MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 1263

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013156	ATTTC	2	10	3836	3845	20 %	60 %	0 %	20 %	256809978
2	NC_013156	TTTAA	2	10	5219	5228	40 %	60 %	0 %	0 %	256809979
3	NC_013156	TAAGT	2	10	6381	6390	40 %	40 %	20 %	0 %	256809979
4	NC_013156	AAGTA	2	10	6946	6955	60 %	20 %	20 %	0 %	256809980
5	NC_013156	ATATG	2	10	7261	7270	40 %	40 %	20 %	0 %	256809980
6	NC_013156	TGTAA	2	10	8679	8688	40 %	40 %	20 %	0 %	256809981
7	NC_013156	TAAAG	2	10	8943	8952	60 %	20 %	20 %	0 %	256809981
8	NC_013156	TAAAA	2	10	9928	9937	80 %	20 %	0 %	0 %	256809982
9	NC_013156	TTTAA	2	10	9953	9962	40 %	60 %	0 %	0 %	256809982
10	NC_013156	TTTAT	2	10	11559	11568	20 %	80 %	0 %	0 %	256809984
11	NC_013156	TCCTC	2	10	12014	12023	0 %	40 %	0 %	60 %	256809986
12	NC_013156	ATTAT	2	10	12890	12899	40 %	60 %	0 %	0 %	256809987
13	NC_013156	TTTAT	2	10	13109	13118	20 %	80 %	0 %	0 %	256809987
14	NC_013156	ACAAA	2	10	13964	13973	80 %	0 %	0 %	20 %	256809988
15	NC_013156	TTAAA	2	10	15291	15300	60 %	40 %	0 %	0 %	256809990
16	NC_013156	ATTTA	2	10	16694	16703	40 %	60 %	0 %	0 %	256809991
17	NC_013156	ACCCA	2	10	16754	16763	40 %	0 %	0 %	60 %	256809991
18	NC_013156	ATTAA	2	10	17456	17465	60 %	40 %	0 %	0 %	256809992
19	NC_013156	AATTT	2	10	18326	18335	40 %	60 %	0 %	0 %	256809994
20	NC_013156	TGTTT	2	10	19090	19099	0 %	80 %	20 %	0 %	256809994
21	NC_013156	AAATA	2	10	22194	22203	80 %	20 %	0 %	0 %	256809998
22	NC_013156	ATAAG	2	10	22424	22433	60 %	20 %	20 %	0 %	256809998
23	NC_013156	AAGGG	2	10	24397	24406	40 %	0 %	60 %	0 %	256809999
24	NC_013156	AACCA	2	10	24770	24779	60 %	0 %	0 %	40 %	256810000
25	NC_013156	ATAGG	2	10	25169	25178	40 %	20 %	40 %	0 %	256810000
26	NC_013156	TAAAT	2	10	26076	26085	60 %	40 %	0 %	0 %	256810000
27	NC_013156	AGATG	2	10	26448	26457	40 %	20 %	40 %	0 %	256810000
28	NC_013156	AAAGA	2	10	26527	26536	80 %	0 %	20 %	0 %	256810000
29	NC_013156	TAATT	2	10	27474	27483	40 %	60 %	0 %	0 %	256810001
30	NC_013156	AAAGG	2	10	29371	29380	60 %	0 %	40 %	0 %	256810003
31	NC_013156	AGAGG	2	10	30852	30861	40 %	0 %	60 %	0 %	256810004
32	NC_013156	TTATA	3	15	33644	33658	40 %	60 %	0 %	0 %	256810008
33	NC_013156	AAAAG	2	10	34170	34179	80 %	0 %	20 %	0 %	256810009
34	NC_013156	ATTAG	2	10	34636	34645	40 %	40 %	20 %	0 %	256810010
35	NC_013156	GAGAT	2	10	35231	35240	40 %	20 %	40 %	0 %	256810010
36	NC_013156	AAAAC	2	10	37401	37410	80 %	0 %	0 %	20 %	256810012
37	NC_013156	ATAAA	2	10	37954	37963	80 %	20 %	0 %	0 %	256810012
38	NC_013156	ACATA	2	10	38494	38503	60 %	20 %	0 %	20 %	256810012
39	NC_013156	TTAGA	2	10	39481	39490	40 %	40 %	20 %	0 %	256810013
40	NC_013156	ATTTT	2	10	40651	40660	20 %	80 %	0 %	0 %	256810014
41	NC_013156	GGACT	2	10	41091	41100	20 %	20 %	40 %	20 %	256810015
42	NC_013156	AGATA	2	10	41431	41440	60 %	20 %	20 %	0 %	256810015
43	NC_013156	ATTTC	2	10	43063	43072	20 %	60 %	0 %	20 %	256810016
44	NC_013156	AAAGC	2	10	43556	43565	60 %	0 %	20 %	20 %	256810016
45	NC_013156	CTCTC	2	10	46715	46724	0 %	40 %	0 %	60 %	256810019
