MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Methylobacterium extorquens AM1 plasmid p1META1

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012807	TTGT	2	8	3928	3935	0 %	75 %	25 %	0 %	240111941
2	NC_012807	TGCA	2	8	5828	5835	25 %	25 %	25 %	25 %	240111943
3	NC_012807	GGCG	2	8	6240	6247	0 %	0 %	75 %	25 %	240111943
4	NC_012807	TCCA	2	8	6290	6297	25 %	25 %	0 %	50 %	240111943
5	NC_012807	AGCC	2	8	6911	6918	25 %	0 %	25 %	50 %	240111944
6	NC_012807	GGCG	2	8	7050	7057	0 %	0 %	75 %	25 %	240111944
7	NC_012807	CCGG	2	8	7342	7349	0 %	0 %	50 %	50 %	240111944
8	NC_012807	CCGC	2	8	7389	7396	0 %	0 %	25 %	75 %	240111944
9	NC_012807	CCGG	2	8	7458	7465	0 %	0 %	50 %	50 %	240111944
10	NC_012807	TCCT	2	8	7616	7623	0 %	50 %	0 %	50 %	240111944
11	NC_012807	TCGC	2	8	8282	8289	0 %	25 %	25 %	50 %	240111944
12	NC_012807	GGGC	2	8	8307	8314	0 %	0 %	75 %	25 %	240111944
13	NC_012807	CGGC	2	8	8531	8538	0 %	0 %	50 %	50 %	240111944
14	NC_012807	CGTC	2	8	9405	9412	0 %	25 %	25 %	50 %	240111945
15	NC_012807	CGGG	2	8	9414	9421	0 %	0 %	75 %	25 %	240111945
16	NC_012807	CCAG	2	8	9660	9667	25 %	0 %	25 %	50 %	240111945
17	NC_012807	GCGG	2	8	10564	10571	0 %	0 %	75 %	25 %	240111946
18	NC_012807	GCAG	2	8	11186	11193	25 %	0 %	50 %	25 %	240111948
19	NC_012807	CGGC	2	8	11483	11490	0 %	0 %	50 %	50 %	240111949
20	NC_012807	ATCG	2	8	11532	11539	25 %	25 %	25 %	25 %	240111949
21	NC_012807	GCCG	2	8	11667	11674	0 %	0 %	50 %	50 %	240111949
22	NC_012807	GCCG	2	8	11895	11902	0 %	0 %	50 %	50 %	240111949
23	NC_012807	CGAA	2	8	12497	12504	50 %	0 %	25 %	25 %	240111950
24	NC_012807	GCGT	2	8	13228	13235	0 %	25 %	50 %	25 %	240111951
25	NC_012807	GGCG	2	8	13724	13731	0 %	0 %	75 %	25 %	240111953
26	NC_012807	GGCC	2	8	13875	13882	0 %	0 %	50 %	50 %	240111953
27	NC_012807	GGCT	2	8	14966	14973	0 %	25 %	50 %	25 %	240111955
28	NC_012807	TCGC	2	8	15023	15030	0 %	25 %	25 %	50 %	240111955
29	NC_012807	CGGG	2	8	15351	15358	0 %	0 %	75 %	25 %	240111955
30	NC_012807	GAGG	2	8	16114	16121	25 %	0 %	75 %	0 %	240111957
31	NC_012807	GCCG	2	8	16697	16704	0 %	0 %	50 %	50 %	240111957
32	NC_012807	GCTC	2	8	16913	16920	0 %	25 %	25 %	50 %	240111957
33	NC_012807	CCGG	2	8	17740	17747	0 %	0 %	50 %	50 %	240111957
34	NC_012807	TTCC	2	8	17902	17909	0 %	50 %	0 %	50 %	240111957
35	NC_012807	CCCG	2	8	18499	18506	0 %	0 %	25 %	75 %	240111957
36	NC_012807	CCGT	2	8	18897	18904	0 %	25 %	25 %	50 %	240111957
37	NC_012807	CGGA	2	8	19382	19389	25 %	0 %	50 %	25 %	240111957
38	NC_012807	GCGG	2	8	20321	20328	0 %	0 %	75 %	25 %	240111958
39	NC_012807	CGTC	2	8	20431	20438	0 %	25 %	25 %	50 %	240111958
