MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 54164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_011832	GGC	2	6	346599	346604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850991
7002	NC_011832	CGGT	2	8	346639	346646	0 %	25 %	50 %	25 %	219850991
7003	NC_011832	TCA	2	6	346670	346675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850991
7004	NC_011832	CGA	2	6	346679	346684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850991
7005	NC_011832	GCC	2	6	346748	346753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850991
7006	NC_011832	CTC	2	6	346755	346760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850991
7007	NC_011832	CTG	2	6	346874	346879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850991
7008	NC_011832	TAAAAG	2	12	347312	347323	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	219850992
7009	NC_011832	A	6	6	347326	347331	100 %	0 %	0 %	0 %	219850992
7010	NC_011832	TGA	2	6	347370	347375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850992
7011	NC_011832	GAT	2	6	347437	347442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850992
7012	NC_011832	GAA	3	9	347511	347519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850992
7013	NC_011832	T	6	6	347589	347594	0 %	100 %	0 %	0 %	219850993
7014	NC_011832	TCA	2	6	347650	347655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850993
7015	NC_011832	TCC	2	6	347683	347688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850993
7016	NC_011832	TAAAAG	2	12	348010	348021	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	219850994
7017	NC_011832	TGA	2	6	348068	348073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850994
7018	NC_011832	GAT	2	6	348135	348140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850994
7019	NC_011832	GAA	3	9	348209	348217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850994
7020	NC_011832	CTGAT	2	10	348239	348248	20 %	40 %	20 %	20 %	219850995
7021	NC_011832	T	6	6	348286	348291	0 %	100 %	0 %	0 %	219850995
7022	NC_011832	TCA	2	6	348347	348352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850995
7023	NC_011832	TCT	2	6	348381	348386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850995
7024	NC_011832	GTAC	2	8	348812	348819	25 %	25 %	25 %	25 %	219850996
7025	NC_011832	GTGA	2	8	348836	348843	25 %	25 %	50 %	0 %	219850996
7026	NC_011832	CCT	2	6	348904	348909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850996
7027	NC_011832	GCT	2	6	348910	348915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850996
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7029	NC_011832	CTG	2	6	349018	349023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850996
7030	NC_011832	TCT	2	6	349036	349041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850996
7031	NC_011832	GGGT	2	8	349051	349058	0 %	25 %	75 %	0 %	219850996
7032	NC_011832	CTG	2	6	349073	349078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850996
7033	NC_011832	CAG	2	6	349322	349327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850996
7034	NC_011832	CTG	2	6	349345	349350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850996
7035	NC_011832	AAG	2	6	349352	349357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850996
7036	NC_011832	CAG	3	9	349364	349372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850996
7037	NC_011832	ATC	2	6	349379	349384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850996
7038	NC_011832	CCTGAT	2	12	349396	349407	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219850996
7039	NC_011832	TCCA	2	8	349436	349443	25 %	25 %	0 %	50 %	219850996
7040	NC_011832	CTG	2	6	349460	349465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850996
7041	NC_011832	GAT	2	6	349507	349512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850996
7042	NC_011832	CTG	2	6	349547	349552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850996
7043	NC_011832	CCG	2	6	349599	349604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850996
7044	NC_011832	GGCC	2	8	349673	349680	0 %	0 %	50 %	50 %	219850996
7045	NC_011832	GAG	3	9	349695	349703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850996
7046	NC_011832	GTC	2	6	349707	349712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850996
7047	NC_011832	TGG	2	6	349736	349741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850996
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7053	NC_011832	ATC	2	6	349909	349914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850997
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7055	NC_011832	CCT	2	6	349973	349978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850997
7056	NC_011832	GGT	2	6	350043	350048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850997
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7058	NC_011832	ATC	2	6	350062	350067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850997
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7062	NC_011832	GCCG	2	8	350187	350194	0 %	0 %	50 %	50 %	219850997
7063	NC_011832	GAG	2	6	350244	350249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850997
7064	NC_011832	GCAC	2	8	350264	350271	25 %	0 %	25 %	50 %	219850997
7065	NC_011832	CAG	2	6	350286	350291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850997
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7071	NC_011832	ACC	2	6	350557	350562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850997
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7105	NC_011832	CAGC	2	8	351856	351863	25 %	0 %	25 %	50 %	219850999
