MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL5

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012000	TTC	2	6	832	837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143326
2	NC_012000	AAT	2	6	933	938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143326
3	NC_012000	TAA	2	6	1041	1046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143326
4	NC_012000	ATA	2	6	1141	1146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143326
5	NC_012000	CAT	2	6	1197	1202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222143326
6	NC_012000	ATG	2	6	1217	1222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222143326
7	NC_012000	TTC	2	6	1243	1248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143326
8	NC_012000	TTA	2	6	1259	1264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222143326
9	NC_012000	TTA	2	6	1439	1444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222143326
10	NC_012000	CAA	2	6	1452	1457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222143326
11	NC_012000	ATA	2	6	1499	1504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143326
12	NC_012000	TCT	2	6	1586	1591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143326
13	NC_012000	TAA	2	6	2382	2387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143327
14	NC_012000	AAT	2	6	2407	2412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143327
15	NC_012000	TTC	2	6	2475	2480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143327
16	NC_012000	TCT	2	6	2521	2526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143327
17	NC_012000	TCC	2	6	2602	2607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222143327
18	NC_012000	GTC	2	6	2608	2613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222143327
19	NC_012000	TGT	2	6	2662	2667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222143327
20	NC_012000	TTA	2	6	2690	2695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222143327
21	NC_012000	TTC	2	6	2727	2732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143327
22	NC_012000	TCT	2	6	2744	2749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143327
23	NC_012000	TTC	3	9	2812	2820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143327
24	NC_012000	TCT	2	6	2912	2917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143328
25	NC_012000	TTC	2	6	2995	3000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143328
26	NC_012000	TTC	2	6	3025	3030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143328
27	NC_012000	TGA	2	6	3112	3117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222143328
28	NC_012000	TTC	2	6	3142	3147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143328
29	NC_012000	GTT	2	6	3183	3188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222143328
30	NC_012000	TTG	2	6	3206	3211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222143328
31	NC_012000	TAA	3	9	3234	3242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143328
32	NC_012000	TTC	2	6	3490	3495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143328
33	NC_012000	GTT	2	6	3542	3547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222143328
34	NC_012000	CAT	2	6	3575	3580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222143329
35	NC_012000	TCT	2	6	3610	3615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143329
36	NC_012000	TAC	2	6	3674	3679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222143329

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.