MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanobrevibacter smithii ATCC 35061 chromosome

Total Repeats: 26482

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009515	TCA	2	6	202	207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642061
2	NC_009515	ACA	2	6	217	222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642061
3	NC_009515	TCA	2	6	241	246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642061
4	NC_009515	TTC	2	6	267	272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642061
5	NC_009515	ATT	2	6	399	404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
6	NC_009515	ATT	2	6	409	414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
7	NC_009515	ATT	2	6	456	461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
8	NC_009515	ATT	2	6	465	470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
9	NC_009515	TTA	2	6	589	594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
10	NC_009515	ATT	2	6	654	659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
11	NC_009515	ATT	2	6	672	677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
12	NC_009515	CAG	2	6	731	736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148642061
13	NC_009515	TAA	2	6	744	749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642061
14	NC_009515	AAC	2	6	918	923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642061
15	NC_009515	TGC	2	6	948	953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148642061
16	NC_009515	TCC	3	9	1086	1094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148642061
17	NC_009515	ATT	2	6	1198	1203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
18	NC_009515	TGT	2	6	1226	1231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148642061
19	NC_009515	TTA	2	6	1268	1273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
20	NC_009515	CTT	2	6	1325	1330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642061
21	NC_009515	CAC	2	6	1445	1450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148642061
22	NC_009515	ACA	2	6	1456	1461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642061
23	NC_009515	TAG	2	6	1555	1560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642061
24	NC_009515	ATC	2	6	1623	1628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642061
25	NC_009515	ATT	2	6	1656	1661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
26	NC_009515	TTC	2	6	1689	1694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642061
27	NC_009515	GAA	2	6	2118	2123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642062
28	NC_009515	GAA	2	6	2217	2222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642062
29	NC_009515	ACA	2	6	2298	2303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642062
30	NC_009515	TCA	2	6	2335	2340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642062
31	NC_009515	AAG	2	6	2356	2361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642062
32	NC_009515	TAA	2	6	2576	2581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642062
33	NC_009515	TGA	2	6	2630	2635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642062
34	NC_009515	ACA	2	6	2673	2678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642062
35	NC_009515	GAA	2	6	2838	2843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642062
36	NC_009515	AAG	2	6	2890	2895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642062
37	NC_009515	TGA	2	6	2921	2926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642062
38	NC_009515	AAC	2	6	3074	3079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642062
39	NC_009515	TAA	2	6	3131	3136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642062
40	NC_009515	ATC	2	6	3907	3912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642063
41	NC_009515	ATA	2	6	3913	3918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642063
42	NC_009515	AGA	2	6	4135	4140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642063
43	NC_009515	TCA	2	6	4154	4159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642063
44	NC_009515	CAG	2	6	4176	4181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148642063
45	NC_009515	TAG	2	6	4188	4193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642063
46	NC_009515	TTA	2	6	4196	4201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642063
47	NC_009515	TAT	2	6	4215	4220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642063
48	NC_009515	TGT	2	6	4225	4230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148642063
49	NC_009515	ATT	2	6	4231	4236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642063
50	NC_009515	GCT	2	6	4246	4251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148642063
51	NC_009515	ACC	2	6	4273	4278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148642063
52	NC_009515	GCA	2	6	4285	4290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148642063
53	NC_009515	ATT	2	6	4422	4427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642064
54	NC_009515	ATT	2	6	4465	4470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642064
55	NC_009515	ATA	2	6	4552	4557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642064
56	NC_009515	ATT	2	6	4616	4621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642064
57	NC_009515	TTA	2	6	4719	4724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642064
58	NC_009515	ATT	2	6	4870	4875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642064
59	NC_009515	CTT	2	6	4908	4913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642064
60	NC_009515	TTA	2	6	5151	5156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642065
61	NC_009515	AGC	2	6	5770	5775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148642067
62	NC_009515	TCG	2	6	5840	5845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148642067
63	NC_009515	CTG	2	6	5896	5901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148642067
64	NC_009515	ATA	2	6	6300	6305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642068
65	NC_009515	ACA	2	6	6404	6409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642068
66	NC_009515	AAT	2	6	6467	6472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642068
67	NC_009515	AAT	2	6	6508	6513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642068
68	NC_009515	AAT	2	6	6529	6534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642068
69	NC_009515	TCA	2	6	6604	6609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642068
