MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methylobacterium extorquens AM1 plasmid p1META1

Total Repeats: 416

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012807	GAT	2	6	4091	4096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240111941
2	NC_012807	TGG	2	6	4235	4240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240111942
3	NC_012807	CGT	2	6	4251	4256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111942
4	NC_012807	CGC	2	6	4311	4316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111942
5	NC_012807	CGC	2	6	4376	4381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111942
6	NC_012807	CGA	2	6	4447	4452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240111942
7	NC_012807	GCT	2	6	4525	4530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111942
8	NC_012807	CCG	2	6	4642	4647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111942
9	NC_012807	CGG	2	6	4704	4709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111942
10	NC_012807	CCG	2	6	4763	4768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111942
11	NC_012807	CGC	2	6	4803	4808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111942
12	NC_012807	GAC	2	6	4816	4821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240111942
13	NC_012807	TCG	2	6	4880	4885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111942
14	NC_012807	GCT	2	6	4923	4928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111942
15	NC_012807	GCG	2	6	4930	4935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111942
16	NC_012807	TCT	2	6	4938	4943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240111942
17	NC_012807	GCA	2	6	4998	5003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240111942
18	NC_012807	GCC	2	6	5017	5022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111942
19	NC_012807	GTG	2	6	5039	5044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240111942
20	NC_012807	AGG	2	6	5045	5050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240111942
21	NC_012807	GCC	2	6	5123	5128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111942
22	NC_012807	TTC	2	6	5243	5248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240111942
23	NC_012807	GAA	2	6	5257	5262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240111942
24	NC_012807	CGA	2	6	5310	5315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240111942
25	NC_012807	CCT	2	6	5859	5864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240111943
26	NC_012807	CTG	2	6	5911	5916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111943
27	NC_012807	GTC	2	6	5995	6000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111943
28	NC_012807	GCG	2	6	6015	6020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111943
29	NC_012807	CCG	2	6	6036	6041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111943
30	NC_012807	CTG	2	6	6139	6144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111943
31	NC_012807	GCC	2	6	6146	6151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111943
32	NC_012807	GCG	2	6	6177	6182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111943
33	NC_012807	GAT	2	6	6187	6192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240111943
34	NC_012807	CGT	2	6	6271	6276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111943
35	NC_012807	TCT	2	6	6339	6344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240111943
36	NC_012807	GGT	2	6	6385	6390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240111943
37	NC_012807	GAT	2	6	6415	6420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240111943
38	NC_012807	TCG	2	6	6812	6817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111944
39	NC_012807	GAG	2	6	6973	6978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240111944
40	NC_012807	GCC	2	6	7025	7030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111944
41	NC_012807	CCA	2	6	7078	7083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240111944
42	NC_012807	GCT	2	6	7161	7166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111944
43	NC_012807	GAG	2	6	7201	7206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240111944
44	NC_012807	GAC	2	6	7435	7440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240111944
45	NC_012807	CGC	2	6	7486	7491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111944
46	NC_012807	GCG	2	6	7583	7588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111944
47	NC_012807	CGC	2	6	7628	7633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111944
48	NC_012807	CCG	2	6	7695	7700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111944
49	NC_012807	CGC	2	6	7762	7767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111944
50	NC_012807	CGC	2	6	7838	7843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111944
51	NC_012807	GCG	2	6	7982	7987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111944
52	NC_012807	TCT	2	6	8001	8006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240111944
53	NC_012807	TCG	3	9	8057	8065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111944
54	NC_012807	GCT	2	6	8188	8193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111944
55	NC_012807	CCT	2	6	8223	8228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240111944
56	NC_012807	GTC	2	6	8239	8244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111944
57	NC_012807	CGG	2	6	8319	8324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111944
58	NC_012807	GCT	2	6	8337	8342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111944
59	NC_012807	CGT	2	6	8356	8361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111944
60	NC_012807	GCG	2	6	8411	8416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111944
61	NC_012807	TCG	2	6	8429	8434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111944
62	NC_012807	CGC	2	6	8450	8455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111944
63	NC_012807	GCC	2	6	8486	8491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111944
64	NC_012807	GCG	2	6	8558	8563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111944
65	NC_012807	CGA	2	6	8580	8585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240111944
66	NC_012807	ACG	2	6	8615	8620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240111944
67	NC_012807	CGC	3	9	8670	8678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111944
68	NC_012807	GCG	2	6	8689	8694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111944
69	NC_012807	GCG	2	6	8750	8755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111944
70	NC_012807	GCC	2	6	8858	8863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111945
