MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Methylobacterium nodulans ORS 2060 plasmid pMNOD03

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011893	CGCC	2	8	137	144	0 %	0 %	25 %	75 %	220920001
2	NC_011893	CCCG	2	8	229	236	0 %	0 %	25 %	75 %	220920001
3	NC_011893	CCGG	2	8	722	729	0 %	0 %	50 %	50 %	220920001
4	NC_011893	ACGG	2	8	752	759	25 %	0 %	50 %	25 %	220920001
5	NC_011893	ATCG	2	8	2201	2208	25 %	25 %	25 %	25 %	220920003
6	NC_011893	CTGA	2	8	2240	2247	25 %	25 %	25 %	25 %	220920003
7	NC_011893	CCCG	2	8	4461	4468	0 %	0 %	25 %	75 %	220920005
8	NC_011893	TGAG	2	8	6524	6531	25 %	25 %	50 %	0 %	220920007
9	NC_011893	CGCA	2	8	6568	6575	25 %	0 %	25 %	50 %	220920007
10	NC_011893	CCTT	2	8	7592	7599	0 %	50 %	0 %	50 %	220920008
11	NC_011893	ACCC	2	8	8725	8732	25 %	0 %	0 %	75 %	220920010
12	NC_011893	CGGC	2	8	9076	9083	0 %	0 %	50 %	50 %	220920010
13	NC_011893	GGCC	2	8	9244	9251	0 %	0 %	50 %	50 %	220920010
14	NC_011893	CAGC	2	8	9331	9338	25 %	0 %	25 %	50 %	220920010
15	NC_011893	CTGC	2	8	10055	10062	0 %	25 %	25 %	50 %	220920011
16	NC_011893	GACA	2	8	10651	10658	50 %	0 %	25 %	25 %	220920012
17	NC_011893	GCGG	2	8	12106	12113	0 %	0 %	75 %	25 %	220920013
18	NC_011893	GCGG	2	8	13967	13974	0 %	0 %	75 %	25 %	220920017
19	NC_011893	CGGC	2	8	14747	14754	0 %	0 %	50 %	50 %	220920019
20	NC_011893	TGCT	2	8	14850	14857	0 %	50 %	25 %	25 %	220920019
21	NC_011893	TGGA	2	8	15501	15508	25 %	25 %	50 %	0 %	220920020
22	NC_011893	TCGG	2	8	16128	16135	0 %	25 %	50 %	25 %	220920021
23	NC_011893	GCAA	2	8	16311	16318	50 %	0 %	25 %	25 %	220920022
24	NC_011893	TGGC	2	8	17213	17220	0 %	25 %	50 %	25 %	220920024
25	NC_011893	GAGC	2	8	17305	17312	25 %	0 %	50 %	25 %	220920024
26	NC_011893	CGAC	2	8	17448	17455	25 %	0 %	25 %	50 %	220920024
27	NC_011893	CCGC	2	8	17562	17569	0 %	0 %	25 %	75 %	220920024
28	NC_011893	CGGC	2	8	17810	17817	0 %	0 %	50 %	50 %	220920024
29	NC_011893	CGTG	2	8	18159	18166	0 %	25 %	50 %	25 %	220920025
30	NC_011893	CCGC	2	8	18269	18276	0 %	0 %	25 %	75 %	220920025
31	NC_011893	GCGG	2	8	18348	18355	0 %	0 %	75 %	25 %	220920025
32	NC_011893	CGGC	2	8	18396	18403	0 %	0 %	50 %	50 %	220920025
33	NC_011893	CCCG	2	8	18978	18985	0 %	0 %	25 %	75 %	220920026
34	NC_011893	CGAG	2	8	19348	19355	25 %	0 %	50 %	25 %	220920028
35	NC_011893	GCGA	2	8	19691	19698	25 %	0 %	50 %	25 %	220920029
36	NC_011893	CGGC	2	8	19705	19712	0 %	0 %	50 %	50 %	220920029
37	NC_011893	GGCG	2	8	20267	20274	0 %	0 %	75 %	25 %	220920030
