MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methylobacterium nodulans ORS 2060 plasmid pMNOD01

Total Repeats: 309

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011892	GCACC	2	10	309	318	20 %	0 %	20 %	60 %	220919598
2	NC_011892	CACGA	2	10	1709	1718	40 %	0 %	20 %	40 %	220919599
3	NC_011892	GATGA	2	10	2083	2092	40 %	20 %	40 %	0 %	220919599
4	NC_011892	CCGGC	2	10	2282	2291	0 %	0 %	40 %	60 %	220919599
5	NC_011892	GGCCG	2	10	4133	4142	0 %	0 %	60 %	40 %	220919601
6	NC_011892	TTCTG	2	10	10514	10523	0 %	60 %	20 %	20 %	220919607
7	NC_011892	GGTCC	2	10	10746	10755	0 %	20 %	40 %	40 %	220919607
8	NC_011892	ATCCA	2	10	10861	10870	40 %	20 %	0 %	40 %	220919607
9	NC_011892	CGGCG	2	10	17145	17154	0 %	0 %	60 %	40 %	220919613
10	NC_011892	GCCAG	2	10	17550	17559	20 %	0 %	40 %	40 %	220919613
11	NC_011892	GAGGC	2	10	18616	18625	20 %	0 %	60 %	20 %	220919614
12	NC_011892	CGCAG	2	10	18722	18731	20 %	0 %	40 %	40 %	220919614
13	NC_011892	CGCGC	2	10	20314	20323	0 %	0 %	40 %	60 %	220919615
14	NC_011892	CGCTG	2	10	21325	21334	0 %	20 %	40 %	40 %	220919615
15	NC_011892	GCTCC	2	10	24429	24438	0 %	20 %	20 %	60 %	220919618
16	NC_011892	GCATC	2	10	25418	25427	20 %	20 %	20 %	40 %	220919619
17	NC_011892	CCGTG	2	10	25871	25880	0 %	20 %	40 %	40 %	220919619
18	NC_011892	CCGGA	2	10	26047	26056	20 %	0 %	40 %	40 %	220919619
19	NC_011892	GGCCG	2	10	28581	28590	0 %	0 %	60 %	40 %	220919623
20	NC_011892	GGCTT	2	10	36867	36876	0 %	40 %	40 %	20 %	220919631
21	NC_011892	ACGCC	2	10	37078	37087	20 %	0 %	20 %	60 %	220919631
22	NC_011892	ACGGT	2	10	38492	38501	20 %	20 %	40 %	20 %	220919632
23	NC_011892	CCGAT	2	10	40383	40392	20 %	20 %	20 %	40 %	220919633
24	NC_011892	GCGTC	2	10	40664	40673	0 %	20 %	40 %	40 %	220919634
25	NC_011892	ATCGC	2	10	41149	41158	20 %	20 %	20 %	40 %	220919634
26	NC_011892	CGGCG	2	10	42810	42819	0 %	0 %	60 %	40 %	220919636
27	NC_011892	CGGCA	2	10	43321	43330	20 %	0 %	40 %	40 %	220919636
28	NC_011892	TCGGC	2	10	47222	47231	0 %	20 %	40 %	40 %	220919638
29	NC_011892	CCGGG	2	10	48413	48422	0 %	0 %	60 %	40 %	220919638
30	NC_011892	CCGGG	2	10	49829	49838	0 %	0 %	60 %	40 %	220919639
31	NC_011892	GCCGG	2	10	52291	52300	0 %	0 %	60 %	40 %	220919641
32	NC_011892	CTGCT	2	10	56076	56085	0 %	40 %	20 %	40 %	220919644
33	NC_011892	CCAGC	2	10	59619	59628	20 %	0 %	20 %	60 %	220919648
34	NC_011892	CGTTC	2	10	60010	60019	0 %	40 %	20 %	40 %	220919648
35	NC_011892	GCAGC	2	10	62349	62358	20 %	0 %	40 %	40 %	220919650
36	NC_011892	GTCCT	2	10	62488	62497	0 %	40 %	20 %	40 %	220919650
37	NC_011892	CGGCG	2	10	63498	63507	0 %	0 %	60 %	40 %	220919652
38	NC_011892	CGGAG	2	10	63669	63678	20 %	0 %	60 %	20 %	220919652
39	NC_011892	AGCGA	2	10	65189	65198	40 %	0 %	40 %	20 %	220919653
40	NC_011892	CAGGC	2	10	65309	65318	20 %	0 %	40 %	40 %	220919653
41	NC_011892	GCCGC	2	10	66166	66175	0 %	0 %	40 %	60 %	220919653
