MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methylobacterium nodulans ORS 2060 plasmid pMNOD03

Total Repeats: 408

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011893	GCC	2	6	121	126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220920001
2	NC_011893	GCC	2	6	130	135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220920001
3	NC_011893	CTC	3	9	147	155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220920001
4	NC_011893	CCG	2	6	176	181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220920001
5	NC_011893	GCC	3	9	184	192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220920001
6	NC_011893	TCC	2	6	211	216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220920001
7	NC_011893	ACC	2	6	220	225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220920001
8	NC_011893	CTT	2	6	262	267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220920001
9	NC_011893	CGT	2	6	292	297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220920001
10	NC_011893	CGC	2	6	438	443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220920001
11	NC_011893	ACC	2	6	448	453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220920001
12	NC_011893	CCT	2	6	491	496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220920001
13	NC_011893	TCT	2	6	545	550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220920001
14	NC_011893	GAT	2	6	552	557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220920001
15	NC_011893	GCA	2	6	575	580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220920001
16	NC_011893	CGG	2	6	618	623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220920001
17	NC_011893	GCC	2	6	682	687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220920001
18	NC_011893	GCC	2	6	739	744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220920001
19	NC_011893	GCA	2	6	767	772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220920001
20	NC_011893	ATC	2	6	827	832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220920001
21	NC_011893	GCC	2	6	1001	1006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220920002
22	NC_011893	CCG	2	6	1011	1016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220920002
23	NC_011893	GCC	2	6	1064	1069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220920002
24	NC_011893	GCC	2	6	1112	1117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220920002
25	NC_011893	GCC	2	6	1157	1162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220920002
26	NC_011893	GCC	6	18	1184	1201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220920002
27	NC_011893	CCG	2	6	1203	1208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220920002
28	NC_011893	GTA	2	6	1217	1222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220920002
29	NC_011893	CCA	2	6	1248	1253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220920002
30	NC_011893	CCG	2	6	1257	1262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220920002
31	NC_011893	GCC	5	15	1283	1297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220920002
32	NC_011893	GCC	2	6	1319	1324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220920002
33	NC_011893	GCC	2	6	1346	1351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220920002
34	NC_011893	CCG	2	6	1371	1376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220920002
35	NC_011893	GCC	2	6	1382	1387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220920002
36	NC_011893	GCC	2	6	1391	1396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220920002
37	NC_011893	GTA	2	6	1397	1402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220920002
38	NC_011893	CTG	2	6	1451	1456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220920002
39	NC_011893	CCG	2	6	1477	1482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220920002
40	NC_011893	TCT	2	6	1501	1506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220920002
41	NC_011893	ATG	2	6	1509	1514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220920002
42	NC_011893	GCA	2	6	2184	2189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220920003
43	NC_011893	GAC	2	6	2224	2229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220920003
44	NC_011893	GAG	2	6	2270	2275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220920003
45	NC_011893	GGT	2	6	2308	2313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220920003
46	NC_011893	ATT	2	6	2802	2807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220920004
47	NC_011893	GTT	2	6	2851	2856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220920004
48	NC_011893	TCA	2	6	2876	2881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220920004
49	NC_011893	GCT	2	6	2923	2928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220920004
50	NC_011893	TGC	2	6	2948	2953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220920004
51	NC_011893	CTT	2	6	3707	3712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220920005
52	NC_011893	ATC	2	6	3744	3749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220920005
53	NC_011893	CCA	2	6	3776	3781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220920005
54	NC_011893	CGT	2	6	3802	3807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220920005
55	NC_011893	CGG	2	6	3888	3893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220920005
56	NC_011893	TGT	2	6	3895	3900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220920005
57	NC_011893	GCA	3	9	3928	3936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220920005
58	NC_011893	CGC	2	6	3940	3945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220920005
59	NC_011893	CCG	2	6	4015	4020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220920005
60	NC_011893	CAA	2	6	4435	4440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220920005
61	NC_011893	GTC	2	6	4521	4526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220920005
62	NC_011893	GCC	2	6	5789	5794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220920006
63	NC_011893	GCC	2	6	5818	5823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220920006
64	NC_011893	TCC	2	6	5962	5967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220920006
65	NC_011893	GCG	2	6	5987	5992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220920006
66	NC_011893	TCA	2	6	6551	6556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220920007
67	NC_011893	AAG	2	6	6596	6601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220920007
68	NC_011893	CCA	2	6	6679	6684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220920007
69	NC_011893	GGT	2	6	6760	6765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220920007
70	NC_011893	CCA	2	6	6951	6956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220920007
