MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanocaldococcus vulcanius M7 chromosome

Total Repeats: 40022

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013407	AAC	2	6	20196	20201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402151
502	NC_013407	TAA	2	6	20213	20218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402151
503	NC_013407	ACA	2	6	20284	20289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402151
504	NC_013407	TCA	2	6	20299	20304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402151
505	NC_013407	ATC	2	6	20319	20324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402151
506	NC_013407	TTAAA	2	10	20431	20440	60 %	40 %	0 %	0 %	261402152
507	NC_013407	GTT	2	6	20501	20506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261402152
508	NC_013407	ATC	2	6	20539	20544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402152
509	NC_013407	CAT	2	6	20574	20579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402152
510	NC_013407	CCT	2	6	20634	20639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261402152
511	NC_013407	TA	3	6	20665	20670	50 %	50 %	0 %	0 %	261402152
512	NC_013407	TCC	2	6	20674	20679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261402152
513	NC_013407	AATC	2	8	20680	20687	50 %	25 %	0 %	25 %	261402152
514	NC_013407	ATC	2	6	20707	20712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402152
515	NC_013407	ATT	2	6	20912	20917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402152
516	NC_013407	CTT	2	6	20927	20932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402152
517	NC_013407	CA	3	6	20973	20978	50 %	0 %	0 %	50 %	261402152
518	NC_013407	ATG	2	6	20986	20991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261402152
519	NC_013407	GTATT	2	10	21012	21021	20 %	60 %	20 %	0 %	261402152
520	NC_013407	TTG	2	6	21069	21074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261402152
521	NC_013407	CAA	2	6	21168	21173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402152
522	NC_013407	ATGC	2	8	21197	21204	25 %	25 %	25 %	25 %	261402152
523	NC_013407	TCA	2	6	21224	21229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402152
524	NC_013407	T	6	6	21274	21279	0 %	100 %	0 %	0 %	261402152
525	NC_013407	CAA	2	6	21291	21296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402152
526	NC_013407	CTC	2	6	21325	21330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261402152
527	NC_013407	CAA	2	6	21345	21350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402152
528	NC_013407	ACAG	2	8	21358	21365	50 %	0 %	25 %	25 %	261402152
529	NC_013407	TTCT	2	8	21406	21413	0 %	75 %	0 %	25 %	261402152
530	NC_013407	GGT	2	6	21464	21469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261402152
531	NC_013407	CATA	2	8	21528	21535	50 %	25 %	0 %	25 %	261402152
532	NC_013407	TATC	2	8	21549	21556	25 %	50 %	0 %	25 %	261402152
533	NC_013407	CT	3	6	21610	21615	0 %	50 %	0 %	50 %	261402152
534	NC_013407	AT	3	6	21645	21650	50 %	50 %	0 %	0 %	261402152
535	NC_013407	AGTTAA	2	12	21700	21711	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	261402152
536	NC_013407	GAT	2	6	21713	21718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261402152
537	NC_013407	TTC	2	6	21796	21801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402152
538	NC_013407	ATC	2	6	21811	21816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402152
539	NC_013407	CAA	2	6	21825	21830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402152
540	NC_013407	CT	3	6	21845	21850	0 %	50 %	0 %	50 %	261402152
541	NC_013407	T	7	7	21871	21877	0 %	100 %	0 %	0 %	261402152
542	NC_013407	ACTA	2	8	22128	22135	50 %	25 %	0 %	25 %	261402153
543	NC_013407	AATCA	2	10	22137	22146	60 %	20 %	0 %	20 %	261402153
544	NC_013407	TCT	2	6	22156	22161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402153
545	NC_013407	AAT	2	6	22163	22168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402153
546	NC_013407	CTCTTG	2	12	22172	22183	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	261402153
547	NC_013407	ATT	2	6	22195	22200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402153
548	NC_013407	TGA	2	6	22232	22237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261402153
549	NC_013407	CT	3	6	22239	22244	0 %	50 %	0 %	50 %	261402153
550	NC_013407	T	6	6	22247	22252	0 %	100 %	0 %	0 %	261402153
