MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methylobacterium extorquens CM4 plasmid pMCHL02

Total Repeats: 280

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011760	GAT	2	6	336	341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218534718
2	NC_011760	TCC	2	6	362	367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218534718
3	NC_011760	CTC	2	6	384	389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218534718
4	NC_011760	AGC	2	6	397	402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534718
5	NC_011760	GGT	2	6	438	443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218534718
6	NC_011760	CCG	2	6	472	477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534718
7	NC_011760	GGC	2	6	485	490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534718
8	NC_011760	GCG	2	6	559	564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534718
9	NC_011760	GGC	2	6	588	593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534718
10	NC_011760	GCG	4	12	597	608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534718
11	NC_011760	TCA	2	6	1245	1250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218534719
12	NC_011760	GGC	2	6	1363	1368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534719
13	NC_011760	CCG	2	6	1377	1382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534719
14	NC_011760	TCG	2	6	1482	1487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534719
15	NC_011760	GGA	2	6	1630	1635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218534720
16	NC_011760	CCT	2	6	1705	1710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218534720
17	NC_011760	GCT	2	6	1819	1824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534720
18	NC_011760	GGC	2	6	1930	1935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534720
19	NC_011760	TCG	2	6	1964	1969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534720
20	NC_011760	CGG	2	6	1973	1978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534720
21	NC_011760	CTT	2	6	2128	2133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218534721
22	NC_011760	GGT	2	6	2250	2255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218534721
23	NC_011760	GAC	2	6	2258	2263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534721
24	NC_011760	GGC	2	6	2266	2271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534721
25	NC_011760	CGG	2	6	2290	2295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534721
26	NC_011760	ACG	2	6	2345	2350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534721
27	NC_011760	ACA	2	6	2394	2399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218534721
28	NC_011760	GCG	3	9	2464	2472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534721
29	NC_011760	CGG	2	6	2489	2494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534721
30	NC_011760	GAG	2	6	2630	2635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218534722
31	NC_011760	GCT	3	9	2664	2672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534722
32	NC_011760	TCA	2	6	2754	2759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218534722
33	NC_011760	TCT	2	6	2775	2780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218534722
34	NC_011760	AGC	2	6	2818	2823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534722
35	NC_011760	CGT	2	6	2884	2889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534722
36	NC_011760	GCT	2	6	2909	2914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534722
37	NC_011760	CCG	2	6	2942	2947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534722
38	NC_011760	GAC	2	6	3099	3104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534722
39	NC_011760	CAG	2	6	3105	3110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534722
40	NC_011760	TTA	2	6	3161	3166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218534722
41	NC_011760	AGC	2	6	3361	3366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534722
42	NC_011760	TGT	2	6	3564	3569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218534722
43	NC_011760	AGC	2	6	3625	3630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534722
44	NC_011760	CGG	2	6	3795	3800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534722
45	NC_011760	GTC	2	6	3872	3877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534722
46	NC_011760	GCG	2	6	3890	3895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534722
47	NC_011760	TAT	2	6	4347	4352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218534723
48	NC_011760	GTC	2	6	4386	4391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534723
49	NC_011760	CTG	2	6	4437	4442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534723
50	NC_011760	TCT	2	6	4483	4488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218534723
51	NC_011760	AGA	2	6	4580	4585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218534723
52	NC_011760	CCG	2	6	4958	4963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534724
53	NC_011760	GAT	2	6	5013	5018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218534724
54	NC_011760	TGC	2	6	5035	5040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534724
55	NC_011760	CTT	2	6	5130	5135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218534724
56	NC_011760	CCT	2	6	5147	5152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218534724
57	NC_011760	TGT	2	6	5270	5275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218534724
58	NC_011760	TGA	2	6	5324	5329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218534724
59	NC_011760	ACG	2	6	5368	5373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534724
60	NC_011760	TCG	3	9	5383	5391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534724
61	NC_011760	ATC	2	6	5788	5793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218534725
62	NC_011760	TGC	2	6	5802	5807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534725
63	NC_011760	CCG	2	6	5834	5839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534725
64	NC_011760	ACA	2	6	5867	5872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218534725
65	NC_011760	CGA	2	6	5991	5996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534725
66	NC_011760	GCC	3	9	6010	6018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534725
67	NC_011760	GGA	2	6	7046	7051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218534726
68	NC_011760	CGA	3	9	7053	7061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534726
69	NC_011760	CAG	2	6	7069	7074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534726
