MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172 chromosome

Total Repeats: 10184

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012207	CGAC	2	8	311	318	25 %	0 %	25 %	50 %	224988384
2	NC_012207	CGTT	2	8	527	534	0 %	50 %	25 %	25 %	224988384
3	NC_012207	CCCG	2	8	589	596	0 %	0 %	25 %	75 %	224988384
4	NC_012207	GGCA	2	8	660	667	25 %	0 %	50 %	25 %	224988384
5	NC_012207	CCCA	2	8	918	925	25 %	0 %	0 %	75 %	224988384
6	NC_012207	GTGG	2	8	2132	2139	0 %	25 %	75 %	0 %	224988385
7	NC_012207	GCCA	2	8	2150	2157	25 %	0 %	25 %	50 %	224988385
8	NC_012207	TCAG	2	8	2494	2501	25 %	25 %	25 %	25 %	224988385
9	NC_012207	CGTT	2	8	2720	2727	0 %	50 %	25 %	25 %	224988385
10	NC_012207	ACGG	2	8	3072	3079	25 %	0 %	50 %	25 %	224988385
11	NC_012207	GCCT	2	8	3134	3141	0 %	25 %	25 %	50 %	224988385
12	NC_012207	CGTC	2	8	3285	3292	0 %	25 %	25 %	50 %	224988386
13	NC_012207	GGTA	2	8	3465	3472	25 %	25 %	50 %	0 %	224988386
14	NC_012207	GGTT	2	8	3647	3654	0 %	50 %	50 %	0 %	224988386
15	NC_012207	CCGC	2	8	3875	3882	0 %	0 %	25 %	75 %	224988386
16	NC_012207	CCAC	2	8	5499	5506	25 %	0 %	0 %	75 %	224988388
17	NC_012207	ACCG	2	8	5518	5525	25 %	0 %	25 %	50 %	224988388
18	NC_012207	CAAG	2	8	5713	5720	50 %	0 %	25 %	25 %	224988388
19	NC_012207	CGCC	2	8	5809	5816	0 %	0 %	25 %	75 %	224988388
20	NC_012207	CGGC	2	8	6624	6631	0 %	0 %	50 %	50 %	224988388
21	NC_012207	GACA	2	8	7304	7311	50 %	0 %	25 %	25 %	224988389
22	NC_012207	CGGT	2	8	7524	7531	0 %	25 %	50 %	25 %	224988389
23	NC_012207	CGAG	2	8	8456	8463	25 %	0 %	50 %	25 %	224988389
24	NC_012207	CGTG	2	8	8735	8742	0 %	25 %	50 %	25 %	224988389
25	NC_012207	CCAC	2	8	8986	8993	25 %	0 %	0 %	75 %	224988389
26	NC_012207	CGAC	2	8	9355	9362	25 %	0 %	25 %	50 %	224988389
27	NC_012207	GGTT	2	8	9583	9590	0 %	50 %	50 %	0 %	224988389
28	NC_012207	CCCG	2	8	10132	10139	0 %	0 %	25 %	75 %	224988390
29	NC_012207	GAGC	2	8	12092	12099	25 %	0 %	50 %	25 %	224988391
30	NC_012207	CTCA	2	8	12303	12310	25 %	25 %	0 %	50 %	224988391
31	NC_012207	AACC	2	8	13337	13344	50 %	0 %	0 %	50 %	224988393
32	NC_012207	CCCG	2	8	13446	13453	0 %	0 %	25 %	75 %	224988393
33	NC_012207	ACCC	2	8	14097	14104	25 %	0 %	0 %	75 %	224988395
34	NC_012207	TGAT	2	8	14134	14141	25 %	50 %	25 %	0 %	224988395
35	NC_012207	TGCT	2	8	14181	14188	0 %	50 %	25 %	25 %	224988395
36	NC_012207	GCCC	2	8	14668	14675	0 %	0 %	25 %	75 %	224988395
37	NC_012207	GGGC	2	8	15449	15456	0 %	0 %	75 %	25 %	224988396
38	NC_012207	CTGA	2	8	15904	15911	25 %	25 %	25 %	25 %	224988397
39	NC_012207	TGGC	2	8	16047	16054	0 %	25 %	50 %	25 %	224988397
40	NC_012207	GCTT	2	8	16106	16113	0 %	50 %	25 %	25 %	224988397
41	NC_012207	CAGT	2	8	16134	16141	25 %	25 %	25 %	25 %	224988397
42	NC_012207	CGGT	2	8	16505	16512	0 %	25 %	50 %	25 %	224988397
43	NC_012207	GCCG	2	8	16564	16571	0 %	0 %	50 %	50 %	224988397
44	NC_012207	CGGG	2	8	17799	17806	0 %	0 %	75 %	25 %	224988398
45	NC_012207	CTGG	2	8	17907	17914	0 %	25 %	50 %	25 %	224988398
46	NC_012207	GTGC	2	8	18407	18414	0 %	25 %	50 %	25 %	224988398
