MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis F11 chromosome

Total Repeats: 3140

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009565	TCATC	2	10	1003	1012	20 %	40 %	0 %	40 %	148821192
2	NC_009565	CGTTT	2	10	2193	2202	0 %	60 %	20 %	20 %	148821193
3	NC_009565	CGGTT	2	10	3342	3351	0 %	40 %	40 %	20 %	148821193
4	NC_009565	GTCGG	2	10	4690	4699	0 %	20 %	60 %	20 %	148821195
5	NC_009565	GCAGC	2	10	7474	7483	20 %	0 %	40 %	40 %	148821197
6	NC_009565	CGGTG	2	10	9382	9391	0 %	20 %	60 %	20 %	148821197
7	NC_009565	CAGAC	2	10	9900	9909	40 %	0 %	20 %	40 %	148821197
8	NC_009565	CGCAA	2	10	10424	10433	40 %	0 %	20 %	40 %	148821198
9	NC_009565	CGGCG	2	10	10550	10559	0 %	0 %	60 %	40 %	148821198
10	NC_009565	GGCGT	2	10	14255	14264	0 %	20 %	60 %	20 %	148821203
11	NC_009565	GGGCC	2	10	14538	14547	0 %	0 %	60 %	40 %	148821203
12	NC_009565	GCGTT	2	10	15283	15292	0 %	40 %	40 %	20 %	148821204
13	NC_009565	CCAGC	2	10	15823	15832	20 %	0 %	20 %	60 %	148821205
14	NC_009565	ACCGA	2	10	16586	16595	40 %	0 %	20 %	40 %	148821205
15	NC_009565	ATCGG	2	10	16978	16987	20 %	20 %	40 %	20 %	148821205
16	NC_009565	CGGCC	2	10	17987	17996	0 %	0 %	40 %	60 %	148821206
17	NC_009565	TTAGC	2	10	19138	19147	20 %	40 %	20 %	20 %	148821207
18	NC_009565	GGTCC	2	10	19210	19219	0 %	20 %	40 %	40 %	148821207
19	NC_009565	GTCGT	2	10	21729	21738	0 %	40 %	40 %	20 %	148821208
20	NC_009565	ATCAC	2	10	24002	24011	40 %	20 %	0 %	40 %	148821211
21	NC_009565	GCCGG	2	10	24689	24698	0 %	0 %	60 %	40 %	148821211
22	NC_009565	GGCAA	2	10	29402	29411	40 %	0 %	40 %	20 %	148821216
23	NC_009565	CGATC	2	10	30228	30237	20 %	20 %	20 %	40 %	148821217
24	NC_009565	CGACG	2	10	32411	32420	20 %	0 %	40 %	40 %	148821220
25	NC_009565	GCGTC	2	10	32466	32475	0 %	20 %	40 %	40 %	148821220
26	NC_009565	GACAC	2	10	32563	32572	40 %	0 %	20 %	40 %	148821220
27	NC_009565	TCCTG	2	10	37568	37577	0 %	40 %	20 %	40 %	148821225
28	NC_009565	CTCGG	2	10	37661	37670	0 %	20 %	40 %	40 %	148821225
29	NC_009565	GGCGC	2	10	38204	38213	0 %	0 %	60 %	40 %	148821225
30	NC_009565	TGGCC	2	10	38352	38361	0 %	20 %	40 %	40 %	148821225
31	NC_009565	CGGCG	2	10	38884	38893	0 %	0 %	60 %	40 %	148821225
32	NC_009565	GTCCA	2	10	39496	39505	20 %	20 %	20 %	40 %	148821226
33	NC_009565	GCCAA	2	10	41630	41639	40 %	0 %	20 %	40 %	148821228
34	NC_009565	GCACA	2	10	42429	42438	40 %	0 %	20 %	40 %	148821229
35	NC_009565	GGTAC	2	10	44963	44972	20 %	20 %	40 %	20 %	148821231
36	NC_009565	TCGAA	2	10	45195	45204	40 %	20 %	20 %	20 %	148821231
37	NC_009565	GCACC	2	10	46125	46134	20 %	0 %	20 %	60 %	148821231
38	NC_009565	CGGTG	2	10	47159	47168	0 %	20 %	60 %	20 %	148821232
39	NC_009565	TCATG	2	10	47305	47314	20 %	40 %	20 %	20 %	148821232
40	NC_009565	GCAGC	2	10	48699	48708	20 %	0 %	40 %	40 %	148821234
