MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Methylobacterium extorquens AM1 plasmid p1META1

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012807	GC	3	6	4225	4230	0 %	0 %	50 %	50 %	240111942
2	NC_012807	GC	3	6	4480	4485	0 %	0 %	50 %	50 %	240111942
3	NC_012807	GC	3	6	4981	4986	0 %	0 %	50 %	50 %	240111942
4	NC_012807	CA	3	6	5834	5839	50 %	0 %	0 %	50 %	240111943
5	NC_012807	GC	3	6	5918	5923	0 %	0 %	50 %	50 %	240111943
6	NC_012807	CG	3	6	6940	6945	0 %	0 %	50 %	50 %	240111944
7	NC_012807	GC	4	8	7706	7713	0 %	0 %	50 %	50 %	240111944
8	NC_012807	GC	4	8	8166	8173	0 %	0 %	50 %	50 %	240111944
9	NC_012807	GC	3	6	8981	8986	0 %	0 %	50 %	50 %	240111945
10	NC_012807	GC	3	6	9811	9816	0 %	0 %	50 %	50 %	240111945
11	NC_012807	CG	3	6	11252	11257	0 %	0 %	50 %	50 %	240111948
12	NC_012807	CG	3	6	11703	11708	0 %	0 %	50 %	50 %	240111949
13	NC_012807	GC	3	6	11809	11814	0 %	0 %	50 %	50 %	240111949
14	NC_012807	CG	3	6	11852	11857	0 %	0 %	50 %	50 %	240111949
15	NC_012807	CG	3	6	11901	11906	0 %	0 %	50 %	50 %	240111949
16	NC_012807	AG	3	6	11966	11971	50 %	0 %	50 %	0 %	240111949
17	NC_012807	TC	3	6	12537	12542	0 %	50 %	0 %	50 %	240111950
18	NC_012807	GC	4	8	12573	12580	0 %	0 %	50 %	50 %	240111950
19	NC_012807	CG	3	6	12646	12651	0 %	0 %	50 %	50 %	240111950
20	NC_012807	GC	3	6	13472	13477	0 %	0 %	50 %	50 %	240111952
21	NC_012807	TC	3	6	13625	13630	0 %	50 %	0 %	50 %	240111952
22	NC_012807	CG	4	8	13914	13921	0 %	0 %	50 %	50 %	240111953
23	NC_012807	CA	3	6	14927	14932	50 %	0 %	0 %	50 %	240111955
24	NC_012807	TC	3	6	15015	15020	0 %	50 %	0 %	50 %	240111955
25	NC_012807	GC	3	6	15315	15320	0 %	0 %	50 %	50 %	240111955
26	NC_012807	GC	3	6	16377	16382	0 %	0 %	50 %	50 %	240111957
27	NC_012807	GC	3	6	16585	16590	0 %	0 %	50 %	50 %	240111957
28	NC_012807	GC	3	6	17692	17697	0 %	0 %	50 %	50 %	240111957
29	NC_012807	GC	3	6	18271	18276	0 %	0 %	50 %	50 %	240111957
30	NC_012807	GC	3	6	18606	18611	0 %	0 %	50 %	50 %	240111957
31	NC_012807	CG	3	6	18652	18657	0 %	0 %	50 %	50 %	240111957
32	NC_012807	GC	3	6	18934	18939	0 %	0 %	50 %	50 %	240111957
33	NC_012807	GC	4	8	19177	19184	0 %	0 %	50 %	50 %	240111957
34	NC_012807	GA	3	6	20181	20186	50 %	0 %	50 %	0 %	240111958
35	NC_012807	CG	3	6	20187	20192	0 %	0 %	50 %	50 %	240111958
36	NC_012807	CG	3	6	20531	20536	0 %	0 %	50 %	50 %	240111958
37	NC_012807	GC	3	6	20641	20646	0 %	0 %	50 %	50 %	240111958
38	NC_012807	AC	3	6	21204	21209	50 %	0 %	0 %	50 %	240111960
39	NC_012807	GT	3	6	23349	23354	0 %	50 %	50 %	0 %	240111962
40	NC_012807	CG	3	6	23564	23569	0 %	0 %	50 %	50 %	240111962
41	NC_012807	AT	3	6	23653	23658	50 %	50 %	0 %	0 %	240111963
42	NC_012807	GC	3	6	23702	23707	0 %	0 %	50 %	50 %	240111963
43	NC_012807	GC	3	6	23871	23876	0 %	0 %	50 %	50 %	240111963
44	NC_012807	GC	3	6	23999	24004	0 %	0 %	50 %	50 %	240111963
45	NC_012807	CG	3	6	24262	24267	0 %	0 %	50 %	50 %	240111963
46	NC_012807	CG	3	6	25302	25307	0 %	0 %	50 %	50 %	240111964
47	NC_012807	CA	3	6	26165	26170	50 %	0 %	0 %	50 %	240111965
48	NC_012807	GC	4	8	26198	26205	0 %	0 %	50 %	50 %	240111965
49	NC_012807	GA	3	6	26512	26517	50 %	0 %	50 %	0 %	240111966
50	NC_012807	GC	3	6	26680	26685	0 %	0 %	50 %	50 %	240111966
51	NC_012807	GC	3	6	26942	26947	0 %	0 %	50 %	50 %	240111967
52	NC_012807	TA	3	6	27608	27613	50 %	50 %	0 %	0 %	240111969
53	NC_012807	GC	3	6	27674	27679	0 %	0 %	50 %	50 %	240111969
54	NC_012807	GC	3	6	37219	37224	0 %	0 %	50 %	50 %	240111970
55	NC_012807	GC	3	6	37254	37259	0 %	0 %	50 %	50 %	240111970
56	NC_012807	CG	3	6	37269	37274	0 %	0 %	50 %	50 %	240111970
57	NC_012807	CG	3	6	37470	37475	0 %	0 %	50 %	50 %	240111970
58	NC_012807	GC	3	6	37630	37635	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
59	NC_012807	CG	3	6	37744	37749	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
60	NC_012807	GC	3	6	37805	37810	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
61	NC_012807	CG	3	6	37858	37863	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
62	NC_012807	GC	3	6	37887	37892	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
63	NC_012807	GC	5	10	38317	38326	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
64	NC_012807	CG	3	6	38386	38391	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
65	NC_012807	GC	4	8	38862	38869	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
66	NC_012807	GC	3	6	38936	38941	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
67	NC_012807	CG	3	6	38998	39003	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
68	NC_012807	GC	3	6	39019	39024	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
69	NC_012807	CG	3	6	39055	39060	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
70	NC_012807	CG	3	6	39170	39175	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
71	NC_012807	GC	3	6	39320	39325	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
72	NC_012807	CG	3	6	39373	39378	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
73	NC_012807	GC	3	6	39679	39684	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
74	NC_012807	CG	3	6	39824	39829	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
75	NC_012807	GC	3	6	39860	39865	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
76	NC_012807	CG	3	6	40574	40579	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
77	NC_012807	CG	3	6	40679	40684	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
78	NC_012807	GA	3	6	40797	40802	50 %	0 %	50 %	0 %	240111971
79	NC_012807	CG	3	6	41350	41355	0 %	0 %	50 %	50 %	240111972
80	NC_012807	AG	3	6	41368	41373	50 %	0 %	50 %	0 %	240111972
81	NC_012807	GC	3	6	41650	41655	0 %	0 %	50 %	50 %	240111973
82	NC_012807	CG	3	6	41840	41845	0 %	0 %	50 %	50 %	240111973
83	NC_012807	GC	3	6	42102	42107	0 %	0 %	50 %	50 %	240111973

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.