MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 35176

< Previous12...59606162636465666768697071Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35001	NC_013156	TGG	2	6	1476831	1476836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256811513
35002	NC_013156	ATT	2	6	1476943	1476948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811513
35003	NC_013156	CAGG	2	8	1476949	1476956	25 %	0 %	50 %	25 %	256811513
35004	NC_013156	AG	3	6	1477107	1477112	50 %	0 %	50 %	0 %	256811513
35005	NC_013156	ACA	2	6	1477182	1477187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811513
35006	NC_013156	CA	3	6	1477186	1477191	50 %	0 %	0 %	50 %	256811513
35007	NC_013156	CCA	2	6	1477216	1477221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256811513
35008	NC_013156	AT	3	6	1477222	1477227	50 %	50 %	0 %	0 %	256811513
35009	NC_013156	AAG	2	6	1477261	1477266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256811513
35010	NC_013156	TTA	2	6	1477295	1477300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811513
35011	NC_013156	A	6	6	1477450	1477455	100 %	0 %	0 %	0 %	256811513
35012	NC_013156	ACA	2	6	1477467	1477472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811513
35013	NC_013156	T	6	6	1477488	1477493	0 %	100 %	0 %	0 %	256811513
35014	NC_013156	CTA	2	6	1477613	1477618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811513
35015	NC_013156	TGC	2	6	1477635	1477640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256811513
35016	NC_013156	TGA	2	6	1477731	1477736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256811513
35017	NC_013156	TAAA	2	8	1477745	1477752	75 %	25 %	0 %	0 %	256811513
35018	NC_013156	TAA	2	6	1477803	1477808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256811513
35019	NC_013156	GGT	2	6	1477810	1477815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256811513
35020	NC_013156	TAG	2	6	1477932	1477937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256811513
35021	NC_013156	ATT	2	6	1478005	1478010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811513
35022	NC_013156	AAAT	2	8	1478015	1478022	75 %	25 %	0 %	0 %	256811513
35023	NC_013156	A	7	7	1478037	1478043	100 %	0 %	0 %	0 %	256811513
35024	NC_013156	GAT	2	6	1478074	1478079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256811513
35025	NC_013156	TA	3	6	1478095	1478100	50 %	50 %	0 %	0 %	256811513
35026	NC_013156	ACAT	2	8	1478113	1478120	50 %	25 %	0 %	25 %	256811513
35027	NC_013156	AAG	2	6	1478135	1478140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256811513
35028	NC_013156	TAT	2	6	1478161	1478166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811513
35029	NC_013156	ATT	2	6	1478233	1478238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811513
35030	NC_013156	GCTAAG	2	12	1478257	1478268	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	256811513
35031	NC_013156	ATT	2	6	1478321	1478326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811513
35032	NC_013156	AGATA	2	10	1478373	1478382	60 %	20 %	20 %	0 %	256811513
35033	NC_013156	AG	3	6	1478402	1478407	50 %	0 %	50 %	0 %	256811513
35034	NC_013156	GAT	2	6	1478458	1478463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256811513
35035	NC_013156	GAG	2	6	1478476	1478481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256811513
35036	NC_013156	GAT	2	6	1478530	1478535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256811513
35037	NC_013156	AAAG	2	8	1478550	1478557	75 %	0 %	25 %	0 %	256811513
35038	NC_013156	CATTGA	2	12	1478637	1478648	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	256811514
35039	NC_013156	TAT	2	6	1478740	1478745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811514
35040	NC_013156	AAG	2	6	1478777	1478782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256811514
35041	NC_013156	A	6	6	1478789	1478794	100 %	0 %	0 %	0 %	256811514
35042	NC_013156	GTG	2	6	1478921	1478926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256811514
35043	NC_013156	AAG	2	6	1478935	1478940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256811514
35044	NC_013156	GAA	2	6	1479027	1479032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256811514
35045	NC_013156	GAA	3	9	1479037	1479045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256811514
35046	NC_013156	GAA	2	6	1479052	1479057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256811514
35047	NC_013156	AG	3	6	1479086	1479091	50 %	0 %	50 %	0 %	256811514
35048	NC_013156	AG	3	6	1479096	1479101	50 %	0 %	50 %	0 %	256811514
35049	NC_013156	AAT	2	6	1479149	1479154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256811514
35050	NC_013156	GAG	2	6	1479173	1479178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256811515
35051	NC_013156	GAG	2	6	1479275	1479280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256811515
35052	NC_013156	AGAGGA	2	12	1479326	1479337	50 %	0 %	50 %	0 %	256811515
35053	NC_013156	TGT	2	6	1479373	1479378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256811515
35054	NC_013156	AAC	2	6	1479422	1479427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811515
35055	NC_013156	CTTTTG	2	12	1479436	1479447	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	256811516
35056	NC_013156	AAGA	2	8	1479454	1479461	75 %	0 %	25 %	0 %	256811516
35057	NC_013156	AGA	2	6	1479468	1479473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256811516
