MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 54164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_011832	GCC	2	6	321442	321447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850962
6502	NC_011832	CCA	2	6	321495	321500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850962
6503	NC_011832	GGCA	2	8	321502	321509	25 %	0 %	50 %	25 %	219850962
6504	NC_011832	GAG	2	6	321536	321541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850962
6505	NC_011832	AGGTGC	2	12	321564	321575	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	219850962
6506	NC_011832	ATC	2	6	321650	321655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850962
6507	NC_011832	AGG	2	6	321693	321698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850962
6508	NC_011832	GCA	2	6	321756	321761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850962
6509	NC_011832	ATC	2	6	321857	321862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850962
6510	NC_011832	GCTG	2	8	322003	322010	0 %	25 %	50 %	25 %	219850962
6511	NC_011832	AGA	2	6	322014	322019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850962
6512	NC_011832	GAAG	2	8	322024	322031	50 %	0 %	50 %	0 %	219850962
6513	NC_011832	TTC	2	6	322098	322103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850963
6514	NC_011832	C	6	6	322105	322110	0 %	0 %	0 %	100 %	219850963
6515	NC_011832	CTG	2	6	322117	322122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850963
6516	NC_011832	GA	3	6	322165	322170	50 %	0 %	50 %	0 %	219850963
6517	NC_011832	GT	3	6	322211	322216	0 %	50 %	50 %	0 %	219850963
6518	NC_011832	TCT	2	6	322255	322260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850963
6519	NC_011832	CGTT	2	8	322266	322273	0 %	50 %	25 %	25 %	219850963
6520	NC_011832	GGA	2	6	322310	322315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850963
6521	NC_011832	ATCC	2	8	322407	322414	25 %	25 %	0 %	50 %	219850963
6522	NC_011832	GATC	2	8	322475	322482	25 %	25 %	25 %	25 %	219850963
6523	NC_011832	CTT	2	6	322508	322513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850963
6524	NC_011832	G	6	6	322624	322629	0 %	0 %	100 %	0 %	219850963
6525	NC_011832	ACT	2	6	322630	322635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850963
6526	NC_011832	CGC	2	6	322736	322741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850963
6527	NC_011832	GAT	2	6	322742	322747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850963
6528	NC_011832	CAG	2	6	322818	322823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850963
6529	NC_011832	ATC	2	6	322837	322842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850963
6530	NC_011832	GCAGA	2	10	322860	322869	40 %	0 %	40 %	20 %	219850963
6531	NC_011832	GT	3	6	322923	322928	0 %	50 %	50 %	0 %	219850963
6532	NC_011832	GA	3	6	322932	322937	50 %	0 %	50 %	0 %	219850963
6533	NC_011832	AGA	2	6	322981	322986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850964
6534	NC_011832	GGCAT	2	10	322996	323005	20 %	20 %	40 %	20 %	219850964
6535	NC_011832	CCGG	2	8	323027	323034	0 %	0 %	50 %	50 %	219850964
6536	NC_011832	GAT	2	6	323095	323100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850964
6537	NC_011832	ACCT	2	8	323117	323124	25 %	25 %	0 %	50 %	219850964
6538	NC_011832	CTCG	2	8	323125	323132	0 %	25 %	25 %	50 %	219850964
6539	NC_011832	CGA	2	6	323137	323142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850964
6540	NC_011832	GAG	2	6	323165	323170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850964
6541	NC_011832	TCT	2	6	323223	323228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850964
6542	NC_011832	TGGG	2	8	323232	323239	0 %	25 %	75 %	0 %	219850964
6543	NC_011832	GATCA	2	10	323279	323288	40 %	20 %	20 %	20 %	219850964
6544	NC_011832	AAG	2	6	323357	323362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850964
6545	NC_011832	CGA	2	6	323364	323369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850964
6546	NC_011832	CGA	2	6	323377	323382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850964
6547	NC_011832	GTG	2	6	323402	323407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850964
6548	NC_011832	CGA	2	6	323416	323421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850964
6549	NC_011832	GGT	2	6	323428	323433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850964
6550	NC_011832	CGCT	2	8	323465	323472	0 %	25 %	25 %	50 %	219850964
6551	NC_011832	GTC	2	6	323482	323487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850964
6552	NC_011832	GCTCG	2	10	323533	323542	0 %	20 %	40 %	40 %	219850964
6553	NC_011832	CCG	2	6	323596	323601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850964
6554	NC_011832	TGA	2	6	323628	323633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850964
6555	NC_011832	CCT	2	6	323646	323651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850964
6556	NC_011832	CTC	2	6	323708	323713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850964
6557	NC_011832	CGA	2	6	323749	323754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850964
6558	NC_011832	TAT	2	6	323768	323773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219850964
