MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methylobacterium extorquens AM1 plasmid p1META1

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012807	TCCCC	2	10	4506	4515	0 %	20 %	0 %	80 %	240111942
2	NC_012807	CAGGG	2	10	7531	7540	20 %	0 %	60 %	20 %	240111944
3	NC_012807	GCCGG	2	10	9383	9392	0 %	0 %	60 %	40 %	240111945
4	NC_012807	TCACA	2	10	11101	11110	40 %	20 %	0 %	40 %	240111948
5	NC_012807	CAGAC	2	10	13512	13521	40 %	0 %	20 %	40 %	240111952
6	NC_012807	CGGCG	2	10	14452	14461	0 %	0 %	60 %	40 %	240111954
7	NC_012807	CAGCG	2	10	16511	16520	20 %	0 %	40 %	40 %	240111957
8	NC_012807	GCGCC	2	10	17594	17603	0 %	0 %	40 %	60 %	240111957
9	NC_012807	GTCGC	2	10	17653	17662	0 %	20 %	40 %	40 %	240111957
10	NC_012807	TCGGG	2	10	18724	18733	0 %	20 %	60 %	20 %	240111957
11	NC_012807	GCCGA	2	10	19004	19013	20 %	0 %	40 %	40 %	240111957
12	NC_012807	GCGCC	2	10	20048	20057	0 %	0 %	40 %	60 %	240111958
13	NC_012807	GCCGC	2	10	21750	21759	0 %	0 %	40 %	60 %	240111961
14	NC_012807	ATCGG	2	10	23159	23168	20 %	20 %	40 %	20 %	240111962
15	NC_012807	CGGCG	2	10	24216	24225	0 %	0 %	60 %	40 %	240111963
16	NC_012807	CGACC	2	10	26389	26398	20 %	0 %	20 %	60 %	240111966
17	NC_012807	GAGCG	2	10	26420	26429	20 %	0 %	60 %	20 %	240111966
18	NC_012807	TCCAC	2	10	26759	26768	20 %	20 %	0 %	60 %	240111967
19	NC_012807	GCTGA	2	10	27797	27806	20 %	20 %	40 %	20 %	240111969
20	NC_012807	AGCGC	2	10	37951	37960	20 %	0 %	40 %	40 %	240111971
21	NC_012807	GGCTG	2	10	37974	37983	0 %	20 %	60 %	20 %	240111971
22	NC_012807	TCCGC	2	10	38419	38428	0 %	20 %	20 %	60 %	240111971
23	NC_012807	GCGCC	2	10	40079	40088	0 %	0 %	40 %	60 %	240111971
24	NC_012807	TCGGC	2	10	40632	40641	0 %	20 %	40 %	40 %	240111971

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.