MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 1435 chromosome

Total Repeats: 3164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012943	TCATC	2	10	1004	1013	20 %	40 %	0 %	40 %	253796916
2	NC_012943	CGTTT	2	10	2194	2203	0 %	60 %	20 %	20 %	253796917
3	NC_012943	CGGTT	2	10	3343	3352	0 %	40 %	40 %	20 %	253796917
4	NC_012943	GTCGG	2	10	4691	4700	0 %	20 %	60 %	20 %	253796919
5	NC_012943	GCAGC	2	10	7475	7484	20 %	0 %	40 %	40 %	253796921
6	NC_012943	CGGTG	2	10	9383	9392	0 %	20 %	60 %	20 %	253796921
7	NC_012943	CAGAC	2	10	9901	9910	40 %	0 %	20 %	40 %	253796921
8	NC_012943	CGCAA	2	10	10425	10434	40 %	0 %	20 %	40 %	253796922
9	NC_012943	CGGCG	2	10	10551	10560	0 %	0 %	60 %	40 %	253796922
10	NC_012943	GGCGT	2	10	14256	14265	0 %	20 %	60 %	20 %	253796927
11	NC_012943	GGGCC	2	10	14539	14548	0 %	0 %	60 %	40 %	253796927
12	NC_012943	GCGTT	2	10	15284	15293	0 %	40 %	40 %	20 %	253796928
13	NC_012943	CCAGC	2	10	15824	15833	20 %	0 %	20 %	60 %	253796929
14	NC_012943	ACCGA	2	10	16587	16596	40 %	0 %	20 %	40 %	253796929
15	NC_012943	ATCGG	2	10	16979	16988	20 %	20 %	40 %	20 %	253796929
16	NC_012943	CGGCC	2	10	17988	17997	0 %	0 %	40 %	60 %	253796930
17	NC_012943	TTAGC	2	10	19139	19148	20 %	40 %	20 %	20 %	253796931
18	NC_012943	GGTCC	2	10	19211	19220	0 %	20 %	40 %	40 %	253796931
19	NC_012943	GTCGT	2	10	21730	21739	0 %	40 %	40 %	20 %	253796932
20	NC_012943	ATCAC	2	10	24003	24012	40 %	20 %	0 %	40 %	253796935
21	NC_012943	GCCGG	2	10	24690	24699	0 %	0 %	60 %	40 %	253796935
22	NC_012943	GGCAA	2	10	29403	29412	40 %	0 %	40 %	20 %	253796940
23	NC_012943	CGATC	2	10	30229	30238	20 %	20 %	20 %	40 %	253796941
24	NC_012943	CGACG	2	10	32412	32421	20 %	0 %	40 %	40 %	253796945
25	NC_012943	GCGTC	2	10	32467	32476	0 %	20 %	40 %	40 %	253796945
26	NC_012943	GACAC	2	10	32564	32573	40 %	0 %	20 %	40 %	253796945
27	NC_012943	TCCTG	2	10	37570	37579	0 %	40 %	20 %	40 %	253796950
28	NC_012943	CTCGG	2	10	37663	37672	0 %	20 %	40 %	40 %	253796950
29	NC_012943	GGCGC	2	10	38206	38215	0 %	0 %	60 %	40 %	253796950
30	NC_012943	TGGCC	2	10	38354	38363	0 %	20 %	40 %	40 %	253796950
31	NC_012943	CGGCG	2	10	38886	38895	0 %	0 %	60 %	40 %	253796950
32	NC_012943	GTCCA	2	10	39498	39507	20 %	20 %	20 %	40 %	253796951
33	NC_012943	GCCAA	2	10	41632	41641	40 %	0 %	20 %	40 %	253796953
34	NC_012943	GCACA	2	10	42431	42440	40 %	0 %	20 %	40 %	253796954
35	NC_012943	GGTAC	2	10	44965	44974	20 %	20 %	40 %	20 %	253796956
36	NC_012943	TCGAA	2	10	45197	45206	40 %	20 %	20 %	20 %	253796956
37	NC_012943	GCACC	2	10	46127	46136	20 %	0 %	20 %	60 %	253796956
38	NC_012943	CGGTG	2	10	47161	47170	0 %	20 %	60 %	20 %	253796957
39	NC_012943	TCATG	2	10	47307	47316	20 %	40 %	20 %	20 %	253796957
40	NC_012943	GCAGC	2	10	48701	48710	20 %	0 %	40 %	40 %	253796959
41	NC_012943	CCCGA	2	10	48784	48793	20 %	0 %	20 %	60 %	253796959
42	NC_012943	CAGCG	2	10	49909	49918	20 %	0 %	40 %	40 %	253796960
43	NC_012943	CTCCC	2	10	56343	56352	0 %	20 %	0 %	80 %	253796966
44	NC_012943	CGGCG	2	10	56792	56801	0 %	0 %	60 %	40 %	253796966
45	NC_012943	CGACC	2	10	58324	58333	20 %	0 %	20 %	60 %	253796968
46	NC_012943	CTTCG	2	10	59011	59020	0 %	40 %	20 %	40 %	253796969
