MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 1435 chromosome

Total Repeats: 101901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012943	GCAGC	2	10	48701	48710	20 %	0 %	40 %	40 %	253796959
1002	NC_012943	GTC	2	6	48717	48722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796959
1003	NC_012943	GGC	2	6	48725	48730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796959
1004	NC_012943	TCG	2	6	48760	48765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796959
1005	NC_012943	CCCGA	2	10	48784	48793	20 %	0 %	20 %	60 %	253796959
1006	NC_012943	GCCG	2	8	48806	48813	0 %	0 %	50 %	50 %	253796959
1007	NC_012943	AGC	2	6	48850	48855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796959
1008	NC_012943	AAG	2	6	48982	48987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253796959
1009	NC_012943	CGG	2	6	49030	49035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796959
1010	NC_012943	G	6	6	49061	49066	0 %	0 %	100 %	0 %	253796959
1011	NC_012943	TGC	2	6	49069	49074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796959
1012	NC_012943	GT	3	6	49151	49156	0 %	50 %	50 %	0 %	253796960
1013	NC_012943	GC	3	6	49186	49191	0 %	0 %	50 %	50 %	253796960
1014	NC_012943	CGA	2	6	49226	49231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796960
1015	NC_012943	CGG	2	6	49271	49276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796960
1016	NC_012943	CGA	2	6	49299	49304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796960
1017	NC_012943	GCC	2	6	49305	49310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796960
1018	NC_012943	CGT	2	6	49346	49351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796960
1019	NC_012943	CGG	2	6	49423	49428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796960
1020	NC_012943	CGC	2	6	49442	49447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796960
1021	NC_012943	GCT	2	6	49556	49561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796960
1022	NC_012943	CGG	2	6	49562	49567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796960
1023	NC_012943	CGA	2	6	49607	49612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796960
1024	NC_012943	GCG	2	6	49751	49756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796960
1025	NC_012943	TCC	2	6	49768	49773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253796960
1026	NC_012943	CGA	2	6	49832	49837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796960
1027	NC_012943	CCG	3	9	49867	49875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796960
1028	NC_012943	GCC	2	6	49902	49907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796960
1029	NC_012943	CAGCG	2	10	49909	49918	20 %	0 %	40 %	40 %	253796960
1030	NC_012943	CAGC	2	8	49991	49998	25 %	0 %	25 %	50 %	253796960
1031	NC_012943	TCG	2	6	50026	50031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796960
1032	NC_012943	GAT	2	6	50130	50135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253796961
1033	NC_012943	GC	5	10	50150	50159	0 %	0 %	50 %	50 %	253796961
1034	NC_012943	GTC	2	6	50163	50168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796961
1035	NC_012943	GCT	2	6	50174	50179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796961
1036	NC_012943	CGGG	2	8	50180	50187	0 %	0 %	75 %	25 %	253796961
1037	NC_012943	TCA	2	6	50192	50197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253796961
1038	NC_012943	CCG	2	6	50224	50229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796961
1039	NC_012943	GCC	2	6	50254	50259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796961
1040	NC_012943	GAT	2	6	50271	50276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253796961
1041	NC_012943	GCCG	2	8	50280	50287	0 %	0 %	50 %	50 %	253796961
1042	NC_012943	TCG	2	6	50383	50388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796961
1043	NC_012943	TCT	2	6	50480	50485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253796961
1044	NC_012943	GCC	2	6	50532	50537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796961
1045	NC_012943	CGC	2	6	50570	50575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796961
1046	NC_012943	GGTG	2	8	50603	50610	0 %	25 %	75 %	0 %	253796961
1047	NC_012943	TCG	2	6	50612	50617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796961
1048	NC_012943	TCA	2	6	50638	50643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253796961
1049	NC_012943	CGA	2	6	50645	50650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796961
1050	NC_012943	CTT	2	6	50673	50678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253796961
1051	NC_012943	TCC	2	6	50773	50778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253796961
1052	NC_012943	CCT	2	6	50819	50824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253796961
1053	NC_012943	GAC	2	6	50835	50840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796961
1054	NC_012943	GTA	2	6	50880	50885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253796961
1055	NC_012943	GTT	2	6	50961	50966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253796961
1056	NC_012943	CTT	2	6	51006	51011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253796961
1057	NC_012943	CGC	2	6	51027	51032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796961
1058	NC_012943	GTC	2	6	51102	51107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796961
1059	NC_012943	GTA	3	9	51114	51122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253796961
1060	NC_012943	GCCGAC	2	12	51156	51167	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	253796961
1061	NC_012943	CTCA	2	8	51219	51226	25 %	25 %	0 %	50 %	253796961
1062	NC_012943	CGG	2	6	51299	51304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796962
1063	NC_012943	TGC	2	6	51312	51317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796962
1064	NC_012943	CGCT	2	8	51358	51365	0 %	25 %	25 %	50 %	253796962
