MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 1435 chromosome

Total Repeats: 10362

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012943	CGAC	2	8	413	420	25 %	0 %	25 %	50 %	253796916
2	NC_012943	CGTT	2	8	629	636	0 %	50 %	25 %	25 %	253796916
3	NC_012943	CCCG	2	8	691	698	0 %	0 %	25 %	75 %	253796916
4	NC_012943	GGCA	2	8	762	769	25 %	0 %	50 %	25 %	253796916
5	NC_012943	CCCA	2	8	1020	1027	25 %	0 %	0 %	75 %	253796916
6	NC_012943	GTGG	2	8	2234	2241	0 %	25 %	75 %	0 %	253796917
7	NC_012943	GCCA	2	8	2252	2259	25 %	0 %	25 %	50 %	253796917
8	NC_012943	TCAG	2	8	2596	2603	25 %	25 %	25 %	25 %	253796917
9	NC_012943	CGTT	2	8	2822	2829	0 %	50 %	25 %	25 %	253796917
10	NC_012943	ACGG	2	8	3174	3181	25 %	0 %	50 %	25 %	253796917
11	NC_012943	GCCT	2	8	3236	3243	0 %	25 %	25 %	50 %	253796917
12	NC_012943	CGTC	2	8	3387	3394	0 %	25 %	25 %	50 %	253796918
13	NC_012943	GGTA	2	8	3567	3574	25 %	25 %	50 %	0 %	253796918
14	NC_012943	GGTT	2	8	3749	3756	0 %	50 %	50 %	0 %	253796918
15	NC_012943	CCGC	2	8	3977	3984	0 %	0 %	25 %	75 %	253796918
16	NC_012943	CCAC	2	8	5601	5608	25 %	0 %	0 %	75 %	253796920
17	NC_012943	ACCG	2	8	5620	5627	25 %	0 %	25 %	50 %	253796920
18	NC_012943	CAAG	2	8	5815	5822	50 %	0 %	25 %	25 %	253796920
19	NC_012943	CGCC	2	8	5911	5918	0 %	0 %	25 %	75 %	253796920
20	NC_012943	CGGC	2	8	6726	6733	0 %	0 %	50 %	50 %	253796920
21	NC_012943	GACA	2	8	7406	7413	50 %	0 %	25 %	25 %	253796921
22	NC_012943	CGGT	2	8	7626	7633	0 %	25 %	50 %	25 %	253796921
23	NC_012943	CGAG	2	8	8558	8565	25 %	0 %	50 %	25 %	253796921
24	NC_012943	CCAC	2	8	9088	9095	25 %	0 %	0 %	75 %	253796921
25	NC_012943	CGAC	2	8	9457	9464	25 %	0 %	25 %	50 %	253796921
26	NC_012943	GGTT	2	8	9685	9692	0 %	50 %	50 %	0 %	253796921
27	NC_012943	CCCG	2	8	10234	10241	0 %	0 %	25 %	75 %	253796922
28	NC_012943	GAGC	2	8	12194	12201	25 %	0 %	50 %	25 %	253796923
29	NC_012943	CTCA	2	8	12405	12412	25 %	25 %	0 %	50 %	253796923
30	NC_012943	AACC	2	8	13440	13447	50 %	0 %	0 %	50 %	253796925
31	NC_012943	CCCG	2	8	13549	13556	0 %	0 %	25 %	75 %	253796925
32	NC_012943	ACCC	2	8	14200	14207	25 %	0 %	0 %	75 %	253796927
33	NC_012943	TGAT	2	8	14237	14244	25 %	50 %	25 %	0 %	253796927
34	NC_012943	TGCT	2	8	14284	14291	0 %	50 %	25 %	25 %	253796927
35	NC_012943	GCCC	2	8	14771	14778	0 %	0 %	25 %	75 %	253796927
36	NC_012943	GGGC	2	8	15552	15559	0 %	0 %	75 %	25 %	253796928
37	NC_012943	CTGA	2	8	16007	16014	25 %	25 %	25 %	25 %	253796929
38	NC_012943	GCTT	2	8	16209	16216	0 %	50 %	25 %	25 %	253796929
39	NC_012943	CAGT	2	8	16237	16244	25 %	25 %	25 %	25 %	253796929
40	NC_012943	CGGT	2	8	16608	16615	0 %	25 %	50 %	25 %	253796929
41	NC_012943	GCCG	2	8	16667	16674	0 %	0 %	50 %	50 %	253796929
42	NC_012943	CGGG	2	8	17902	17909	0 %	0 %	75 %	25 %	253796930
43	NC_012943	CTGG	2	8	18010	18017	0 %	25 %	50 %	25 %	253796930
44	NC_012943	GTGC	2	8	18510	18517	0 %	25 %	50 %	25 %	253796930
45	NC_012943	GCCG	2	8	18528	18535	0 %	0 %	50 %	50 %	253796930