40	NC_012807	CAAT	2	8	21098	21105	50 %	25 %	0 %	25 %	240111959
41	NC_012807	CGGG	2	8	21468	21475	0 %	0 %	75 %	25 %	240111960
42	NC_012807	CAGG	2	8	21480	21487	25 %	0 %	50 %	25 %	240111960
43	NC_012807	TGAG	2	8	21523	21530	25 %	25 %	50 %	0 %	240111960
44	NC_012807	AGGC	2	8	21659	21666	25 %	0 %	50 %	25 %	240111961
45	NC_012807	CGAC	2	8	21773	21780	25 %	0 %	25 %	50 %	240111961
46	NC_012807	ACCG	2	8	22107	22114	25 %	0 %	25 %	50 %	240111961
47	NC_012807	CCGG	2	8	22554	22561	0 %	0 %	50 %	50 %	240111961
48	NC_012807	GGCT	2	8	22624	22631	0 %	25 %	50 %	25 %	240111961
49	NC_012807	GGCC	2	8	22715	22722	0 %	0 %	50 %	50 %	240111961
50	NC_012807	GCCA	2	8	22842	22849	25 %	0 %	25 %	50 %	240111961
51	NC_012807	TGCC	2	8	22874	22881	0 %	25 %	25 %	50 %	240111962
52	NC_012807	TGGT	2	8	23343	23350	0 %	50 %	50 %	0 %	240111962
53	NC_012807	GGCC	2	8	23425	23432	0 %	0 %	50 %	50 %	240111962
54	NC_012807	CATG	2	8	23802	23809	25 %	25 %	25 %	25 %	240111963
55	NC_012807	CGGC	2	8	24332	24339	0 %	0 %	50 %	50 %	240111963
56	NC_012807	CAGG	2	8	25237	25244	25 %	0 %	50 %	25 %	240111964
57	NC_012807	GCAG	2	8	25383	25390	25 %	0 %	50 %	25 %	240111964
58	NC_012807	GCCA	2	8	26025	26032	25 %	0 %	25 %	50 %	240111965
59	NC_012807	GATG	2	8	26096	26103	25 %	25 %	50 %	0 %	240111965
60	NC_012807	TCGC	2	8	26804	26811	0 %	25 %	25 %	50 %	240111967
61	NC_012807	GCCC	2	8	26953	26960	0 %	0 %	25 %	75 %	240111967
62	NC_012807	CTGC	2	8	27036	27043	0 %	25 %	25 %	50 %	240111967
63	NC_012807	GCTC	2	8	27066	27073	0 %	25 %	25 %	50 %	240111967
64	NC_012807	CCGG	2	8	36966	36973	0 %	0 %	50 %	50 %	240111970
65	NC_012807	AGGC	2	8	37071	37078	25 %	0 %	50 %	25 %	240111970
66	NC_012807	CGTC	2	8	37504	37511	0 %	25 %	25 %	50 %	240111970
67	NC_012807	GCCC	2	8	37620	37627	0 %	0 %	25 %	75 %	240111971
68	NC_012807	GGAC	2	8	37675	37682	25 %	0 %	50 %	25 %	240111971
69	NC_012807	CGGC	2	8	38238	38245	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
70	NC_012807	CGGC	2	8	38535	38542	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
71	NC_012807	GTCC	2	8	38725	38732	0 %	25 %	25 %	50 %	240111971
72	NC_012807	GCTC	2	8	39149	39156	0 %	25 %	25 %	50 %	240111971
73	NC_012807	GCCC	2	8	39719	39726	0 %	0 %	25 %	75 %	240111971
74	NC_012807	TCGG	2	8	40164	40171	0 %	25 %	50 %	25 %	240111971
75	NC_012807	GCGA	2	8	40198	40205	25 %	0 %	50 %	25 %	240111971
76	NC_012807	CGAA	2	8	40489	40496	50 %	0 %	25 %	25 %	240111971
77	NC_012807	GAGG	2	8	41065	41072	25 %	0 %	75 %	0 %	240111972
78	NC_012807	CTCA	2	8	41602	41609	25 %	25 %	0 %	50 %	240111973

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.