MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanobrevibacter smithii ATCC 35061 chromosome

Total Repeats: 40690

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009515	ATG	2	6	229933	229938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642304
5002	NC_009515	CTC	2	6	229953	229958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148642304
5003	NC_009515	CTG	2	6	229959	229964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148642304
5004	NC_009515	TTG	2	6	230050	230055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148642304
5005	NC_009515	TAA	2	6	230172	230177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642304
5006	NC_009515	TCT	2	6	230182	230187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642304
5007	NC_009515	T	6	6	230208	230213	0 %	100 %	0 %	0 %	148642304
5008	NC_009515	CAG	2	6	230217	230222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148642304
5009	NC_009515	CTT	2	6	230301	230306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642304
5010	NC_009515	T	6	6	230323	230328	0 %	100 %	0 %	0 %	148642304
5011	NC_009515	TTC	2	6	230344	230349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642304
5012	NC_009515	AGA	2	6	230357	230362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642304
5013	NC_009515	CTG	2	6	230403	230408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148642304
5014	NC_009515	TAT	2	6	230464	230469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642304
5015	NC_009515	TTC	2	6	230521	230526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642305
5016	NC_009515	TCT	2	6	230543	230548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642305
5017	NC_009515	TCA	2	6	230561	230566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642305
5018	NC_009515	CTT	2	6	230580	230585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642305
5019	NC_009515	CTT	2	6	230607	230612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642305
5020	NC_009515	CAC	2	6	230613	230618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148642305
5021	NC_009515	TAA	2	6	230622	230627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642305
5022	NC_009515	AGT	2	6	230650	230655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642305
5023	NC_009515	ATTG	2	8	230674	230681	25 %	50 %	25 %	0 %	148642305
5024	NC_009515	AAT	2	6	230822	230827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642305
5025	NC_009515	CCA	2	6	230849	230854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148642305
5026	NC_009515	T	6	6	230923	230928	0 %	100 %	0 %	0 %	148642305
5027	NC_009515	TATT	2	8	230970	230977	25 %	75 %	0 %	0 %	148642305
5028	NC_009515	CAA	2	6	231021	231026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642305
5029	NC_009515	TGC	2	6	231037	231042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148642305
5030	NC_009515	T	6	6	231069	231074	0 %	100 %	0 %	0 %	148642305
5031	NC_009515	AGT	2	6	231103	231108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642305
5032	NC_009515	TAT	2	6	232039	232044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642306
5033	NC_009515	TCA	2	6	232077	232082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642306
5034	NC_009515	CT	3	6	232088	232093	0 %	50 %	0 %	50 %	148642306
5035	NC_009515	GAA	2	6	232102	232107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642306
5036	NC_009515	T	6	6	232135	232140	0 %	100 %	0 %	0 %	148642306
5037	NC_009515	A	6	6	232196	232201	100 %	0 %	0 %	0 %	148642306
5038	NC_009515	ATC	2	6	232235	232240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642306
5039	NC_009515	GAA	2	6	232309	232314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642306
5040	NC_009515	TCA	2	6	232324	232329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642306
5041	NC_009515	TTA	2	6	232372	232377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642307
5042	NC_009515	GAAA	2	8	232441	232448	75 %	0 %	25 %	0 %	148642307
5043	NC_009515	ATT	3	9	232629	232637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642307
5044	NC_009515	CCA	2	6	232753	232758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148642307
5045	NC_009515	ATG	2	6	232772	232777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642307
5046	NC_009515	ATTT	2	8	232778	232785	25 %	75 %	0 %	0 %	148642307
5047	NC_009515	ATTT	2	8	232907	232914	25 %	75 %	0 %	0 %	148642307
5048	NC_009515	ATT	2	6	232977	232982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642307
5049	NC_009515	A	6	6	233013	233018	100 %	0 %	0 %	0 %	148642307
5050	NC_009515	A	6	6	233138	233143	100 %	0 %	0 %	0 %	148642308
5051	NC_009515	GGA	2	6	233152	233157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148642308
5052	NC_009515	AAT	2	6	233270	233275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642308
5053	NC_009515	AAAATA	2	12	233380	233391	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	148642308
5054	NC_009515	ACC	2	6	233733	233738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148642309
5055	NC_009515	TTGAAT	2	12	233831	233842	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148642309
