MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycoplasma agalactiae PG2 chromosome

Total Repeats: 474

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009497	TAAAAC	2	12	363	374	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	148377269
2	NC_009497	ACATTA	2	12	1905	1916	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148377270
3	NC_009497	ACTTCA	2	12	6859	6870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148377274
4	NC_009497	AACTTC	2	12	7965	7976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148377275
5	NC_009497	TTTATC	2	12	11753	11764	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148377280
6	NC_009497	AGCTAA	2	12	13761	13772	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148377282
7	NC_009497	AAATTA	2	12	14357	14368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148377282
8	NC_009497	TTTAGC	2	12	14856	14867	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148377282
9	NC_009497	CAAAAT	2	12	15751	15762	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	148377283
10	NC_009497	AATTAA	2	12	16345	16356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148377283
11	NC_009497	TACAAA	2	12	17575	17586	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	148377284
12	NC_009497	ATTATG	2	12	17698	17709	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148377284
13	NC_009497	AATGAA	2	12	19399	19410	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148377286
14	NC_009497	TATCAT	2	12	20994	21005	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148377288
15	NC_009497	ACAGTT	2	12	22296	22307	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148377290
16	NC_009497	TGCTTC	2	12	23368	23379	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	148377291
17	NC_009497	AATATA	2	12	25997	26008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148377294
18	NC_009497	CATTTT	2	12	31193	31204	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148377299
19	NC_009497	AACATT	2	12	31771	31782	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148377299
20	NC_009497	TTTTAA	2	12	32184	32195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148377300
21	NC_009497	TAAATT	2	12	32373	32384	50 %	50 %	0 %	0 %	148377300
22	NC_009497	GAAAAA	2	12	32577	32588	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	148377301
23	NC_009497	TTAAAC	2	12	32799	32810	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148377301
24	NC_009497	CTTTTC	2	12	33119	33130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148377302
25	NC_009497	ACCAGA	2	12	34058	34069	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148377302
26	NC_009497	ATTTAA	2	12	34106	34117	50 %	50 %	0 %	0 %	148377302
27	NC_009497	CTAAAC	2	12	38379	38390	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	148377306
28	NC_009497	TTTTCA	2	12	41356	41367	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148377307
29	NC_009497	AGCTCT	2	12	41595	41606	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148377307
30	NC_009497	ACCATT	2	12	43308	43319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148377307
31	NC_009497	TTCCCA	2	12	49102	49113	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	148377307
32	NC_009497	ATCTTT	2	12	49971	49982	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148377307
33	NC_009497	TTTGTT	2	12	50403	50414	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	148377307
34	NC_009497	ATGAAA	2	12	52043	52054	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148377308
35	NC_009497	ACTTTA	2	12	52418	52429	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148377308
36	NC_009497	GTTGAA	2	12	54943	54954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148377312
37	NC_009497	AGTGTT	2	12	55458	55469	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148377313
38	NC_009497	GATAGT	2	12	62087	62098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148377320
39	NC_009497	GAAAAT	2	12	63859	63870	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148377322
40	NC_009497	CAATAT	2	12	65287	65298	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148377323
41	NC_009497	TCAAAA	2	12	66533	66544	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	148377324
42	NC_009497	GTCATC	2	12	67720	67731	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148377325
43	NC_009497	ATGCAA	2	12	71298	71309	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148377329
44	NC_009497	TAAAAA	2	12	75662	75673	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	148377333
45	NC_009497	AATTTC	2	12	78488	78499	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148377333
46	NC_009497	GAAAAG	2	12	78667	78678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148377333
47	NC_009497	TTGATA	2	12	79042	79053	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148377333
48	NC_009497	CAAAAA	2	12	82439	82450	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	148377336
49	NC_009497	ATGTTG	2	12	84926	84937	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148377338
50	NC_009497	AATGGC	2	12	88286	88297	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148377341
51	NC_009497	AATGGC	2	12	89226	89237	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148377342
52	NC_009497	AGATAT	2	12	92230	92241	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148377345
53	NC_009497	TGTTCG	2	12	94787	94798	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	148377348
54	NC_009497	CCAGTT	2	12	94917	94928	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148377348
55	NC_009497	AACTCC	2	12	95677	95688	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	148377349
56	NC_009497	TTGAAA	2	12	99268	99279	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148377354
57	NC_009497	TGTTTT	2	12	103501	103512	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	148377359
58	NC_009497	GAAAAA	2	12	105828	105839	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	148377361
59	NC_009497	ATTAAA	2	12	108037	108048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148377363
