MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Ra chromosome

Total Repeats: 101352

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009525	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659758
2	NC_009525	GTC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659758
3	NC_009525	GAC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659758
4	NC_009525	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659758
5	NC_009525	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659758
6	NC_009525	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659758
7	NC_009525	GCC	2	6	260	265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659758
8	NC_009525	CCG	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659758
9	NC_009525	CGAC	2	8	311	318	25 %	0 %	25 %	50 %	148659758
10	NC_009525	CGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659758
11	NC_009525	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659758
12	NC_009525	ACG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659758
13	NC_009525	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659758
14	NC_009525	CGTT	2	8	527	534	0 %	50 %	25 %	25 %	148659758
15	NC_009525	CGC	3	9	561	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659758
16	NC_009525	CCCG	2	8	589	596	0 %	0 %	25 %	75 %	148659758
17	NC_009525	AC	3	6	643	648	50 %	0 %	0 %	50 %	148659758
18	NC_009525	GGCA	2	8	660	667	25 %	0 %	50 %	25 %	148659758
19	NC_009525	GTT	2	6	681	686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659758
20	NC_009525	CGA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659758
21	NC_009525	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148659758
22	NC_009525	CAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148659758
23	NC_009525	TCATC	2	10	902	911	20 %	40 %	0 %	40 %	148659758
24	NC_009525	CCCA	2	8	918	925	25 %	0 %	0 %	75 %	148659758
25	NC_009525	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659758
26	NC_009525	ACC	2	6	993	998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659758
27	NC_009525	CGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659758
28	NC_009525	CAG	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659758
29	NC_009525	GC	3	6	1121	1126	0 %	0 %	50 %	50 %	148659758
30	NC_009525	GCG	2	6	1237	1242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659758
31	NC_009525	CCG	2	6	1259	1264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659758
32	NC_009525	CA	3	6	1408	1413	50 %	0 %	0 %	50 %	148659758
33	NC_009525	CAC	2	6	1491	1496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659758
34	NC_009525	CGTTT	2	10	2092	2101	0 %	60 %	20 %	20 %	148659759
35	NC_009525	GTGG	2	8	2132	2139	0 %	25 %	75 %	0 %	148659759
36	NC_009525	GCCA	2	8	2150	2157	25 %	0 %	25 %	50 %	148659759
37	NC_009525	CGGTGC	2	12	2164	2175	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148659759
38	NC_009525	GTT	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659759
39	NC_009525	CCG	2	6	2242	2247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659759
40	NC_009525	TTG	2	6	2304	2309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659759
41	NC_009525	CGA	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659759
42	NC_009525	TTG	2	6	2463	2468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659759
43	NC_009525	ATT	2	6	2477	2482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148659759
44	NC_009525	TCAG	2	8	2494	2501	25 %	25 %	25 %	25 %	148659759
45	NC_009525	CGC	2	6	2510	2515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659759
46	NC_009525	GAC	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659759
47	NC_009525	GGT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659759
48	NC_009525	CGT	2	6	2635	2640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659759
49	NC_009525	GCC	2	6	2691	2696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659759
50	NC_009525	CGG	2	6	2708	2713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659759
51	NC_009525	CGTT	2	8	2720	2727	0 %	50 %	25 %	25 %	148659759
52	NC_009525	GCA	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659759
53	NC_009525	CTT	2	6	2808	2813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148659759
54	NC_009525	AC	3	6	2855	2860	50 %	0 %	0 %	50 %	148659759
55	NC_009525	CCA	2	6	2869	2874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659759
56	NC_009525	GC	3	6	2932	2937	0 %	0 %	50 %	50 %	148659759
57	NC_009525	GAT	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659759
58	NC_009525	TTG	3	9	3016	3024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659759
59	NC_009525	ACGG	2	8	3072	3079	25 %	0 %	50 %	25 %	148659759
60	NC_009525	GCCT	2	8	3134	3141	0 %	25 %	25 %	50 %	148659759
61	NC_009525	CGG	2	6	3205	3210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659759
62	NC_009525	CGGTT	2	10	3241	3250	0 %	40 %	40 %	20 %	148659759
63	NC_009525	CGTC	2	8	3285	3292	0 %	25 %	25 %	50 %	148659760
64	NC_009525	TTG	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659760
65	NC_009525	CGA	2	6	3416	3421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659760
66	NC_009525	GGTA	2	8	3465	3472	25 %	25 %	50 %	0 %	148659760
67	NC_009525	GTG	2	6	3499	3504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659760
68	NC_009525	ACG	2	6	3506	3511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659760
69	NC_009525	CAA	2	6	3555	3560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148659760
70	NC_009525	ATC	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659760
71	NC_009525	TGT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659760
72	NC_009525	GGTT	2	8	3647	3654	0 %	50 %	50 %	0 %	148659760
73	NC_009525	CGG	2	6	3673	3678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659760
74	NC_009525	GAT	2	6	3688	3693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659760
75	NC_009525	GT	3	6	3812	3817	0 %	50 %	50 %	0 %	148659760
76	NC_009525	TGG	2	6	3869	3874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659760
77	NC_009525	CCGC	2	8	3875	3882	0 %	0 %	25 %	75 %	148659760
78	NC_009525	GAA	2	6	3915	3920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148659760
79	NC_009525	ATCG	2	8	4012	4019	25 %	25 %	25 %	25 %	148659760
80	NC_009525	AGC	2	6	4029	4034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659760
81	NC_009525	GGC	2	6	4044	4049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659760
82	NC_009525	GGC	2	6	4053	4058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659760
83	NC_009525	GAC	2	6	4111	4116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659760
84	NC_009525	GGC	2	6	4200	4205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659760