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7107	NC_011832	CTC	2	6	352027	352032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850999
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7110	NC_011832	GATCTC	2	12	352234	352245	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219850999
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7112	NC_011832	TC	3	6	352273	352278	0 %	50 %	0 %	50 %	219850999
7113	NC_011832	AGTG	2	8	352280	352287	25 %	25 %	50 %	0 %	219850999
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7120	NC_011832	ACTG	2	8	353062	353069	25 %	25 %	25 %	25 %	219851000
7121	NC_011832	AAG	2	6	353087	353092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851000
7122	NC_011832	ATC	2	6	353210	353215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851000
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7158	NC_011832	CGG	2	6	355142	355147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851002
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7230	NC_011832	CGAT	2	8	358966	358973	25 %	25 %	25 %	25 %	219851008
7231	NC_011832	TTGC	2	8	359028	359035	0 %	50 %	25 %	25 %	219851008
7232	NC_011832	GAC	2	6	359085	359090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851008
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7235	NC_011832	CCTC	2	8	359189	359196	0 %	25 %	0 %	75 %	219851008
7236	NC_011832	GACT	2	8	359249	359256	25 %	25 %	25 %	25 %	219851008
7237	NC_011832	GTC	4	12	359280	359291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851008
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7240	NC_011832	CAA	2	6	359363	359368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219851008
7241	NC_011832	GGGGA	2	10	359472	359481	20 %	0 %	80 %	0 %	219851008
7242	NC_011832	GGC	2	6	359648	359653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851009
7243	NC_011832	GAA	2	6	359679	359684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851009
7244	NC_011832	GAA	2	6	359731	359736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851009
7245	NC_011832	GCA	2	6	359808	359813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851009
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7249	NC_011832	CAT	2	6	359905	359910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851009
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7254	NC_011832	CT	3	6	360267	360272	0 %	50 %	0 %	50 %	219851010
7255	NC_011832	CGGT	2	8	360379	360386	0 %	25 %	50 %	25 %	219851010
7256	NC_011832	GCA	2	6	360413	360418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851010
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7259	NC_011832	GATT	2	8	360554	360561	25 %	50 %	25 %	0 %	219851010
7260	NC_011832	CTG	2	6	360565	360570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851011
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7264	NC_011832	TCT	2	6	360696	360701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851011
7265	NC_011832	AGC	2	6	360732	360737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851011
7266	NC_011832	GTG	2	6	360832	360837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851011
7267	NC_011832	CTG	2	6	360880	360885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851011
7268	NC_011832	CATC	2	8	360898	360905	25 %	25 %	0 %	50 %	219851011
7269	NC_011832	TAC	2	6	361023	361028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851012
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7272	NC_011832	TGG	2	6	361192	361197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851012
7273	NC_011832	CGATGG	2	12	361204	361215	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	219851012
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7276	NC_011832	CTG	2	6	361433	361438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851012
7277	NC_011832	CTG	2	6	361454	361459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851012
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7284	NC_011832	TCC	2	6	361767	361772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851012
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7344	NC_011832	GAA	2	6	366500	366505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851015
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7346	NC_011832	CGT	2	6	366550	366555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851015
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7349	NC_011832	GGTTG	2	10	366587	366596	0 %	40 %	60 %	0 %	219851015
7350	NC_011832	TCG	2	6	366618	366623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851015
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7353	NC_011832	GCC	2	6	366701	366706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851015
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7355	NC_011832	AGG	2	6	366756	366761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851015
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7357	NC_011832	CGAGGG	2	12	366805	366816	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	219851015
7358	NC_011832	CCCG	2	8	366855	366862	0 %	0 %	25 %	75 %	219851015
7359	NC_011832	TGG	3	9	366916	366924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851015
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7361	NC_011832	ACG	2	6	367029	367034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851015
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7485	NC_011832	TACT	2	8	373255	373262	25 %	50 %	0 %	25 %	219851022
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