MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanococcus aeolicus Nankai-3 chromosome

Total Repeats: 36988

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009635	A	8	8	226	233	100 %	0 %	0 %	0 %	150400440
2	NC_009635	TTATT	2	10	260	269	20 %	80 %	0 %	0 %	150400440
3	NC_009635	TTA	3	9	303	311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400440
4	NC_009635	ATTT	2	8	320	327	25 %	75 %	0 %	0 %	150400440
5	NC_009635	AT	3	6	338	343	50 %	50 %	0 %	0 %	150400440
6	NC_009635	T	7	7	353	359	0 %	100 %	0 %	0 %	150400440
7	NC_009635	ATA	2	6	413	418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400440
8	NC_009635	TTA	3	9	448	456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400440
9	NC_009635	TAT	3	9	459	467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400440
10	NC_009635	TGT	2	6	483	488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150400440
11	NC_009635	TGTT	2	8	524	531	0 %	75 %	25 %	0 %	150400440
12	NC_009635	A	6	6	588	593	100 %	0 %	0 %	0 %	150400440
13	NC_009635	ACA	2	6	597	602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150400440
14	NC_009635	ATA	2	6	647	652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400440
15	NC_009635	ATT	2	6	694	699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400440
16	NC_009635	GTT	2	6	714	719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150400440
17	NC_009635	TAA	2	6	798	803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400440
18	NC_009635	TATTT	2	10	806	815	20 %	80 %	0 %	0 %	150400440
19	NC_009635	ATT	2	6	840	845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400440
20	NC_009635	T	6	6	882	887	0 %	100 %	0 %	0 %	150400440
21	NC_009635	TA	3	6	890	895	50 %	50 %	0 %	0 %	150400440
22	NC_009635	CAAA	2	8	901	908	75 %	0 %	0 %	25 %	150400440
23	NC_009635	AAAAAT	2	12	909	920	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150400440
24	NC_009635	AT	4	8	924	931	50 %	50 %	0 %	0 %	150400440
25	NC_009635	TGT	2	6	932	937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150400440
26	NC_009635	ATT	2	6	957	962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400440
27	NC_009635	TA	3	6	986	991	50 %	50 %	0 %	0 %	150400440
28	NC_009635	ATCAA	2	10	993	1002	60 %	20 %	0 %	20 %	150400440
29	NC_009635	A	6	6	1067	1072	100 %	0 %	0 %	0 %	150400440
30	NC_009635	TAA	2	6	1073	1078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400440
31	NC_009635	AT	3	6	1086	1091	50 %	50 %	0 %	0 %	150400440
32	NC_009635	ATA	2	6	1169	1174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400440
33	NC_009635	CAA	2	6	1181	1186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150400440
34	NC_009635	ATT	2	6	1200	1205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400440
35	NC_009635	ATT	3	9	1227	1235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400440
36	NC_009635	AT	3	6	1267	1272	50 %	50 %	0 %	0 %	150400440
37	NC_009635	AT	3	6	1297	1302	50 %	50 %	0 %	0 %	150400440
38	NC_009635	ATT	2	6	1311	1316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400440
39	NC_009635	TG	3	6	1322	1327	0 %	50 %	50 %	0 %	150400440
40	NC_009635	ATTA	2	8	1336	1343	50 %	50 %	0 %	0 %	150400440
41	NC_009635	T	6	6	1347	1352	0 %	100 %	0 %	0 %	150400440
42	NC_009635	ATT	2	6	1354	1359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400440
43	NC_009635	A	6	6	1401	1406	100 %	0 %	0 %	0 %	150400440
44	NC_009635	AAATAA	2	12	1416	1427	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150400440
45	NC_009635	ATA	2	6	1489	1494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400441
46	NC_009635	ATA	2	6	1504	1509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400441
47	NC_009635	A	6	6	1518	1523	100 %	0 %	0 %	0 %	150400441
48	NC_009635	AT	3	6	1541	1546	50 %	50 %	0 %	0 %	150400441
49	NC_009635	TTG	3	9	1552	1560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150400441
50	NC_009635	GAA	2	6	1579	1584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150400441
51	NC_009635	GATACA	2	12	1665	1676	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150400441
52	NC_009635	G	6	6	1688	1693	0 %	0 %	100 %	0 %	150400441
53	NC_009635	ATG	2	6	1705	1710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150400441
54	NC_009635	A	7	7	1715	1721	100 %	0 %	0 %	0 %	150400441