551	NC_013407	T	6	6	22281	22286	0 %	100 %	0 %	0 %	261402154
552	NC_013407	ATTT	2	8	22296	22303	25 %	75 %	0 %	0 %	261402154
553	NC_013407	TG	3	6	22356	22361	0 %	50 %	50 %	0 %	261402154
554	NC_013407	AAAT	2	8	22399	22406	75 %	25 %	0 %	0 %	261402154
555	NC_013407	ATT	2	6	22415	22420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402154
556	NC_013407	CAA	2	6	22458	22463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402154
557	NC_013407	T	6	6	22465	22470	0 %	100 %	0 %	0 %	261402154
558	NC_013407	T	7	7	22528	22534	0 %	100 %	0 %	0 %	261402154
559	NC_013407	TTAT	2	8	22571	22578	25 %	75 %	0 %	0 %	261402154
560	NC_013407	T	6	6	22578	22583	0 %	100 %	0 %	0 %	261402154
561	NC_013407	T	7	7	22603	22609	0 %	100 %	0 %	0 %	261402154
562	NC_013407	TTC	2	6	22612	22617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402154
563	NC_013407	TTAA	2	8	22625	22632	50 %	50 %	0 %	0 %	261402154
564	NC_013407	T	6	6	22685	22690	0 %	100 %	0 %	0 %	261402154
565	NC_013407	CT	4	8	22692	22699	0 %	50 %	0 %	50 %	261402154
566	NC_013407	A	6	6	22721	22726	100 %	0 %	0 %	0 %	261402154
567	NC_013407	TGT	2	6	22743	22748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261402154
568	NC_013407	TTA	2	6	22836	22841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402155
569	NC_013407	TC	3	6	22923	22928	0 %	50 %	0 %	50 %	261402155
570	NC_013407	CAA	4	12	22951	22962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402155
571	NC_013407	TGT	2	6	22984	22989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261402155
572	NC_013407	GTTT	2	8	22992	22999	0 %	75 %	25 %	0 %	261402155
573	NC_013407	TAAAA	2	10	23054	23063	80 %	20 %	0 %	0 %	261402155
574	NC_013407	TAA	2	6	23068	23073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402155
575	NC_013407	AACA	2	8	23077	23084	75 %	0 %	0 %	25 %	261402155
576	NC_013407	TAA	3	9	23085	23093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402155
577	NC_013407	AAAT	2	8	23173	23180	75 %	25 %	0 %	0 %	261402155
578	NC_013407	T	7	7	23194	23200	0 %	100 %	0 %	0 %	261402155
579	NC_013407	T	7	7	23203	23209	0 %	100 %	0 %	0 %	261402155
580	NC_013407	TAA	2	6	23254	23259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402155
581	NC_013407	TA	3	6	23310	23315	50 %	50 %	0 %	0 %	261402155
582	NC_013407	GTAT	2	8	23341	23348	25 %	50 %	25 %	0 %	261402155
583	NC_013407	ATA	2	6	23351	23356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402155
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585	NC_013407	ATC	2	6	24272	24277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402156
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591	NC_013407	GAT	2	6	24501	24506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261402156
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594	NC_013407	AAATA	2	10	24578	24587	80 %	20 %	0 %	0 %	261402156
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596	NC_013407	CAAT	2	8	24624	24631	50 %	25 %	0 %	25 %	261402156
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599	NC_013407	T	6	6	24715	24720	0 %	100 %	0 %	0 %	261402156
600	NC_013407	T	6	6	24775	24780	0 %	100 %	0 %	0 %	261402156
601	NC_013407	T	6	6	24847	24852	0 %	100 %	0 %	0 %	261402156
602	NC_013407	CTT	2	6	24876	24881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402156
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611	NC_013407	TC	3	6	25089	25094	0 %	50 %	0 %	50 %	261402156
612	NC_013407	AAT	2	6	25101	25106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402156
613	NC_013407	AAT	2	6	25130	25135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402156
614	NC_013407	AAT	2	6	25166	25171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402156
615	NC_013407	T	6	6	25202	25207	0 %	100 %	0 %	0 %	261402156
616	NC_013407	TCT	2	6	25225	25230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402156
617	NC_013407	CTT	2	6	25254	25259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402156
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626	NC_013407	TAA	2	6	25814	25819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402157
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628	NC_013407	AGG	2	6	26011	26016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261402157
629	NC_013407	TGT	2	6	26066	26071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261402157
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