MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 1263

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013156	AGCTG	2	10	596711	596720	20 %	20 %	40 %	20 %	256810583
502	NC_013156	ATTTT	2	10	598275	598284	20 %	80 %	0 %	0 %	256810584
503	NC_013156	TTTAA	2	10	599583	599592	40 %	60 %	0 %	0 %	256810585
504	NC_013156	CCTTT	2	10	600079	600088	0 %	60 %	0 %	40 %	256810585
505	NC_013156	GTTGA	2	10	600801	600810	20 %	40 %	40 %	0 %	256810586
506	NC_013156	TTTCT	2	10	605114	605123	0 %	80 %	0 %	20 %	256810590
507	NC_013156	AATTT	2	10	610298	610307	40 %	60 %	0 %	0 %	256810595
508	NC_013156	TTTTA	2	10	611082	611091	20 %	80 %	0 %	0 %	256810596
509	NC_013156	TAAAA	2	10	611231	611240	80 %	20 %	0 %	0 %	256810596
510	NC_013156	AAGAG	2	10	612437	612446	60 %	0 %	40 %	0 %	256810597
511	NC_013156	AGATA	2	10	614210	614219	60 %	20 %	20 %	0 %	256810598
512	NC_013156	GAAAA	2	10	615349	615358	80 %	0 %	20 %	0 %	256810600
513	NC_013156	ACGCC	2	10	616414	616423	20 %	0 %	20 %	60 %	256810602
514	NC_013156	TTACT	2	10	616688	616697	20 %	60 %	0 %	20 %	256810602
515	NC_013156	ATTTT	2	10	620280	620289	20 %	80 %	0 %	0 %	256810604
516	NC_013156	CCAAA	2	10	620379	620388	60 %	0 %	0 %	40 %	256810605
517	NC_013156	TGTTT	2	10	620404	620413	0 %	80 %	20 %	0 %	256810605
518	NC_013156	AAAGA	2	10	621564	621573	80 %	0 %	20 %	0 %	256810607
519	NC_013156	TAAAA	2	10	621993	622002	80 %	20 %	0 %	0 %	256810607
520	NC_013156	ATGTT	2	10	622490	622499	20 %	60 %	20 %	0 %	256810608
521	NC_013156	TTAAA	2	10	624659	624668	60 %	40 %	0 %	0 %	256810610
522	NC_013156	AGTTT	2	10	627808	627817	20 %	60 %	20 %	0 %	256810611
523	NC_013156	TTCCA	2	10	628338	628347	20 %	40 %	0 %	40 %	256810611
524	NC_013156	TGATT	2	10	630583	630592	20 %	60 %	20 %	0 %	256810613
525	NC_013156	AGATA	2	10	631687	631696	60 %	20 %	20 %	0 %	256810614
526	NC_013156	CTTTT	2	10	633802	633811	0 %	80 %	0 %	20 %	256810617
527	NC_013156	AGAGG	2	10	634588	634597	40 %	0 %	60 %	0 %	256810618
528	NC_013156	AGCCA	2	10	636325	636334	40 %	0 %	20 %	40 %	256810621
529	NC_013156	CCTTT	2	10	639238	639247	0 %	60 %	0 %	40 %	256810624
530	NC_013156	TAATT	2	10	639736	639745	40 %	60 %	0 %	0 %	256810625
531	NC_013156	TAACT	2	10	641157	641166	40 %	40 %	0 %	20 %	256810627
532	NC_013156	CTTCT	2	10	641318	641327	0 %	60 %	0 %	40 %	256810627
533	NC_013156	CAACT	2	10	643115	643124	40 %	20 %	0 %	40 %	256810631
534	NC_013156	CTCTT	2	10	643608	643617	0 %	60 %	0 %	40 %	256810633
535	NC_013156	CCATA	2	10	643706	643715	40 %	20 %	0 %	40 %	256810633
536	NC_013156	TGTAA	2	10	644289	644298	40 %	40 %	20 %	0 %	256810634
537	NC_013156	TTTAA	2	10	644524	644533	40 %	60 %	0 %	0 %	256810634
538	NC_013156	TTCTT	2	10	647040	647049	0 %	80 %	0 %	20 %	256810640
539	NC_013156	AATCA	2	10	650490	650499	60 %	20 %	0 %	20 %	256810646
540	NC_013156	CTTTT	2	10	650931	650940	0 %	80 %	0 %	20 %	256810646
541	NC_013156	TTTTC	2	10	651191	651200	0 %	80 %	0 %	20 %	256810647
542	NC_013156	TGAGT	2	10	653938	653947	20 %	40 %	40 %	0 %	256810649
