MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Methylobacterium extorquens DM4 plasmid p1METDI

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012987	CTTCGA	2	12	157	168	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	254558119
2	NC_012987	ACCGGC	2	12	514	525	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	254558120
3	NC_012987	GGCCGG	2	12	3036	3047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254558123
4	NC_012987	GCTACC	2	12	5390	5401	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	254558124
5	NC_012987	GATCGA	2	12	8773	8784	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	254558126
6	NC_012987	TCACAA	2	12	10540	10551	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	254558127
7	NC_012987	TGAGCG	2	12	14341	14352	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	254558129
8	NC_012987	CCGGCA	2	12	14686	14697	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	254558130
9	NC_012987	CACCGG	2	12	19630	19641	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	254558132
10	NC_012987	TCGGCG	2	12	22933	22944	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	254558133
11	NC_012987	AGCGCG	2	12	24654	24665	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	254558134
12	NC_012987	GGAGGC	2	12	30904	30915	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	254558138
13	NC_012987	ACCGCC	2	12	31241	31252	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	254558138
14	NC_012987	GCGGCT	2	12	37097	37108	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	254558141
15	NC_012987	AGGCCG	2	12	37979	37990	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	254558141
16	NC_012987	GCCTCG	2	12	38108	38119	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	254558141
17	NC_012987	GCCCGC	2	12	39426	39437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254558143
18	NC_012987	GGATGC	2	12	49203	49214	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	254558146
19	NC_012987	GGTGCT	2	12	49269	49280	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	254558146
20	NC_012987	GCCACG	2	12	49400	49411	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	254558146
21	NC_012987	GGCGAA	2	12	51493	51504	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	254558147
22	NC_012987	GCGCTC	2	12	52353	52364	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	254558148
23	NC_012987	TCGAAC	2	12	62671	62682	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	254558151
24	NC_012987	TGCGCA	2	12	62704	62715	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	254558151
25	NC_012987	ACTGGG	2	12	63619	63630	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	254558152
26	NC_012987	CCCCGC	2	12	63998	64009	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	254558152
27	NC_012987	TCGGCC	2	12	66704	66715	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	254558155
28	NC_012987	CCGACG	2	12	67438	67449	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	254558156
29	NC_012987	CGAGGG	2	12	71424	71435	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	254558160
30	NC_012987	TGCCGG	2	12	71460	71471	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	254558160
31	NC_012987	CCGACG	2	12	72628	72639	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	254558161
32	NC_012987	GCACCG	2	12	77868	77879	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	254558164
33	NC_012987	CAGGCG	2	12	79002	79013	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	254558165
34	NC_012987	CTCGGC	2	12	84249	84260	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	254558169
35	NC_012987	CTTCTG	2	12	84854	84865	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	254558169
36	NC_012987	CGGCCT	2	12	85723	85734	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	254558170
37	NC_012987	GAACGT	2	12	90360	90371	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	254558171
38	NC_012987	CTCGGG	2	12	103041	103052	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	254558187
39	NC_012987	CCGCCC	2	12	103233	103244	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	254558187
40	NC_012987	CCGAGC	2	12	103741	103752	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	254558187
41	NC_012987	GCCCGC	2	12	106968	106979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254558192
42	NC_012987	GTCGCT	2	12	107153	107164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254558192
43	NC_012987	TACGGC	2	12	107280	107291	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	254558192
44	NC_012987	CGCCCG	2	12	108858	108869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254558193
45	NC_012987	GCCACG	2	12	109490	109501	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	254558193
46	NC_012987	TTCCCG	2	12	110834	110845	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	254558193
47	NC_012987	GTCGAG	2	12	110963	110974	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	254558193
48	NC_012987	CCGACG	2	12	111405	111416	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	254558193
49	NC_012987	TCACGG	2	12	112329	112340	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	254558193
50	NC_012987	CGCCCT	2	12	112438	112449	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	254558193
51	NC_012987	CGGCGC	2	12	112855	112866	0 %	0 %	50 %	50 %	254558193
52	NC_012987	CCGAGA	2	12	115140	115151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254558195
53	NC_012987	CGGGGC	2	12	115536	115547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254558196
54	NC_012987	AGGATC	2	12	118081	118092	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	254558200
55	NC_012987	CCGGAG	2	12	118522	118533	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	254558200
56	NC_012987	AGTTCG	2	12	120538	120549	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	254558203
57	NC_012987	GCTGGT	2	12	121538	121549	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	254558203
58	NC_012987	AGGCCC	2	12	122788	122799	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	254558203
59	NC_012987	CCTTCG	2	12	125699	125710	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	254558206
60	NC_012987	TCGATC	2	12	130164	130175	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	254558208
61	NC_012987	GTGTTG	2	12	131306	131317	0 %	50 %	50 %	0 %	254558211
62	NC_012987	GATCGC	2	12	131446	131457	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	254558211
63	NC_012987	TCGCGG	2	12	131906	131917	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	254558211
64	NC_012987	CCGGGG	2	12	131937	131948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254558211
65	NC_012987	GCATCG	2	12	133338	133349	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	254558212
66	NC_012987	CTCGCC	2	12	135937	135948	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	254558216
67	NC_012987	CTACGG	2	12	137230	137241	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	254558218
68	NC_012987	TACGGC	2	12	137261	137272	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	254558218
69	NC_012987	GGCTAT	2	12	137318	137329	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	254558218

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.