46	NC_013156	AATAA	2	10	47714	47723	80 %	20 %	0 %	0 %	256810020
47	NC_013156	ATTAG	2	10	48709	48718	40 %	40 %	20 %	0 %	256810022
48	NC_013156	TTTTA	2	10	49584	49593	20 %	80 %	0 %	0 %	256810022
49	NC_013156	ATCCA	2	10	49700	49709	40 %	20 %	0 %	40 %	256810022
50	NC_013156	CTAAG	2	10	49757	49766	40 %	20 %	20 %	20 %	256810022
51	NC_013156	TAAAA	2	10	52679	52688	80 %	20 %	0 %	0 %	256810023
52	NC_013156	GCCAC	2	10	53039	53048	20 %	0 %	20 %	60 %	256810024
53	NC_013156	GAGGG	2	10	54057	54066	20 %	0 %	80 %	0 %	256810024
54	NC_013156	TAAAT	2	10	58506	58515	60 %	40 %	0 %	0 %	256810030
55	NC_013156	AATCC	2	10	58993	59002	40 %	20 %	0 %	40 %	256810030
56	NC_013156	ATGGA	2	10	59117	59126	40 %	20 %	40 %	0 %	256810030
57	NC_013156	CTTTT	2	10	59690	59699	0 %	80 %	0 %	20 %	256810030
58	NC_013156	AATAT	2	10	60869	60878	60 %	40 %	0 %	0 %	256810032
59	NC_013156	TATAA	2	10	61203	61212	60 %	40 %	0 %	0 %	256810034
60	NC_013156	TAGAA	2	10	64215	64224	60 %	20 %	20 %	0 %	256810038
61	NC_013156	ATTAA	2	10	65248	65257	60 %	40 %	0 %	0 %	256810038
62	NC_013156	CTGGT	2	10	66003	66012	0 %	40 %	40 %	20 %	256810039
63	NC_013156	TCTTT	2	10	67763	67772	0 %	80 %	0 %	20 %	256810041
64	NC_013156	TGTTT	2	10	69269	69278	0 %	80 %	20 %	0 %	256810044
65	NC_013156	AATTT	2	10	69628	69637	40 %	60 %	0 %	0 %	256810044
66	NC_013156	GAGAT	2	10	71216	71225	40 %	20 %	40 %	0 %	256810046
67	NC_013156	TTCAT	2	10	72120	72129	20 %	60 %	0 %	20 %	256810047
68	NC_013156	AAATT	2	10	75602	75611	60 %	40 %	0 %	0 %	256810052
69	NC_013156	TCATT	2	10	76244	76253	20 %	60 %	0 %	20 %	256810052
70	NC_013156	TAAAC	2	10	80760	80769	60 %	20 %	0 %	20 %	256810057
71	NC_013156	CCTTC	2	10	81711	81720	0 %	40 %	0 %	60 %	256810058
72	NC_013156	TATAA	2	10	82026	82035	60 %	40 %	0 %	0 %	256810058
73	NC_013156	TTGTT	2	10	82970	82979	0 %	80 %	20 %	0 %	256810059
74	NC_013156	TAAAT	2	10	83275	83284	60 %	40 %	0 %	0 %	256810059
75	NC_013156	TTATA	2	10	83952	83961	40 %	60 %	0 %	0 %	256810061
76	NC_013156	TTCTT	2	10	84274	84283	0 %	80 %	0 %	20 %	256810061
77	NC_013156	AAACA	2	10	84438	84447	80 %	0 %	0 %	20 %	256810062
78	NC_013156	ATTTA	2	10	85257	85266	40 %	60 %	0 %	0 %	256810062
79	NC_013156	TTTCA	2	10	85554	85563	20 %	60 %	0 %	20 %	256810062
80	NC_013156	AATAA	2	10	85870	85879	80 %	20 %	0 %	0 %	256810062
81	NC_013156	ATTGG	2	10	87047	87056	20 %	40 %	40 %	0 %	256810063
82	NC_013156	TCATC	2	10	87294	87303	20 %	40 %	0 %	40 %	256810063
83	NC_013156	TTGTT	2	10	88934	88943	0 %	80 %	20 %	0 %	256810066
84	NC_013156	GTTTA	2	10	89422	89431	20 %	60 %	20 %	0 %	256810067
85	NC_013156	ATCCA	2	10	90926	90935	40 %	20 %	0 %	40 %	256810068
86	NC_013156	TATTC	2	10	91326	91335	20 %	60 %	0 %	20 %	256810068
87	NC_013156	GAACA	2	10	92171	92180	60 %	0 %	20 %	20 %	256810068
88	NC_013156	AATTA	2	10	92485	92494	60 %	40 %	0 %	0 %	256810068
89	NC_013156	ATTTT	2	10	92711	92720	20 %	80 %	0 %	0 %	256810068
90	NC_013156	AAAAG	2	10	93038	93047	80 %	0 %	20 %	0 %	256810068
91	NC_013156	AGAAA	2	10	98289	98298	80 %	0 %	20 %	0 %	256810075
92	NC_013156	CTCTC	2	10	98860	98869	0 %	40 %	0 %	60 %	256810076
