MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methylobacterium nodulans ORS 2060 plasmid pMNOD05

Total Repeats: 221

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011888	ATC	2	6	745	750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915081
2	NC_011888	GCG	2	6	808	813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915081
3	NC_011888	CCT	2	6	885	890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220915081
4	NC_011888	TCG	2	6	983	988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915081
5	NC_011888	CAT	2	6	1011	1016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915081
6	NC_011888	TCG	2	6	1040	1045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915081
7	NC_011888	AAG	2	6	1121	1126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220915081
8	NC_011888	ACC	2	6	1573	1578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220915082
9	NC_011888	TCC	2	6	1608	1613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220915082
10	NC_011888	GCG	2	6	1713	1718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915082
11	NC_011888	CCG	2	6	1965	1970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915083
12	NC_011888	CGT	2	6	2013	2018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915083
13	NC_011888	TCG	2	6	2093	2098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915083
14	NC_011888	GCC	2	6	2194	2199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915083
15	NC_011888	CCG	4	12	2232	2243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915083
16	NC_011888	CCG	2	6	2451	2456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915083
17	NC_011888	ATG	2	6	2666	2671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915083
18	NC_011888	GCC	2	6	2728	2733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915083
19	NC_011888	GGC	3	9	2746	2754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915083
20	NC_011888	TCG	2	6	2786	2791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915083
21	NC_011888	GCG	2	6	2816	2821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915083
22	NC_011888	GGT	2	6	2845	2850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220915083
23	NC_011888	GCC	4	12	2878	2889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915083
24	NC_011888	CGA	2	6	2943	2948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915083
25	NC_011888	GAG	2	6	2983	2988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220915083
26	NC_011888	AGG	2	6	3020	3025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220915083
27	NC_011888	GCC	2	6	3038	3043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915083
28	NC_011888	TGT	2	6	3104	3109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220915083
29	NC_011888	CGT	2	6	3148	3153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915083
30	NC_011888	GCG	2	6	3170	3175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915083
31	NC_011888	GCG	2	6	3316	3321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915083
32	NC_011888	GCG	2	6	3341	3346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915083
33	NC_011888	ACG	3	9	3362	3370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915083
34	NC_011888	CTC	2	6	3427	3432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220915083
35	NC_011888	CGG	2	6	3571	3576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915083
36	NC_011888	TCG	2	6	3584	3589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915083
37	NC_011888	AAG	2	6	3631	3636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220915083
38	NC_011888	CGC	2	6	3676	3681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915083
39	NC_011888	CCG	2	6	3705	3710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915083
40	NC_011888	TCG	2	6	3719	3724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915083
41	NC_011888	CCG	2	6	3762	3767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915083
42	NC_011888	ACG	2	6	3869	3874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915083
43	NC_011888	GCG	2	6	3968	3973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915083
44	NC_011888	CGG	2	6	3975	3980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915083
45	NC_011888	AGC	2	6	3998	4003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915083
46	NC_011888	GCC	2	6	4205	4210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915083
47	NC_011888	CGG	2	6	4246	4251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915083
48	NC_011888	CGC	2	6	4314	4319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915083
49	NC_011888	CCA	2	6	4372	4377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220915084
50	NC_011888	GGC	2	6	4427	4432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915084
51	NC_011888	TGA	2	6	4438	4443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915084
52	NC_011888	CCA	2	6	4449	4454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220915084
53	NC_011888	GCC	3	9	4648	4656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915084
54	NC_011888	ACA	2	6	4778	4783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220915085
55	NC_011888	GAG	2	6	4813	4818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220915085
56	NC_011888	CCA	2	6	4909	4914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220915085
57	NC_011888	CGC	2	6	4976	4981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915085
58	NC_011888	CGC	2	6	4992	4997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915085
59	NC_011888	GAG	2	6	5065	5070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220915085
60	NC_011888	GGC	2	6	5071	5076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915085
61	NC_011888	ACG	2	6	5081	5086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915085
62	NC_011888	CTC	2	6	5149	5154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220915085
63	NC_011888	CCG	2	6	5180	5185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915085
64	NC_011888	TGG	3	9	5195	5203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220915085
65	NC_011888	GCT	2	6	5289	5294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915085
66	NC_011888	GCC	2	6	5321	5326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915085
67	NC_011888	GAG	2	6	5400	5405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220915086
68	NC_011888	GCG	2	6	5412	5417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915086