35058	NC_013156	AGAGG	2	10	1479510	1479519	40 %	0 %	60 %	0 %	256811516
35059	NC_013156	CAA	2	6	1479542	1479547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811516
35060	NC_013156	ATT	2	6	1479584	1479589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811516
35061	NC_013156	ATTA	2	8	1479592	1479599	50 %	50 %	0 %	0 %	256811516
35062	NC_013156	A	6	6	1479606	1479611	100 %	0 %	0 %	0 %	256811516
35063	NC_013156	AGA	2	6	1479615	1479620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256811516
35064	NC_013156	T	6	6	1479646	1479651	0 %	100 %	0 %	0 %	256811516
35065	NC_013156	ATT	2	6	1479653	1479658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811516
35066	NC_013156	ATG	2	6	1479743	1479748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256811516
35067	NC_013156	TTG	2	6	1479761	1479766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256811516
35068	NC_013156	AG	3	6	1479777	1479782	50 %	0 %	50 %	0 %	256811516
35069	NC_013156	ACA	2	6	1479807	1479812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811516
35070	NC_013156	ATG	2	6	1479815	1479820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256811516
35071	NC_013156	ATT	2	6	1479859	1479864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811516
35072	NC_013156	ATT	2	6	1479901	1479906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811516
35073	NC_013156	CTT	2	6	1479910	1479915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811516
35074	NC_013156	GAG	2	6	1480015	1480020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256811516
35075	NC_013156	TGT	2	6	1480026	1480031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256811516
35076	NC_013156	AGG	2	6	1480162	1480167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256811516
35077	NC_013156	AGG	2	6	1480187	1480192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256811516
35078	NC_013156	TTG	2	6	1480255	1480260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256811516
35079	NC_013156	TAC	2	6	1480317	1480322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811516
35080	NC_013156	TTA	2	6	1480367	1480372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811516
35081	NC_013156	GTT	2	6	1480377	1480382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256811516
35082	NC_013156	T	6	6	1480846	1480851	0 %	100 %	0 %	0 %	256811517
35083	NC_013156	TCA	2	6	1480877	1480882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811517
35084	NC_013156	T	6	6	1480886	1480891	0 %	100 %	0 %	0 %	256811517
35085	NC_013156	ATC	2	6	1480906	1480911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811517
35086	NC_013156	TA	3	6	1480918	1480923	50 %	50 %	0 %	0 %	256811517
35087	NC_013156	TA	3	6	1480942	1480947	50 %	50 %	0 %	0 %	256811517
35088	NC_013156	TAC	2	6	1480951	1480956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811517
35089	NC_013156	AT	3	6	1480980	1480985	50 %	50 %	0 %	0 %	256811517
35090	NC_013156	TTA	2	6	1481042	1481047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811517
35091	NC_013156	TCA	2	6	1481078	1481083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811517
35092	NC_013156	TA	3	6	1481119	1481124	50 %	50 %	0 %	0 %	256811517
35093	NC_013156	CTC	2	6	1481128	1481133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256811517
35094	NC_013156	ACA	2	6	1481144	1481149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811517
35095	NC_013156	AT	3	6	1481160	1481165	50 %	50 %	0 %	0 %	256811517
35096	NC_013156	CCAA	2	8	1481215	1481222	50 %	0 %	0 %	50 %	256811517
35097	NC_013156	ATC	2	6	1481227	1481232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811517
35098	NC_013156	T	8	8	1481253	1481260	0 %	100 %	0 %	0 %	256811517
35099	NC_013156	TA	3	6	1481313	1481318	50 %	50 %	0 %	0 %	256811517
35100	NC_013156	CTT	2	6	1481383	1481388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811517
35101	NC_013156	TCA	2	6	1481442	1481447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811517
35102	NC_013156	CCT	2	6	1481476	1481481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256811517
35103	NC_013156	TTA	2	6	1481523	1481528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811517
35104	NC_013156	ATGG	2	8	1481556	1481563	25 %	25 %	50 %	0 %	256811517
35105	NC_013156	AT	3	6	1481569	1481574	50 %	50 %	0 %	0 %	256811517
35106	NC_013156	ACT	2	6	1481702	1481707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811517
35107	NC_013156	TTG	2	6	1481742	1481747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256811517
35108	NC_013156	AATTTT	2	12	1481777	1481788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811517
35109	NC_013156	CCA	2	6	1481789	1481794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256811517
35110	NC_013156	AAC	2	6	1481821	1481826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811517
35111	NC_013156	TA	3	6	1481835	1481840	50 %	50 %	0 %	0 %	256811517
35112	NC_013156	A	6	6	1481846	1481851	100 %	0 %	0 %	0 %	256811517
35113	NC_013156	ATC	2	6	1481866	1481871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811517
35114	NC_013156	CCA	2	6	1481882	1481887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256811517
35115	NC_013156	CCT	2	6	1481909	1481914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256811517
35116	NC_013156	A	6	6	1481956	1481961	100 %	0 %	0 %	0 %	256811517
35117	NC_013156	CAA	2	6	1481970	1481975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811517
