MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL1

Total Repeats: 175

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011995	GTA	2	6	636	641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142562
2	NC_011995	TGT	2	6	704	709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222142562
3	NC_011995	CTT	2	6	734	739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142562
4	NC_011995	ATT	2	6	763	768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142562
5	NC_011995	ATG	2	6	885	890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142562
6	NC_011995	CAT	2	6	930	935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142562
7	NC_011995	AAT	2	6	961	966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142562
8	NC_011995	CTT	2	6	1669	1674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142563
9	NC_011995	TTC	2	6	1687	1692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142563
10	NC_011995	TTC	2	6	1754	1759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142563
11	NC_011995	CTT	2	6	1821	1826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142563
12	NC_011995	CTT	2	6	1843	1848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142563
13	NC_011995	GTT	2	6	1875	1880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222142563
14	NC_011995	TCT	2	6	1881	1886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142563
15	NC_011995	TCT	2	6	1889	1894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142563
16	NC_011995	TGA	2	6	2667	2672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142564
17	NC_011995	AAT	2	6	2701	2706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142564
18	NC_011995	AAC	2	6	2778	2783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222142564
19	NC_011995	GTT	2	6	2821	2826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222142564
20	NC_011995	AGA	2	6	2864	2869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222142564
21	NC_011995	CTC	2	6	2870	2875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222142564
22	NC_011995	GAT	2	6	2893	2898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142564
23	NC_011995	ATT	2	6	2923	2928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142564
24	NC_011995	TTA	2	6	2936	2941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142564
25	NC_011995	TAA	2	6	2949	2954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142564
26	NC_011995	GTT	2	6	2962	2967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222142564
27	NC_011995	AGT	2	6	2983	2988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142564
28	NC_011995	GAA	2	6	3007	3012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222142564
29	NC_011995	TAT	2	6	3019	3024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142564
30	NC_011995	TTA	2	6	3136	3141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142564
31	NC_011995	ATG	2	6	3272	3277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142564
32	NC_011995	TTA	2	6	3317	3322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142564
33	NC_011995	TAA	2	6	3535	3540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142565
34	NC_011995	GAT	2	6	3737	3742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142565
35	NC_011995	TCT	2	6	3770	3775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142565
36	NC_011995	ATA	2	6	3894	3899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142565
37	NC_011995	TCA	2	6	3959	3964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142565
38	NC_011995	CTT	2	6	4114	4119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142566
39	NC_011995	ATA	2	6	4203	4208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142566
40	NC_011995	TAT	2	6	4223	4228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142566
41	NC_011995	TTA	2	6	4276	4281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142566
42	NC_011995	TAA	2	6	4293	4298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142566
43	NC_011995	TCC	2	6	4377	4382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222142566
44	NC_011995	TAT	2	6	4403	4408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142566
45	NC_011995	ATA	2	6	4422	4427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142566
46	NC_011995	TAT	2	6	4451	4456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142566
47	NC_011995	TAA	2	6	4493	4498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142566
48	NC_011995	CAT	2	6	4803	4808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142567
49	NC_011995	CTT	2	6	4856	4861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142567
50	NC_011995	TAA	2	6	4935	4940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142567
51	NC_011995	ATT	2	6	4956	4961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142567
52	NC_011995	TAT	2	6	4980	4985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142567
53	NC_011995	CCA	2	6	5071	5076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222142567
54	NC_011995	TAT	2	6	5088	5093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142567
55	NC_011995	TAT	2	6	5123	5128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142567
56	NC_011995	ATT	2	6	5152	5157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142567
57	NC_011995	GAT	2	6	5284	5289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142567
58	NC_011995	TAA	2	6	5330	5335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142567
59	NC_011995	ATA	2	6	5354	5359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142567
60	NC_011995	AAT	3	9	5364	5372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142567
61	NC_011995	CTA	2	6	5396	5401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142567
62	NC_011995	GAT	2	6	5477	5482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142567
63	NC_011995	TAG	2	6	5492	5497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142567
64	NC_011995	ATT	2	6	5554	5559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142567
65	NC_011995	TAA	3	9	5601	5609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142567
66	NC_011995	TAA	2	6	5648	5653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142567
