MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanococcus maripaludis C7 chromosome

Total Repeats: 20338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009637	TAA	2	6	125	130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401931
2	NC_009637	ACT	2	6	137	142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150401931
3	NC_009637	GAT	2	6	168	173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150401931
4	NC_009637	TAA	2	6	181	186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401931
5	NC_009637	CAT	2	6	211	216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150401931
6	NC_009637	TAT	2	6	217	222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401931
7	NC_009637	AAT	2	6	243	248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401931
8	NC_009637	TGA	2	6	266	271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150401931
9	NC_009637	GAT	2	6	378	383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150401931
10	NC_009637	TGA	2	6	403	408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150401931
11	NC_009637	ATA	2	6	424	429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401931
12	NC_009637	ATA	2	6	435	440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401931
13	NC_009637	GAA	2	6	528	533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150401931
14	NC_009637	ATT	2	6	687	692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401931
15	NC_009637	TAA	2	6	728	733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401931
16	NC_009637	CAA	2	6	740	745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150401931
17	NC_009637	ATT	2	6	755	760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401931
18	NC_009637	GAA	2	6	786	791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150401931
19	NC_009637	ACA	2	6	959	964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150401931
20	NC_009637	TGG	2	6	977	982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150401931
21	NC_009637	TAC	2	6	986	991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150401931
22	NC_009637	ATA	2	6	1006	1011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401931
23	NC_009637	ATT	2	6	1148	1153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401931
24	NC_009637	GAA	2	6	1158	1163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150401931
25	NC_009637	GCT	2	6	1220	1225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150401931
26	NC_009637	TTA	2	6	1276	1281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401931
27	NC_009637	ATG	2	6	1527	1532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150401931
28	NC_009637	TAA	3	9	1700	1708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401931
29	NC_009637	ACA	2	6	1785	1790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150401931
30	NC_009637	CTT	2	6	1795	1800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150401931
31	NC_009637	ATT	2	6	1834	1839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401931
32	NC_009637	ACA	2	6	1884	1889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150401931
33	NC_009637	ATG	2	6	1957	1962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150401931
34	NC_009637	ATT	2	6	2144	2149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401931
35	NC_009637	AAT	2	6	2285	2290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401932
36	NC_009637	TCT	2	6	2293	2298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150401932
37	NC_009637	GTG	2	6	2301	2306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150401932
38	NC_009637	TAA	2	6	2343	2348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401932
39	NC_009637	CAG	2	6	2406	2411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150401932
40	NC_009637	AAT	2	6	2480	2485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401932
41	NC_009637	AAT	2	6	2518	2523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401932
42	NC_009637	AAT	2	6	2641	2646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401932
43	NC_009637	CCA	2	6	2674	2679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150401932
44	NC_009637	TGA	2	6	2743	2748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150401932
45	NC_009637	ATT	2	6	2819	2824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401932
46	NC_009637	ATG	3	9	2856	2864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150401932
47	NC_009637	AGT	2	6	2911	2916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150401932
48	NC_009637	GAA	2	6	2931	2936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150401932
49	NC_009637	ATT	2	6	3041	3046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401932
50	NC_009637	GAT	2	6	3284	3289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150401932
51	NC_009637	GAA	2	6	3314	3319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150401932
52	NC_009637	GAT	2	6	3352	3357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150401932
53	NC_009637	GAA	2	6	3397	3402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150401932
54	NC_009637	ATA	2	6	3456	3461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401932
55	NC_009637	GAT	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150401932
56	NC_009637	TAA	2	6	3510	3515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401932
57	NC_009637	GAA	2	6	3674	3679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150401932
58	NC_009637	TGA	2	6	3694	3699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150401932
59	NC_009637	ATT	2	6	3810	3815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401932
60	NC_009637	ACA	2	6	3841	3846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150401932
61	NC_009637	AAT	2	6	3905	3910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401932
62	NC_009637	TTA	2	6	4021	4026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401932
63	NC_009637	GAA	2	6	4076	4081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150401932
64	NC_009637	ATT	2	6	4257	4262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401933
65	NC_009637	AGC	2	6	4285	4290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150401933
66	NC_009637	ATC	2	6	4374	4379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150401933
