MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Methylobacterium extorquens DM4 plasmid p1METDI

Total Repeats: 204

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012987	CG	3	6	121	126	0 %	0 %	50 %	50 %	254558119
2	NC_012987	GC	3	6	221	226	0 %	0 %	50 %	50 %	254558119
3	NC_012987	GC	3	6	380	385	0 %	0 %	50 %	50 %	254558120
4	NC_012987	GC	3	6	652	657	0 %	0 %	50 %	50 %	254558120
5	NC_012987	CG	3	6	1281	1286	0 %	0 %	50 %	50 %	254558121
6	NC_012987	CG	4	8	2516	2523	0 %	0 %	50 %	50 %	254558122
7	NC_012987	GC	3	6	3712	3717	0 %	0 %	50 %	50 %	254558123
8	NC_012987	GC	4	8	5433	5440	0 %	0 %	50 %	50 %	254558124
9	NC_012987	GC	3	6	5443	5448	0 %	0 %	50 %	50 %	254558124
10	NC_012987	TC	3	6	6289	6294	0 %	50 %	0 %	50 %	254558124
11	NC_012987	CG	3	6	7406	7411	0 %	0 %	50 %	50 %	254558125
12	NC_012987	GC	3	6	7503	7508	0 %	0 %	50 %	50 %	254558125
13	NC_012987	CG	3	6	8060	8065	0 %	0 %	50 %	50 %	254558125
14	NC_012987	AC	3	6	8329	8334	50 %	0 %	0 %	50 %	254558125
15	NC_012987	CG	3	6	8496	8501	0 %	0 %	50 %	50 %	254558125
16	NC_012987	AC	3	6	8884	8889	50 %	0 %	0 %	50 %	254558126
17	NC_012987	GC	3	6	8989	8994	0 %	0 %	50 %	50 %	254558126
18	NC_012987	CG	4	8	9052	9059	0 %	0 %	50 %	50 %	254558126
19	NC_012987	GC	3	6	9079	9084	0 %	0 %	50 %	50 %	254558126
20	NC_012987	CG	3	6	9861	9866	0 %	0 %	50 %	50 %	254558127
21	NC_012987	GC	3	6	10048	10053	0 %	0 %	50 %	50 %	254558127
22	NC_012987	CG	5	10	10213	10222	0 %	0 %	50 %	50 %	254558127
23	NC_012987	CG	4	8	10373	10380	0 %	0 %	50 %	50 %	254558127
24	NC_012987	GC	3	6	11977	11982	0 %	0 %	50 %	50 %	254558128
25	NC_012987	GC	3	6	12208	12213	0 %	0 %	50 %	50 %	254558128
26	NC_012987	CT	4	8	12228	12235	0 %	50 %	0 %	50 %	254558128
27	NC_012987	GA	3	6	12938	12943	50 %	0 %	50 %	0 %	254558129
28	NC_012987	AC	3	6	12983	12988	50 %	0 %	0 %	50 %	254558129
29	NC_012987	CG	3	6	13475	13480	0 %	0 %	50 %	50 %	254558129
30	NC_012987	TG	3	6	13895	13900	0 %	50 %	50 %	0 %	254558129
31	NC_012987	GC	3	6	14074	14079	0 %	0 %	50 %	50 %	254558129
32	NC_012987	GC	3	6	14289	14294	0 %	0 %	50 %	50 %	254558129
33	NC_012987	GC	3	6	14634	14639	0 %	0 %	50 %	50 %	254558130
34	NC_012987	GC	3	6	16759	16764	0 %	0 %	50 %	50 %	254558131
35	NC_012987	GC	3	6	18908	18913	0 %	0 %	50 %	50 %	254558132
36	NC_012987	GA	3	6	19358	19363	50 %	0 %	50 %	0 %	254558132
37	NC_012987	CG	4	8	19694	19701	0 %	0 %	50 %	50 %	254558132
38	NC_012987	GC	3	6	19790	19795	0 %	0 %	50 %	50 %	254558132
39	NC_012987	CG	4	8	22982	22989	0 %	0 %	50 %	50 %	254558133
40	NC_012987	CG	3	6	23932	23937	0 %	0 %	50 %	50 %	254558134
41	NC_012987	CG	3	6	25377	25382	0 %	0 %	50 %	50 %	254558135
42	NC_012987	CG	4	8	29420	29427	0 %	0 %	50 %	50 %	254558137
43	NC_012987	GC	4	8	29581	29588	0 %	0 %	50 %	50 %	254558137