55	NC_009635	TTATAG	2	12	1741	1752	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150400441
56	NC_009635	AGA	2	6	1775	1780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150400441
57	NC_009635	T	6	6	1811	1816	0 %	100 %	0 %	0 %	150400441
58	NC_009635	TA	5	10	1841	1850	50 %	50 %	0 %	0 %	150400441
59	NC_009635	AGA	2	6	1865	1870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150400441
60	NC_009635	ATT	2	6	1885	1890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400441
61	NC_009635	ATA	3	9	1897	1905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400441
62	NC_009635	A	7	7	1917	1923	100 %	0 %	0 %	0 %	150400441
63	NC_009635	CT	3	6	2053	2058	0 %	50 %	0 %	50 %	150400441
64	NC_009635	AAT	2	6	2078	2083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400441
65	NC_009635	TA	3	6	2101	2106	50 %	50 %	0 %	0 %	150400441
66	NC_009635	AAAG	2	8	2163	2170	75 %	0 %	25 %	0 %	150400441
67	NC_009635	AT	3	6	2203	2208	50 %	50 %	0 %	0 %	150400441
68	NC_009635	ATT	2	6	2217	2222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400441
69	NC_009635	ATA	2	6	2223	2228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400441
70	NC_009635	ATATT	2	10	2235	2244	40 %	60 %	0 %	0 %	150400441
71	NC_009635	AT	3	6	2270	2275	50 %	50 %	0 %	0 %	150400441
72	NC_009635	T	6	6	2291	2296	0 %	100 %	0 %	0 %	150400441
73	NC_009635	TAT	2	6	2365	2370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400441
74	NC_009635	TAA	2	6	2386	2391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400441
75	NC_009635	ATT	2	6	2444	2449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400441
76	NC_009635	TAA	3	9	2491	2499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400441
77	NC_009635	GT	3	6	2500	2505	0 %	50 %	50 %	0 %	150400441
78	NC_009635	AT	4	8	2514	2521	50 %	50 %	0 %	0 %	150400441
79	NC_009635	ATA	2	6	2526	2531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400441
80	NC_009635	CAG	2	6	2542	2547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150400441
81	NC_009635	TAT	2	6	2548	2553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400441
82	NC_009635	A	6	6	2571	2576	100 %	0 %	0 %	0 %	150400441
83	NC_009635	ATG	2	6	2691	2696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150400442
84	NC_009635	GAA	2	6	2699	2704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150400442
85	NC_009635	GAG	2	6	2723	2728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150400442
86	NC_009635	TGA	2	6	2779	2784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150400442
87	NC_009635	GAA	2	6	2870	2875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150400442
88	NC_009635	GAC	2	6	2879	2884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150400442
89	NC_009635	TAT	2	6	2885	2890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400442
90	NC_009635	GAA	2	6	2918	2923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150400442
91	NC_009635	ACA	3	9	2930	2938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150400442
92	NC_009635	ATA	2	6	2961	2966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400442
93	NC_009635	ATAAA	2	10	2988	2997	80 %	20 %	0 %	0 %	150400442
94	NC_009635	A	6	6	3032	3037	100 %	0 %	0 %	0 %	150400442
95	NC_009635	T	6	6	3046	3051	0 %	100 %	0 %	0 %	150400442
96	NC_009635	T	8	8	3068	3075	0 %	100 %	0 %	0 %	150400442
97	NC_009635	GAT	2	6	3131	3136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150400442
98	NC_009635	GAA	2	6	3152	3157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150400442
99	NC_009635	TTA	2	6	3161	3166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400442
100	NC_009635	ACT	2	6	3188	3193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150400442
101	NC_009635	TTCT	2	8	3258	3265	0 %	75 %	0 %	25 %	150400442
102	NC_009635	GAT	2	6	3302	3307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150400442
103	NC_009635	TAT	2	6	3329	3334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400442
104	NC_009635	CTA	2	6	3387	3392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150400442
105	NC_009635	GAAT	2	8	3423	3430	50 %	25 %	25 %	0 %	150400442
106	NC_009635	A	6	6	3432	3437	100 %	0 %	0 %	0 %	150400442
107	NC_009635	ATT	2	6	3463	3468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400442
