MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium liflandii 128FXT plasmid pMUM002

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011355	GCCTAC	2	12	308	319	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	209418038
2	NC_011355	CCGCAG	2	12	695	706	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	209418038
3	NC_011355	CGCCAG	2	12	3471	3482	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	209418042
4	NC_011355	ATGGGA	2	12	5899	5910	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	209418043
5	NC_011355	CCCGGC	2	12	7668	7679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209418045
6	NC_011355	AGCGCC	2	12	7916	7927	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	209418046
7	NC_011355	CGGCAC	3	18	9136	9153	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	209418048
8	NC_011355	GACCAG	2	12	19191	19202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209418052
9	NC_011355	ACCGTC	2	12	19353	19364	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	209418052
10	NC_011355	CGCGGC	2	12	21636	21647	0 %	0 %	50 %	50 %	209418055
11	NC_011355	ACGCCG	2	12	22061	22072	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	209418055
12	NC_011355	GCACCC	2	12	27041	27052	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	209418059
13	NC_011355	GATCTG	2	12	27439	27450	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	209418060
14	NC_011355	GTAGGG	3	18	29030	29047	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	209418062
15	NC_011355	GGGTAG	2	12	29067	29078	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	209418062
16	NC_011355	CCCCGC	3	18	31038	31055	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	209418064
17	NC_011355	CCCGGC	2	12	32132	32143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209418066
18	NC_011355	GCGGGC	2	12	40683	40694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209418074
19	NC_011355	CCCGAT	2	12	43011	43022	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	209418075
20	NC_011355	AACCGG	2	12	44464	44475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209418076
21	NC_011355	ATCGGG	2	12	47215	47226	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	209418078
22	NC_011355	GGTATT	2	12	50942	50953	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	209418080
23	NC_011355	CGGTGG	2	12	51759	51770	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	209418080
24	NC_011355	GGGTGT	2	12	51933	51944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209418080
25	NC_011355	GGCGGT	2	12	52137	52148	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	209418080
26	NC_011355	TCGGTG	2	12	53903	53914	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	209418080
27	NC_011355	GAACAC	2	12	55252	55263	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	209418080
28	NC_011355	CGGTGG	2	12	57174	57185	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	209418080
29	NC_011355	GGCGGT	2	12	57552	57563	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	209418080
30	NC_011355	TCGGTG	2	12	59318	59329	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	209418080
31	NC_011355	GGCACC	2	12	60292	60303	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	209418080
32	NC_011355	GAACAC	2	12	60667	60678	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	209418080
33	NC_011355	CGGTGG	2	12	62589	62600	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	209418080
34	NC_011355	GGCGGT	2	12	62967	62978	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	209418080
35	NC_011355	TCGGTG	2	12	64733	64744	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	209418080
36	NC_011355	GGCACC	2	12	65707	65718	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	209418080
37	NC_011355	GAACAC	2	12	66082	66093	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	209418080
38	NC_011355	CGGTGG	2	12	68004	68015	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	209418080
39	NC_011355	GGCGGT	2	12	68382	68393	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	209418080
40	NC_011355	TCGGTG	2	12	70154	70165	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	209418080
41	NC_011355	GGCACC	2	12	71128	71139	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	209418080
42	NC_011355	GAACAC	2	12	71503	71514	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	209418080
43	NC_011355	TACATC	2	12	76204	76215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209418080
44	NC_011355	TGGGGG	2	12	76521	76532	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	209418080
45	NC_011355	TACATC	2	12	80827	80838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209418080
46	NC_011355	TGGGGG	2	12	81144	81155	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	209418080
47	NC_011355	CGGTGG	2	12	82668	82679	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	209418080
48	NC_011355	GGCGGT	2	12	83046	83057	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	209418080
49	NC_011355	TCGGTG	2	12	84812	84823	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	209418080
50	NC_011355	GGCACC	2	12	85786	85797	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	209418080
51	NC_011355	GAACAC	2	12	86161	86172	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	209418080
52	NC_011355	GGTGCC	2	12	86911	86922	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	209418080
53	NC_011355	CGCTAC	2	12	87492	87503	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	209418080
54	NC_011355	CTCGAA	2	12	91625	91636	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	209418082
55	NC_011355	TCGGGC	2	12	91704	91715	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	209418082
56	NC_011355	ATCGGG	2	12	92687	92698	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	209418083
57	NC_011355	GGTATT	2	12	97548	97559	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	209418086
58	NC_011355	CGGTGG	2	12	98365	98376	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	209418086
59	NC_011355	GGGTGT	2	12	98539	98550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209418086
60	NC_011355	GGCGGT	2	12	98743	98754	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	209418086