44	NC_012987	GC	3	6	29971	29976	0 %	0 %	50 %	50 %	254558137
45	NC_012987	CG	3	6	29980	29985	0 %	0 %	50 %	50 %	254558137
46	NC_012987	GC	3	6	30226	30231	0 %	0 %	50 %	50 %	254558137
47	NC_012987	CG	3	6	30378	30383	0 %	0 %	50 %	50 %	254558137
48	NC_012987	GA	3	6	30599	30604	50 %	0 %	50 %	0 %	254558138
49	NC_012987	AG	3	6	30728	30733	50 %	0 %	50 %	0 %	254558138
50	NC_012987	GC	3	6	31294	31299	0 %	0 %	50 %	50 %	254558138
51	NC_012987	CG	4	8	31501	31508	0 %	0 %	50 %	50 %	254558138
52	NC_012987	CG	3	6	31661	31666	0 %	0 %	50 %	50 %	254558138
53	NC_012987	GC	3	6	31909	31914	0 %	0 %	50 %	50 %	254558138
54	NC_012987	AC	3	6	33327	33332	50 %	0 %	0 %	50 %	254558139
55	NC_012987	GC	4	8	33570	33577	0 %	0 %	50 %	50 %	254558139
56	NC_012987	GC	3	6	33853	33858	0 %	0 %	50 %	50 %	254558139
57	NC_012987	CG	3	6	33897	33902	0 %	0 %	50 %	50 %	254558139
58	NC_012987	CG	3	6	34153	34158	0 %	0 %	50 %	50 %	254558139
59	NC_012987	GA	3	6	34218	34223	50 %	0 %	50 %	0 %	254558139
60	NC_012987	CG	3	6	34743	34748	0 %	0 %	50 %	50 %	254558140
61	NC_012987	CT	3	6	35126	35131	0 %	50 %	0 %	50 %	254558140
62	NC_012987	GC	4	8	38298	38305	0 %	0 %	50 %	50 %	254558142
63	NC_012987	GA	3	6	38662	38667	50 %	0 %	50 %	0 %	254558142
64	NC_012987	GC	3	6	47357	47362	0 %	0 %	50 %	50 %	254558145
65	NC_012987	TC	3	6	47388	47393	0 %	50 %	0 %	50 %	254558145
66	NC_012987	GT	3	6	47605	47610	0 %	50 %	50 %	0 %	254558145
67	NC_012987	GC	4	8	49543	49550	0 %	0 %	50 %	50 %	254558146
68	NC_012987	GC	3	6	49838	49843	0 %	0 %	50 %	50 %	254558146
69	NC_012987	TG	3	6	51050	51055	0 %	50 %	50 %	0 %	254558147
70	NC_012987	GC	3	6	52049	52054	0 %	0 %	50 %	50 %	254558148
71	NC_012987	GC	4	8	52120	52127	0 %	0 %	50 %	50 %	254558148
72	NC_012987	GC	3	6	52180	52185	0 %	0 %	50 %	50 %	254558148
73	NC_012987	GC	3	6	52585	52590	0 %	0 %	50 %	50 %	254558148
74	NC_012987	GC	3	6	52723	52728	0 %	0 %	50 %	50 %	254558148
75	NC_012987	CG	3	6	52988	52993	0 %	0 %	50 %	50 %	254558148
76	NC_012987	GC	3	6	53196	53201	0 %	0 %	50 %	50 %	254558148
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80	NC_012987	TC	3	6	62729	62734	0 %	50 %	0 %	50 %	254558151
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82	NC_012987	CG	3	6	64645	64650	0 %	0 %	50 %	50 %	254558153
83	NC_012987	GC	3	6	65025	65030	0 %	0 %	50 %	50 %	254558154
84	NC_012987	CG	3	6	65190	65195	0 %	0 %	50 %	50 %	254558154
85	NC_012987	CG	3	6	65403	65408	0 %	0 %	50 %	50 %	254558154
86	NC_012987	CG	3	6	66541	66546	0 %	0 %	50 %	50 %	254558155
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89	NC_012987	CG	3	6	68241	68246	0 %	0 %	50 %	50 %	254558156
90	NC_012987	CG	3	6	68560	68565	0 %	0 %	50 %	50 %	254558157