47	NC_012207	GCCG	2	8	18425	18432	0 %	0 %	50 %	50 %	224988398
48	NC_012207	CCGC	2	8	18790	18797	0 %	0 %	25 %	75 %	224988399
49	NC_012207	GCCG	2	8	20254	20261	0 %	0 %	50 %	50 %	224988400
50	NC_012207	CCAG	2	8	20742	20749	25 %	0 %	25 %	50 %	224988400
51	NC_012207	CACC	2	8	20925	20932	25 %	0 %	0 %	75 %	224988400
52	NC_012207	CGGG	2	8	21881	21888	0 %	0 %	75 %	25 %	224988401
53	NC_012207	GCCG	2	8	21972	21979	0 %	0 %	50 %	50 %	224988401
54	NC_012207	GCTG	2	8	22352	22359	0 %	25 %	50 %	25 %	224988401
55	NC_012207	CGGC	2	8	22372	22379	0 %	0 %	50 %	50 %	224988401
56	NC_012207	GCCG	2	8	23043	23050	0 %	0 %	50 %	50 %	224988401
57	NC_012207	CCCA	2	8	23055	23062	25 %	0 %	0 %	75 %	224988401
58	NC_012207	GCTG	2	8	24194	24201	0 %	25 %	50 %	25 %	224988403
59	NC_012207	CGGC	2	8	24242	24249	0 %	0 %	50 %	50 %	224988403
60	NC_012207	GCCG	2	8	24342	24349	0 %	0 %	50 %	50 %	224988403
61	NC_012207	CGGG	2	8	24417	24424	0 %	0 %	75 %	25 %	224988403
62	NC_012207	GCTC	2	8	26486	26493	0 %	25 %	25 %	50 %	224988404
63	NC_012207	CCAA	2	8	26703	26710	50 %	0 %	0 %	50 %	224988404
64	NC_012207	CAGC	2	8	26769	26776	25 %	0 %	25 %	50 %	224988404
65	NC_012207	CGGC	2	8	27589	27596	0 %	0 %	50 %	50 %	224988406
66	NC_012207	CCGG	2	8	28075	28082	0 %	0 %	50 %	50 %	224988406
67	NC_012207	GCTC	2	8	28631	28638	0 %	25 %	25 %	50 %	224988407
68	NC_012207	TGCG	2	8	28770	28777	0 %	25 %	50 %	25 %	224988407
69	NC_012207	CCGG	2	8	29034	29041	0 %	0 %	50 %	50 %	224988407
70	NC_012207	CGTC	2	8	29365	29372	0 %	25 %	25 %	50 %	224988408
71	NC_012207	CACG	2	8	29725	29732	25 %	0 %	25 %	50 %	224988409
72	NC_012207	ACCG	2	8	29806	29813	25 %	0 %	25 %	50 %	224988409
73	NC_012207	CCGG	2	8	30125	30132	0 %	0 %	50 %	50 %	224988409
74	NC_012207	GTCG	2	8	30301	30308	0 %	25 %	50 %	25 %	224988409
75	NC_012207	CCCG	2	8	30923	30930	0 %	0 %	25 %	75 %	224988409
76	NC_012207	ACCA	2	8	31108	31115	50 %	0 %	0 %	50 %	224988409
77	NC_012207	CGAG	2	8	31439	31446	25 %	0 %	50 %	25 %	224988410
78	NC_012207	CGAC	2	8	31736	31743	25 %	0 %	25 %	50 %	224988411
79	NC_012207	GCCG	2	8	32463	32470	0 %	0 %	50 %	50 %	224988412
80	NC_012207	CCGA	2	8	33452	33459	25 %	0 %	25 %	50 %	224988413
81	NC_012207	GGCC	2	8	34587	34594	0 %	0 %	50 %	50 %	224988415
82	NC_012207	ATCG	2	8	35080	35087	25 %	25 %	25 %	25 %	224988415
83	NC_012207	GATC	2	8	35418	35425	25 %	25 %	25 %	25 %	224988415
84	NC_012207	CCAC	2	8	36239	36246	25 %	0 %	0 %	75 %	224988415
85	NC_012207	ACCG	2	8	36633	36640	25 %	0 %	25 %	50 %	224988416
86	NC_012207	CTGG	2	8	36977	36984	0 %	25 %	50 %	25 %	224988417
87	NC_012207	GCAT	2	8	37372	37379	25 %	25 %	25 %	25 %	224988418
88	NC_012207	GCTG	2	8	37886	37893	0 %	25 %	50 %	25 %	224988418
89	NC_012207	AACG	2	8	38641	38648	50 %	0 %	25 %	25 %	224988418
90	NC_012207	CCGA	2	8	38702	38709	25 %	0 %	25 %	50 %	224988418
91	NC_012207	CCAC	2	8	38858	38865	25 %	0 %	0 %	75 %	224988418
92	NC_012207	CCGG	2	8	39580	39587	0 %	0 %	50 %	50 %	224988419
93	NC_012207	GGCC	2	8	40111	40118	0 %	0 %	50 %	50 %	224988420
