20	NC_013407	CAT	2	6	1794	1799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402133
21	NC_013407	AAT	2	6	1848	1853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402133
22	NC_013407	ATA	2	6	1986	1991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402133
23	NC_013407	ATA	2	6	2277	2282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402134
24	NC_013407	TCT	2	6	2374	2379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402134
25	NC_013407	ATA	2	6	2469	2474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402134
26	NC_013407	AAT	2	6	2544	2549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402134
27	NC_013407	CAA	2	6	2645	2650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402134
28	NC_013407	TTC	2	6	2763	2768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402134
29	NC_013407	TCA	2	6	2807	2812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402135
30	NC_013407	TCC	2	6	3031	3036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261402135
31	NC_013407	AAC	2	6	3088	3093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402135
32	NC_013407	TAA	3	9	3120	3128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402135
33	NC_013407	TTA	2	6	3143	3148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402135
34	NC_013407	CAA	2	6	3153	3158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402135
35	NC_013407	CCA	2	6	3274	3279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261402135
36	NC_013407	TTC	2	6	3289	3294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402135
37	NC_013407	TCA	2	6	3305	3310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402135
38	NC_013407	TTC	2	6	3316	3321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402135
39	NC_013407	TCT	2	6	3329	3334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402135
40	NC_013407	AAT	2	6	3375	3380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402135
41	NC_013407	TTC	2	6	3445	3450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402135
42	NC_013407	TTA	2	6	3621	3626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402135
43	NC_013407	TGT	2	6	3760	3765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261402135
44	NC_013407	TAT	2	6	3766	3771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402135
45	NC_013407	TTG	2	6	3803	3808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261402135
46	NC_013407	TCT	2	6	3815	3820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402135
47	NC_013407	AAT	2	6	3871	3876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402135
48	NC_013407	AAT	2	6	3913	3918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402135
49	NC_013407	TCT	2	6	3924	3929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402135
50	NC_013407	TCT	2	6	4145	4150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402135
51	NC_013407	TCA	2	6	4238	4243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402135
52	NC_013407	AAG	2	6	4286	4291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261402135
53	NC_013407	TCT	2	6	4520	4525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402135
54	NC_013407	TTG	2	6	4536	4541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261402135
55	NC_013407	TAA	2	6	4725	4730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402135
56	NC_013407	AAT	2	6	4858	4863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402136
57	NC_013407	TCT	2	6	4926	4931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402136
58	NC_013407	ATA	2	6	4986	4991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402136
59	NC_013407	AAT	2	6	5109	5114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402136
60	NC_013407	TCT	2	6	5152	5157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402136
61	NC_013407	TAT	2	6	5391	5396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402136
62	NC_013407	TCT	2	6	5457	5462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402137
63	NC_013407	AAT	2	6	5463	5468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402137
64	NC_013407	TCT	2	6	5481	5486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402137
65	NC_013407	GAT	2	6	5492	5497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261402137
66	NC_013407	TTC	2	6	5561	5566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402137
67	NC_013407	TCA	2	6	5580	5585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402137
68	NC_013407	CTT	2	6	5686	5691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402137
69	NC_013407	TGG	2	6	5726	5731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261402137
70	NC_013407	TTG	2	6	5809	5814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261402137
71	NC_013407	CTT	3	9	5941	5949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402137
72	NC_013407	CTT	2	6	5965	5970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402137
73	NC_013407	CAT	2	6	6067	6072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402137
74	NC_013407	ACT	2	6	6165	6170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402137
75	NC_013407	TTA	2	6	6249	6254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402137
76	NC_013407	TTG	2	6	6259	6264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261402137
77	NC_013407	TTG	2	6	6325	6330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261402137
78	NC_013407	ATT	2	6	6390	6395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402137
79	NC_013407	AAC	2	6	6422	6427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402137
80	NC_013407	TCA	2	6	6432	6437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402137
81	NC_013407	TCT	2	6	6515	6520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402138
82	NC_013407	CTT	2	6	6536	6541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402138
83	NC_013407	CAT	2	6	6558	6563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402138
84	NC_013407	TCA	2	6	6644	6649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402138
85	NC_013407	ACT	2	6	6653	6658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402138
86	NC_013407	CAT	2	6	6724	6729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402138
87	NC_013407	TCA	2	6	6743	6748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402138
88	NC_013407	TGA	2	6	6811	6816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261402138
89	NC_013407	AAT	2	6	6868	6873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402138
90	NC_013407	AAT	2	6	7001	7006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402138
91	NC_013407	CCT	2	6	7034	7039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261402138
92	NC_013407	ATT	2	6	7157	7162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402138
93	NC_013407	TTC	2	6	7315	7320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402138
94	NC_013407	CAT	2	6	7365	7370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402138
95	NC_013407	TTC	2	6	7423	7428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402138
96	NC_013407	AGT	2	6	7443	7448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261402138
97	NC_013407	TAA	2	6	7740	7745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402138
98	NC_013407	TTA	2	6	7797	7802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402138
99	NC_013407	TCA	2	6	7823	7828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402138
100	NC_013407	TTA	2	6	7976	7981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402138
101	NC_013407	TCT	2	6	8046	8051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402138