46	NC_012943	CCGC	2	8	18893	18900	0 %	0 %	25 %	75 %	253796931
47	NC_012943	GCCG	2	8	20357	20364	0 %	0 %	50 %	50 %	253796932
48	NC_012943	CCAG	2	8	20845	20852	25 %	0 %	25 %	50 %	253796932
49	NC_012943	CACC	2	8	21028	21035	25 %	0 %	0 %	75 %	253796932
50	NC_012943	CGGG	2	8	21984	21991	0 %	0 %	75 %	25 %	253796933
51	NC_012943	GCCG	2	8	22075	22082	0 %	0 %	50 %	50 %	253796933
52	NC_012943	GCTG	2	8	22455	22462	0 %	25 %	50 %	25 %	253796933
53	NC_012943	CGGC	2	8	22475	22482	0 %	0 %	50 %	50 %	253796933
54	NC_012943	GCCG	2	8	23146	23153	0 %	0 %	50 %	50 %	253796933
55	NC_012943	CCCA	2	8	23158	23165	25 %	0 %	0 %	75 %	253796933
56	NC_012943	GCTG	2	8	24297	24304	0 %	25 %	50 %	25 %	253796935
57	NC_012943	CGGC	2	8	24345	24352	0 %	0 %	50 %	50 %	253796935
58	NC_012943	GCCG	2	8	24445	24452	0 %	0 %	50 %	50 %	253796935
59	NC_012943	CGGG	2	8	24520	24527	0 %	0 %	75 %	25 %	253796935
60	NC_012943	GCTC	2	8	26607	26614	0 %	25 %	25 %	50 %	253796936
61	NC_012943	CCAA	2	8	26824	26831	50 %	0 %	0 %	50 %	253796936
62	NC_012943	CAGC	2	8	26890	26897	25 %	0 %	25 %	50 %	253796936
63	NC_012943	CGGC	2	8	27710	27717	0 %	0 %	50 %	50 %	253796938
64	NC_012943	CCGG	2	8	28196	28203	0 %	0 %	50 %	50 %	253796938
65	NC_012943	GCTC	2	8	28752	28759	0 %	25 %	25 %	50 %	253796939
66	NC_012943	TGCG	2	8	28891	28898	0 %	25 %	50 %	25 %	253796939
67	NC_012943	CCGG	2	8	29156	29163	0 %	0 %	50 %	50 %	253796939
68	NC_012943	CGTC	2	8	29487	29494	0 %	25 %	25 %	50 %	253796940
69	NC_012943	CACG	2	8	29847	29854	25 %	0 %	25 %	50 %	253796941
70	NC_012943	ACCG	2	8	29928	29935	25 %	0 %	25 %	50 %	253796941
71	NC_012943	CCGG	2	8	30247	30254	0 %	0 %	50 %	50 %	253796941
72	NC_012943	GTCG	2	8	30423	30430	0 %	25 %	50 %	25 %	253796941
73	NC_012943	CCCG	2	8	31045	31052	0 %	0 %	25 %	75 %	253796941
74	NC_012943	CGAG	2	8	31557	31564	25 %	0 %	50 %	25 %	253796942
75	NC_012943	CGAC	2	8	31854	31861	25 %	0 %	25 %	50 %	253796943
76	NC_012943	GCCG	2	8	32581	32588	0 %	0 %	50 %	50 %	253796945
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79	NC_012943	ATCG	2	8	35198	35205	25 %	25 %	25 %	25 %	253796947
80	NC_012943	GATC	2	8	35536	35543	25 %	25 %	25 %	25 %	253796947
81	NC_012943	CCAC	2	8	36357	36364	25 %	0 %	0 %	75 %	253796947
82	NC_012943	ACCG	2	8	36752	36759	25 %	0 %	25 %	50 %	253796948
83	NC_012943	CTGG	2	8	37096	37103	0 %	25 %	50 %	25 %	253796949
84	NC_012943	GCAT	2	8	37491	37498	25 %	25 %	25 %	25 %	253796950
85	NC_012943	GCTG	2	8	38005	38012	0 %	25 %	50 %	25 %	253796950
86	NC_012943	AACG	2	8	38760	38767	50 %	0 %	25 %	25 %	253796950
87	NC_012943	CCGA	2	8	38821	38828	25 %	0 %	25 %	50 %	253796950
88	NC_012943	CCAC	2	8	38977	38984	25 %	0 %	0 %	75 %	253796950
89	NC_012943	CAGC	2	8	39204	39211	25 %	0 %	25 %	50 %	253796951
90	NC_012943	CCGG	2	8	39700	39707	0 %	0 %	50 %	50 %	253796951
91	NC_012943	GGCC	2	8	40231	40238	0 %	0 %	50 %	50 %	253796952
92	NC_012943	CGAT	2	8	40681	40688	25 %	25 %	25 %	25 %	253796952
93	NC_012943	GCCG	2	8	40981	40988	0 %	0 %	50 %	50 %	253796952