60	NC_009497	CATCCA	2	12	109722	109733	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	148377364
61	NC_009497	TAGAAT	2	12	112410	112421	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148377368
62	NC_009497	TGTCTT	2	12	115598	115609	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	148377369
63	NC_009497	AAGAAA	2	12	116201	116212	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	148377369
64	NC_009497	TAAGTT	2	12	117471	117482	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148377370
65	NC_009497	TTAAAT	2	12	118010	118021	50 %	50 %	0 %	0 %	148377371
66	NC_009497	GAAGTA	2	12	120363	120374	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148377372
67	NC_009497	CTAATG	2	12	120892	120903	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148377372
68	NC_009497	AATTAT	2	12	124671	124682	50 %	50 %	0 %	0 %	148377378
69	NC_009497	AAAGAA	2	12	132244	132255	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	148377386
70	NC_009497	ATGTTG	2	12	134695	134706	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148377388
71	NC_009497	TTAGAA	2	12	135402	135413	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148377388
72	NC_009497	ATGTTA	2	12	135962	135973	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148377389
73	NC_009497	AGTTCC	2	12	137727	137738	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148377390
74	NC_009497	TAATTT	2	12	140713	140724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148377391
75	NC_009497	GACATT	2	12	142473	142484	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148377392
76	NC_009497	AGCTAG	2	12	144352	144363	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148377394
77	NC_009497	GATAAA	2	12	145992	146003	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148377395
78	NC_009497	TAATAT	2	12	148873	148884	50 %	50 %	0 %	0 %	148377398
79	NC_009497	AAAATT	2	12	153703	153714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148377403
80	NC_009497	TTGAAA	2	12	154097	154108	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148377403
81	NC_009497	TAAAAG	2	12	154148	154159	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148377403
82	NC_009497	GCTAAT	2	12	154465	154476	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148377403
83	NC_009497	GATATT	2	12	157037	157048	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148377404
84	NC_009497	CATTTT	2	12	157545	157556	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148377404
85	NC_009497	TGAAAG	2	12	158268	158279	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148377404
86	NC_009497	ACACCA	2	12	159460	159471	50 %	0 %	0 %	50 %	148377405
87	NC_009497	TGGCTA	2	12	162447	162458	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148377409
88	NC_009497	TAAATT	2	12	166913	166924	50 %	50 %	0 %	0 %	148377412
89	NC_009497	AGCTTT	2	12	167726	167737	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148377413
90	NC_009497	AATGGC	2	12	167957	167968	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148377413
91	NC_009497	CAAAGA	2	12	168656	168667	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	148377413
92	NC_009497	AATTTA	2	12	169917	169928	50 %	50 %	0 %	0 %	148377414
93	NC_009497	TATTGT	2	12	173634	173645	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148377418
94	NC_009497	CATATG	2	12	175575	175586	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148377419
95	NC_009497	TGGTTG	2	12	177970	177981	0 %	50 %	50 %	0 %	148377420
96	NC_009497	AAATTT	2	12	181111	181122	50 %	50 %	0 %	0 %	148377422
97	NC_009497	TAACAA	2	12	182956	182967	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	148377423
98	NC_009497	TTTCAT	2	12	183252	183263	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148377423
99	NC_009497	TCAAAG	2	12	183344	183355	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148377423
100	NC_009497	TGAATA	2	12	186514	186525	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148377426
101	NC_009497	ATCTTT	2	12	191041	191052	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148377432
102	NC_009497	TATATT	2	12	191722	191733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148377433
103	NC_009497	GCACTT	2	12	192997	193008	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148377433
104	NC_009497	AATATC	2	12	193403	193414	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148377433
105	NC_009497	CTACCT	2	12	193530	193541	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	148377433
106	NC_009497	AATAGC	2	12	195138	195149	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148377434
107	NC_009497	TATTCA	2	12	199838	199849	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148377437
108	NC_009497	CAGCAT	2	12	200817	200828	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148377437
109	NC_009497	AAATTG	2	12	201109	201120	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148377437
110	NC_009497	AATGTT	2	12	205800	205811	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148377441
111	NC_009497	ACTTTT	2	12	208415	208426	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148377444
112	NC_009497	TGAGCC	2	12	209649	209660	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148377445
113	NC_009497	GAAATA	2	12	212725	212736	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148377448
114	NC_009497	AAAGAA	2	12	213235	213246	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	148377448
115	NC_009497	TAAATA	2	12	214698	214709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148377449
116	NC_009497	ATAAAA	2	12	215017	215028	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	148377449
117	NC_009497	ACTAAT	2	12	219433	219444	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148377452
118	NC_009497	CTATTG	2	12	222866	222877	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148377455
119	NC_009497	ATTAGC	2	12	230518	230529	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148377463
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234	NC_009497	TTTTAT	2	12	444141	444152	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	148377642
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