MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL4

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011998	T	7	7	637	643	0 %	100 %	0 %	0 %	222142649
2	NC_011998	TCT	2	6	680	685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142649
3	NC_011998	ATCAAA	2	12	691	702	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	222142649
4	NC_011998	TCT	2	6	767	772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142649
5	NC_011998	T	6	6	772	777	0 %	100 %	0 %	0 %	222142649
6	NC_011998	ATATTT	2	12	838	849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142649
7	NC_011998	CATT	2	8	872	879	25 %	50 %	0 %	25 %	222142649
8	NC_011998	CAA	2	6	889	894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222142649
9	NC_011998	CATA	2	8	895	902	50 %	25 %	0 %	25 %	222142649
10	NC_011998	TTG	2	6	930	935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222142649
11	NC_011998	TCA	2	6	986	991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142649
12	NC_011998	AAT	2	6	1026	1031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142649
13	NC_011998	T	6	6	1075	1080	0 %	100 %	0 %	0 %	222142649
14	NC_011998	CT	4	8	1106	1113	0 %	50 %	0 %	50 %	222142649
15	NC_011998	TTC	2	6	1166	1171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142649
16	NC_011998	TCA	2	6	1185	1190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142649
17	NC_011998	A	7	7	1192	1198	100 %	0 %	0 %	0 %	222142649
18	NC_011998	TCT	2	6	1208	1213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142649
19	NC_011998	TCAAAA	2	12	1214	1225	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	222142649
20	NC_011998	AGA	2	6	1264	1269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222142649
21	NC_011998	TCA	2	6	1295	1300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142649
22	NC_011998	ATT	2	6	1309	1314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142649
23	NC_011998	AATTC	2	10	1322	1331	40 %	40 %	0 %	20 %	222142649
24	NC_011998	TCT	2	6	1339	1344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142649
25	NC_011998	TA	3	6	1378	1383	50 %	50 %	0 %	0 %	222142649
26	NC_011998	TTCA	2	8	1390	1397	25 %	50 %	0 %	25 %	222142649
27	NC_011998	TAT	2	6	1416	1421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142649
28	NC_011998	T	6	6	1425	1430	0 %	100 %	0 %	0 %	222142649
29	NC_011998	G	6	6	1539	1544	0 %	0 %	100 %	0 %	222142649
30	NC_011998	T	7	7	1595	1601	0 %	100 %	0 %	0 %	222142649
31	NC_011998	ATTC	2	8	1605	1612	25 %	50 %	0 %	25 %	222142649
32	NC_011998	TGT	2	6	2102	2107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222142650
33	NC_011998	CTT	2	6	2147	2152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142650
34	NC_011998	ATT	2	6	2170	2175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142650
35	NC_011998	TC	3	6	2177	2182	0 %	50 %	0 %	50 %	222142650
36	NC_011998	GCTATT	2	12	2218	2229	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	222142650
37	NC_011998	TTC	2	6	2232	2237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142650
38	NC_011998	TAA	2	6	2262	2267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142650
39	NC_011998	T	6	6	2324	2329	0 %	100 %	0 %	0 %	222142650
40	NC_011998	TTC	2	6	2359	2364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142650
41	NC_011998	CT	3	6	2383	2388	0 %	50 %	0 %	50 %	222142650
42	NC_011998	CTT	2	6	2416	2421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142650
43	NC_011998	T	7	7	2464	2470	0 %	100 %	0 %	0 %	222142650
44	NC_011998	TTC	2	6	2476	2481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142650
45	NC_011998	CAA	2	6	2496	2501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222142650
46	NC_011998	CTT	2	6	2517	2522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142650
47	NC_011998	CTT	2	6	2526	2531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142650
48	NC_011998	TCT	2	6	2534	2539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142650
49	NC_011998	TTTC	2	8	2558	2565	0 %	75 %	0 %	25 %	222142650
50	NC_011998	TCT	2	6	2582	2587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142650
51	NC_011998	T	6	6	2622	2627	0 %	100 %	0 %	0 %	222142650
52	NC_011998	TTC	2	6	2707	2712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142650
53	NC_011998	TTTC	2	8	2727	2734	0 %	75 %	0 %	25 %	222142650
54	NC_011998	T	6	6	2782	2787	0 %	100 %	0 %	0 %	222142650
55	NC_011998	T	8	8	2827	2834	0 %	100 %	0 %	0 %	222142650
56	NC_011998	TCA	2	6	2867	2872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142650
57	NC_011998	TCTTT	2	10	2893	2902	0 %	80 %	0 %	20 %	222142650
58	NC_011998	T	7	7	2917	2923	0 %	100 %	0 %	0 %	222142650
59	NC_011998	TCA	2	6	2930	2935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142650
60	NC_011998	ATC	2	6	2977	2982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142650
61	NC_011998	TGA	2	6	3002	3007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142650
62	NC_011998	CTG	2	6	3057	3062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222142650
63	NC_011998	T	6	6	3116	3121	0 %	100 %	0 %	0 %	222142650
64	NC_011998	TAC	2	6	3180	3185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142650
65	NC_011998	AAC	2	6	3190	3195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222142650
66	NC_011998	T	8	8	3199	3206	0 %	100 %	0 %	0 %	222142650
67	NC_011998	AGC	2	6	3226	3231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222142650

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.