6559	NC_011832	TGA	2	6	323892	323897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850964
6560	NC_011832	GAT	2	6	323926	323931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850964
6561	NC_011832	GAT	2	6	323945	323950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850964
6562	NC_011832	TTC	2	6	323975	323980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850964
6563	NC_011832	ACCG	2	8	323993	324000	25 %	0 %	25 %	50 %	219850964
6564	NC_011832	GAG	2	6	324029	324034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850964
6565	NC_011832	GGGA	2	8	324129	324136	25 %	0 %	75 %	0 %	219850964
6566	NC_011832	CGGC	2	8	324145	324152	0 %	0 %	50 %	50 %	219850964
6567	NC_011832	GGA	2	6	324178	324183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850964
6568	NC_011832	CGGCC	2	10	324199	324208	0 %	0 %	40 %	60 %	219850964
6569	NC_011832	ACCT	2	8	324308	324315	25 %	25 %	0 %	50 %	219850964
6570	NC_011832	GCG	2	6	324326	324331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850964
6571	NC_011832	GGC	2	6	324334	324339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850964
6572	NC_011832	GAG	2	6	324350	324355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850964
6573	NC_011832	GCC	2	6	324356	324361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850964
6574	NC_011832	GAC	2	6	324376	324381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850964
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6576	NC_011832	ATGCG	2	10	324438	324447	20 %	20 %	40 %	20 %	219850964
6577	NC_011832	AGA	2	6	324468	324473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850964
6578	NC_011832	CTGT	2	8	324661	324668	0 %	50 %	25 %	25 %	219850965
6579	NC_011832	TTG	2	6	324696	324701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219850965
6580	NC_011832	CGCAT	2	10	324702	324711	20 %	20 %	20 %	40 %	219850965
6581	NC_011832	GCAG	2	8	324738	324745	25 %	0 %	50 %	25 %	219850965
6582	NC_011832	CCTG	2	8	324751	324758	0 %	25 %	25 %	50 %	219850965
6583	NC_011832	TGG	2	6	324784	324789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850965
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6586	NC_011832	TGC	2	6	324945	324950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850965
6587	NC_011832	TCCA	2	8	324959	324966	25 %	25 %	0 %	50 %	219850965
6588	NC_011832	TGA	2	6	324985	324990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850965
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6592	NC_011832	TCC	2	6	325107	325112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850965
6593	NC_011832	TCG	2	6	325117	325122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850965
6594	NC_011832	CCGGTG	2	12	325143	325154	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219850965
6595	NC_011832	GAT	2	6	325199	325204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850965
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6599	NC_011832	CCGC	2	8	325513	325520	0 %	0 %	25 %	75 %	219850966
6600	NC_011832	GAT	2	6	325540	325545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850966
6601	NC_011832	GAC	2	6	325549	325554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850966
6602	NC_011832	CT	3	6	325563	325568	0 %	50 %	0 %	50 %	219850966
6603	NC_011832	GAC	2	6	325573	325578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850966
6604	NC_011832	CTC	3	9	325579	325587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850966
6605	NC_011832	AGC	2	6	325592	325597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850966
6606	NC_011832	CGA	2	6	325635	325640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850966
6607	NC_011832	AGC	2	6	325652	325657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850966
6608	NC_011832	C	6	6	325659	325664	0 %	0 %	0 %	100 %	219850966
6609	NC_011832	CAGC	2	8	325698	325705	25 %	0 %	25 %	50 %	219850966
6610	NC_011832	AGG	2	6	325794	325799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850966
6611	NC_011832	TGA	2	6	325830	325835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850966
6612	NC_011832	TTC	2	6	325870	325875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850966
6613	NC_011832	TGAA	2	8	326572	326579	50 %	25 %	25 %	0 %	219850967
6614	NC_011832	AGAGA	2	10	326585	326594	60 %	0 %	40 %	0 %	219850967
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6617	NC_011832	AG	3	6	326627	326632	50 %	0 %	50 %	0 %	219850967
6618	NC_011832	CGA	2	6	326711	326716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850967
6619	NC_011832	AGA	2	6	326722	326727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850967
6620	NC_011832	CAGTC	2	10	326758	326767	20 %	20 %	20 %	40 %	219850967
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6622	NC_011832	GAG	2	6	326817	326822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850967
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6985	NC_011832	TAA	2	6	346077	346082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219850990
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