MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL6

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012001	TGAT	2	8	1133	1140	25 %	50 %	25 %	0 %	222143331
2	NC_012001	CAA	2	6	1155	1160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222143331
3	NC_012001	AGT	2	6	1170	1175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222143331
4	NC_012001	TCTTT	2	10	1206	1215	0 %	80 %	0 %	20 %	222143331
5	NC_012001	GAAT	2	8	1269	1276	50 %	25 %	25 %	0 %	222143331
6	NC_012001	A	7	7	1345	1351	100 %	0 %	0 %	0 %	222143331
7	NC_012001	A	6	6	1387	1392	100 %	0 %	0 %	0 %	222143331
8	NC_012001	TAT	2	6	1415	1420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222143331
9	NC_012001	ATTG	2	8	1435	1442	25 %	50 %	25 %	0 %	222143331
10	NC_012001	ATGA	2	8	1447	1454	50 %	25 %	25 %	0 %	222143331
11	NC_012001	TAG	2	6	1484	1489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222143331
12	NC_012001	AGA	2	6	1557	1562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222143331
13	NC_012001	GAA	2	6	1651	1656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222143331
14	NC_012001	AG	3	6	1660	1665	50 %	0 %	50 %	0 %	222143331
15	NC_012001	ATCA	2	8	1702	1709	50 %	25 %	0 %	25 %	222143331
16	NC_012001	ATAA	2	8	1765	1772	75 %	25 %	0 %	0 %	222143331
17	NC_012001	A	6	6	1786	1791	100 %	0 %	0 %	0 %	222143331
18	NC_012001	AGT	2	6	1800	1805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222143331
19	NC_012001	A	6	6	1832	1837	100 %	0 %	0 %	0 %	222143331
20	NC_012001	ACT	2	6	1853	1858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222143331
21	NC_012001	A	6	6	1864	1869	100 %	0 %	0 %	0 %	222143331
22	NC_012001	CAA	2	6	1912	1917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222143331
23	NC_012001	TGA	2	6	1929	1934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222143331
24	NC_012001	GAA	3	9	1942	1950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222143331
25	NC_012001	AT	3	6	2025	2030	50 %	50 %	0 %	0 %	222143331
26	NC_012001	AGA	2	6	2163	2168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222143332
27	NC_012001	CTG	2	6	2191	2196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222143332
28	NC_012001	GAAA	2	8	2211	2218	75 %	0 %	25 %	0 %	222143332
29	NC_012001	CTT	2	6	2236	2241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143332
30	NC_012001	TC	3	6	2290	2295	0 %	50 %	0 %	50 %	222143332
31	NC_012001	GAA	3	9	2328	2336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222143332
32	NC_012001	GAT	2	6	2359	2364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222143332
33	NC_012001	CGT	2	6	2368	2373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222143332
34	NC_012001	AAGA	2	8	2406	2413	75 %	0 %	25 %	0 %	222143332
35	NC_012001	ATT	2	6	2429	2434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222143332
36	NC_012001	A	8	8	3084	3091	100 %	0 %	0 %	0 %	222143333
37	NC_012001	A	6	6	3093	3098	100 %	0 %	0 %	0 %	222143333
38	NC_012001	ATT	2	6	3105	3110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222143333
39	NC_012001	AGA	2	6	3239	3244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222143333
40	NC_012001	GTT	2	6	3255	3260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222143333
41	NC_012001	CAA	2	6	3319	3324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222143333
42	NC_012001	GATAAA	2	12	3522	3533	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	222143334
43	NC_012001	ATA	2	6	3607	3612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143334
44	NC_012001	GATT	2	8	3646	3653	25 %	50 %	25 %	0 %	222143334
45	NC_012001	GAA	2	6	3672	3677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222143334
46	NC_012001	GAA	2	6	3687	3692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222143334
47	NC_012001	TGG	2	6	3740	3745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222143334
48	NC_012001	AC	3	6	3768	3773	50 %	0 %	0 %	50 %	222143334
49	NC_012001	TGA	2	6	3881	3886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222143334
50	NC_012001	A	8	8	3925	3932	100 %	0 %	0 %	0 %	222143334
51	NC_012001	CGAA	2	8	3950	3957	50 %	0 %	25 %	25 %	222143334
52	NC_012001	AAAG	2	8	4110	4117	75 %	0 %	25 %	0 %	222143334
53	NC_012001	ACTT	2	8	4140	4147	25 %	50 %	0 %	25 %	222143334
54	NC_012001	TGA	2	6	4163	4168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222143334
55	NC_012001	A	7	7	4176	4182	100 %	0 %	0 %	0 %	222143334

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.