5056	NC_009515	CCA	2	6	233998	234003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148642309
5057	NC_009515	ACT	2	6	234051	234056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642309
5058	NC_009515	AGA	2	6	234093	234098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642309
5059	NC_009515	TGA	3	9	234099	234107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642309
5060	NC_009515	TCA	2	6	234130	234135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642309
5061	NC_009515	ACA	2	6	234172	234177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642309
5062	NC_009515	AAC	2	6	234183	234188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642309
5063	NC_009515	AAT	2	6	234210	234215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642309
5064	NC_009515	T	6	6	234227	234232	0 %	100 %	0 %	0 %	148642309
5065	NC_009515	CTC	2	6	234359	234364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148642310
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5068	NC_009515	TAAG	2	8	234445	234452	50 %	25 %	25 %	0 %	148642310
5069	NC_009515	CTGA	2	8	234503	234510	25 %	25 %	25 %	25 %	148642310
5070	NC_009515	TAG	2	6	234539	234544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642310
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5072	NC_009515	GAACCT	2	12	234613	234624	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148642310
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5080	NC_009515	ATT	2	6	234939	234944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642310
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5085	NC_009515	TA	3	6	235144	235149	50 %	50 %	0 %	0 %	148642311
5086	NC_009515	CATTT	2	10	235220	235229	20 %	60 %	0 %	20 %	148642311
5087	NC_009515	TAA	2	6	235258	235263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642311
5088	NC_009515	AT	3	6	235293	235298	50 %	50 %	0 %	0 %	148642311
5089	NC_009515	CAC	2	6	235303	235308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148642311
5090	NC_009515	TTTAC	2	10	235320	235329	20 %	60 %	0 %	20 %	148642311
5091	NC_009515	ATTG	2	8	235361	235368	25 %	50 %	25 %	0 %	148642311
5092	NC_009515	TAA	2	6	235403	235408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642311
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5099	NC_009515	CAT	3	9	235540	235548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642311
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5101	NC_009515	GCA	3	9	235836	235844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148642312
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5103	NC_009515	GAA	2	6	235901	235906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642312
5104	NC_009515	AAAG	2	8	235988	235995	75 %	0 %	25 %	0 %	148642312
5105	NC_009515	CAG	2	6	236083	236088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148642312
5106	NC_009515	TAG	2	6	236101	236106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642312
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5108	NC_009515	ATT	2	6	236157	236162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642312
5109	NC_009515	CTG	2	6	236236	236241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148642312
5110	NC_009515	CTG	2	6	236245	236250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148642312
5111	NC_009515	ATT	2	6	236271	236276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642312
5112	NC_009515	GAA	2	6	236337	236342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642312
5113	NC_009515	AATAT	2	10	236497	236506	60 %	40 %	0 %	0 %	148642312
5114	NC_009515	TTG	2	6	236536	236541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148642312
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5118	NC_009515	CAC	2	6	236752	236757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148642312
5119	NC_009515	GAA	2	6	236788	236793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642312
5120	NC_009515	ACAAT	2	10	236797	236806	60 %	20 %	0 %	20 %	148642312
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5122	NC_009515	TGC	2	6	236849	236854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148642312
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5245	NC_009515	T	6	6	242273	242278	0 %	100 %	0 %	0 %	148642319
5246	NC_009515	TCA	2	6	242282	242287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642319
5247	NC_009515	AT	3	6	242289	242294	50 %	50 %	0 %	0 %	148642319
5248	NC_009515	TAT	2	6	242361	242366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642319
5249	NC_009515	T	6	6	242434	242439	0 %	100 %	0 %	0 %	148642319
5250	NC_009515	CAA	2	6	242460	242465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642319
5251	NC_009515	CTT	2	6	242587	242592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642320
5252	NC_009515	CCG	2	6	242640	242645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148642320
5253	NC_009515	CTG	2	6	242653	242658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148642320
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5255	NC_009515	TTA	2	6	242737	242742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642320