71	NC_011893	ATA	2	6	7008	7013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220920007
72	NC_011893	GTC	2	6	7029	7034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220920007
73	NC_011893	TTG	2	6	7661	7666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220920008
74	NC_011893	TGG	2	6	8089	8094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220920009
75	NC_011893	ACG	2	6	8129	8134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220920009
76	NC_011893	GTG	2	6	8169	8174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220920009
77	NC_011893	CGG	2	6	8216	8221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220920009
78	NC_011893	GGC	2	6	8744	8749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220920010
79	NC_011893	ACC	2	6	8776	8781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220920010
80	NC_011893	CTC	2	6	8837	8842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220920010
81	NC_011893	CAC	2	6	8855	8860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220920010
82	NC_011893	GGC	2	6	8995	9000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220920010
83	NC_011893	CGG	2	6	9022	9027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220920010
84	NC_011893	GCC	2	6	9088	9093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220920010
85	NC_011893	GCC	2	6	9099	9104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220920010
86	NC_011893	GCG	4	12	9107	9118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220920010
87	NC_011893	CTC	2	6	9218	9223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220920010
88	NC_011893	GCC	2	6	9273	9278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220920010
89	NC_011893	GCC	2	6	9312	9317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220920010
90	NC_011893	CGA	2	6	9841	9846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220920011
91	NC_011893	AGC	2	6	9910	9915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220920011
92	NC_011893	CGA	2	6	9932	9937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220920011
93	NC_011893	GCT	2	6	10159	10164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220920011
94	NC_011893	TCG	2	6	10168	10173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220920011
95	NC_011893	TCG	2	6	10481	10486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220920012
96	NC_011893	GCT	2	6	10545	10550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220920012
97	NC_011893	GCT	2	6	10606	10611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220920012
98	NC_011893	CTC	2	6	10709	10714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220920012
99	NC_011893	GCC	2	6	10826	10831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220920012
100	NC_011893	GCG	2	6	11616	11621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220920013
101	NC_011893	CAA	2	6	11631	11636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220920013
102	NC_011893	ACG	2	6	11654	11659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220920013
103	NC_011893	CTC	2	6	11687	11692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220920013
104	NC_011893	CGA	2	6	11790	11795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220920013
105	NC_011893	GGC	2	6	11814	11819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220920013
106	NC_011893	TCG	2	6	11823	11828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220920013
107	NC_011893	TGG	2	6	11829	11834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220920013
108	NC_011893	CAT	2	6	11872	11877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220920013
109	NC_011893	CGC	2	6	11923	11928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220920013
110	NC_011893	GGC	2	6	11932	11937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220920013
111	NC_011893	AGG	3	9	11958	11966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220920013
112	NC_011893	GAT	2	6	12046	12051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220920013
113	NC_011893	CGA	2	6	12055	12060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220920013
114	NC_011893	CAG	2	6	12235	12240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220920013
115	NC_011893	GCC	2	6	12254	12259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220920013
116	NC_011893	ACC	2	6	12265	12270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220920013
117	NC_011893	CGC	2	6	12400	12405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220920014
118	NC_011893	CGA	2	6	12423	12428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220920014
119	NC_011893	GTG	2	6	12486	12491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220920014
120	NC_011893	GCT	2	6	12681	12686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220920015
121	NC_011893	AGC	2	6	12713	12718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220920015
122	NC_011893	CGT	2	6	12756	12761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220920015
123	NC_011893	CCG	2	6	12783	12788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220920015
124	NC_011893	GCC	2	6	12806	12811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220920015
125	NC_011893	GTC	2	6	12889	12894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220920015
126	NC_011893	CAA	2	6	13557	13562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220920016
127	NC_011893	CGT	3	9	13599	13607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220920016
128	NC_011893	CGT	2	6	13647	13652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220920016
129	NC_011893	TCA	2	6	13823	13828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220920017
130	NC_011893	GCT	2	6	13837	13842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220920017
131	NC_011893	CGA	2	6	13858	13863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220920017
132	NC_011893	AGC	2	6	13914	13919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220920017
133	NC_011893	CCG	2	6	13988	13993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220920017
134	NC_011893	TCG	2	6	14022	14027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220920017
135	NC_011893	ACA	2	6	14203	14208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220920018
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143	NC_011893	TCA	2	6	15495	15500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220920020
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152	NC_011893	CGG	2	6	16244	16249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220920022
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163	NC_011893	GCT	2	6	17012	17017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220920024
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.