MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycoplasma conjunctivae HRC/581 chromosome

Total Repeats: 12074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012806	ATA	2	6	168	173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047136
2	NC_012806	TAA	2	6	181	186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047136
3	NC_012806	AAT	2	6	205	210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047136
4	NC_012806	ATC	2	6	233	238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240047136
5	NC_012806	GTT	2	6	389	394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240047136
6	NC_012806	ACA	2	6	453	458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240047136
7	NC_012806	ATT	2	6	461	466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047136
8	NC_012806	ATT	2	6	536	541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047136
9	NC_012806	TGA	2	6	772	777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047136
10	NC_012806	TAA	2	6	793	798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047136
11	NC_012806	ATA	2	6	827	832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047136
12	NC_012806	GAA	2	6	845	850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047136
13	NC_012806	CAA	2	6	960	965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240047136
14	NC_012806	AAG	2	6	966	971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047136
15	NC_012806	GAA	3	9	1001	1009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047136
16	NC_012806	ATT	2	6	1023	1028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047136
17	NC_012806	ATA	2	6	1106	1111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047136
18	NC_012806	TGA	2	6	1126	1131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047136
19	NC_012806	GAA	2	6	1190	1195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047136
20	NC_012806	TAA	2	6	1230	1235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047136
21	NC_012806	AAT	2	6	1333	1338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047136
22	NC_012806	CAA	2	6	1401	1406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240047136
23	NC_012806	TAT	2	6	1733	1738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047137
24	NC_012806	CAA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240047137
25	NC_012806	TTA	2	6	1803	1808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047137
26	NC_012806	CAT	2	6	1825	1830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240047137
27	NC_012806	ATT	2	6	1874	1879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047137
28	NC_012806	CTT	2	6	2073	2078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047137
29	NC_012806	TAA	2	6	2586	2591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047137
30	NC_012806	ATC	2	6	2681	2686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240047137
31	NC_012806	TTC	2	6	2821	2826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047138
32	NC_012806	TGA	2	6	2892	2897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047138
33	NC_012806	ATG	2	6	2912	2917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047138
34	NC_012806	ATA	2	6	2949	2954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047138
35	NC_012806	TAG	2	6	2970	2975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047139
36	NC_012806	TGG	3	9	2977	2985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240047139
37	NC_012806	TAA	2	6	3042	3047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047139
38	NC_012806	TGG	2	6	3094	3099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240047139
39	NC_012806	TGG	2	6	3139	3144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240047139
40	NC_012806	GAT	2	6	3172	3177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047139
41	NC_012806	TTC	2	6	3429	3434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047139
42	NC_012806	CTT	2	6	3441	3446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047139
43	NC_012806	ACC	2	6	3544	3549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240047139
44	NC_012806	AGA	2	6	3592	3597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047139
45	NC_012806	AAT	2	6	3697	3702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047139
46	NC_012806	CAA	2	6	3801	3806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240047139
47	NC_012806	ATG	2	6	3972	3977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047139
48	NC_012806	AGC	2	6	4075	4080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240047139
49	NC_012806	ATG	2	6	4155	4160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047139
50	NC_012806	GAT	2	6	4181	4186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047139
51	NC_012806	GAA	2	6	4319	4324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047139
52	NC_012806	TGC	2	6	4564	4569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240047139
53	NC_012806	ATT	2	6	4617	4622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047139
54	NC_012806	TCT	2	6	4640	4645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047139
55	NC_012806	CTG	2	6	4719	4724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240047139
56	NC_012806	ATT	2	6	4887	4892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047140
57	NC_012806	AAT	2	6	4953	4958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047140
58	NC_012806	CAA	2	6	5033	5038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240047140
59	NC_012806	ATT	2	6	5122	5127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047140
60	NC_012806	CCA	2	6	5312	5317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240047141
61	NC_012806	CGA	2	6	5450	5455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240047141
62	NC_012806	CAC	2	6	5586	5591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240047141
63	NC_012806	GAA	2	6	5607	5612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047141
64	NC_012806	TTG	2	6	5644	5649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240047141
65	NC_012806	TGA	2	6	5677	5682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047141
66	NC_012806	GCT	2	6	5793	5798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240047141
67	NC_012806	GAA	2	6	5862	5867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047141
68	NC_012806	AGA	2	6	5966	5971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047141
69	NC_012806	ATA	2	6	6010	6015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047141