1065	NC_012943	CTG	2	6	51415	51420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796962
1066	NC_012943	GGC	2	6	51467	51472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796962
1067	NC_012943	GAA	2	6	51519	51524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253796962
1068	NC_012943	CGT	2	6	51545	51550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796962
1069	NC_012943	TG	3	6	51560	51565	0 %	50 %	50 %	0 %	253796962
1070	NC_012943	CCA	2	6	51578	51583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796962
1071	NC_012943	CGT	2	6	51628	51633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796962
1072	NC_012943	CGC	2	6	51637	51642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796962
1073	NC_012943	GGC	2	6	51660	51665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796962
1074	NC_012943	CAG	2	6	51747	51752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796962
1075	NC_012943	CCG	2	6	51989	51994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796963
1076	NC_012943	ACAACG	3	18	52011	52028	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	253796963
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1078	NC_012943	CGA	2	6	52059	52064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796963
1079	NC_012943	ATG	2	6	52124	52129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253796963
1080	NC_012943	GCC	2	6	52216	52221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796963
1081	NC_012943	GGTA	2	8	52224	52231	25 %	25 %	50 %	0 %	253796963
1082	NC_012943	CGG	2	6	52244	52249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796963
1083	NC_012943	CCG	2	6	52254	52259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796963
1084	NC_012943	CAG	2	6	52345	52350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796963
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1086	NC_012943	CAC	2	6	52396	52401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796963
1087	NC_012943	CAG	2	6	52495	52500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796963
1088	NC_012943	CCA	2	6	52605	52610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796963
1089	NC_012943	TCC	2	6	52670	52675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253796963
1090	NC_012943	CGT	2	6	52701	52706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796963
1091	NC_012943	CG	3	6	52767	52772	0 %	0 %	50 %	50 %	253796963
1092	NC_012943	CTG	2	6	52961	52966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796964
1093	NC_012943	GT	3	6	52992	52997	0 %	50 %	50 %	0 %	253796964
1094	NC_012943	CTG	2	6	53024	53029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796964
1095	NC_012943	CGC	2	6	53032	53037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796964
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1098	NC_012943	CCG	2	6	53154	53159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796964
1099	NC_012943	CTG	2	6	53171	53176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796964
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1101	NC_012943	ATC	2	6	53238	53243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253796964
1102	NC_012943	C	6	6	53284	53289	0 %	0 %	0 %	100 %	253796964
1103	NC_012943	GC	3	6	53315	53320	0 %	0 %	50 %	50 %	253796964
1104	NC_012943	GTC	2	6	53366	53371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796965
1105	NC_012943	GCG	2	6	53374	53379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796965
1106	NC_012943	CG	3	6	53383	53388	0 %	0 %	50 %	50 %	253796965
1107	NC_012943	CGA	2	6	53426	53431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796965
1108	NC_012943	TCC	2	6	53446	53451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253796965
1109	NC_012943	GC	3	6	53521	53526	0 %	0 %	50 %	50 %	253796965
1110	NC_012943	CGC	2	6	53539	53544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796965
1111	NC_012943	GAG	2	6	53556	53561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253796965
1112	NC_012943	GCC	2	6	53577	53582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796965
1113	NC_012943	CCG	2	6	53595	53600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796965
1114	NC_012943	G	6	6	53602	53607	0 %	0 %	100 %	0 %	253796965
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1116	NC_012943	GCC	2	6	53639	53644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796965
1117	NC_012943	C	6	6	53649	53654	0 %	0 %	0 %	100 %	253796965
1118	NC_012943	GCCG	2	8	53673	53680	0 %	0 %	50 %	50 %	253796965
1119	NC_012943	CGG	2	6	53761	53766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796965
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1121	NC_012943	ACCA	2	8	53844	53851	50 %	0 %	0 %	50 %	253796965
1122	NC_012943	CG	3	6	54023	54028	0 %	0 %	50 %	50 %	253796965
1123	NC_012943	AAC	2	6	54039	54044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253796965
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1125	NC_012943	CGA	2	6	54073	54078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796965
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1243	NC_012943	G	6	6	58906	58911	0 %	0 %	100 %	0 %	253796969
1244	NC_012943	GCGG	2	8	58927	58934	0 %	0 %	75 %	25 %	253796969
1245	NC_012943	AGC	2	6	58939	58944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796969
1246	NC_012943	TCGAGG	2	12	58984	58995	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	253796969
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1497	NC_012943	ACC	2	6	70475	70480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796980
1498	NC_012943	GAC	2	6	70481	70486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796980
1499	NC_012943	GGT	3	9	70498	70506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796980
1500	NC_012943	TCG	2	6	70527	70532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796980

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