42	NC_011892	GACGG	2	10	67548	67557	20 %	0 %	60 %	20 %	220919654
43	NC_011892	GCCGA	2	10	67659	67668	20 %	0 %	40 %	40 %	220919654
44	NC_011892	CGCGC	2	10	70580	70589	0 %	0 %	40 %	60 %	220919656
45	NC_011892	CAGCG	2	10	70612	70621	20 %	0 %	40 %	40 %	220919656
46	NC_011892	CCCGC	2	10	75582	75591	0 %	0 %	20 %	80 %	220919661
47	NC_011892	CGCGG	2	10	76147	76156	0 %	0 %	60 %	40 %	220919661
48	NC_011892	CGACG	2	10	77536	77545	20 %	0 %	40 %	40 %	220919663
49	NC_011892	CGGCG	2	10	77941	77950	0 %	0 %	60 %	40 %	220919663
50	NC_011892	CTCGG	2	10	78234	78243	0 %	20 %	40 %	40 %	220919664
51	NC_011892	GACCA	2	10	78956	78965	40 %	0 %	20 %	40 %	220919664
52	NC_011892	CGGCG	2	10	79897	79906	0 %	0 %	60 %	40 %	220919664
53	NC_011892	CATCA	2	10	81743	81752	40 %	20 %	0 %	40 %	220919667
54	NC_011892	GCGCA	2	10	81830	81839	20 %	0 %	40 %	40 %	220919667
55	NC_011892	GCGCA	2	10	85372	85381	20 %	0 %	40 %	40 %	220919673
56	NC_011892	CCTAT	2	10	86187	86196	20 %	40 %	0 %	40 %	220919674
57	NC_011892	ATGCC	2	10	86250	86259	20 %	20 %	20 %	40 %	220919674
58	NC_011892	TGCAT	2	10	92253	92262	20 %	40 %	20 %	20 %	220919679
59	NC_011892	ATTGG	2	10	92798	92807	20 %	40 %	40 %	0 %	220919679
60	NC_011892	CGGCA	2	10	93821	93830	20 %	0 %	40 %	40 %	220919680
61	NC_011892	CCGCG	2	10	94567	94576	0 %	0 %	40 %	60 %	220919681
62	NC_011892	GGCCG	2	10	94964	94973	0 %	0 %	60 %	40 %	220919681
63	NC_011892	CAGGC	2	10	94983	94992	20 %	0 %	40 %	40 %	220919681
64	NC_011892	GCCGG	2	10	95480	95489	0 %	0 %	60 %	40 %	220919681
65	NC_011892	CCGTG	2	10	95539	95548	0 %	20 %	40 %	40 %	220919681
66	NC_011892	AGCCG	2	10	96079	96088	20 %	0 %	40 %	40 %	220919681
67	NC_011892	GCCGA	2	10	96132	96141	20 %	0 %	40 %	40 %	220919681
68	NC_011892	GGCCG	2	10	96380	96389	0 %	0 %	60 %	40 %	220919681
69	NC_011892	GGGAT	2	10	97053	97062	20 %	20 %	60 %	0 %	220919681
70	NC_011892	CCGGC	2	10	97192	97201	0 %	0 %	40 %	60 %	220919681
71	NC_011892	GCCGA	2	10	97672	97681	20 %	0 %	40 %	40 %	220919682
72	NC_011892	CTGCC	2	10	99458	99467	0 %	20 %	20 %	60 %	220919683
73	NC_011892	AGCCA	2	10	101984	101993	40 %	0 %	20 %	40 %	220919685
74	NC_011892	AGCCG	2	10	102501	102510	20 %	0 %	40 %	40 %	220919685
75	NC_011892	CTGCG	2	10	104290	104299	0 %	20 %	40 %	40 %	220919687
76	NC_011892	CTGCG	2	10	104725	104734	0 %	20 %	40 %	40 %	220919687
77	NC_011892	CGGAT	2	10	107414	107423	20 %	20 %	40 %	20 %	220919690
78	NC_011892	GGCCG	2	10	109842	109851	0 %	0 %	60 %	40 %	220919693
79	NC_011892	CCAGC	2	10	110708	110717	20 %	0 %	20 %	60 %	220919694
80	NC_011892	GTGCG	2	10	110832	110841	0 %	20 %	60 %	20 %	220919694
81	NC_011892	GGCAC	2	10	111481	111490	20 %	0 %	40 %	40 %	220919694
82	NC_011892	TCCAG	2	10	112045	112054	20 %	20 %	20 %	40 %	220919695
83	NC_011892	TCCCA	2	10	112168	112177	20 %	20 %	0 %	60 %	220919695