543	NC_013156	GAAAA	2	10	656176	656185	80 %	0 %	20 %	0 %	256810652
544	NC_013156	GAAGA	2	10	657181	657190	60 %	0 %	40 %	0 %	256810653
545	NC_013156	GGTAA	2	10	657994	658003	40 %	20 %	40 %	0 %	256810655
546	NC_013156	ATTTT	2	10	659219	659228	20 %	80 %	0 %	0 %	256810657
547	NC_013156	TTTTG	2	10	659317	659326	0 %	80 %	20 %	0 %	256810657
548	NC_013156	TATCT	2	10	661592	661601	20 %	60 %	0 %	20 %	256810660
549	NC_013156	ATTTA	2	10	663448	663457	40 %	60 %	0 %	0 %	256810661
550	NC_013156	AAGAG	2	10	664944	664953	60 %	0 %	40 %	0 %	256810662
551	NC_013156	TTGTT	2	10	666639	666648	0 %	80 %	20 %	0 %	256810665
552	NC_013156	TATTT	2	10	667709	667718	20 %	80 %	0 %	0 %	256810666
553	NC_013156	AATTA	2	10	668377	668386	60 %	40 %	0 %	0 %	256810667
554	NC_013156	TATAA	2	10	669901	669910	60 %	40 %	0 %	0 %	256810670
555	NC_013156	TTTAA	2	10	671734	671743	40 %	60 %	0 %	0 %	256810672
556	NC_013156	TTTTC	2	10	673576	673585	0 %	80 %	0 %	20 %	256810674
557	NC_013156	CTTTT	2	10	673705	673714	0 %	80 %	0 %	20 %	256810674
558	NC_013156	TTTTG	2	10	673786	673795	0 %	80 %	20 %	0 %	256810674
559	NC_013156	CTTCT	2	10	673868	673877	0 %	60 %	0 %	40 %	256810674
560	NC_013156	CCCTT	2	10	673890	673899	0 %	40 %	0 %	60 %	256810674
561	NC_013156	TGCAA	2	10	674348	674357	40 %	20 %	20 %	20 %	256810675
562	NC_013156	AGAAA	2	10	679026	679035	80 %	0 %	20 %	0 %	256810677
563	NC_013156	CTTAT	2	10	679085	679094	20 %	60 %	0 %	20 %	256810677
564	NC_013156	AAGAT	2	10	681542	681551	60 %	20 %	20 %	0 %	256810679
565	NC_013156	CAAGC	2	10	683175	683184	40 %	0 %	20 %	40 %	256810682
566	NC_013156	TGGAT	2	10	683391	683400	20 %	40 %	40 %	0 %	256810682
567	NC_013156	AAAAT	2	10	684016	684025	80 %	20 %	0 %	0 %	256810683
568	NC_013156	TATAA	2	10	684222	684231	60 %	40 %	0 %	0 %	256810683
569	NC_013156	TAATT	2	10	684369	684378	40 %	60 %	0 %	0 %	256810683
570	NC_013156	TGAAC	2	10	688657	688666	40 %	20 %	20 %	20 %	256810689
571	NC_013156	GTATT	2	10	691926	691935	20 %	60 %	20 %	0 %	256810692
572	NC_013156	TATTG	2	10	692051	692060	20 %	60 %	20 %	0 %	256810692
573	NC_013156	GATAA	2	10	695707	695716	60 %	20 %	20 %	0 %	256810695
574	NC_013156	ATTTT	3	15	695928	695942	20 %	80 %	0 %	0 %	256810695
575	NC_013156	CAAAA	2	10	696109	696118	80 %	0 %	0 %	20 %	256810696
576	NC_013156	ACCTT	2	10	697250	697259	20 %	40 %	0 %	40 %	256810697
577	NC_013156	TAACC	2	10	697366	697375	40 %	20 %	0 %	40 %	256810697
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579	NC_013156	AAAGT	2	10	698060	698069	60 %	20 %	20 %	0 %	256810698
580	NC_013156	ATTTA	2	10	700304	700313	40 %	60 %	0 %	0 %	256810699
581	NC_013156	ATATT	2	10	700963	700972	40 %	60 %	0 %	0 %	256810700
582	NC_013156	AAAGG	2	10	701446	701455	60 %	0 %	40 %	0 %	256810701
583	NC_013156	GTTGA	2	10	701788	701797	20 %	40 %	40 %	0 %	256810701
584	NC_013156	ATGGG	2	10	706172	706181	20 %	20 %	60 %	0 %	256810703
585	NC_013156	CAGTT	2	10	706538	706547	20 %	40 %	20 %	20 %	256810703
