MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methylobacterium extorquens AM1 plasmid p2META1

Total Repeats: 293

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012809	GCA	2	6	2279	2284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141742
2	NC_012809	CAG	2	6	2317	2322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141742
3	NC_012809	CTA	2	6	2455	2460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240141743
4	NC_012809	CGG	2	6	2461	2466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141743
5	NC_012809	GGA	2	6	2470	2475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240141743
6	NC_012809	GCT	2	6	2491	2496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141743
7	NC_012809	CGG	2	6	3730	3735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141744
8	NC_012809	GCG	2	6	3788	3793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141744
9	NC_012809	GCC	2	6	3842	3847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141744
10	NC_012809	GGC	2	6	3848	3853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141744
11	NC_012809	CTC	2	6	3959	3964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240141744
12	NC_012809	ATC	2	6	4080	4085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240141744
13	NC_012809	GCA	2	6	4087	4092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141744
14	NC_012809	GCT	2	6	4118	4123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141744
15	NC_012809	GCG	2	6	4162	4167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141744
16	NC_012809	CTG	2	6	4268	4273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141744
17	NC_012809	TTG	2	6	4308	4313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240141744
18	NC_012809	GTA	2	6	4370	4375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240141744
19	NC_012809	CGA	2	6	4507	4512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141744
20	NC_012809	CCG	2	6	4618	4623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141744
21	NC_012809	GCG	2	6	4628	4633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141744
22	NC_012809	GCT	2	6	4675	4680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141744
23	NC_012809	TTC	2	6	4682	4687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240141744
24	NC_012809	GTC	2	6	4707	4712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141744
25	NC_012809	CGG	2	6	5005	5010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141745
26	NC_012809	TGC	2	6	5072	5077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141745
27	NC_012809	CGG	2	6	5085	5090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141745
28	NC_012809	GCC	2	6	5116	5121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141745
29	NC_012809	GCA	2	6	5191	5196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141745
30	NC_012809	CGG	3	9	5209	5217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141745
31	NC_012809	GCA	2	6	5323	5328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141746
32	NC_012809	TGC	2	6	5413	5418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141746
33	NC_012809	CGG	2	6	5497	5502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141746
34	NC_012809	GAT	2	6	5534	5539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240141746
35	NC_012809	CTT	2	6	5558	5563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240141746
36	NC_012809	GGC	2	6	5576	5581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141746
37	NC_012809	GAT	2	6	5678	5683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240141746
38	NC_012809	GCT	2	6	5735	5740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141746
39	NC_012809	GCC	2	6	5750	5755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141746
40	NC_012809	GGC	2	6	5786	5791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141746
41	NC_012809	CGG	2	6	6140	6145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141747
42	NC_012809	GTC	2	6	6219	6224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141747
43	NC_012809	CGT	2	6	6257	6262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141747
44	NC_012809	ACC	2	6	6309	6314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240141747
45	NC_012809	ACC	2	6	6370	6375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240141747
46	NC_012809	CTG	2	6	6525	6530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141747
47	NC_012809	CGC	2	6	6544	6549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141747
48	NC_012809	CCG	2	6	6624	6629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141747
49	NC_012809	AGT	2	6	6824	6829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240141747
50	NC_012809	GCT	2	6	6870	6875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141747
51	NC_012809	GAT	2	6	6921	6926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240141747
52	NC_012809	GCT	2	6	7079	7084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141747
53	NC_012809	CAG	2	6	7110	7115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141747
54	NC_012809	CGG	2	6	7370	7375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141748
55	NC_012809	GGC	2	6	7415	7420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141748
56	NC_012809	ATC	2	6	7563	7568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240141748
57	NC_012809	GCA	2	6	7595	7600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141748
58	NC_012809	GAC	2	6	7602	7607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141748
59	NC_012809	ACG	2	6	7643	7648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141748
60	NC_012809	AGG	3	9	7654	7662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240141748
61	NC_012809	CTG	2	6	7739	7744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141749
62	NC_012809	CGA	2	6	7818	7823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141749
63	NC_012809	GGC	2	6	7969	7974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141749
64	NC_012809	CAA	2	6	8278	8283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240141750
65	NC_012809	AAC	2	6	8289	8294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240141750
66	NC_012809	CTT	2	6	8305	8310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240141750
67	NC_012809	TCA	2	6	8327	8332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240141750
68	NC_012809	GAA	2	6	8338	8343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240141750
69	NC_012809	ATT	2	6	8383	8388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240141750