70	NC_011760	GCT	2	6	7132	7137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534726
71	NC_011760	GCT	2	6	7168	7173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534726
72	NC_011760	GCG	2	6	7344	7349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534727
73	NC_011760	GCG	2	6	7371	7376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534727
74	NC_011760	CAT	2	6	7561	7566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218534727
75	NC_011760	GAA	2	6	7574	7579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218534727
76	NC_011760	CGA	2	6	7681	7686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534727
77	NC_011760	GTG	2	6	7752	7757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218534727
78	NC_011760	CCT	2	6	7813	7818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218534727
79	NC_011760	GCC	2	6	7824	7829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534727
80	NC_011760	GCG	2	6	7903	7908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534727
81	NC_011760	GCC	2	6	7968	7973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534727
82	NC_011760	CAG	2	6	8048	8053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534727
83	NC_011760	GCG	3	9	8077	8085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534727
84	NC_011760	GCG	3	9	8112	8120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534727
85	NC_011760	CGC	2	6	8191	8196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534727
86	NC_011760	GCA	2	6	8206	8211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534727
87	NC_011760	CGT	2	6	8245	8250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534727
88	NC_011760	CCG	2	6	8265	8270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534727
89	NC_011760	TGA	2	6	8277	8282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218534727
90	NC_011760	CTT	2	6	8369	8374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218534727
91	NC_011760	GGC	2	6	8411	8416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534727
92	NC_011760	CGG	2	6	8561	8566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534728
93	NC_011760	GAT	2	6	8578	8583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218534728
94	NC_011760	TGA	2	6	8598	8603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218534728
95	NC_011760	CTC	2	6	8768	8773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218534729
96	NC_011760	CCG	2	6	8833	8838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534729
97	NC_011760	GAC	2	6	8853	8858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534729
98	NC_011760	GCC	3	9	9150	9158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534730
99	NC_011760	CAT	2	6	9310	9315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218534730
100	NC_011760	GCC	2	6	9410	9415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534730
101	NC_011760	CAC	2	6	9418	9423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218534730
102	NC_011760	CGC	2	6	9512	9517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534731
103	NC_011760	GCC	2	6	9548	9553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534731
104	NC_011760	CCG	2	6	9595	9600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534731
105	NC_011760	GCC	2	6	9617	9622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534731
106	NC_011760	CGC	2	6	9731	9736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534731
107	NC_011760	CGA	2	6	9766	9771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534731
108	NC_011760	TGG	2	6	10246	10251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218534732
109	NC_011760	ACA	2	6	10283	10288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218534732
110	NC_011760	CGA	2	6	10290	10295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534732
111	NC_011760	CGC	3	9	10434	10442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534732
112	NC_011760	GCC	2	6	10492	10497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534732
113	NC_011760	CGG	2	6	10512	10517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534732
114	NC_011760	CCG	2	6	10684	10689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534733
115	NC_011760	TGG	2	6	10790	10795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218534733
116	NC_011760	GAC	2	6	10970	10975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534733
117	NC_011760	TCG	3	9	10986	10994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534733
118	NC_011760	GCT	2	6	10999	11004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534733
119	NC_011760	CGG	2	6	11090	11095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534733
120	NC_011760	CTG	2	6	11195	11200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534733
121	NC_011760	ACG	2	6	11204	11209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534733
122	NC_011760	CGA	2	6	11211	11216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534733
123	NC_011760	TCG	2	6	11304	11309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534733
124	NC_011760	CCG	2	6	11400	11405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534734
125	NC_011760	AGC	2	6	11463	11468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534734
126	NC_011760	CGC	2	6	11507	11512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534734
127	NC_011760	TGG	2	6	11571	11576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218534734
128	NC_011760	GCG	2	6	11593	11598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534734
129	NC_011760	CTG	2	6	11666	11671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534734
130	NC_011760	GAG	2	6	11738	11743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218534734
131	NC_011760	GCG	2	6	11807	11812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534734
132	NC_011760	GCT	2	6	11821	11826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534734
133	NC_011760	GCG	2	6	11852	11857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534734
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163	NC_011760	TGA	2	6	14829	14834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218534740
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253	NC_011760	CGG	2	6	20825	20830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534753
254	NC_011760	GGC	2	6	20887	20892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534753
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257	NC_011760	GGC	2	6	21019	21024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534753
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.