84	NC_011892	GATCA	2	10	112935	112944	40 %	20 %	20 %	20 %	220919697
85	NC_011892	CGGGG	2	10	119079	119088	0 %	0 %	80 %	20 %	220919703
86	NC_011892	CGACG	2	10	120256	120265	20 %	0 %	40 %	40 %	220919703
87	NC_011892	GGCGA	2	10	125783	125792	20 %	0 %	60 %	20 %	220919705
88	NC_011892	AGCCC	2	10	126808	126817	20 %	0 %	20 %	60 %	220919705
89	NC_011892	ACCGA	2	10	126893	126902	40 %	0 %	20 %	40 %	220919705
90	NC_011892	TGCAA	2	10	129925	129934	40 %	20 %	20 %	20 %	220919709
91	NC_011892	GGATC	2	10	130531	130540	20 %	20 %	40 %	20 %	220919709
92	NC_011892	ATCGC	2	10	134179	134188	20 %	20 %	20 %	40 %	220919712
93	NC_011892	GCGCG	2	10	138369	138378	0 %	0 %	60 %	40 %	220919715
94	NC_011892	TGGCG	2	10	140164	140173	0 %	20 %	60 %	20 %	220919716
95	NC_011892	ACGGC	2	10	141024	141033	20 %	0 %	40 %	40 %	220919717
96	NC_011892	GCGAT	2	10	147408	147417	20 %	20 %	40 %	20 %	220919721
97	NC_011892	CGCCC	2	10	152671	152680	0 %	0 %	20 %	80 %	220919724
98	NC_011892	CGGCA	2	10	153224	153233	20 %	0 %	40 %	40 %	220919724
99	NC_011892	GCCCT	2	10	158490	158499	0 %	20 %	20 %	60 %	220919729
100	NC_011892	GGCGA	2	10	158886	158895	20 %	0 %	60 %	20 %	220919730
101	NC_011892	CTGAG	2	10	159829	159838	20 %	20 %	40 %	20 %	220919731
102	NC_011892	CTGGC	2	10	166228	166237	0 %	20 %	40 %	40 %	220919736
103	NC_011892	GCGAT	2	10	167640	167649	20 %	20 %	40 %	20 %	220919738
104	NC_011892	GCGCA	2	10	175381	175390	20 %	0 %	40 %	40 %	220919747
105	NC_011892	CTCGG	2	10	176257	176266	0 %	20 %	40 %	40 %	220919748
106	NC_011892	CCGCG	2	10	177680	177689	0 %	0 %	40 %	60 %	220919749
107	NC_011892	GCTCT	2	10	178889	178898	0 %	40 %	20 %	40 %	220919751
108	NC_011892	GCTCG	2	10	179533	179542	0 %	20 %	40 %	40 %	220919752
109	NC_011892	GCGCC	2	10	187908	187917	0 %	0 %	40 %	60 %	220919758
110	NC_011892	GCCCA	2	10	190543	190552	20 %	0 %	20 %	60 %	220919760
111	NC_011892	GTCGA	2	10	192599	192608	20 %	20 %	40 %	20 %	220919762
112	NC_011892	TCGCA	2	10	193165	193174	20 %	20 %	20 %	40 %	220919763
113	NC_011892	GCGCC	2	10	198555	198564	0 %	0 %	40 %	60 %	220919766
114	NC_011892	CACCG	2	10	198616	198625	20 %	0 %	20 %	60 %	220919766
115	NC_011892	CCGAG	2	10	198957	198966	20 %	0 %	40 %	40 %	220919766
116	NC_011892	GCCTC	2	10	200431	200440	0 %	20 %	20 %	60 %	220919767
117	NC_011892	GCTGA	2	10	201242	201251	20 %	20 %	40 %	20 %	220919769
118	NC_011892	GCTGG	2	10	203160	203169	0 %	20 %	60 %	20 %	220919770
119	NC_011892	GGCCG	2	10	206258	206267	0 %	0 %	60 %	40 %	220919773
120	NC_011892	CGCGG	2	10	207007	207016	0 %	0 %	60 %	40 %	220919773
121	NC_011892	TTCCG	2	10	207047	207056	0 %	40 %	20 %	40 %	220919773
122	NC_011892	GGTCG	2	10	208400	208409	0 %	20 %	60 %	20 %	220919774
123	NC_011892	ATTAT	2	10	209252	209261	40 %	60 %	0 %	0 %	220919775
124	NC_011892	GACGG	2	10	212919	212928	20 %	0 %	60 %	20 %	220919777
125	NC_011892	TCCAC	2	10	213552	213561	20 %	20 %	0 %	60 %	220919778