47	NC_012943	CGGTG	2	10	60067	60076	0 %	20 %	60 %	20 %	253796972
48	NC_012943	TCAGG	2	10	62553	62562	20 %	20 %	40 %	20 %	253796973
49	NC_012943	GGCGA	2	10	66516	66525	20 %	0 %	60 %	20 %	253796977
50	NC_012943	GGTGT	2	10	69092	69101	0 %	40 %	60 %	0 %	253796980
51	NC_012943	ATCGG	2	10	69729	69738	20 %	20 %	40 %	20 %	253796980
52	NC_012943	CCGCG	2	10	70266	70275	0 %	0 %	40 %	60 %	253796980
53	NC_012943	GGCAA	2	10	70617	70626	40 %	0 %	40 %	20 %	253796980
54	NC_012943	CGACC	2	10	70906	70915	20 %	0 %	20 %	60 %	253796980
55	NC_012943	CGGGT	2	10	71360	71369	0 %	20 %	60 %	20 %	253796980
56	NC_012943	GGTCG	2	10	71420	71429	0 %	20 %	60 %	20 %	253796980
57	NC_012943	TGCCT	2	10	72161	72170	0 %	40 %	20 %	40 %	253796982
58	NC_012943	GTCCA	2	10	73032	73041	20 %	20 %	20 %	40 %	253796983
59	NC_012943	TGACC	2	10	75656	75665	20 %	20 %	20 %	40 %	253796985
60	NC_012943	GCCAA	2	10	75970	75979	40 %	0 %	20 %	40 %	253796985
61	NC_012943	GTCGC	2	10	76047	76056	0 %	20 %	40 %	40 %	253796985
62	NC_012943	GCGCG	2	10	77135	77144	0 %	0 %	60 %	40 %	253796986
63	NC_012943	CACGA	2	10	79983	79992	40 %	0 %	20 %	40 %	253796988
64	NC_012943	GAGCA	2	10	82521	82530	40 %	0 %	40 %	20 %	253796990
65	NC_012943	GCCGG	2	10	82620	82629	0 %	0 %	60 %	40 %	253796990
66	NC_012943	GCGAC	2	10	82696	82705	20 %	0 %	40 %	40 %	253796990
67	NC_012943	ATCCG	2	10	83466	83475	20 %	20 %	20 %	40 %	253796991
68	NC_012943	CACCG	2	10	84246	84255	20 %	0 %	20 %	60 %	253796992
69	NC_012943	TGGTC	2	10	86381	86390	0 %	40 %	40 %	20 %	253796994
70	NC_012943	GCTGG	2	10	87018	87027	0 %	20 %	60 %	20 %	253796995
71	NC_012943	TGGGT	2	10	90056	90065	0 %	40 %	60 %	0 %	253797000
72	NC_012943	TCGCC	2	10	90263	90272	0 %	20 %	20 %	60 %	253797000
73	NC_012943	GGGCC	2	10	91236	91245	0 %	0 %	60 %	40 %	253797001
74	NC_012943	GGCCG	2	10	92555	92564	0 %	0 %	60 %	40 %	253797002
75	NC_012943	GCGCC	2	10	93207	93216	0 %	0 %	40 %	60 %	253797002
76	NC_012943	GCTTG	2	10	95239	95248	0 %	40 %	40 %	20 %	253797004
77	NC_012943	CGTGT	2	10	95671	95680	0 %	40 %	40 %	20 %	253797005
78	NC_012943	AGATC	2	10	95750	95759	40 %	20 %	20 %	20 %	253797005
79	NC_012943	CGGCG	2	10	99331	99340	0 %	0 %	60 %	40 %	253797008
80	NC_012943	GCGGT	2	10	100407	100416	0 %	20 %	60 %	20 %	253797009
81	NC_012943	GCGCC	2	10	103239	103248	0 %	0 %	40 %	60 %	253797011
82	NC_012943	GGTGG	2	10	103927	103936	0 %	20 %	80 %	0 %	253797012
83	NC_012943	GGCTT	2	10	104940	104949	0 %	40 %	40 %	20 %	253797013
84	NC_012943	CTGGC	2	10	105662	105671	0 %	20 %	40 %	40 %	253797014
85	NC_012943	GCACA	2	10	106783	106792	40 %	0 %	20 %	40 %	253797014
86	NC_012943	CTGAA	2	10	109113	109122	40 %	20 %	20 %	20 %	253797017
87	NC_012943	ATCGC	2	10	109608	109617	20 %	20 %	20 %	40 %	253797017
88	NC_012943	TCTGA	2	10	110942	110951	20 %	40 %	20 %	20 %	253797019
89	NC_012943	CGGTC	2	10	111217	111226	0 %	20 %	40 %	40 %	253797019
90	NC_012943	GACCA	2	10	112355	112364	40 %	0 %	20 %	40 %	253797019
91	NC_012943	GGCTG	2	10	114919	114928	0 %	20 %	60 %	20 %	253797019
92	NC_012943	CCGCG	2	10	118839	118848	0 %	0 %	40 %	60 %	253797020
93	NC_012943	TCGTG	2	10	122792	122801	0 %	40 %	40 %	20 %	253797022
