MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methylobacterium extorquens AM1 plasmid p2META1

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012809	TCGCG	2	10	4465	4474	0 %	20 %	40 %	40 %	240141744
2	NC_012809	GCGCG	2	10	4574	4583	0 %	0 %	60 %	40 %	240141744
3	NC_012809	CTGGC	2	10	5054	5063	0 %	20 %	40 %	40 %	240141745
4	NC_012809	CTTCC	2	10	5162	5171	0 %	40 %	0 %	60 %	240141745
5	NC_012809	CCCTG	2	10	5247	5256	0 %	20 %	20 %	60 %	240141745
6	NC_012809	GGCCG	2	10	5427	5436	0 %	0 %	60 %	40 %	240141746
7	NC_012809	GCAAA	2	10	8843	8852	60 %	0 %	20 %	20 %	240141750
8	NC_012809	GGCGC	2	10	20808	20817	0 %	0 %	60 %	40 %	240141757
9	NC_012809	TCCCA	2	10	24384	24393	20 %	20 %	0 %	60 %	240141763
10	NC_012809	GGGTT	2	10	25065	25074	0 %	40 %	60 %	0 %	240141764
11	NC_012809	CCGTT	2	10	26323	26332	0 %	40 %	20 %	40 %	240141764
12	NC_012809	CCGGC	2	10	28205	28214	0 %	0 %	40 %	60 %	240141766
13	NC_012809	GATCC	2	10	28371	28380	20 %	20 %	20 %	40 %	240141766
14	NC_012809	CCAGC	2	10	29070	29079	20 %	0 %	20 %	60 %	240141767
15	NC_012809	CGCTC	2	10	30401	30410	0 %	20 %	20 %	60 %	240141771
16	NC_012809	CGGCC	2	10	30692	30701	0 %	0 %	40 %	60 %	240141771
17	NC_012809	GGCCG	2	10	32640	32649	0 %	0 %	60 %	40 %	240141771
18	NC_012809	GCCGG	2	10	33814	33823	0 %	0 %	60 %	40 %	240141772
19	NC_012809	GCTGC	2	10	34608	34617	0 %	20 %	40 %	40 %	240141774
20	NC_012809	GCTTG	2	10	34735	34744	0 %	40 %	40 %	20 %	240141775

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.