94	NC_012943	CACC	2	8	41006	41013	25 %	0 %	0 %	75 %	253796952
95	NC_012943	ACCG	2	8	41229	41236	25 %	0 %	25 %	50 %	253796952
96	NC_012943	GCGT	2	8	41255	41262	0 %	25 %	50 %	25 %	253796952
97	NC_012943	CCAC	2	8	41984	41991	25 %	0 %	0 %	75 %	253796953
98	NC_012943	CGAT	2	8	41993	42000	25 %	25 %	25 %	25 %	253796953
99	NC_012943	GGCC	2	8	42689	42696	0 %	0 %	50 %	50 %	253796955
100	NC_012943	CCCG	2	8	43280	43287	0 %	0 %	25 %	75 %	253796955
101	NC_012943	CGGG	2	8	43309	43316	0 %	0 %	75 %	25 %	253796955
102	NC_012943	CGAC	2	8	43948	43955	25 %	0 %	25 %	50 %	253796956
103	NC_012943	GAGC	2	8	44328	44335	25 %	0 %	50 %	25 %	253796956
104	NC_012943	GGGC	2	8	45487	45494	0 %	0 %	75 %	25 %	253796956
105	NC_012943	CGGC	2	8	45582	45589	0 %	0 %	50 %	50 %	253796956
106	NC_012943	GCCG	2	8	46545	46552	0 %	0 %	50 %	50 %	253796956
107	NC_012943	TTGC	2	8	46709	46716	0 %	50 %	25 %	25 %	253796957
108	NC_012943	CCGC	2	8	46857	46864	0 %	0 %	25 %	75 %	253796957
109	NC_012943	CCGC	2	8	46890	46897	0 %	0 %	25 %	75 %	253796957
110	NC_012943	GGTC	2	8	46998	47005	0 %	25 %	50 %	25 %	253796957
111	NC_012943	CGGG	2	8	47549	47556	0 %	0 %	75 %	25 %	253796958
112	NC_012943	GCAG	2	8	47622	47629	25 %	0 %	50 %	25 %	253796958
113	NC_012943	GTGC	2	8	48522	48529	0 %	25 %	50 %	25 %	253796959
114	NC_012943	GCCG	2	8	48806	48813	0 %	0 %	50 %	50 %	253796959
115	NC_012943	CAGC	2	8	49991	49998	25 %	0 %	25 %	50 %	253796960
116	NC_012943	CGGG	2	8	50180	50187	0 %	0 %	75 %	25 %	253796961
117	NC_012943	GCCG	2	8	50280	50287	0 %	0 %	50 %	50 %	253796961
118	NC_012943	GGTG	2	8	50603	50610	0 %	25 %	75 %	0 %	253796961
119	NC_012943	CTCA	2	8	51219	51226	25 %	25 %	0 %	50 %	253796961
120	NC_012943	CGCT	2	8	51358	51365	0 %	25 %	25 %	50 %	253796962
121	NC_012943	GGTA	2	8	52224	52231	25 %	25 %	50 %	0 %	253796963
122	NC_012943	GCCG	2	8	53673	53680	0 %	0 %	50 %	50 %	253796965
123	NC_012943	ACCA	2	8	53844	53851	50 %	0 %	0 %	50 %	253796965
124	NC_012943	GTGC	2	8	54729	54736	0 %	25 %	50 %	25 %	253796965
125	NC_012943	ACCG	2	8	55607	55614	25 %	0 %	25 %	50 %	253796965
126	NC_012943	CCCG	2	8	55769	55776	0 %	0 %	25 %	75 %	253796965
127	NC_012943	GGCC	2	8	56443	56450	0 %	0 %	50 %	50 %	253796966
128	NC_012943	CGCT	2	8	57170	57177	0 %	25 %	25 %	50 %	253796966
129	NC_012943	GCGG	2	8	58927	58934	0 %	0 %	75 %	25 %	253796969
130	NC_012943	GTTC	2	8	59146	59153	0 %	50 %	25 %	25 %	253796969
131	NC_012943	AGCG	2	8	59351	59358	25 %	0 %	50 %	25 %	253796970
132	NC_012943	CGGC	2	8	60093	60100	0 %	0 %	50 %	50 %	253796972
133	NC_012943	GCGG	2	8	60105	60112	0 %	0 %	75 %	25 %	253796972
134	NC_012943	CAGC	2	8	61623	61630	25 %	0 %	25 %	50 %	253796973
135	NC_012943	TGGC	3	12	62251	62262	0 %	25 %	50 %	25 %	253796973
136	NC_012943	AAGG	2	8	63994	64001	50 %	0 %	50 %	0 %	253796974
137	NC_012943	AACC	2	8	64771	64778	50 %	0 %	0 %	50 %	253796975
138	NC_012943	CGGA	2	8	65135	65142	25 %	0 %	50 %	25 %	253796976
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