61	NC_011355	TCGGTG	2	12	101457	101468	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	209418086
62	NC_011355	GAACAC	2	12	102806	102817	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	209418086
63	NC_011355	CGGTGG	2	12	105047	105058	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	209418087
64	NC_011355	GGCGGT	2	12	105425	105436	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	209418087
65	NC_011355	TCGGTG	2	12	107191	107202	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	209418087
66	NC_011355	GAACAC	2	12	108540	108551	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	209418087
67	NC_011355	CGGTGG	2	12	110459	110470	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	209418087
68	NC_011355	GGGTGT	2	12	110633	110644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209418087
69	NC_011355	GGCGGT	2	12	110837	110848	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	209418087
70	NC_011355	TCGGTG	2	12	113569	113580	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	209418087
71	NC_011355	GGCACC	2	12	114543	114554	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	209418087
72	NC_011355	GAACAC	2	12	114918	114929	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	209418087
73	NC_011355	CGGTGG	2	12	116840	116851	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	209418087
74	NC_011355	GGCGGT	2	12	117218	117229	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	209418087
75	NC_011355	TCGGTG	2	12	118984	118995	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	209418087
76	NC_011355	GGCACC	2	12	119958	119969	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	209418087
77	NC_011355	GAACAC	2	12	120333	120344	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	209418087
78	NC_011355	TACATC	2	12	125052	125063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209418087
79	NC_011355	TGGGGG	2	12	125369	125380	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	209418087
80	NC_011355	CGGTGG	2	12	126893	126904	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	209418087
81	NC_011355	GGGTGT	2	12	127067	127078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209418087
82	NC_011355	GGCGGT	2	12	127271	127282	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	209418087
83	NC_011355	TCGGTG	2	12	129985	129996	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	209418087
84	NC_011355	GGCACC	2	12	130959	130970	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	209418087
85	NC_011355	GAACAC	2	12	131334	131345	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	209418087
86	NC_011355	CGGTGG	2	12	133235	133246	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	209418087
87	NC_011355	GGCGGT	2	12	133613	133624	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	209418087
88	NC_011355	TCGGTG	2	12	135385	135396	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	209418087
89	NC_011355	GGCACC	2	12	136359	136370	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	209418087
90	NC_011355	GAACAC	2	12	136734	136745	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	209418087
91	NC_011355	CGGTGG	2	12	138656	138667	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	209418087
92	NC_011355	GGCGGT	2	12	139034	139045	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	209418087
93	NC_011355	TCGGTG	2	12	141748	141759	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	209418087
94	NC_011355	GGCACC	2	12	142722	142733	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	209418087
95	NC_011355	GAACAC	2	12	143097	143108	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	209418087
96	NC_011355	CGGTGG	2	12	145016	145027	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	209418087
97	NC_011355	GGCGGT	2	12	145394	145405	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	209418087
98	NC_011355	TCGGTG	2	12	147160	147171	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	209418087
99	NC_011355	GAACAC	2	12	148509	148520	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	209418087
100	NC_011355	CGGTGG	2	12	150428	150439	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	209418087
101	NC_011355	GGCGGT	2	12	150806	150817	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	209418087
102	NC_011355	TCGGTG	2	12	152572	152583	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	209418087
103	NC_011355	GAACAC	2	12	153921	153932	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	209418087
104	NC_011355	GGTGCC	2	12	154653	154664	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	209418087
105	NC_011355	CGCTAC	2	12	155234	155245	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	209418087
106	NC_011355	GCGTTG	2	12	162178	162189	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	209418090
107	NC_011355	CGTTGG	2	12	163502	163513	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	209418091
108	NC_011355	TGCCGG	2	12	167380	167391	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	209418093
109	NC_011355	AGTCAC	2	12	172784	172795	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	209418094
110	NC_011355	TTCGGC	2	12	175768	175779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209418095
111	NC_011355	CAAGTT	2	12	175935	175946	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	209418095
112	NC_011355	GCCCTA	2	12	176393	176404	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	209418096
113	NC_011355	GTTGCT	2	12	183323	183334	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	209418100
114	NC_011355	CCGCAG	2	12	185728	185739	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	209418103
115	NC_011355	CATCGC	2	12	185866	185877	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	209418103
116	NC_011355	CGATGC	2	12	187076	187087	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	209418104
117	NC_011355	GCGTGG	2	12	187461	187472	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	209418104
118	NC_011355	GCTCGA	2	12	189545	189556	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	209418107

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.