41	NC_009565	CCCGA	2	10	48782	48791	20 %	0 %	20 %	60 %	148821234
42	NC_009565	CAGCG	2	10	49907	49916	20 %	0 %	40 %	40 %	148821235
43	NC_009565	CTCCC	2	10	56344	56353	0 %	20 %	0 %	80 %	148821241
44	NC_009565	CGGCG	2	10	56793	56802	0 %	0 %	60 %	40 %	148821241
45	NC_009565	CGACC	2	10	58325	58334	20 %	0 %	20 %	60 %	148821243
46	NC_009565	CTTCG	2	10	59012	59021	0 %	40 %	20 %	40 %	148821244
47	NC_009565	CGGTG	2	10	60068	60077	0 %	20 %	60 %	20 %	148821247
48	NC_009565	TCAGG	2	10	62554	62563	20 %	20 %	40 %	20 %	148821248
49	NC_009565	GGCGA	2	10	66517	66526	20 %	0 %	60 %	20 %	148821252
50	NC_009565	GGTGT	2	10	69093	69102	0 %	40 %	60 %	0 %	148821254
51	NC_009565	ATCGG	2	10	69731	69740	20 %	20 %	40 %	20 %	148821254
52	NC_009565	CCGCG	2	10	70268	70277	0 %	0 %	40 %	60 %	148821255
53	NC_009565	GGCAA	2	10	70619	70628	40 %	0 %	40 %	20 %	148821255
54	NC_009565	CGACC	2	10	70908	70917	20 %	0 %	20 %	60 %	148821255
55	NC_009565	CGGGT	2	10	71362	71371	0 %	20 %	60 %	20 %	148821255
56	NC_009565	GGTCG	2	10	71422	71431	0 %	20 %	60 %	20 %	148821255
57	NC_009565	TGCCT	2	10	72163	72172	0 %	40 %	20 %	40 %	148821256
58	NC_009565	GTCCA	2	10	73034	73043	20 %	20 %	20 %	40 %	148821257
59	NC_009565	TGACC	2	10	75658	75667	20 %	20 %	20 %	40 %	148821259
60	NC_009565	GCCAA	2	10	75972	75981	40 %	0 %	20 %	40 %	148821259
61	NC_009565	GTCGC	2	10	76049	76058	0 %	20 %	40 %	40 %	148821259
62	NC_009565	GCGCG	2	10	77137	77146	0 %	0 %	60 %	40 %	148821260
63	NC_009565	CACGA	2	10	79985	79994	40 %	0 %	20 %	40 %	148821262
64	NC_009565	GAGCA	2	10	82523	82532	40 %	0 %	40 %	20 %	148821264
65	NC_009565	GCCGG	2	10	82622	82631	0 %	0 %	60 %	40 %	148821264
66	NC_009565	GCGAC	2	10	82698	82707	20 %	0 %	40 %	40 %	148821264
67	NC_009565	ATCCG	2	10	83468	83477	20 %	20 %	20 %	40 %	148821265
68	NC_009565	CACCG	2	10	84248	84257	20 %	0 %	20 %	60 %	148821266
69	NC_009565	TGGTC	2	10	86383	86392	0 %	40 %	40 %	20 %	148821268
70	NC_009565	GCTGG	2	10	87020	87029	0 %	20 %	60 %	20 %	148821269
71	NC_009565	TGGGT	2	10	90058	90067	0 %	40 %	60 %	0 %	148821274
72	NC_009565	TCGCC	2	10	90265	90274	0 %	20 %	20 %	60 %	148821274
73	NC_009565	GGGCC	2	10	91238	91247	0 %	0 %	60 %	40 %	148821275
74	NC_009565	GGCCG	2	10	92557	92566	0 %	0 %	60 %	40 %	148821276
75	NC_009565	GCGCC	2	10	93209	93218	0 %	0 %	40 %	60 %	148821276
76	NC_009565	GCTTG	2	10	95241	95250	0 %	40 %	40 %	20 %	148821278
77	NC_009565	CGTGT	2	10	95673	95682	0 %	40 %	40 %	20 %	148821279
78	NC_009565	AGATC	2	10	95752	95761	40 %	20 %	20 %	20 %	148821279
79	NC_009565	CGGCG	2	10	99333	99342	0 %	0 %	60 %	40 %	148821282
80	NC_009565	GCGGT	2	10	100409	100418	0 %	20 %	60 %	20 %	148821283
81	NC_009565	GCGCC	2	10	103241	103250	0 %	0 %	40 %	60 %	148821285
82	NC_009565	GGTGG	2	10	103929	103938	0 %	20 %	80 %	0 %	148821286
