MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL2

Total Repeats: 142

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011996	AT	3	6	272	277	50 %	50 %	0 %	0 %	222142577
2	NC_011996	AT	3	6	350	355	50 %	50 %	0 %	0 %	222142577
3	NC_011996	AT	3	6	1241	1246	50 %	50 %	0 %	0 %	222142577
4	NC_011996	AG	3	6	1455	1460	50 %	0 %	50 %	0 %	222142577
5	NC_011996	AT	3	6	1778	1783	50 %	50 %	0 %	0 %	222142578
6	NC_011996	AT	3	6	2277	2282	50 %	50 %	0 %	0 %	222142578
7	NC_011996	TA	3	6	2779	2784	50 %	50 %	0 %	0 %	222142578
8	NC_011996	GA	3	6	3883	3888	50 %	0 %	50 %	0 %	222142578
9	NC_011996	AT	3	6	5260	5265	50 %	50 %	0 %	0 %	222142579
10	NC_011996	AT	3	6	5513	5518	50 %	50 %	0 %	0 %	222142579
11	NC_011996	AG	3	6	5578	5583	50 %	0 %	50 %	0 %	222142580
12	NC_011996	AT	3	6	5629	5634	50 %	50 %	0 %	0 %	222142580
13	NC_011996	AT	3	6	5706	5711	50 %	50 %	0 %	0 %	222142580
14	NC_011996	AC	3	6	6112	6117	50 %	0 %	0 %	50 %	222142580
15	NC_011996	AT	4	8	6119	6126	50 %	50 %	0 %	0 %	222142580
16	NC_011996	AT	3	6	6399	6404	50 %	50 %	0 %	0 %	222142581
17	NC_011996	GT	3	6	8593	8598	0 %	50 %	50 %	0 %	222142582
18	NC_011996	AT	3	6	8602	8607	50 %	50 %	0 %	0 %	222142582
19	NC_011996	AT	3	6	9054	9059	50 %	50 %	0 %	0 %	222142582
20	NC_011996	TA	3	6	9178	9183	50 %	50 %	0 %	0 %	222142582
21	NC_011996	AT	3	6	9859	9864	50 %	50 %	0 %	0 %	222142583
22	NC_011996	AT	3	6	9904	9909	50 %	50 %	0 %	0 %	222142583
23	NC_011996	AT	3	6	10012	10017	50 %	50 %	0 %	0 %	222142583
24	NC_011996	AG	3	6	10513	10518	50 %	0 %	50 %	0 %	222142584
25	NC_011996	TA	3	6	12175	12180	50 %	50 %	0 %	0 %	222142586
26	NC_011996	TA	3	6	12914	12919	50 %	50 %	0 %	0 %	222142586
27	NC_011996	AG	3	6	13273	13278	50 %	0 %	50 %	0 %	222142586
28	NC_011996	AG	3	6	13316	13321	50 %	0 %	50 %	0 %	222142586
29	NC_011996	AG	3	6	14287	14292	50 %	0 %	50 %	0 %	222142588
30	NC_011996	AT	3	6	14772	14777	50 %	50 %	0 %	0 %	222142588
31	NC_011996	TA	3	6	15236	15241	50 %	50 %	0 %	0 %	222142588
32	NC_011996	AT	4	8	15344	15351	50 %	50 %	0 %	0 %	222142588
33	NC_011996	AT	3	6	15383	15388	50 %	50 %	0 %	0 %	222142588
34	NC_011996	GA	3	6	15390	15395	50 %	0 %	50 %	0 %	222142588
35	NC_011996	CA	3	6	15399	15404	50 %	0 %	0 %	50 %	222142588
36	NC_011996	GA	3	6	15653	15658	50 %	0 %	50 %	0 %	222142589
37	NC_011996	AG	3	6	15825	15830	50 %	0 %	50 %	0 %	222142589
38	NC_011996	TA	3	6	16679	16684	50 %	50 %	0 %	0 %	222142589
39	NC_011996	TA	3	6	16895	16900	50 %	50 %	0 %	0 %	222142589
40	NC_011996	AT	3	6	17681	17686	50 %	50 %	0 %	0 %	222142590
41	NC_011996	CA	3	6	18053	18058	50 %	0 %	0 %	50 %	222142590
42	NC_011996	TA	3	6	19445	19450	50 %	50 %	0 %	0 %	222142591
43	NC_011996	TA	5	10	20016	20025	50 %	50 %	0 %	0 %	222142592
44	NC_011996	AT	3	6	20080	20085	50 %	50 %	0 %	0 %	222142593
45	NC_011996	AT	3	6	21259	21264	50 %	50 %	0 %	0 %	222142594