38	NC_011893	CGGG	2	8	20558	20565	0 %	0 %	75 %	25 %	220920031
39	NC_011893	CGGC	2	8	22286	22293	0 %	0 %	50 %	50 %	220920033
40	NC_011893	CGGC	2	8	22389	22396	0 %	0 %	50 %	50 %	220920033
41	NC_011893	GCCT	2	8	22428	22435	0 %	25 %	25 %	50 %	220920033
42	NC_011893	TCGC	2	8	22651	22658	0 %	25 %	25 %	50 %	220920034
43	NC_011893	CATT	2	8	22777	22784	25 %	50 %	0 %	25 %	220920034
44	NC_011893	CGGG	2	8	23638	23645	0 %	0 %	75 %	25 %	220920035
45	NC_011893	GCCG	2	8	25418	25425	0 %	0 %	50 %	50 %	220920038
46	NC_011893	AGGC	2	8	28703	28710	25 %	0 %	50 %	25 %	220920040
47	NC_011893	ACCG	2	8	28961	28968	25 %	0 %	25 %	50 %	220920040
48	NC_011893	GACC	2	8	28996	29003	25 %	0 %	25 %	50 %	220920040
49	NC_011893	GCCG	2	8	29036	29043	0 %	0 %	50 %	50 %	220920040
50	NC_011893	TGAC	2	8	29108	29115	25 %	25 %	25 %	25 %	220920040
51	NC_011893	CGGC	2	8	29285	29292	0 %	0 %	50 %	50 %	220920040
52	NC_011893	CCTG	2	8	32211	32218	0 %	25 %	25 %	50 %	220920043
53	NC_011893	GGAC	2	8	32446	32453	25 %	0 %	50 %	25 %	220920044
54	NC_011893	GGCA	2	8	32465	32472	25 %	0 %	50 %	25 %	220920044
55	NC_011893	TCGG	2	8	32703	32710	0 %	25 %	50 %	25 %	220920044
56	NC_011893	CTGG	2	8	33575	33582	0 %	25 %	50 %	25 %	220920045
57	NC_011893	TGGC	2	8	33659	33666	0 %	25 %	50 %	25 %	220920045
58	NC_011893	CCGC	2	8	34718	34725	0 %	0 %	25 %	75 %	220920046
59	NC_011893	CCGC	2	8	35000	35007	0 %	0 %	25 %	75 %	220920046
60	NC_011893	CTGC	2	8	35282	35289	0 %	25 %	25 %	50 %	220920046
61	NC_011893	CTGC	2	8	35423	35430	0 %	25 %	25 %	50 %	220920046
62	NC_011893	AGCG	2	8	35752	35759	25 %	0 %	50 %	25 %	220920046
63	NC_011893	GGCC	2	8	35885	35892	0 %	0 %	50 %	50 %	220920046
64	NC_011893	CCGG	2	8	36793	36800	0 %	0 %	50 %	50 %	220920047
65	NC_011893	CGGC	2	8	37107	37114	0 %	0 %	50 %	50 %	220920047
66	NC_011893	TCGC	2	8	37203	37210	0 %	25 %	25 %	50 %	220920047
67	NC_011893	TGAG	2	8	37215	37222	25 %	25 %	50 %	0 %	220920047
68	NC_011893	CCCG	2	8	37425	37432	0 %	0 %	25 %	75 %	220920048
69	NC_011893	CAGG	2	8	37852	37859	25 %	0 %	50 %	25 %	220920049
70	NC_011893	GCCT	2	8	37868	37875	0 %	25 %	25 %	50 %	220920049
71	NC_011893	CCGC	2	8	38348	38355	0 %	0 %	25 %	75 %	220920051
72	NC_011893	CTGC	2	8	38675	38682	0 %	25 %	25 %	50 %	220920051
73	NC_011893	GGCG	2	8	39438	39445	0 %	0 %	75 %	25 %	220920052
74	NC_011893	ATGC	2	8	39469	39476	25 %	25 %	25 %	25 %	220920052
75	NC_011893	TGCC	2	8	39663	39670	0 %	25 %	25 %	50 %	220920052

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.