85	NC_009525	TGG	2	6	4227	4232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659760
86	NC_009525	GTT	2	6	4242	4247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659760
87	NC_009525	CGA	2	6	4251	4256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659760
88	NC_009525	CGG	2	6	4301	4306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659760
89	NC_009525	CCG	2	6	4313	4318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659760
90	NC_009525	CCG	2	6	4358	4363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659760
91	NC_009525	GGT	2	6	4422	4427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659760
92	NC_009525	TGC	3	9	4532	4540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659761
93	NC_009525	CG	5	10	4542	4551	0 %	0 %	50 %	50 %	148659761
94	NC_009525	GTCGG	2	10	4589	4598	0 %	20 %	60 %	20 %	148659761
95	NC_009525	CGA	2	6	4611	4616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659761
96	NC_009525	GGT	2	6	4745	4750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659761
97	NC_009525	CCA	2	6	4754	4759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659761
98	NC_009525	ACG	2	6	4792	4797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659761
99	NC_009525	CGC	2	6	4877	4882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659761
100	NC_009525	CGG	2	6	4927	4932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659761
101	NC_009525	CG	3	6	4978	4983	0 %	0 %	50 %	50 %	148659761
102	NC_009525	AGA	2	6	5141	5146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148659762
103	NC_009525	GTG	2	6	5174	5179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659762
104	NC_009525	GCG	2	6	5191	5196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659762
105	NC_009525	GAG	2	6	5222	5227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148659762
106	NC_009525	AAG	2	6	5255	5260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148659762
107	NC_009525	GGT	2	6	5383	5388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659762
108	NC_009525	CGA	2	6	5401	5406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659762
109	NC_009525	TGC	2	6	5442	5447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659762
110	NC_009525	CGA	2	6	5473	5478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659762
111	NC_009525	CCAC	2	8	5499	5506	25 %	0 %	0 %	75 %	148659762
112	NC_009525	ACCG	2	8	5518	5525	25 %	0 %	25 %	50 %	148659762
113	NC_009525	GTG	2	6	5531	5536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659762
114	NC_009525	CGG	2	6	5554	5559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659762
115	NC_009525	TGG	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659762
116	NC_009525	CGGCGT	2	12	5602	5613	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148659762
117	NC_009525	GGT	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659762
118	NC_009525	CAAG	2	8	5713	5720	50 %	0 %	25 %	25 %	148659762
119	NC_009525	AAG	2	6	5732	5737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148659762
120	NC_009525	CGCC	2	8	5809	5816	0 %	0 %	25 %	75 %	148659762
121	NC_009525	CAA	2	6	5839	5844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148659762
122	NC_009525	CGA	2	6	5866	5871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659762
123	NC_009525	GTC	2	6	5891	5896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659762
124	NC_009525	TGG	2	6	6009	6014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659762
125	NC_009525	AGC	2	6	6056	6061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659762
126	NC_009525	GGC	2	6	6176	6181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659762
127	NC_009525	GC	3	6	6204	6209	0 %	0 %	50 %	50 %	148659762
128	NC_009525	GGT	2	6	6217	6222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659762
129	NC_009525	AAGGAC	2	12	6254	6265	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	148659762
130	NC_009525	AGACCA	2	12	6348	6359	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148659762
131	NC_009525	GCG	2	6	6520	6525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659762
132	NC_009525	CGGC	2	8	6624	6631	0 %	0 %	50 %	50 %	148659762
133	NC_009525	ATC	2	6	6692	6697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659762
134	NC_009525	GC	3	6	6710	6715	0 %	0 %	50 %	50 %	148659762
135	NC_009525	ATC	2	6	6752	6757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659762
136	NC_009525	ACG	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659762
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139	NC_009525	CCG	2	6	6935	6940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659762
140	NC_009525	CTG	2	6	7007	7012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659762
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149	NC_009525	GACA	2	8	7304	7311	50 %	0 %	25 %	25 %	148659763
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155	NC_009525	CGGT	2	8	7524	7531	0 %	25 %	50 %	25 %	148659763
156	NC_009525	ACC	2	6	7552	7557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659763
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247	NC_009525	GGC	2	6	12108	12113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659765
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249	NC_009525	GAG	2	6	12210	12215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148659765
250	NC_009525	CTCA	2	8	12303	12310	25 %	25 %	0 %	50 %	148659765
251	NC_009525	ACG	2	6	12664	12669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659766
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256	NC_009525	CAG	2	6	13223	13228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659767
257	NC_009525	C	6	6	13229	13234	0 %	0 %	0 %	100 %	148659767
258	NC_009525	GGC	2	6	13267	13272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659767
259	NC_009525	TCG	2	6	13287	13292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659767
260	NC_009525	GAT	2	6	13298	13303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659767
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262	NC_009525	GC	3	6	13389	13394	0 %	0 %	50 %	50 %	148659767
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385	NC_009525	AGC	2	6	19099	19104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659774
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387	NC_009525	ACC	2	6	19146	19151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659774
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500	NC_009525	CAG	2	6	23976	23981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659777

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