46	NC_011996	TA	3	6	21486	21491	50 %	50 %	0 %	0 %	222142594
47	NC_011996	TA	3	6	23927	23932	50 %	50 %	0 %	0 %	222142598
48	NC_011996	AT	3	6	24479	24484	50 %	50 %	0 %	0 %	222142598
49	NC_011996	AT	3	6	24569	24574	50 %	50 %	0 %	0 %	222142598
50	NC_011996	TA	3	6	24991	24996	50 %	50 %	0 %	0 %	222142598
51	NC_011996	TA	3	6	25090	25095	50 %	50 %	0 %	0 %	222142598
52	NC_011996	TA	4	8	26512	26519	50 %	50 %	0 %	0 %	222142599
53	NC_011996	AT	3	6	27228	27233	50 %	50 %	0 %	0 %	222142599
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55	NC_011996	AT	3	6	28737	28742	50 %	50 %	0 %	0 %	222142601
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57	NC_011996	AT	3	6	28970	28975	50 %	50 %	0 %	0 %	222142601
58	NC_011996	AT	3	6	30351	30356	50 %	50 %	0 %	0 %	222142602
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60	NC_011996	AT	3	6	31106	31111	50 %	50 %	0 %	0 %	222142603
61	NC_011996	TA	3	6	31693	31698	50 %	50 %	0 %	0 %	222142603
62	NC_011996	AG	3	6	31856	31861	50 %	0 %	50 %	0 %	222142603
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64	NC_011996	TA	3	6	31967	31972	50 %	50 %	0 %	0 %	222142603
65	NC_011996	TA	3	6	32151	32156	50 %	50 %	0 %	0 %	222142603
66	NC_011996	TA	3	6	32279	32284	50 %	50 %	0 %	0 %	222142603
67	NC_011996	TA	3	6	32294	32299	50 %	50 %	0 %	0 %	222142603
68	NC_011996	GA	4	8	32483	32490	50 %	0 %	50 %	0 %	222142603
69	NC_011996	TA	3	6	34504	34509	50 %	50 %	0 %	0 %	222142606
70	NC_011996	TA	3	6	34537	34542	50 %	50 %	0 %	0 %	222142606
71	NC_011996	AT	4	8	34547	34554	50 %	50 %	0 %	0 %	222142606
72	NC_011996	TA	3	6	35676	35681	50 %	50 %	0 %	0 %	222142607
73	NC_011996	TA	4	8	35713	35720	50 %	50 %	0 %	0 %	222142607
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82	NC_011996	AT	3	6	42653	42658	50 %	50 %	0 %	0 %	222142614
83	NC_011996	TA	3	6	42671	42676	50 %	50 %	0 %	0 %	222142614
84	NC_011996	TA	3	6	42976	42981	50 %	50 %	0 %	0 %	222142615
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86	NC_011996	TA	3	6	43771	43776	50 %	50 %	0 %	0 %	222142616
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90	NC_011996	AT	3	6	44513	44518	50 %	50 %	0 %	0 %	222142617
91	NC_011996	AT	3	6	44895	44900	50 %	50 %	0 %	0 %	222142617
92	NC_011996	TA	3	6	45162	45167	50 %	50 %	0 %	0 %	222142617
93	NC_011996	TA	3	6	45216	45221	50 %	50 %	0 %	0 %	222142617
94	NC_011996	TA	3	6	45386	45391	50 %	50 %	0 %	0 %	222142617
95	NC_011996	AT	3	6	45439	45444	50 %	50 %	0 %	0 %	222142617
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109	NC_011996	TA	3	6	55454	55459	50 %	50 %	0 %	0 %	222142623
110	NC_011996	TG	3	6	55723	55728	0 %	50 %	50 %	0 %	222142623
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113	NC_011996	TA	3	6	57718	57723	50 %	50 %	0 %	0 %	222142626
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.