91	NC_012987	GC	3	6	68733	68738	0 %	0 %	50 %	50 %	254558157
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93	NC_012987	CG	3	6	69921	69926	0 %	0 %	50 %	50 %	254558158
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96	NC_012987	CG	4	8	71164	71171	0 %	0 %	50 %	50 %	254558159
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102	NC_012987	CG	3	6	74032	74037	0 %	0 %	50 %	50 %	254558162
103	NC_012987	CG	3	6	74394	74399	0 %	0 %	50 %	50 %	254558162
104	NC_012987	GC	3	6	74653	74658	0 %	0 %	50 %	50 %	254558163
105	NC_012987	CG	6	12	75171	75182	0 %	0 %	50 %	50 %	254558163
106	NC_012987	GC	3	6	77427	77432	0 %	0 %	50 %	50 %	254558164
107	NC_012987	AC	3	6	77887	77892	50 %	0 %	0 %	50 %	254558164
108	NC_012987	GT	3	6	78261	78266	0 %	50 %	50 %	0 %	254558164
109	NC_012987	GC	3	6	78798	78803	0 %	0 %	50 %	50 %	254558165
110	NC_012987	CA	3	6	78818	78823	50 %	0 %	0 %	50 %	254558165
111	NC_012987	GC	3	6	78850	78855	0 %	0 %	50 %	50 %	254558165
112	NC_012987	GT	3	6	79957	79962	0 %	50 %	50 %	0 %	254558166
113	NC_012987	TG	3	6	80235	80240	0 %	50 %	50 %	0 %	254558166
114	NC_012987	CA	4	8	80297	80304	50 %	0 %	0 %	50 %	254558166
115	NC_012987	CG	3	6	80347	80352	0 %	0 %	50 %	50 %	254558166
116	NC_012987	CG	3	6	83480	83485	0 %	0 %	50 %	50 %	254558168
117	NC_012987	AC	3	6	83651	83656	50 %	0 %	0 %	50 %	254558168
118	NC_012987	GC	3	6	83914	83919	0 %	0 %	50 %	50 %	254558168
119	NC_012987	TC	3	6	84265	84270	0 %	50 %	0 %	50 %	254558169
120	NC_012987	GC	3	6	84333	84338	0 %	0 %	50 %	50 %	254558169
121	NC_012987	CG	3	6	84360	84365	0 %	0 %	50 %	50 %	254558169
122	NC_012987	CG	3	6	85179	85184	0 %	0 %	50 %	50 %	254558170
123	NC_012987	GC	3	6	85737	85742	0 %	0 %	50 %	50 %	254558170
124	NC_012987	CG	3	6	90014	90019	0 %	0 %	50 %	50 %	254558171
125	NC_012987	CG	3	6	90974	90979	0 %	0 %	50 %	50 %	254558171
126	NC_012987	CG	3	6	91026	91031	0 %	0 %	50 %	50 %	254558171
127	NC_012987	CA	3	6	91205	91210	50 %	0 %	0 %	50 %	254558171
128	NC_012987	GC	3	6	92601	92606	0 %	0 %	50 %	50 %	254558172
129	NC_012987	GC	3	6	92878	92883	0 %	0 %	50 %	50 %	254558172
130	NC_012987	GC	3	6	96517	96522	0 %	0 %	50 %	50 %	254558174
131	NC_012987	CG	3	6	97747	97752	0 %	0 %	50 %	50 %	254558177
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133	NC_012987	GC	3	6	98738	98743	0 %	0 %	50 %	50 %	254558179
134	NC_012987	GA	3	6	98856	98861	50 %	0 %	50 %	0 %	254558179
135	NC_012987	CG	3	6	99326	99331	0 %	0 %	50 %	50 %	254558180
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140	NC_012987	CG	4	8	102785	102792	0 %	0 %	50 %	50 %	254558187
141	NC_012987	GC	3	6	103152	103157	0 %	0 %	50 %	50 %	254558187
142	NC_012987	GC	3	6	103245	103250	0 %	0 %	50 %	50 %	254558187
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.