71	NC_012807	GCG	2	6	8867	8872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111945
72	NC_012807	GCG	2	6	8894	8899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111945
73	NC_012807	GGA	2	6	8967	8972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240111945
74	NC_012807	GCG	2	6	8999	9004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111945
75	NC_012807	GGC	2	6	9058	9063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111945
76	NC_012807	CGG	2	6	9099	9104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111945
77	NC_012807	TCG	2	6	9155	9160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111945
78	NC_012807	TAG	2	6	9242	9247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240111945
79	NC_012807	GGC	2	6	9265	9270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111945
80	NC_012807	GCA	2	6	9350	9355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240111945
81	NC_012807	CTC	2	6	9505	9510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240111945
82	NC_012807	GTC	2	6	9520	9525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111945
83	NC_012807	GAC	2	6	9556	9561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240111945
84	NC_012807	CGC	2	6	9576	9581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111945
85	NC_012807	CGC	2	6	9744	9749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111945
86	NC_012807	CAC	2	6	9761	9766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240111945
87	NC_012807	GTG	2	6	9803	9808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240111945
88	NC_012807	CGC	3	9	9841	9849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111945
89	NC_012807	GAG	2	6	10334	10339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240111946
90	NC_012807	CGG	2	6	10349	10354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111946
91	NC_012807	CAG	2	6	10442	10447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240111946
92	NC_012807	CGG	2	6	10486	10491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111946
93	NC_012807	GCG	2	6	10494	10499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111946
94	NC_012807	TGG	2	6	10500	10505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240111946
95	NC_012807	GGA	2	6	10513	10518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240111946
96	NC_012807	ACG	2	6	10521	10526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240111946
97	NC_012807	TGC	2	6	10578	10583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111946
98	NC_012807	AAG	3	9	10592	10600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240111946
99	NC_012807	GAG	2	6	10756	10761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240111947
100	NC_012807	TGG	2	6	10800	10805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240111947
101	NC_012807	TCG	2	6	10827	10832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111947
102	NC_012807	GGA	2	6	10834	10839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240111947
103	NC_012807	CCG	2	6	10843	10848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111947
104	NC_012807	TGA	2	6	10914	10919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240111947
105	NC_012807	TCG	2	6	10962	10967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111947
106	NC_012807	GCC	2	6	10968	10973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111947
107	NC_012807	GCC	2	6	11039	11044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111947
108	NC_012807	ACC	2	6	11287	11292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240111948
109	NC_012807	ATC	2	6	11390	11395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240111949
110	NC_012807	GGC	2	6	11580	11585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111949
111	NC_012807	GCT	2	6	11693	11698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111949
112	NC_012807	CAC	2	6	11790	11795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240111949
113	NC_012807	GAG	2	6	11823	11828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240111949
114	NC_012807	CTT	2	6	11868	11873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240111949
115	NC_012807	GCC	2	6	11911	11916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111949
116	NC_012807	GTG	2	6	11941	11946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240111949
117	NC_012807	CGC	2	6	12346	12351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111950
118	NC_012807	CGC	2	6	12369	12374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111950
119	NC_012807	GCT	2	6	12462	12467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111950
120	NC_012807	TGC	2	6	12482	12487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111950
121	NC_012807	CCG	2	6	12505	12510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111950
122	NC_012807	GCG	2	6	12523	12528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111950
123	NC_012807	GGC	2	6	12654	12659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111950
124	NC_012807	GCC	2	6	12948	12953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111951
125	NC_012807	GCC	2	6	13005	13010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111951
126	NC_012807	GCC	2	6	13035	13040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111951
127	NC_012807	GCC	2	6	13062	13067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111951
128	NC_012807	GCC	2	6	13080	13085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111951
129	NC_012807	CCA	2	6	13102	13107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240111951
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254	NC_012807	TGG	2	6	21713	21718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240111961
255	NC_012807	TGG	2	6	21767	21772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240111961
256	NC_012807	TCG	2	6	21815	21820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111961
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379	NC_012807	CGT	2	6	38872	38877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111971
380	NC_012807	CGC	2	6	38951	38956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111971
381	NC_012807	GCC	2	6	39108	39113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111971
382	NC_012807	CGA	2	6	39313	39318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240111971
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393	NC_012807	CGC	2	6	39731	39736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111971
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.