94	NC_012207	CGAT	2	8	40561	40568	25 %	25 %	25 %	25 %	224988420
95	NC_012207	GCCG	2	8	40861	40868	0 %	0 %	50 %	50 %	224988420
96	NC_012207	CACC	2	8	40886	40893	25 %	0 %	0 %	75 %	224988420
97	NC_012207	ACCG	2	8	41109	41116	25 %	0 %	25 %	50 %	224988420
98	NC_012207	GCGT	2	8	41135	41142	0 %	25 %	50 %	25 %	224988420
99	NC_012207	CCAC	2	8	41864	41871	25 %	0 %	0 %	75 %	224988421
100	NC_012207	CGAT	2	8	41873	41880	25 %	25 %	25 %	25 %	224988421
101	NC_012207	GGCC	2	8	42569	42576	0 %	0 %	50 %	50 %	224988423
102	NC_012207	CCCG	2	8	43160	43167	0 %	0 %	25 %	75 %	224988423
103	NC_012207	CGGG	2	8	43189	43196	0 %	0 %	75 %	25 %	224988423
104	NC_012207	CGAC	2	8	43828	43835	25 %	0 %	25 %	50 %	224988424
105	NC_012207	GAGC	2	8	44208	44215	25 %	0 %	50 %	25 %	224988424
106	NC_012207	GGGC	2	8	45367	45374	0 %	0 %	75 %	25 %	224988424
107	NC_012207	CGGC	2	8	45462	45469	0 %	0 %	50 %	50 %	224988424
108	NC_012207	GCCG	2	8	46425	46432	0 %	0 %	50 %	50 %	224988424
109	NC_012207	TTGC	2	8	46589	46596	0 %	50 %	25 %	25 %	224988425
110	NC_012207	CCGC	2	8	46737	46744	0 %	0 %	25 %	75 %	224988425
111	NC_012207	CCGC	2	8	46770	46777	0 %	0 %	25 %	75 %	224988425
112	NC_012207	GGTC	2	8	46878	46885	0 %	25 %	50 %	25 %	224988425
113	NC_012207	CGGG	2	8	47429	47436	0 %	0 %	75 %	25 %	224988426
114	NC_012207	GCAG	2	8	47502	47509	25 %	0 %	50 %	25 %	224988426
115	NC_012207	GTGC	2	8	48402	48409	0 %	25 %	50 %	25 %	224988427
116	NC_012207	GCCG	2	8	48686	48693	0 %	0 %	50 %	50 %	224988427
117	NC_012207	CAGC	2	8	49871	49878	25 %	0 %	25 %	50 %	224988428
118	NC_012207	CGGG	2	8	50060	50067	0 %	0 %	75 %	25 %	224988429
119	NC_012207	GCCG	2	8	50160	50167	0 %	0 %	50 %	50 %	224988429
120	NC_012207	GGTG	2	8	50483	50490	0 %	25 %	75 %	0 %	224988429
121	NC_012207	CTCA	2	8	51099	51106	25 %	25 %	0 %	50 %	224988429
122	NC_012207	CGCT	2	8	51238	51245	0 %	25 %	25 %	50 %	224988430
123	NC_012207	GGTA	2	8	52104	52111	25 %	25 %	50 %	0 %	224988431
124	NC_012207	ACCA	2	8	53724	53731	50 %	0 %	0 %	50 %	224988433
125	NC_012207	GTGC	2	8	54609	54616	0 %	25 %	50 %	25 %	224988433
126	NC_012207	ACCG	2	8	55487	55494	25 %	0 %	25 %	50 %	224988433
127	NC_012207	CCCG	2	8	55658	55665	0 %	0 %	25 %	75 %	224988433
128	NC_012207	GGCC	2	8	56332	56339	0 %	0 %	50 %	50 %	224988434
129	NC_012207	CGCT	2	8	57059	57066	0 %	25 %	25 %	50 %	224988434
130	NC_012207	GCGG	2	8	58816	58823	0 %	0 %	75 %	25 %	224988437
131	NC_012207	GTTC	2	8	59035	59042	0 %	50 %	25 %	25 %	224988437
132	NC_012207	AGCG	2	8	59240	59247	25 %	0 %	50 %	25 %	224988438
133	NC_012207	CGGC	2	8	59982	59989	0 %	0 %	50 %	50 %	224988440
134	NC_012207	GCGG	2	8	59994	60001	0 %	0 %	75 %	25 %	224988440
135	NC_012207	CAGC	2	8	61512	61519	25 %	0 %	25 %	50 %	224988441
136	NC_012207	TGGC	3	12	62140	62151	0 %	25 %	50 %	25 %	224988441
137	NC_012207	AAGG	2	8	63883	63890	50 %	0 %	50 %	0 %	224988442
138	NC_012207	AACC	2	8	64660	64667	50 %	0 %	0 %	50 %	224988443
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