MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL1

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011995	TCAG	2	8	674	681	25 %	25 %	25 %	25 %	222142562
2	NC_011995	TCAT	2	8	692	699	25 %	50 %	0 %	25 %	222142562
3	NC_011995	GATT	2	8	752	759	25 %	50 %	25 %	0 %	222142562
4	NC_011995	ATTG	2	8	1677	1684	25 %	50 %	25 %	0 %	222142563
5	NC_011995	CTGA	2	8	1725	1732	25 %	25 %	25 %	25 %	222142563
6	NC_011995	TCTA	2	8	2601	2608	25 %	50 %	0 %	25 %	222142564
7	NC_011995	ACAA	2	8	3113	3120	75 %	0 %	0 %	25 %	222142564
8	NC_011995	ATGA	2	8	3485	3492	50 %	25 %	25 %	0 %	222142565
9	NC_011995	TAAA	2	8	3494	3501	75 %	25 %	0 %	0 %	222142565
10	NC_011995	GATT	2	8	3591	3598	25 %	50 %	25 %	0 %	222142565
11	NC_011995	CGAT	2	8	3718	3725	25 %	25 %	25 %	25 %	222142565
12	NC_011995	TCTT	2	8	3808	3815	0 %	75 %	0 %	25 %	222142565
13	NC_011995	TCAC	2	8	3832	3839	25 %	25 %	0 %	50 %	222142565
14	NC_011995	GTAT	2	8	4533	4540	25 %	50 %	25 %	0 %	222142566
15	NC_011995	CATT	2	8	4814	4821	25 %	50 %	0 %	25 %	222142567
16	NC_011995	AATG	2	8	4962	4969	50 %	25 %	25 %	0 %	222142567
17	NC_011995	ATAG	2	8	5140	5147	50 %	25 %	25 %	0 %	222142567
18	NC_011995	ATAG	2	8	5263	5270	50 %	25 %	25 %	0 %	222142567
19	NC_011995	AGTA	2	8	5340	5347	50 %	25 %	25 %	0 %	222142567
20	NC_011995	TATT	2	8	5876	5883	25 %	75 %	0 %	0 %	222142567
21	NC_011995	TTTA	2	8	7558	7565	25 %	75 %	0 %	0 %	222142569
22	NC_011995	ATTT	2	8	7663	7670	25 %	75 %	0 %	0 %	222142569
23	NC_011995	TAAA	2	8	7675	7682	75 %	25 %	0 %	0 %	222142569
24	NC_011995	ATTT	2	8	7863	7870	25 %	75 %	0 %	0 %	222142569
25	NC_011995	AGAA	2	8	7890	7897	75 %	0 %	25 %	0 %	222142569
26	NC_011995	AAAT	2	8	7966	7973	75 %	25 %	0 %	0 %	222142569
27	NC_011995	AAAT	2	8	8182	8189	75 %	25 %	0 %	0 %	222142569
28	NC_011995	ATTT	2	8	8220	8227	25 %	75 %	0 %	0 %	222142569
29	NC_011995	ATTA	2	8	8441	8448	50 %	50 %	0 %	0 %	222142570
30	NC_011995	TAAA	2	8	8497	8504	75 %	25 %	0 %	0 %	222142570
31	NC_011995	TTCA	2	8	8519	8526	25 %	50 %	0 %	25 %	222142570
32	NC_011995	TTTG	2	8	8607	8614	0 %	75 %	25 %	0 %	222142570
33	NC_011995	GCAG	2	8	8645	8652	25 %	0 %	50 %	25 %	222142570
34	NC_011995	TTTC	2	8	9967	9974	0 %	75 %	0 %	25 %	222142571
35	NC_011995	TTTG	2	8	10297	10304	0 %	75 %	25 %	0 %	222142571
36	NC_011995	TTAA	2	8	10527	10534	50 %	50 %	0 %	0 %	222142571
37	NC_011995	TAAA	2	8	10594	10601	75 %	25 %	0 %	0 %	222142571
38	NC_011995	CTTA	2	8	10679	10686	25 %	50 %	0 %	25 %	222142571
39	NC_011995	ATCA	2	8	11002	11009	50 %	25 %	0 %	25 %	222142572
40	NC_011995	TAAA	2	8	11049	11056	75 %	25 %	0 %	0 %	222142572
41	NC_011995	TTCT	2	8	11132	11139	0 %	75 %	0 %	25 %	222142572
42	NC_011995	AGAA	2	8	12574	12581	75 %	0 %	25 %	0 %	222142573
43	NC_011995	ATGA	2	8	12977	12984	50 %	25 %	25 %	0 %	222142573
44	NC_011995	CTAT	2	8	14377	14384	25 %	50 %	0 %	25 %	222142574
45	NC_011995	TCTG	2	8	14444	14451	0 %	50 %	25 %	25 %	222142574
46	NC_011995	ACGT	2	8	14482	14489	25 %	25 %	25 %	25 %	222142574
47	NC_011995	GATT	2	8	14649	14656	25 %	50 %	25 %	0 %	222142574
48	NC_011995	ACAG	2	8	14962	14969	50 %	0 %	25 %	25 %	222142574
49	NC_011995	TGTT	2	8	15167	15174	0 %	75 %	25 %	0 %	222142575

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.