67	NC_011995	ATT	2	6	5836	5841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142567
68	NC_011995	TCT	2	6	6233	6238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142568
69	NC_011995	ATT	2	6	6243	6248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142568
70	NC_011995	TAT	2	6	6296	6301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142568
71	NC_011995	CAA	2	6	6362	6367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222142568
72	NC_011995	ATA	2	6	6412	6417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142568
73	NC_011995	TAT	2	6	6432	6437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142568
74	NC_011995	TTA	2	6	6445	6450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142568
75	NC_011995	GTT	2	6	6691	6696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222142568
76	NC_011995	TCT	2	6	6865	6870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142568
77	NC_011995	TAG	2	6	6930	6935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142568
78	NC_011995	TAA	2	6	6948	6953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142568
79	NC_011995	AAT	2	6	7007	7012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142568
80	NC_011995	CAT	2	6	7218	7223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142569
81	NC_011995	TAT	2	6	7224	7229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142569
82	NC_011995	AAG	2	6	7245	7250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222142569
83	NC_011995	TTA	2	6	7349	7354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142569
84	NC_011995	ACA	2	6	7405	7410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222142569
85	NC_011995	AAT	2	6	7416	7421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142569
86	NC_011995	ATT	2	6	7522	7527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142569
87	NC_011995	ATT	2	6	7552	7557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142569
88	NC_011995	TTC	2	6	7639	7644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142569
89	NC_011995	TAT	2	6	7650	7655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142569
90	NC_011995	GTT	2	6	7732	7737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222142569
91	NC_011995	TCT	2	6	7752	7757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142569
92	NC_011995	GTT	2	6	7781	7786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222142569
93	NC_011995	TCT	2	6	7793	7798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142569
94	NC_011995	TCT	2	6	7850	7855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142569
95	NC_011995	ATT	2	6	8059	8064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142569
96	NC_011995	ACT	2	6	8065	8070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142569
97	NC_011995	GTT	2	6	8108	8113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222142569
98	NC_011995	ATT	2	6	8128	8133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142569
99	NC_011995	ATT	2	6	8140	8145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142569
100	NC_011995	TTG	2	6	8197	8202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222142569
101	NC_011995	ATT	2	6	8281	8286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142569
102	NC_011995	TAA	2	6	8293	8298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142569
103	NC_011995	TCC	2	6	8372	8377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222142570
104	NC_011995	CAA	2	6	8414	8419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222142570
105	NC_011995	ATG	2	6	8687	8692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142570
106	NC_011995	AAT	2	6	8740	8745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142570
107	NC_011995	TAA	2	6	8827	8832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142570
108	NC_011995	ATT	2	6	8877	8882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142570
109	NC_011995	ATT	2	6	8909	8914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142570
110	NC_011995	ATA	2	6	9054	9059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142570
111	NC_011995	TTA	2	6	9208	9213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142570
112	NC_011995	ATT	2	6	9237	9242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142570
113	NC_011995	TAA	2	6	9322	9327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142570
114	NC_011995	AAG	2	6	9328	9333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222142570
115	NC_011995	ATT	2	6	9390	9395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142570
116	NC_011995	TAT	2	6	9977	9982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142571
117	NC_011995	TCA	2	6	10023	10028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142571
118	NC_011995	AAT	2	6	10066	10071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142571
119	NC_011995	AAC	2	6	10097	10102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222142571
120	NC_011995	TTC	2	6	10157	10162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142571
121	NC_011995	ATA	2	6	10180	10185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142571
122	NC_011995	AGT	2	6	10267	10272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142571
123	NC_011995	TAT	2	6	10366	10371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142571
124	NC_011995	TTA	2	6	10426	10431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142571
125	NC_011995	TCT	2	6	10458	10463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142571
126	NC_011995	TAA	2	6	10492	10497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142571
127	NC_011995	ATA	2	6	10551	10556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142571
128	NC_011995	AGC	2	6	11166	11171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222142572
129	NC_011995	ACT	2	6	11313	11318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142572
130	NC_011995	TGT	2	6	11332	11337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222142572
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132	NC_011995	TAT	2	6	11489	11494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142572
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.