69	NC_011888	GCC	2	6	5512	5517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915086
70	NC_011888	TCA	2	6	5539	5544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915086
71	NC_011888	GTT	2	6	5547	5552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220915086
72	NC_011888	TCG	2	6	5829	5834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915087
73	NC_011888	TCG	2	6	5874	5879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915087
74	NC_011888	TGC	2	6	5976	5981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915087
75	NC_011888	TGG	2	6	6103	6108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220915087
76	NC_011888	AAC	2	6	6152	6157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220915087
77	NC_011888	GTC	2	6	6168	6173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915087
78	NC_011888	CCA	2	6	6206	6211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220915087
79	NC_011888	TCA	2	6	6357	6362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915087
80	NC_011888	TTG	2	6	6474	6479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220915087
81	NC_011888	GTC	2	6	6515	6520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915087
82	NC_011888	TCT	2	6	6738	6743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220915087
83	NC_011888	GCG	2	6	6813	6818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915087
84	NC_011888	CCA	2	6	6869	6874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220915087
85	NC_011888	TTG	2	6	6933	6938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220915087
86	NC_011888	GCA	2	6	6976	6981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915087
87	NC_011888	CCG	2	6	7036	7041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915088
88	NC_011888	TCG	2	6	7045	7050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915088
89	NC_011888	GCG	2	6	7086	7091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915088
90	NC_011888	CGC	2	6	7163	7168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915088
91	NC_011888	TCG	2	6	7246	7251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915088
92	NC_011888	GAG	2	6	7838	7843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220915089
93	NC_011888	GCG	2	6	7846	7851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915089
94	NC_011888	CGG	2	6	7893	7898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915089
95	NC_011888	CGC	2	6	7987	7992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915089
96	NC_011888	CGG	2	6	7995	8000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915089
97	NC_011888	CGG	2	6	8009	8014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915089
98	NC_011888	GCC	2	6	8058	8063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915089
99	NC_011888	GGT	2	6	8067	8072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220915089
100	NC_011888	AGC	2	6	8078	8083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915089
101	NC_011888	GGC	2	6	8101	8106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915089
102	NC_011888	CGC	2	6	8197	8202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915089
103	NC_011888	GAG	2	6	8276	8281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220915089
104	NC_011888	CGT	2	6	8323	8328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915089
105	NC_011888	AAG	2	6	8402	8407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220915089
106	NC_011888	GCC	2	6	8865	8870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915090
107	NC_011888	CGG	2	6	8976	8981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915090
108	NC_011888	TGC	2	6	8995	9000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915090
109	NC_011888	GCC	2	6	9001	9006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915090
110	NC_011888	GGC	2	6	9030	9035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915090
111	NC_011888	TGA	2	6	9056	9061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915090
112	NC_011888	TCG	2	6	9073	9078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915090
113	NC_011888	GCG	2	6	9187	9192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915091
114	NC_011888	GCG	2	6	9253	9258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915091
115	NC_011888	TGA	2	6	9371	9376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915091
116	NC_011888	CCT	2	6	9413	9418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220915091
117	NC_011888	GGC	2	6	9504	9509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915091
118	NC_011888	GAT	2	6	9543	9548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915091
119	NC_011888	TCG	2	6	9641	9646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915091
120	NC_011888	TCG	2	6	9685	9690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915091
121	NC_011888	ATG	2	6	9730	9735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915091
122	NC_011888	GCC	2	6	9768	9773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915091
123	NC_011888	GCC	2	6	9780	9785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915091
124	NC_011888	ACG	2	6	9787	9792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915091
125	NC_011888	GGC	2	6	9924	9929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915092
126	NC_011888	CAG	2	6	9933	9938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915092
127	NC_011888	CGA	2	6	10159	10164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915092
128	NC_011888	TCG	2	6	10222	10227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915092
129	NC_011888	GTT	2	6	10427	10432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220915092
130	NC_011888	GGC	2	6	10567	10572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915092
131	NC_011888	CTG	2	6	10912	10917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915093
132	NC_011888	CTC	2	6	10967	10972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220915093
133	NC_011888	TCC	2	6	10983	10988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220915093
134	NC_011888	GGC	2	6	11030	11035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915093
135	NC_011888	TCG	2	6	11106	11111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915093
136	NC_011888	ACG	2	6	11112	11117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915093
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.