35118	NC_013156	TCT	2	6	1481981	1481986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811517
35119	NC_013156	T	6	6	1482023	1482028	0 %	100 %	0 %	0 %	256811517
35120	NC_013156	TCG	2	6	1482065	1482070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256811517
35121	NC_013156	T	7	7	1482075	1482081	0 %	100 %	0 %	0 %	256811517
35122	NC_013156	T	6	6	1482137	1482142	0 %	100 %	0 %	0 %	256811517
35123	NC_013156	C	6	6	1482166	1482171	0 %	0 %	0 %	100 %	256811517
35124	NC_013156	CAA	2	6	1482183	1482188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811517
35125	NC_013156	T	7	7	1482229	1482235	0 %	100 %	0 %	0 %	256811517
35126	NC_013156	TCA	2	6	1482245	1482250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811517
35127	NC_013156	TAA	2	6	1482261	1482266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256811517
35128	NC_013156	ATT	2	6	1482269	1482274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811517
35129	NC_013156	TCA	2	6	1482379	1482384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811518
35130	NC_013156	GTA	2	6	1482405	1482410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256811518
35131	NC_013156	TC	3	6	1482443	1482448	0 %	50 %	0 %	50 %	256811518
35132	NC_013156	ATCTTT	2	12	1482540	1482551	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	256811518
35133	NC_013156	ATA	2	6	1482552	1482557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256811518
35134	NC_013156	ATC	2	6	1482753	1482758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811518
35135	NC_013156	T	6	6	1482898	1482903	0 %	100 %	0 %	0 %	256811518
35136	NC_013156	T	6	6	1482940	1482945	0 %	100 %	0 %	0 %	256811518
35137	NC_013156	AAT	2	6	1482946	1482951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256811518
35138	NC_013156	TTAAC	2	10	1482989	1482998	40 %	40 %	0 %	20 %	256811518
35139	NC_013156	TCT	2	6	1483080	1483085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811518
35140	NC_013156	ATAC	2	8	1483205	1483212	50 %	25 %	0 %	25 %	256811518
35141	NC_013156	ACT	2	6	1483231	1483236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811518
35142	NC_013156	TTC	2	6	1483248	1483253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811518
35143	NC_013156	TC	3	6	1483363	1483368	0 %	50 %	0 %	50 %	256811518
35144	NC_013156	ATA	2	6	1483378	1483383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256811518
35145	NC_013156	TTC	2	6	1483558	1483563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811519
35146	NC_013156	T	7	7	1483591	1483597	0 %	100 %	0 %	0 %	256811519
35147	NC_013156	TTC	2	6	1483629	1483634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811519
35148	NC_013156	CTT	2	6	1483645	1483650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811519
35149	NC_013156	TAA	2	6	1483661	1483666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256811519
35150	NC_013156	AAGT	2	8	1483705	1483712	50 %	25 %	25 %	0 %	256811519
35151	NC_013156	AAC	2	6	1483896	1483901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811519
35152	NC_013156	C	6	6	1483944	1483949	0 %	0 %	0 %	100 %	256811519
35153	NC_013156	CTTTC	2	10	1483970	1483979	0 %	60 %	0 %	40 %	256811519
35154	NC_013156	TATC	2	8	1483982	1483989	25 %	50 %	0 %	25 %	256811519
35155	NC_013156	ACA	2	6	1484029	1484034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811519
35156	NC_013156	TCA	2	6	1484068	1484073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811519
35157	NC_013156	ATA	2	6	1484091	1484096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256811519
35158	NC_013156	CTT	2	6	1484113	1484118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811519
35159	NC_013156	TCA	2	6	1484155	1484160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811519
35160	NC_013156	AAC	2	6	1484235	1484240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811519
35161	NC_013156	TCA	2	6	1484326	1484331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811519
35162	NC_013156	CTT	2	6	1484387	1484392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811519
35163	NC_013156	ATTT	2	8	1484417	1484424	25 %	75 %	0 %	0 %	256811519
35164	NC_013156	TAA	2	6	1484438	1484443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256811519
35165	NC_013156	TCC	2	6	1484447	1484452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256811519
35166	NC_013156	AT	3	6	1484481	1484486	50 %	50 %	0 %	0 %	256811519
35167	NC_013156	ATC	2	6	1484571	1484576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811519
35168	NC_013156	AAC	2	6	1484619	1484624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811519
35169	NC_013156	CTTT	2	8	1484656	1484663	0 %	75 %	0 %	25 %	256811519
35170	NC_013156	T	7	7	1484666	1484672	0 %	100 %	0 %	0 %	256811519
35171	NC_013156	A	6	6	1484677	1484682	100 %	0 %	0 %	0 %	256811519
35172	NC_013156	TCT	2	6	1484854	1484859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811519
35173	NC_013156	TTA	2	6	1484920	1484925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811519
35174	NC_013156	TGA	2	6	1484973	1484978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256811519
35175	NC_013156	CAA	2	6	1484984	1484989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811519
35176	NC_013156	TCA	2	6	1485011	1485016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811519

< Previous12...59606162636465666768697071Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.