94	NC_012943	CCGGA	2	10	124573	124582	20 %	0 %	40 %	40 %	253797024
95	NC_012943	TGCGC	2	10	127046	127055	0 %	20 %	40 %	40 %	253797025
96	NC_012943	GCGAG	2	10	127557	127566	20 %	0 %	60 %	20 %	253797025
97	NC_012943	GGGGT	2	10	128566	128575	0 %	20 %	80 %	0 %	253797025
98	NC_012943	CCCAC	2	10	129128	129137	20 %	0 %	0 %	80 %	253797025
99	NC_012943	CCGGC	2	10	129638	129647	0 %	0 %	40 %	60 %	253797025
100	NC_012943	TGCGG	2	10	130048	130057	0 %	20 %	60 %	20 %	253797025
101	NC_012943	ATCAC	2	10	131527	131536	40 %	20 %	0 %	40 %	253797027
102	NC_012943	ATCGG	2	10	131575	131584	20 %	20 %	40 %	20 %	253797027
103	NC_012943	CGGGC	2	10	132666	132675	0 %	0 %	60 %	40 %	253797027
104	NC_012943	GCGAT	2	10	134471	134480	20 %	20 %	40 %	20 %	253797029
105	NC_012943	GTTCG	2	10	134692	134701	0 %	40 %	40 %	20 %	253797029
106	NC_012943	CCTGG	2	10	135084	135093	0 %	20 %	40 %	40 %	253797029
107	NC_012943	GGCCC	2	10	135190	135199	0 %	0 %	40 %	60 %	253797029
108	NC_012943	CGTTG	2	10	135702	135711	0 %	40 %	40 %	20 %	253797029
109	NC_012943	CGACC	2	10	135774	135783	20 %	0 %	20 %	60 %	253797029
110	NC_012943	GAGAT	2	10	138794	138803	40 %	20 %	40 %	0 %	253797033
111	NC_012943	CGGCG	2	10	140948	140957	0 %	0 %	60 %	40 %	253797034
112	NC_012943	TGCGG	2	10	141581	141590	0 %	20 %	60 %	20 %	253797035
113	NC_012943	CGCTG	2	10	142288	142297	0 %	20 %	40 %	40 %	253797036
114	NC_012943	GTTGC	2	10	142834	142843	0 %	40 %	40 %	20 %	253797036
115	NC_012943	CCGAT	2	10	143582	143591	20 %	20 %	20 %	40 %	253797036
116	NC_012943	ATCGC	2	10	144273	144282	20 %	20 %	20 %	40 %	253797037
117	NC_012943	AACCG	2	10	145012	145021	40 %	0 %	20 %	40 %	253797037
118	NC_012943	CCGCC	2	10	145599	145608	0 %	0 %	20 %	80 %	253797037
119	NC_012943	CCGCC	2	10	146242	146251	0 %	0 %	20 %	80 %	253797038
120	NC_012943	ATCGG	2	10	149726	149735	20 %	20 %	40 %	20 %	253797042
121	NC_012943	TCGTC	2	10	154812	154821	0 %	40 %	20 %	40 %	253797046
122	NC_012943	CACGC	2	10	155276	155285	20 %	0 %	20 %	60 %	253797046
123	NC_012943	ATTCT	2	10	156120	156129	20 %	60 %	0 %	20 %	253797047
124	NC_012943	AGGCG	2	10	156648	156657	20 %	0 %	60 %	20 %	253797047
125	NC_012943	TGACC	2	10	159652	159661	20 %	20 %	20 %	40 %	253797050
126	NC_012943	CGGCG	2	10	159898	159907	0 %	0 %	60 %	40 %	253797050
127	NC_012943	GCACC	2	10	160068	160077	20 %	0 %	20 %	60 %	253797051
128	NC_012943	CCGCA	2	10	161246	161255	20 %	0 %	20 %	60 %	253797052
129	NC_012943	CGCGG	2	10	161325	161334	0 %	0 %	60 %	40 %	253797052
130	NC_012943	CGGTT	2	10	161652	161661	0 %	40 %	40 %	20 %	253797052
131	NC_012943	GCCGG	2	10	162113	162122	0 %	0 %	60 %	40 %	253797053
132	NC_012943	GCGCG	2	10	162235	162244	0 %	0 %	60 %	40 %	253797053
133	NC_012943	CTGGG	2	10	164449	164458	0 %	20 %	60 %	20 %	253797055
134	NC_012943	GCCGG	2	10	165042	165051	0 %	0 %	60 %	40 %	253797056
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250	NC_012943	CGCGG	2	10	343552	343561	0 %	0 %	60 %	40 %	253797207
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262	NC_012943	CGCGC	2	10	366353	366362	0 %	0 %	40 %	60 %	253797226
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