MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Methylobacterium nodulans ORS 2060 plasmid pMNOD05

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011888	TGGA	2	8	1095	1102	25 %	25 %	50 %	0 %	220915081
2	NC_011888	CGCC	2	8	1468	1475	0 %	0 %	25 %	75 %	220915082
3	NC_011888	GTAA	2	8	1671	1678	50 %	25 %	25 %	0 %	220915082
4	NC_011888	GGCC	2	8	1766	1773	0 %	0 %	50 %	50 %	220915082
5	NC_011888	CCGC	2	8	1905	1912	0 %	0 %	25 %	75 %	220915083
6	NC_011888	GCCG	2	8	1945	1952	0 %	0 %	50 %	50 %	220915083
7	NC_011888	GCCG	2	8	2293	2300	0 %	0 %	50 %	50 %	220915083
8	NC_011888	GCCG	2	8	3378	3385	0 %	0 %	50 %	50 %	220915083
9	NC_011888	CCGG	2	8	3552	3559	0 %	0 %	50 %	50 %	220915083
10	NC_011888	GCGG	2	8	4047	4054	0 %	0 %	75 %	25 %	220915083
11	NC_011888	GCTT	2	8	4289	4296	0 %	50 %	25 %	25 %	220915083
12	NC_011888	ACTC	2	8	4350	4357	25 %	25 %	0 %	50 %	220915083
13	NC_011888	CCGT	2	8	4568	4575	0 %	25 %	25 %	50 %	220915084
14	NC_011888	TCGA	2	8	4691	4698	25 %	25 %	25 %	25 %	220915085
15	NC_011888	TCCA	2	8	5029	5036	25 %	25 %	0 %	50 %	220915085
16	NC_011888	GCCG	2	8	5055	5062	0 %	0 %	50 %	50 %	220915085
17	NC_011888	GAGG	2	8	5332	5339	25 %	0 %	75 %	0 %	220915085
18	NC_011888	TGAT	2	8	5851	5858	25 %	50 %	25 %	0 %	220915087
19	NC_011888	CCTT	2	8	5998	6005	0 %	50 %	0 %	50 %	220915087
20	NC_011888	TGAT	2	8	6701	6708	25 %	50 %	25 %	0 %	220915087
21	NC_011888	TCGA	2	8	7853	7860	25 %	25 %	25 %	25 %	220915089
22	NC_011888	GCCG	2	8	8116	8123	0 %	0 %	50 %	50 %	220915089
23	NC_011888	GGTG	2	8	8372	8379	0 %	25 %	75 %	0 %	220915089
24	NC_011888	CGGG	2	8	8493	8500	0 %	0 %	75 %	25 %	220915089
25	NC_011888	TGTC	2	8	9142	9149	0 %	50 %	25 %	25 %	220915091
26	NC_011888	AGGT	2	8	9481	9488	25 %	25 %	50 %	0 %	220915091
27	NC_011888	CGCC	2	8	9529	9536	0 %	0 %	25 %	75 %	220915091
28	NC_011888	AGTC	2	8	9665	9672	25 %	25 %	25 %	25 %	220915091
29	NC_011888	CGTC	2	8	10177	10184	0 %	25 %	25 %	50 %	220915092
30	NC_011888	CCCG	2	8	10303	10310	0 %	0 %	25 %	75 %	220915092
31	NC_011888	CGCC	2	8	10493	10500	0 %	0 %	25 %	75 %	220915092
32	NC_011888	ACTC	2	8	10690	10697	25 %	25 %	0 %	50 %	220915092
33	NC_011888	GACG	2	8	11690	11697	25 %	0 %	50 %	25 %	220915094
34	NC_011888	GCTC	2	8	12453	12460	0 %	25 %	25 %	50 %	220915095
35	NC_011888	GCGA	2	8	12601	12608	25 %	0 %	50 %	25 %	220915095
36	NC_011888	AGCG	2	8	13129	13136	25 %	0 %	50 %	25 %	220915095
37	NC_011888	AAGA	2	8	13880	13887	75 %	0 %	25 %	0 %	220915096
38	NC_011888	AATA	2	8	14133	14140	75 %	25 %	0 %	0 %	220915096
39	NC_011888	GGAC	2	8	15015	15022	25 %	0 %	50 %	25 %	220915097
40	NC_011888	CGAT	2	8	15041	15048	25 %	25 %	25 %	25 %	220915097
41	NC_011888	ATTC	2	8	16342	16349	25 %	50 %	0 %	25 %	220915098
42	NC_011888	ACCG	2	8	18305	18312	25 %	0 %	25 %	50 %	220915099
43	NC_011888	TCGG	2	8	18414	18421	0 %	25 %	50 %	25 %	220915099
44	NC_011888	TTCC	2	8	18686	18693	0 %	50 %	0 %	50 %	220915099
45	NC_011888	TGCT	2	8	19122	19129	0 %	50 %	25 %	25 %	220915099
46	NC_011888	CGAA	2	8	19418	19425	50 %	0 %	25 %	25 %	220915100
47	NC_011888	CCGG	2	8	19460	19467	0 %	0 %	50 %	50 %	220915100
48	NC_011888	CGCC	2	8	19489	19496	0 %	0 %	25 %	75 %	220915100

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.