70	NC_012809	GTT	3	9	8620	8628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240141750
71	NC_012809	CAT	2	6	8721	8726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240141750
72	NC_012809	GAG	2	6	8782	8787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240141750
73	NC_012809	CGA	2	6	8922	8927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141750
74	NC_012809	CGA	2	6	8967	8972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141750
75	NC_012809	GCC	2	6	9054	9059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141750
76	NC_012809	CAA	2	6	9087	9092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240141750
77	NC_012809	CGG	2	6	9095	9100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141750
78	NC_012809	AAC	2	6	9266	9271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240141750
79	NC_012809	GCC	2	6	9283	9288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141750
80	NC_012809	GTG	2	6	9368	9373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240141750
81	NC_012809	AAG	2	6	9562	9567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240141750
82	NC_012809	AAC	2	6	9583	9588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240141750
83	NC_012809	ACA	2	6	9624	9629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240141750
84	NC_012809	TTC	2	6	9854	9859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240141751
85	NC_012809	GTT	2	6	9865	9870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240141751
86	NC_012809	GGT	2	6	9913	9918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240141751
87	NC_012809	GCG	2	6	10001	10006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141751
88	NC_012809	CCA	2	6	10009	10014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240141751
89	NC_012809	GCA	2	6	10069	10074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141751
90	NC_012809	AGA	2	6	10131	10136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240141751
91	NC_012809	CGG	2	6	10276	10281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141751
92	NC_012809	GCC	2	6	10330	10335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141751
93	NC_012809	CAT	2	6	10436	10441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240141752
94	NC_012809	GCA	2	6	10507	10512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141752
95	NC_012809	ACC	2	6	10569	10574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240141752
96	NC_012809	GGC	2	6	10604	10609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141752
97	NC_012809	CGG	2	6	10675	10680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141752
98	NC_012809	GCA	2	6	11682	11687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141753
99	NC_012809	CTC	2	6	11715	11720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240141753
100	NC_012809	CTC	2	6	11806	11811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240141753
101	NC_012809	GCT	2	6	11813	11818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141753
102	NC_012809	GAA	2	6	11851	11856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240141753
103	NC_012809	AGG	2	6	11861	11866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240141753
104	NC_012809	ACG	2	6	14976	14981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141754
105	NC_012809	ACG	2	6	15063	15068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141754
106	NC_012809	GGA	2	6	15091	15096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240141754
107	NC_012809	CGG	2	6	15201	15206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141754
108	NC_012809	GCC	2	6	15329	15334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141754
109	NC_012809	TGG	2	6	15413	15418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240141754
110	NC_012809	GAT	2	6	19727	19732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240141755
111	NC_012809	GTC	2	6	19857	19862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141755
112	NC_012809	CTG	2	6	20226	20231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141756
113	NC_012809	GCC	2	6	20381	20386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141756
114	NC_012809	GGC	2	6	20395	20400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141756
115	NC_012809	TCC	2	6	20489	20494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240141757
116	NC_012809	CAT	2	6	20578	20583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240141757
117	NC_012809	CCG	2	6	20606	20611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141757
118	NC_012809	GAT	2	6	20704	20709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240141757
119	NC_012809	CAC	2	6	20755	20760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240141757
120	NC_012809	CGA	2	6	20928	20933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141757
121	NC_012809	TTC	2	6	21294	21299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240141758
122	NC_012809	GCT	2	6	21323	21328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141758
123	NC_012809	TCT	2	6	21355	21360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240141758
124	NC_012809	CCG	2	6	21384	21389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141758
125	NC_012809	GCT	2	6	21424	21429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141758
126	NC_012809	CTA	2	6	21502	21507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240141759
127	NC_012809	AAT	2	6	21641	21646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240141759
128	NC_012809	ATG	2	6	21687	21692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240141759
129	NC_012809	ATG	2	6	21699	21704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240141759
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253	NC_012809	CCA	2	6	31883	31888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240141771
254	NC_012809	CCA	2	6	31949	31954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240141771
255	NC_012809	TCG	2	6	31963	31968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141771
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257	NC_012809	CGC	2	6	32223	32228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141771
258	NC_012809	GGC	2	6	32262	32267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141771
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293	NC_012809	ACG	2	6	34881	34886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141775

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.