70	NC_012806	GAT	2	6	6047	6052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047141
71	NC_012806	GGT	2	6	6111	6116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240047141
72	NC_012806	TTG	2	6	6172	6177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240047141
73	NC_012806	GAA	2	6	6207	6212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047141
74	NC_012806	TGT	2	6	6237	6242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240047142
75	NC_012806	AAT	2	6	6246	6251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047142
76	NC_012806	TCA	2	6	6279	6284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240047142
77	NC_012806	GAA	2	6	6436	6441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047142
78	NC_012806	AAT	2	6	6459	6464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047142
79	NC_012806	AAT	2	6	6531	6536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047142
80	NC_012806	ATG	2	6	6557	6562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047142
81	NC_012806	AAT	2	6	6643	6648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047142
82	NC_012806	ACA	2	6	6727	6732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240047142
83	NC_012806	AGC	2	6	6750	6755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240047142
84	NC_012806	TTA	2	6	6879	6884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047142
85	NC_012806	AAG	2	6	6995	7000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047142
86	NC_012806	CTC	2	6	7029	7034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240047142
87	NC_012806	GGT	3	9	7069	7077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240047142
88	NC_012806	TAA	2	6	7133	7138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047142
89	NC_012806	TCT	2	6	7295	7300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047143
90	NC_012806	CTT	2	6	7305	7310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047143
91	NC_012806	TTG	2	6	7370	7375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240047143
92	NC_012806	GTT	2	6	7385	7390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240047143
93	NC_012806	CAG	2	6	7449	7454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240047143
94	NC_012806	TAG	2	6	7502	7507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047143
95	NC_012806	CTT	2	6	7563	7568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047143
96	NC_012806	GAA	2	6	7883	7888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047143
97	NC_012806	AGA	2	6	7920	7925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047143
98	NC_012806	AGT	2	6	8100	8105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047143
99	NC_012806	ACA	2	6	8170	8175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240047143
100	NC_012806	TTG	2	6	8294	8299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240047143
101	NC_012806	TAA	2	6	8379	8384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047143
102	NC_012806	ATT	2	6	8404	8409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047143
103	NC_012806	TAA	2	6	8410	8415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047143
104	NC_012806	TTC	2	6	8425	8430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047143
105	NC_012806	CAT	2	6	8475	8480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240047143
106	NC_012806	GTT	2	6	8506	8511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240047143
107	NC_012806	GTG	2	6	8626	8631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240047143
108	NC_012806	TTG	2	6	9052	9057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240047143
109	NC_012806	CAT	2	6	9060	9065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240047143
110	NC_012806	TCA	2	6	9164	9169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240047143
111	NC_012806	CTT	2	6	9318	9323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047143
112	NC_012806	AAT	2	6	9335	9340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047143
113	NC_012806	TCT	2	6	9368	9373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047143
114	NC_012806	TAC	2	6	9378	9383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240047143
115	NC_012806	TGT	2	6	9398	9403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240047143
116	NC_012806	ATT	2	6	9416	9421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047143
117	NC_012806	ATT	2	6	9437	9442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047144
118	NC_012806	CAT	2	6	9466	9471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240047144
119	NC_012806	CTC	2	6	9586	9591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240047144
120	NC_012806	ATT	2	6	9614	9619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047144
121	NC_012806	TAA	2	6	9628	9633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047144
122	NC_012806	GAA	2	6	9798	9803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047144
123	NC_012806	ACA	2	6	9810	9815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240047144
124	NC_012806	TCT	2	6	9907	9912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047145
125	NC_012806	ATG	2	6	9929	9934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047145
126	NC_012806	TCT	2	6	10015	10020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047145
127	NC_012806	CTT	2	6	10109	10114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047145
128	NC_012806	TTG	2	6	10191	10196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240047145
129	NC_012806	AGT	3	9	10244	10252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047145
130	NC_012806	TAA	2	6	10283	10288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047145
131	NC_012806	ACC	2	6	10344	10349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240047145
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249	NC_012806	GCT	2	6	19208	19213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240047151
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252	NC_012806	ATA	2	6	19521	19526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047151
253	NC_012806	GAA	3	9	19637	19645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047151
254	NC_012806	CTA	2	6	19878	19883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240047151
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261	NC_012806	TAG	2	6	20184	20189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047151
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