83	NC_009565	CTGGC	2	10	105665	105674	0 %	20 %	40 %	40 %	148821288
84	NC_009565	GCACA	2	10	106786	106795	40 %	0 %	20 %	40 %	148821288
85	NC_009565	CTGAA	2	10	109116	109125	40 %	20 %	20 %	20 %	148821291
86	NC_009565	ATCGC	2	10	109611	109620	20 %	20 %	20 %	40 %	148821291
87	NC_009565	TCTGA	2	10	110945	110954	20 %	40 %	20 %	20 %	148821293
88	NC_009565	CGGTC	2	10	111220	111229	0 %	20 %	40 %	40 %	148821293
89	NC_009565	GACCA	2	10	112358	112367	40 %	0 %	20 %	40 %	148821293
90	NC_009565	GGCTG	2	10	114922	114931	0 %	20 %	60 %	20 %	148821293
91	NC_009565	CCGCG	2	10	118842	118851	0 %	0 %	40 %	60 %	148821294
92	NC_009565	TCGTG	2	10	122795	122804	0 %	40 %	40 %	20 %	148821296
93	NC_009565	CCGGA	2	10	124576	124585	20 %	0 %	40 %	40 %	148821298
94	NC_009565	TGCGC	2	10	127049	127058	0 %	20 %	40 %	40 %	148821299
95	NC_009565	GCGAG	2	10	127560	127569	20 %	0 %	60 %	20 %	148821299
96	NC_009565	GGGGT	2	10	128569	128578	0 %	20 %	80 %	0 %	148821299
97	NC_009565	CCCAC	2	10	129131	129140	20 %	0 %	0 %	80 %	148821299
98	NC_009565	CCGGC	2	10	129641	129650	0 %	0 %	40 %	60 %	148821299
99	NC_009565	TGCGG	2	10	130051	130060	0 %	20 %	60 %	20 %	148821299
100	NC_009565	ATCAC	2	10	131530	131539	40 %	20 %	0 %	40 %	148821301
101	NC_009565	ATCGG	2	10	131578	131587	20 %	20 %	40 %	20 %	148821301
102	NC_009565	CGGGC	2	10	132669	132678	0 %	0 %	60 %	40 %	148821301
103	NC_009565	GCGAT	2	10	134474	134483	20 %	20 %	40 %	20 %	148821303
104	NC_009565	GTTCG	2	10	134695	134704	0 %	40 %	40 %	20 %	148821303
105	NC_009565	CCTGG	2	10	135087	135096	0 %	20 %	40 %	40 %	148821303
106	NC_009565	GGCCC	2	10	135193	135202	0 %	0 %	40 %	60 %	148821303
107	NC_009565	CGTTG	2	10	135705	135714	0 %	40 %	40 %	20 %	148821303
108	NC_009565	CGACC	2	10	135777	135786	20 %	0 %	20 %	60 %	148821303
109	NC_009565	GAGAT	2	10	138797	138806	40 %	20 %	40 %	0 %	148821307
110	NC_009565	CGGCG	2	10	140951	140960	0 %	0 %	60 %	40 %	148821308
111	NC_009565	TGCGG	2	10	141584	141593	0 %	20 %	60 %	20 %	148821309
112	NC_009565	CGCTG	2	10	142291	142300	0 %	20 %	40 %	40 %	148821310
113	NC_009565	GTTGC	2	10	142837	142846	0 %	40 %	40 %	20 %	148821310
114	NC_009565	CCGAT	2	10	143585	143594	20 %	20 %	20 %	40 %	148821310
115	NC_009565	ATCGC	2	10	144276	144285	20 %	20 %	20 %	40 %	148821311
116	NC_009565	AACCG	2	10	145015	145024	40 %	0 %	20 %	40 %	148821311
117	NC_009565	CCGCC	2	10	145602	145611	0 %	0 %	20 %	80 %	148821311
118	NC_009565	CCGCC	2	10	146245	146254	0 %	0 %	20 %	80 %	148821312
119	NC_009565	ATCGG	2	10	149729	149738	20 %	20 %	40 %	20 %	148821316
120	NC_009565	TCGTC	2	10	154867	154876	0 %	40 %	20 %	40 %	148821319
121	NC_009565	CACGC	2	10	155331	155340	20 %	0 %	20 %	60 %	148821319
122	NC_009565	ATTCT	2	10	156175	156184	20 %	60 %	0 %	20 %	148821320
