MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium marinum M plasmid pMM23

Total Repeats: 421

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010604	CAC	2	6	336	341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184152626
2	NC_010604	GTT	2	6	348	353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152626
3	NC_010604	CGC	2	6	360	365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152626
4	NC_010604	GCC	2	6	398	403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152626
5	NC_010604	CCG	2	6	464	469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152626
6	NC_010604	ACC	2	6	566	571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184152626
7	NC_010604	CCG	2	6	631	636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152626
8	NC_010604	TTC	2	6	654	659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152626
9	NC_010604	ACG	2	6	896	901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152626
10	NC_010604	GCA	2	6	1031	1036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152626
11	NC_010604	CGC	2	6	1046	1051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152626
12	NC_010604	GTG	2	6	1057	1062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152626
13	NC_010604	CCG	2	6	1091	1096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152626
14	NC_010604	CCG	2	6	1110	1115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152626
15	NC_010604	GCA	2	6	1160	1165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152626
16	NC_010604	CGT	2	6	1175	1180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152626
17	NC_010604	AGA	2	6	1242	1247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152626
18	NC_010604	CGA	2	6	1303	1308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152626
19	NC_010604	TAC	2	6	1673	1678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152627
20	NC_010604	CGG	2	6	1695	1700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152627
21	NC_010604	CGG	2	6	1704	1709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152627
22	NC_010604	TAC	2	6	1748	1753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152627
23	NC_010604	CCG	2	6	1788	1793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152627
24	NC_010604	GAC	2	6	1880	1885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152627
25	NC_010604	ACG	2	6	2001	2006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152627
26	NC_010604	GGC	2	6	2146	2151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152627
27	NC_010604	GGC	2	6	2238	2243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152627
28	NC_010604	GCC	2	6	2285	2290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152627
29	NC_010604	ATC	2	6	2294	2299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152627
30	NC_010604	GCG	2	6	2314	2319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152627
31	NC_010604	ACG	2	6	2352	2357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152627
32	NC_010604	CGA	2	6	2476	2481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152627
33	NC_010604	CGA	2	6	2599	2604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152627
34	NC_010604	CAG	2	6	2612	2617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152627
35	NC_010604	GGT	2	6	2662	2667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152627
36	NC_010604	GGC	2	6	2698	2703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152627
37	NC_010604	CGA	2	6	2752	2757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152627
38	NC_010604	GCC	2	6	2834	2839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152627
39	NC_010604	CCG	3	9	2868	2876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152627
40	NC_010604	GAA	2	6	2888	2893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152627
41	NC_010604	CAT	2	6	2899	2904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152627
42	NC_010604	GCC	3	9	2916	2924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152627
43	NC_010604	CGC	3	9	3076	3084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152627
44	NC_010604	ACG	2	6	3087	3092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152627
45	NC_010604	TGG	2	6	3108	3113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152627
46	NC_010604	GTT	2	6	3187	3192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152627
47	NC_010604	GCC	2	6	3195	3200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152627
48	NC_010604	GTC	3	9	3239	3247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152627
49	NC_010604	CCG	3	9	3303	3311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152627
50	NC_010604	CGG	2	6	3367	3372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152627
51	NC_010604	CGG	2	6	3486	3491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152627
52	NC_010604	CCG	2	6	3517	3522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152627
53	NC_010604	CGC	2	6	3595	3600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152627
54	NC_010604	CGA	2	6	3682	3687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152627
55	NC_010604	GCC	2	6	3701	3706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152627
56	NC_010604	GTG	2	6	3737	3742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152627
57	NC_010604	ACC	2	6	3758	3763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184152627
58	NC_010604	CGA	2	6	3877	3882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152627
59	NC_010604	CGC	2	6	3955	3960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152627
60	NC_010604	CCG	2	6	3972	3977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152627
61	NC_010604	CGC	2	6	4142	4147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152627
62	NC_010604	CGA	2	6	4195	4200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152627
63	NC_010604	CGC	2	6	4204	4209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152627
64	NC_010604	CCG	3	9	4218	4226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152627
65	NC_010604	CGA	2	6	4231	4236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152627
66	NC_010604	GCC	2	6	4269	4274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152627
67	NC_010604	ACC	2	6	4275	4280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184152627
68	NC_010604	CGC	2	6	4327	4332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152627
69	NC_010604	TCG	2	6	4368	4373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152627
70	NC_010604	GCC	2	6	4382	4387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152627
71	NC_010604	CTC	2	6	4414	4419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184152627
72	NC_010604	GCA	2	6	4420	4425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152627
73	NC_010604	CGT	2	6	4465	4470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152627
74	NC_010604	GCC	2	6	4481	4486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152627
75	NC_010604	GCC	3	9	4526	4534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152627
76	NC_010604	CGC	3	9	4561	4569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152627
77	NC_010604	TCG	4	12	4647	4658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152627
78	NC_010604	CGC	2	6	4663	4668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152627
79	NC_010604	GCC	2	6	4670	4675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152627
80	NC_010604	CGG	2	6	4692	4697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152627
81	NC_010604	GCG	2	6	4746	4751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152627
82	NC_010604	CTC	2	6	4772	4777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184152627
83	NC_010604	CGC	3	9	4867	4875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152627
84	NC_010604	CCA	2	6	4996	5001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184152628
85	NC_010604	TCG	2	6	5075	5080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152628
86	NC_010604	CAG	2	6	5119	5124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152628
87	NC_010604	GGC	2	6	5179	5184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152628
88	NC_010604	GCG	2	6	5303	5308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152628