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587	NC_013156	TAAAA	2	10	707466	707475	80 %	20 %	0 %	0 %	256810703
588	NC_013156	ATAAA	2	10	708614	708623	80 %	20 %	0 %	0 %	256810704
589	NC_013156	ATTCT	2	10	711036	711045	20 %	60 %	0 %	20 %	256810707
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591	NC_013156	AAAGA	2	10	712590	712599	80 %	0 %	20 %	0 %	256810709
592	NC_013156	AGGAA	2	10	712776	712785	60 %	0 %	40 %	0 %	256810710
593	NC_013156	CCTTA	2	10	713625	713634	20 %	40 %	0 %	40 %	256810711
594	NC_013156	TAAAT	2	10	713871	713880	60 %	40 %	0 %	0 %	256810711
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596	NC_013156	TTATT	2	10	715670	715679	20 %	80 %	0 %	0 %	256810713
597	NC_013156	TCTCA	2	10	717104	717113	20 %	40 %	0 %	40 %	256810714
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599	NC_013156	TCCTA	2	10	722695	722704	20 %	40 %	0 %	40 %	256810719
600	NC_013156	CAGCT	2	10	724401	724410	20 %	20 %	20 %	40 %	256810721
601	NC_013156	CCAAA	2	10	725239	725248	60 %	0 %	0 %	40 %	256810722
602	NC_013156	CAATT	2	10	725714	725723	40 %	40 %	0 %	20 %	256810722
603	NC_013156	ATATG	2	10	726037	726046	40 %	40 %	20 %	0 %	256810723
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605	NC_013156	GTATT	2	10	727179	727188	20 %	60 %	20 %	0 %	256810723
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607	NC_013156	TAAAT	2	10	729533	729542	60 %	40 %	0 %	0 %	256810725
608	NC_013156	TACCT	2	10	729794	729803	20 %	40 %	0 %	40 %	256810725
609	NC_013156	AAAGA	2	10	730110	730119	80 %	0 %	20 %	0 %	256810725
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611	NC_013156	ATTTA	2	10	734010	734019	40 %	60 %	0 %	0 %	256810728
612	NC_013156	AGAAA	2	10	734326	734335	80 %	0 %	20 %	0 %	256810729
613	NC_013156	ATAAA	2	10	734831	734840	80 %	20 %	0 %	0 %	256810729
614	NC_013156	CAATA	2	10	735132	735141	60 %	20 %	0 %	20 %	256810729
615	NC_013156	TATCA	2	10	736818	736827	40 %	40 %	0 %	20 %	256810732
616	NC_013156	TGCTC	2	10	742261	742270	0 %	40 %	20 %	40 %	256810737
617	NC_013156	TTTCT	2	10	743003	743012	0 %	80 %	0 %	20 %	256810737
618	NC_013156	ATTTT	2	10	745546	745555	20 %	80 %	0 %	0 %	256810740
619	NC_013156	TTCTT	2	10	745585	745594	0 %	80 %	0 %	20 %	256810740
620	NC_013156	ATTTA	2	10	746014	746023	40 %	60 %	0 %	0 %	256810741
621	NC_013156	CTTTA	2	10	746086	746095	20 %	60 %	0 %	20 %	256810741
622	NC_013156	CTTGT	2	10	750266	750275	0 %	60 %	20 %	20 %	256810746
623	NC_013156	ATAAA	2	10	751107	751116	80 %	20 %	0 %	0 %	256810747
624	NC_013156	ATTAT	2	10	752916	752925	40 %	60 %	0 %	0 %	256810749
625	NC_013156	TGGAT	2	10	755581	755590	20 %	40 %	40 %	0 %	256810752
626	NC_013156	TACTC	2	10	755809	755818	20 %	40 %	0 %	40 %	256810753
627	NC_013156	ATTGC	2	10	758310	758319	20 %	40 %	20 %	20 %	256810754
628	NC_013156	AGAAA	2	10	762024	762033	80 %	0 %	20 %	0 %	256810757
629	NC_013156	GAAAA	2	10	762600	762609	80 %	0 %	20 %	0 %	256810758
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