108	NC_009635	AT	3	6	3514	3519	50 %	50 %	0 %	0 %	150400442
109	NC_009635	AAT	2	6	3530	3535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400442
110	NC_009635	AAT	2	6	3568	3573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400442
111	NC_009635	TAT	2	6	3577	3582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400442
112	NC_009635	TGTA	2	8	3591	3598	25 %	50 %	25 %	0 %	150400442
113	NC_009635	ATA	2	6	3622	3627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400442
114	NC_009635	ATA	2	6	3714	3719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400443
115	NC_009635	A	6	6	3745	3750	100 %	0 %	0 %	0 %	150400443
116	NC_009635	GAAG	2	8	3759	3766	50 %	0 %	50 %	0 %	150400443
117	NC_009635	AAT	2	6	3792	3797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400443
118	NC_009635	AT	4	8	3811	3818	50 %	50 %	0 %	0 %	150400443
119	NC_009635	AAAT	2	8	3860	3867	75 %	25 %	0 %	0 %	150400443
120	NC_009635	TGG	2	6	3882	3887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150400443
121	NC_009635	AT	3	6	3899	3904	50 %	50 %	0 %	0 %	150400443
122	NC_009635	TAAAGT	2	12	3905	3916	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150400443
123	NC_009635	ATG	2	6	3919	3924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150400443
124	NC_009635	A	6	6	3969	3974	100 %	0 %	0 %	0 %	150400443
125	NC_009635	A	7	7	3976	3982	100 %	0 %	0 %	0 %	150400443
126	NC_009635	AT	3	6	4291	4296	50 %	50 %	0 %	0 %	150400444
127	NC_009635	T	6	6	4299	4304	0 %	100 %	0 %	0 %	150400444
128	NC_009635	CTT	2	6	4310	4315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150400444
129	NC_009635	TAA	2	6	4317	4322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400444
130	NC_009635	CAA	2	6	4334	4339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150400444
131	NC_009635	CTA	2	6	4391	4396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150400444
132	NC_009635	TCT	2	6	4438	4443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150400444
133	NC_009635	AAT	2	6	4471	4476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400444
134	NC_009635	TATT	2	8	4483	4490	25 %	75 %	0 %	0 %	150400444
135	NC_009635	T	7	7	4586	4592	0 %	100 %	0 %	0 %	150400444
136	NC_009635	GTT	2	6	4595	4600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150400444
137	NC_009635	AATAT	2	10	4638	4647	60 %	40 %	0 %	0 %	150400444
138	NC_009635	TAT	2	6	4737	4742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400444
139	NC_009635	T	6	6	4742	4747	0 %	100 %	0 %	0 %	150400444
140	NC_009635	TTC	2	6	4755	4760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150400444
141	NC_009635	ATTA	2	8	4836	4843	50 %	50 %	0 %	0 %	150400444
142	NC_009635	T	6	6	4846	4851	0 %	100 %	0 %	0 %	150400444
143	NC_009635	ATTTTT	2	12	4891	4902	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	150400444
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145	NC_009635	T	7	7	4906	4912	0 %	100 %	0 %	0 %	150400444
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152	NC_009635	TATT	2	8	5183	5190	25 %	75 %	0 %	0 %	150400444
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154	NC_009635	ATTATC	2	12	5271	5282	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150400444
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156	NC_009635	TTCT	2	8	5390	5397	0 %	75 %	0 %	25 %	150400444
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262	NC_009635	TA	3	6	10312	10317	50 %	50 %	0 %	0 %	150400447
263	NC_009635	ATAA	2	8	10336	10343	75 %	25 %	0 %	0 %	150400447
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266	NC_009635	AT	3	6	10432	10437	50 %	50 %	0 %	0 %	150400448
267	NC_009635	AAG	2	6	10441	10446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150400448
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269	NC_009635	A	7	7	10469	10475	100 %	0 %	0 %	0 %	150400448
270	NC_009635	TTA	2	6	10507	10512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400448
271	NC_009635	AAAAT	2	10	10540	10549	80 %	20 %	0 %	0 %	150400448
272	NC_009635	AT	3	6	10554	10559	50 %	50 %	0 %	0 %	150400448
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401	NC_009635	AAAAT	2	10	15872	15881	80 %	20 %	0 %	0 %	150400452
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