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5260	NC_009515	CTG	2	6	243130	243135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148642320
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5263	NC_009515	TCA	2	6	243324	243329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642320
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5275	NC_009515	T	6	6	243872	243877	0 %	100 %	0 %	0 %	148642320
5276	NC_009515	TCA	2	6	244002	244007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642320
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5282	NC_009515	CAT	2	6	244252	244257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642320
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5285	NC_009515	TACA	2	8	244537	244544	50 %	25 %	0 %	25 %	148642320
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5302	NC_009515	ATAGCT	2	12	245264	245275	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148642321
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5311	NC_009515	CTA	2	6	245884	245889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642322
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5320	NC_009515	TCA	2	6	246398	246403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642323
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5322	NC_009515	CAT	2	6	246540	246545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642324
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5334	NC_009515	ACCTG	2	10	247014	247023	20 %	20 %	20 %	40 %	148642324
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5337	NC_009515	AT	3	6	247081	247086	50 %	50 %	0 %	0 %	148642324
5338	NC_009515	GAT	2	6	247123	247128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642324
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5340	NC_009515	TTC	2	6	247152	247157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642324
5341	NC_009515	ACTTTA	2	12	247165	247176	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148642324
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5348	NC_009515	AAATTT	2	12	247742	247753	50 %	50 %	0 %	0 %	148642325
5349	NC_009515	ATC	2	6	247773	247778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642325
5350	NC_009515	TTC	3	9	247851	247859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642325
5351	NC_009515	TGA	2	6	247870	247875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642325
5352	NC_009515	GTA	2	6	247876	247881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642325
5353	NC_009515	AAG	2	6	247926	247931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642325
5354	NC_009515	AG	3	6	247930	247935	50 %	0 %	50 %	0 %	148642325
5355	NC_009515	AAT	2	6	247936	247941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642325
5356	NC_009515	TGA	2	6	247952	247957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642325
5357	NC_009515	ATA	2	6	248010	248015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642325
5358	NC_009515	T	6	6	248028	248033	0 %	100 %	0 %	0 %	148642325
5359	NC_009515	TAA	2	6	248223	248228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642325
5360	NC_009515	TCC	2	6	248385	248390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148642325
5361	NC_009515	TGC	2	6	248430	248435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148642325
5362	NC_009515	TAT	2	6	248486	248491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642325
5363	NC_009515	CCG	2	6	248701	248706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148642325
5364	NC_009515	TCA	2	6	248731	248736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642325
5365	NC_009515	TGC	2	6	248772	248777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148642325
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5367	NC_009515	AGC	2	6	248820	248825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148642325
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5373	NC_009515	T	6	6	249358	249363	0 %	100 %	0 %	0 %	148642326
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5489	NC_009515	ATC	2	6	255143	255148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642326
5490	NC_009515	TAT	2	6	255151	255156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642326
5491	NC_009515	TTA	2	6	255169	255174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642326
5492	NC_009515	T	6	6	255180	255185	0 %	100 %	0 %	0 %	148642326
5493	NC_009515	TTA	2	6	255201	255206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642326
5494	NC_009515	TAT	2	6	255245	255250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642326
5495	NC_009515	TGA	2	6	255296	255301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642326
5496	NC_009515	GAA	2	6	255318	255323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642326
5497	NC_009515	CAT	2	6	255454	255459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642326
5498	NC_009515	ATT	2	6	255470	255475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642326
5499	NC_009515	AAT	2	6	255518	255523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642326
5500	NC_009515	T	7	7	255544	255550	0 %	100 %	0 %	0 %	148642326

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