93	NC_013156	ATGTT	2	10	99131	99140	20 %	60 %	20 %	0 %	256810076
94	NC_013156	TTCCT	2	10	99559	99568	0 %	60 %	0 %	40 %	256810077
95	NC_013156	TCTTA	2	10	100738	100747	20 %	60 %	0 %	20 %	256810079
96	NC_013156	AAGAA	2	10	100904	100913	80 %	0 %	20 %	0 %	256810079
97	NC_013156	TTAAA	2	10	101912	101921	60 %	40 %	0 %	0 %	256810080
98	NC_013156	GAAAA	2	10	102925	102934	80 %	0 %	20 %	0 %	256810080
99	NC_013156	GAAAA	2	10	102996	103005	80 %	0 %	20 %	0 %	256810080
100	NC_013156	CAAAA	2	10	104289	104298	80 %	0 %	0 %	20 %	256810083
101	NC_013156	TTAAA	2	10	104842	104851	60 %	40 %	0 %	0 %	256810083
102	NC_013156	AATTT	2	10	105090	105099	40 %	60 %	0 %	0 %	256810083
103	NC_013156	GATAA	2	10	105336	105345	60 %	20 %	20 %	0 %	256810083
104	NC_013156	CAAAT	2	10	109799	109808	60 %	20 %	0 %	20 %	256810090
105	NC_013156	ATTGG	2	10	110868	110877	20 %	40 %	40 %	0 %	256810090
106	NC_013156	TAAAA	2	10	112194	112203	80 %	20 %	0 %	0 %	256810091
107	NC_013156	TAATT	2	10	113365	113374	40 %	60 %	0 %	0 %	256810093
108	NC_013156	AAATC	2	10	113671	113680	60 %	20 %	0 %	20 %	256810093
109	NC_013156	ATTTT	2	10	114252	114261	20 %	80 %	0 %	0 %	256810094
110	NC_013156	ATTAA	2	10	116059	116068	60 %	40 %	0 %	0 %	256810097
111	NC_013156	TCCTC	2	10	116089	116098	0 %	40 %	0 %	60 %	256810097
112	NC_013156	ATTCA	2	10	116592	116601	40 %	40 %	0 %	20 %	256810097
113	NC_013156	GCTTA	2	10	116700	116709	20 %	40 %	20 %	20 %	256810097
114	NC_013156	ATCCA	2	10	118079	118088	40 %	20 %	0 %	40 %	256810098
115	NC_013156	GGGAT	2	10	119887	119896	20 %	20 %	60 %	0 %	256810099
116	NC_013156	TTTAA	2	10	123191	123200	40 %	60 %	0 %	0 %	256810102
117	NC_013156	TTATT	2	10	123517	123526	20 %	80 %	0 %	0 %	256810103
118	NC_013156	AAATT	2	10	123580	123589	60 %	40 %	0 %	0 %	256810103
119	NC_013156	ATCCC	2	10	124000	124009	20 %	20 %	0 %	60 %	256810103
120	NC_013156	GTTAT	2	10	125691	125700	20 %	60 %	20 %	0 %	256810105
121	NC_013156	GGATG	2	10	127577	127586	20 %	20 %	60 %	0 %	256810108
122	NC_013156	TAGAG	2	10	132423	132432	40 %	20 %	40 %	0 %	256810111
123	NC_013156	TTGAT	2	10	137092	137101	20 %	60 %	20 %	0 %	256810115
124	NC_013156	GAAGA	2	10	137232	137241	60 %	0 %	40 %	0 %	256810115
125	NC_013156	GGAAG	2	10	137488	137497	40 %	0 %	60 %	0 %	256810115
126	NC_013156	CAATC	2	10	138074	138083	40 %	20 %	0 %	40 %	256810116
127	NC_013156	AAGCA	2	10	139105	139114	60 %	0 %	20 %	20 %	256810117
128	NC_013156	AGGTA	2	10	140318	140327	40 %	20 %	40 %	0 %	256810117
129	NC_013156	TTTTA	2	10	141068	141077	20 %	80 %	0 %	0 %	256810118
130	NC_013156	ATATT	2	10	142424	142433	40 %	60 %	0 %	0 %	256810119
131	NC_013156	ATTGA	2	10	142991	143000	40 %	40 %	20 %	0 %	256810119
132	NC_013156	TAGGA	2	10	144674	144683	40 %	20 %	40 %	0 %	256810121
133	NC_013156	TTCCC	2	10	145627	145636	0 %	40 %	0 %	60 %	256810122
134	NC_013156	TTCAT	2	10	146508	146517	20 %	60 %	0 %	20 %	256810123
135	NC_013156	TAAAT	2	10	146585	146594	60 %	40 %	0 %	0 %	256810123
136	NC_013156	AGGGA	2	10	149074	149083	40 %	0 %	60 %	0 %	256810125
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