123	NC_009565	AGGCG	2	10	156703	156712	20 %	0 %	60 %	20 %	148821320
124	NC_009565	TGACC	2	10	159707	159716	20 %	20 %	20 %	40 %	148821323
125	NC_009565	CGGCG	2	10	159953	159962	0 %	0 %	60 %	40 %	148821323
126	NC_009565	GCACC	2	10	160123	160132	20 %	0 %	20 %	60 %	148821324
127	NC_009565	CCGCA	2	10	161301	161310	20 %	0 %	20 %	60 %	148821325
128	NC_009565	CGCGG	2	10	161380	161389	0 %	0 %	60 %	40 %	148821325
129	NC_009565	CGGTT	2	10	161707	161716	0 %	40 %	40 %	20 %	148821325
130	NC_009565	GCCGG	2	10	162168	162177	0 %	0 %	60 %	40 %	148821326
131	NC_009565	GCGCG	2	10	162290	162299	0 %	0 %	60 %	40 %	148821326
132	NC_009565	CTGGG	2	10	164504	164513	0 %	20 %	60 %	20 %	148821328
133	NC_009565	GCCGG	2	10	165097	165106	0 %	0 %	60 %	40 %	148821329
134	NC_009565	GTTGG	2	10	167066	167075	0 %	40 %	60 %	0 %	148821331
135	NC_009565	GCGTG	2	10	168232	168241	0 %	20 %	60 %	20 %	148821334
136	NC_009565	GCCGC	2	10	168905	168914	0 %	0 %	40 %	60 %	148821334
137	NC_009565	CCGCC	2	10	170156	170165	0 %	0 %	20 %	80 %	148821335
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139	NC_009565	GCGCC	2	10	174281	174290	0 %	0 %	40 %	60 %	148821339
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144	NC_009565	GGGCT	2	10	176594	176603	0 %	20 %	60 %	20 %	148821341
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148	NC_009565	TTCAT	2	10	180617	180626	20 %	60 %	0 %	20 %	148821344
149	NC_009565	CGGCC	2	10	182754	182763	0 %	0 %	40 %	60 %	148821346
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153	NC_009565	GGCTG	2	10	191279	191288	0 %	20 %	60 %	20 %	148821353
154	NC_009565	ACGGT	2	10	191425	191434	20 %	20 %	40 %	20 %	148821353
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161	NC_009565	TTGCG	2	10	207429	207438	0 %	40 %	40 %	20 %	148821367
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174	NC_009565	GCGTC	2	10	222240	222249	0 %	20 %	40 %	40 %	148821382
175	NC_009565	CCGTG	2	10	222393	222402	0 %	20 %	40 %	40 %	148821382
176	NC_009565	GCCGC	2	10	222853	222862	0 %	0 %	40 %	60 %	148821383
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247	NC_009565	CTCGA	2	10	336418	336427	20 %	20 %	20 %	40 %	148821475
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250	NC_009565	CGCGG	2	10	343826	343835	0 %	0 %	60 %	40 %	148821478
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256	NC_009565	CGGTT	2	10	351948	351957	0 %	40 %	40 %	20 %	148821482
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262	NC_009565	CGCGC	2	10	366637	366646	0 %	0 %	40 %	60 %	148821497
263	NC_009565	CCGGG	2	10	366740	366749	0 %	0 %	60 %	40 %	148821497
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499	NC_009565	GCGGT	2	10	665768	665777	0 %	20 %	60 %	20 %	148821771
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