67	NC_009637	TCT	2	6	4426	4431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150401933
68	NC_009637	TAA	2	6	4571	4576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401933
69	NC_009637	AAG	2	6	4608	4613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150401933
70	NC_009637	TCA	2	6	4693	4698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150401933
71	NC_009637	CAA	2	6	4823	4828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150401933
72	NC_009637	ATT	2	6	5164	5169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401933
73	NC_009637	AAT	2	6	5343	5348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401933
74	NC_009637	ATT	2	6	5373	5378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401933
75	NC_009637	TTC	2	6	5488	5493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150401934
76	NC_009637	TTC	2	6	5575	5580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150401934
77	NC_009637	ATT	2	6	5666	5671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401934
78	NC_009637	TTC	3	9	5707	5715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150401934
79	NC_009637	AAT	2	6	5836	5841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401934
80	NC_009637	AAT	2	6	5849	5854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401934
81	NC_009637	TTC	2	6	5872	5877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150401934
82	NC_009637	CTT	2	6	5888	5893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150401934
83	NC_009637	CAG	2	6	5928	5933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150401934
84	NC_009637	GTA	2	6	6002	6007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150401934
85	NC_009637	ATC	2	6	6034	6039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150401934
86	NC_009637	TCA	2	6	6095	6100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150401934
87	NC_009637	ATT	2	6	6101	6106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401934
88	NC_009637	TTA	2	6	6155	6160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401934
89	NC_009637	ATT	2	6	6214	6219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401934
90	NC_009637	AAT	2	6	6327	6332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401934
91	NC_009637	TCA	2	6	6413	6418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150401934
92	NC_009637	TAT	2	6	6429	6434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401934
93	NC_009637	TCA	2	6	6563	6568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150401934
94	NC_009637	AAT	2	6	6643	6648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401934
95	NC_009637	TAC	2	6	6688	6693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150401934
96	NC_009637	CAG	2	6	6732	6737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150401934
97	NC_009637	AAG	2	6	6747	6752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150401934
98	NC_009637	TCT	2	6	6824	6829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150401934
99	NC_009637	TCA	2	6	6935	6940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150401934
100	NC_009637	ATT	2	6	7193	7198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401934
101	NC_009637	AGG	2	6	7240	7245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150401934
102	NC_009637	TTC	2	6	7300	7305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150401934
103	NC_009637	TTC	3	9	7309	7317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150401934
104	NC_009637	TCA	2	6	7340	7345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150401934
105	NC_009637	ATA	2	6	7375	7380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401934
106	NC_009637	ATT	2	6	7825	7830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401934
107	NC_009637	TTC	2	6	7846	7851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150401934
108	NC_009637	GAA	2	6	7890	7895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150401934
109	NC_009637	TGA	2	6	8256	8261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150401935
110	NC_009637	TTG	2	6	8351	8356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150401935
111	NC_009637	CAA	2	6	8438	8443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150401935
112	NC_009637	ATT	2	6	8489	8494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401935
113	NC_009637	AGA	2	6	8589	8594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150401935
114	NC_009637	ATT	2	6	8662	8667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401935
115	NC_009637	AAT	2	6	8694	8699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401935
116	NC_009637	TGA	2	6	8952	8957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150401935
117	NC_009637	TCA	2	6	9250	9255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150401935
118	NC_009637	GAA	2	6	9301	9306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150401935
119	NC_009637	ATT	2	6	9333	9338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401935
120	NC_009637	TAC	2	6	9358	9363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150401935
121	NC_009637	AGA	2	6	9501	9506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150401935
122	NC_009637	AAC	2	6	9571	9576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150401935
123	NC_009637	TTA	2	6	9769	9774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401935
124	NC_009637	ATT	2	6	9906	9911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401935
125	NC_009637	CAA	2	6	10004	10009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150401935
126	NC_009637	TTC	2	6	10171	10176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150401935
127	NC_009637	TGA	2	6	10218	10223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150401935
128	NC_009637	TTG	2	6	10229	10234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150401935
129	NC_009637	TAT	2	6	10243	10248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401935
130	NC_009637	GAA	2	6	10573	10578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150401935
131	NC_009637	TGT	2	6	10759	10764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150401936
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