126	NC_011892	CTCTG	2	10	215366	215375	0 %	40 %	20 %	40 %	220919779
127	NC_011892	GGCCC	2	10	216155	216164	0 %	0 %	40 %	60 %	220919780
128	NC_011892	CGCGG	2	10	217772	217781	0 %	0 %	60 %	40 %	220919781
129	NC_011892	TGCCG	2	10	221176	221185	0 %	20 %	40 %	40 %	220919783
130	NC_011892	CAGCG	2	10	221312	221321	20 %	0 %	40 %	40 %	220919783
131	NC_011892	GTGGC	2	10	224330	224339	0 %	20 %	60 %	20 %	220919786
132	NC_011892	CATCG	2	10	224737	224746	20 %	20 %	20 %	40 %	220919786
133	NC_011892	CTGAT	2	10	225971	225980	20 %	40 %	20 %	20 %	220919787
134	NC_011892	GCGCC	2	10	228082	228091	0 %	0 %	40 %	60 %	220919789
135	NC_011892	CCGGC	2	10	229559	229568	0 %	0 %	40 %	60 %	220919790
136	NC_011892	CGCTG	2	10	232468	232477	0 %	20 %	40 %	40 %	220919793
137	NC_011892	ACCGA	2	10	233246	233255	40 %	0 %	20 %	40 %	220919793
138	NC_011892	GCGCA	2	10	235935	235944	20 %	0 %	40 %	40 %	220919795
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141	NC_011892	CCGTT	2	10	241920	241929	0 %	40 %	20 %	40 %	220919797
142	NC_011892	GACCA	2	10	245126	245135	40 %	0 %	20 %	40 %	220919800
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148	NC_011892	CACGG	2	10	256535	256544	20 %	0 %	40 %	40 %	220919812
149	NC_011892	CGAAG	2	10	262819	262828	40 %	0 %	40 %	20 %	220919816
150	NC_011892	GTCCT	2	10	264036	264045	0 %	40 %	20 %	40 %	220919816
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152	NC_011892	GAGAA	2	10	266438	266447	60 %	0 %	40 %	0 %	220919818
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157	NC_011892	GCGCG	3	15	269771	269785	0 %	0 %	60 %	40 %	220919820
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161	NC_011892	GGTCA	2	10	273593	273602	20 %	20 %	40 %	20 %	220919822
162	NC_011892	ATCGC	2	10	274491	274500	20 %	20 %	20 %	40 %	220919822
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164	NC_011892	ATGCC	2	10	284143	284152	20 %	20 %	20 %	40 %	220919827
165	NC_011892	TCCCC	2	10	285711	285720	0 %	20 %	0 %	80 %	220919828
166	NC_011892	AGGCG	2	10	287120	287129	20 %	0 %	60 %	20 %	220919829
167	NC_011892	CCCTG	2	10	292439	292448	0 %	20 %	20 %	60 %	220919831
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169	NC_011892	GCGCC	2	10	295111	295120	0 %	0 %	40 %	60 %	220919833
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251	NC_011892	CCGCG	2	10	392608	392617	0 %	0 %	40 %	60 %	220919914
252	NC_011892	AGCGA	2	10	393398	393407	40 %	0 %	40 %	20 %	220919915
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261	NC_011892	GGTTG	2	10	407594	407603	0 %	40 %	60 %	0 %	220919928
262	NC_011892	GAGCG	2	10	407981	407990	20 %	0 %	60 %	20 %	220919928
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307	NC_011892	GCCCA	2	10	485425	485434	20 %	0 %	20 %	60 %	220919995
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.