89	NC_010604	GAG	2	6	5377	5382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184152628
90	NC_010604	GCC	2	6	5392	5397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152628
91	NC_010604	AGT	2	6	5403	5408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152628
92	NC_010604	AGC	2	6	5567	5572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152628
93	NC_010604	GGT	2	6	5582	5587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152628
94	NC_010604	GAG	2	6	5741	5746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184152629
95	NC_010604	GCC	2	6	5863	5868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152629
96	NC_010604	GCC	2	6	5871	5876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152629
97	NC_010604	CGG	2	6	5885	5890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152629
98	NC_010604	CCG	2	6	5959	5964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152629
99	NC_010604	GTG	2	6	5992	5997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152629
100	NC_010604	TGC	2	6	6037	6042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152629
101	NC_010604	GTG	2	6	6043	6048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152629
102	NC_010604	CCG	2	6	6061	6066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152629
103	NC_010604	ATG	2	6	6193	6198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152629
104	NC_010604	GCA	2	6	6200	6205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152629
105	NC_010604	CAG	2	6	6228	6233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152629
106	NC_010604	GTC	2	6	6255	6260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152629
107	NC_010604	GCA	2	6	6293	6298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152629
108	NC_010604	GCG	2	6	6379	6384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152629
109	NC_010604	CGA	2	6	6425	6430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152629
110	NC_010604	CGT	2	6	6554	6559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152629
111	NC_010604	TGG	2	6	6560	6565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152629
112	NC_010604	GCG	2	6	6643	6648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152629
113	NC_010604	GCC	2	6	6676	6681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152629
114	NC_010604	GCG	2	6	6682	6687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152629
115	NC_010604	CGG	2	6	6689	6694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152629
116	NC_010604	GGC	2	6	6711	6716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152629
117	NC_010604	CGG	2	6	6764	6769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152629
118	NC_010604	GCC	2	6	6796	6801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152629
119	NC_010604	TCG	2	6	6812	6817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152629
120	NC_010604	CGC	2	6	6843	6848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152629
121	NC_010604	GCA	2	6	6893	6898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152629
122	NC_010604	GCG	2	6	6955	6960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152629
123	NC_010604	CCA	2	6	6965	6970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184152629
124	NC_010604	CCG	2	6	7003	7008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152629
125	NC_010604	GGC	2	6	7011	7016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152629
126	NC_010604	CGG	3	9	7074	7082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152629
127	NC_010604	GGT	2	6	7087	7092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152629
128	NC_010604	CGC	2	6	7097	7102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152629
129	NC_010604	GCT	3	9	7117	7125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152629
130	NC_010604	CCA	2	6	7183	7188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184152629
131	NC_010604	CGC	2	6	7229	7234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152629
132	NC_010604	GCC	2	6	7263	7268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152629
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135	NC_010604	CCG	3	9	7357	7365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152629
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381	NC_010604	GCA	2	6	20227	20232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152647
382	NC_010604	CGC	2	6	20237	20242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152648
383	NC_010604	CCG	2	6	20251	20256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152648
384	NC_010604	CCG	2	6	20323	20328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152648
385	NC_010604	AGG	2	6	20410	20415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184152648
386	NC_010604	TCA	2	6	20536	20541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152648
387	NC_010604	CGA	2	6	20552	20557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152648
388	NC_010604	ATC	2	6	21131	21136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152649
389	NC_010604	TCG	2	6	21249	21254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152649
390	NC_010604	ATC	2	6	21281	21286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152649
391	NC_010604	GCT	2	6	21611	21616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152650
392	NC_010604	CTG	2	6	21654	21659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152650
393	NC_010604	CCG	2	6	21703	21708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152650
394	NC_010604	GAC	2	6	21844	21849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152651
395	NC_010604	CGC	2	6	21927	21932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152651
396	NC_010604	CTC	2	6	21940	21945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184152651
397	NC_010604	CGG	2	6	22053	22058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152651
398	NC_010604	GTC	2	6	22078	22083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152651
399	NC_010604	GCG	2	6	22087	22092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152651
400	NC_010604	TGA	2	6	22108	22113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152652
401	NC_010604	CGC	3	9	22123	22131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152652
402	NC_010604	CGG	2	6	22178	22183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152652
403	NC_010604	ACG	2	6	22230	22235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152652
404	NC_010604	TCT	2	6	22258	22263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152652
405	NC_010604	GCG	2	6	22321	22326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152652
406	NC_010604	CGC	2	6	22343	22348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152652
407	NC_010604	CAC	2	6	22471	22476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184152653
408	NC_010604	GTG	2	6	22477	22482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152653
409	NC_010604	CTG	2	6	22538	22543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152653
410	NC_010604	ATC	2	6	22547	22552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152653
411	NC_010604	ATC	2	6	22616	22621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152653
412	NC_010604	CGC	2	6	22635	22640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152653
413	NC_010604	CGC	2	6	22711	22716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152653
414	NC_010604	CTC	2	6	22729	22734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184152653
415	NC_010604	CGC	2	6	22741	22746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152653
416	NC_010604	GCC	2	6	22808	22813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152653
417	NC_010604	CAC	2	6	22834	22839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184152653
418	NC_010604	AGG	2	6	22860	22865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184152654
419	NC_010604	GCC	2	6	23007	23012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152654
420	NC_010604	GGC	2	6	23068	23073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152654
421	NC_010604	AGG	2	6	23098	23103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184152654

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.