70	NC_009515	GAA	2	6	6641	6646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642068
71	NC_009515	TAT	2	6	6680	6685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642068
72	NC_009515	ATG	2	6	6690	6695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642068
73	NC_009515	AAC	2	6	6856	6861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642068
74	NC_009515	AGA	2	6	6971	6976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642068
75	NC_009515	GTT	2	6	7112	7117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148642068
76	NC_009515	TGA	3	9	7177	7185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642068
77	NC_009515	TAC	2	6	7220	7225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642068
78	NC_009515	ATT	2	6	7411	7416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642069
79	NC_009515	TCA	3	9	7571	7579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642069
80	NC_009515	CAT	2	6	7671	7676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642069
81	NC_009515	ATC	3	9	7690	7698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642069
82	NC_009515	TTC	2	6	7732	7737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642069
83	NC_009515	AAC	2	6	7758	7763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642069
84	NC_009515	ATA	2	6	7766	7771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642069
85	NC_009515	ATT	2	6	7988	7993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642070
86	NC_009515	TAC	2	6	8117	8122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642070
87	NC_009515	ATG	2	6	8169	8174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642070
88	NC_009515	ATA	2	6	8177	8182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642070
89	NC_009515	AGA	2	6	8245	8250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642070
90	NC_009515	TGA	2	6	8278	8283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642070
91	NC_009515	AGA	2	6	8291	8296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642070
92	NC_009515	CAA	2	6	8307	8312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642070
93	NC_009515	TAG	2	6	8325	8330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642070
94	NC_009515	AAC	2	6	8428	8433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642070
95	NC_009515	AAT	2	6	8498	8503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642070
96	NC_009515	ATT	3	9	8567	8575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642071
97	NC_009515	GTT	2	6	8585	8590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148642071
98	NC_009515	ATT	2	6	8677	8682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642071
99	NC_009515	TTC	2	6	8730	8735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642071
100	NC_009515	TCA	2	6	8792	8797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642071
101	NC_009515	CAT	2	6	8853	8858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642071
102	NC_009515	TGC	2	6	8911	8916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148642071
103	NC_009515	GAA	2	6	8927	8932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642071
104	NC_009515	AAT	2	6	8944	8949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642071
105	NC_009515	AAT	2	6	9335	9340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642072
106	NC_009515	ATA	2	6	9354	9359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642072
107	NC_009515	TTA	2	6	9590	9595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642072
108	NC_009515	ATT	2	6	9638	9643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642072
109	NC_009515	ATT	2	6	9796	9801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642072
110	NC_009515	TAA	2	6	9804	9809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642072
111	NC_009515	TAT	2	6	9826	9831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642072
112	NC_009515	AAT	2	6	9849	9854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642072
113	NC_009515	TAA	2	6	9924	9929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642072
114	NC_009515	TTA	2	6	10014	10019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642072
115	NC_009515	TGA	2	6	10033	10038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642072
116	NC_009515	ATA	2	6	10136	10141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642072
117	NC_009515	TAA	2	6	10678	10683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642073
118	NC_009515	ATT	2	6	10727	10732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642073
119	NC_009515	AAT	2	6	10855	10860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642073
120	NC_009515	TTA	2	6	10906	10911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642073
121	NC_009515	ATG	2	6	11106	11111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642074
122	NC_009515	TAA	2	6	11130	11135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642074
123	NC_009515	AAT	2	6	11207	11212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642074
124	NC_009515	TTA	2	6	11351	11356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642074
125	NC_009515	AAG	2	6	11507	11512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642075
126	NC_009515	CTA	2	6	11522	11527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642075
127	NC_009515	ATC	2	6	11579	11584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642075
128	NC_009515	CTT	2	6	11606	11611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642075
129	NC_009515	TGA	2	6	11613	11618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642075
130	NC_009515	GAA	2	6	11668	11673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642075
131	NC_009515	TCC	2	6	11799	11804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148642075
132	NC_009515	GTC	2	6	12017	12022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148642076
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380	NC_009515	TGA	2	6	32219	32224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642104
381	NC_009515	ATA	2	6	32264	32269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642104
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383	NC_009515	TCA	2	6	32368	32373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642104
384	NC_009515	TTA	2	6	32389	32394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642104
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