102	NC_013407	TCA	3	9	8054	8062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402138
103	NC_013407	TCA	2	6	8102	8107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402138
104	NC_013407	TTC	2	6	8179	8184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402138
105	NC_013407	AAT	2	6	8289	8294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402138
106	NC_013407	CAA	2	6	8376	8381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402138
107	NC_013407	TCA	2	6	8411	8416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402138
108	NC_013407	TAA	2	6	8467	8472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402138
109	NC_013407	AAT	2	6	8518	8523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402138
110	NC_013407	ATC	2	6	8533	8538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402138
111	NC_013407	TTA	2	6	8541	8546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402138
112	NC_013407	TTG	2	6	8565	8570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261402138
113	NC_013407	AAT	2	6	8587	8592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402138
114	NC_013407	TCT	2	6	8645	8650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402138
115	NC_013407	TTA	2	6	8814	8819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402138
116	NC_013407	ATT	2	6	8864	8869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402138
117	NC_013407	TCC	2	6	8909	8914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261402138
118	NC_013407	TTC	2	6	8941	8946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402138
119	NC_013407	TAA	2	6	8997	9002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402138
120	NC_013407	ATA	2	6	9249	9254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402139
121	NC_013407	AGA	2	6	9341	9346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261402139
122	NC_013407	AGA	2	6	9356	9361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261402139
123	NC_013407	TGA	2	6	9377	9382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261402139
124	NC_013407	AGA	2	6	9398	9403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261402139
125	NC_013407	GTA	2	6	9409	9414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261402139
126	NC_013407	TGG	2	6	9527	9532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261402139
127	NC_013407	ATT	2	6	9621	9626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402139
128	NC_013407	AGA	2	6	9725	9730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261402139
129	NC_013407	AAT	2	6	9752	9757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402139
130	NC_013407	TAA	2	6	9790	9795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402139
131	NC_013407	TTA	2	6	9971	9976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402140
132	NC_013407	TTG	2	6	10099	10104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261402140
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257	NC_013407	AAG	2	6	19628	19633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261402150
258	NC_013407	TGA	2	6	19679	19684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261402150
259	NC_013407	GAT	2	6	19722	19727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261402150
260	NC_013407	AAC	2	6	19836	19841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402150
261	NC_013407	TCC	2	6	19883	19888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261402150
262	NC_013407	CAT	2	6	19927	19932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402150
263	NC_013407	TAA	2	6	20111	20116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402151
264	NC_013407	TAA	2	6	20126	20131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402151
265	NC_013407	AAC	2	6	20196	20201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402151
266	NC_013407	TAA	2	6	20213	20218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402151
267	NC_013407	ACA	2	6	20284	20289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402151
268	NC_013407	TCA	2	6	20299	20304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402151
269	NC_013407	ATC	2	6	20319	20324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402151
270	NC_013407	GTT	2	6	20501	20506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261402152
271	NC_013407	ATC	2	6	20539	20544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402152
272	NC_013407	CAT	2	6	20574	20579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402152
273	NC_013407	CCT	2	6	20634	20639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261402152
274	NC_013407	TCC	2	6	20674	20679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261402152
275	NC_013407	ATC	2	6	20707	20712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402152
276	NC_013407	ATT	2	6	20912	20917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402152
277	NC_013407	CTT	2	6	20927	20932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402152
278	NC_013407	ATG	2	6	20986	20991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261402152
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280	NC_013407	CAA	2	6	21168	21173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402152
281	NC_013407	TCA	2	6	21224	21229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402152
282	NC_013407	CAA	2	6	21291	21296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402152
283	NC_013407	CTC	2	6	21325	21330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261402152
284	NC_013407	CAA	2	6	21345	21350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402152
285	NC_013407	GGT	2	6	21464	21469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261402152
286	NC_013407	GAT	2	6	21713	21718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261402152
287	NC_013407	TTC	2	6	21796	21801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402152
288	NC_013407	ATC	2	6	21811	21816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402152
289	NC_013407	CAA	2	6	21825	21830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402152
290	NC_013407	TCT	2	6	22156	22161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402153
291	NC_013407	AAT	2	6	22163	22168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402153
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293	NC_013407	TGA	2	6	22232	22237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261402153
294	NC_013407	ATT	2	6	22415	22420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402154
295	NC_013407	CAA	2	6	22458	22463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402154
296	NC_013407	TTC	2	6	22612	22617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402154
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299	NC_013407	CAA	4	12	22951	22962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402155
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301	NC_013407	TAA	2	6	23068	23073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402155
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303	NC_013407	TAA	2	6	23254	23259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402155
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324	NC_013407	TCT	2	6	25225	25230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402156
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332	NC_013407	TCA	2	6	25746	25751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402157
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