MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanocella arvoryzae MRE50 chromosome

Total Repeats: 40710

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009464	CAT	2	6	301	306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918683
2	NC_009464	GCA	2	6	414	419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918683
3	NC_009464	CGA	2	6	436	441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918683
4	NC_009464	CGG	2	6	469	474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918683
5	NC_009464	TCC	2	6	486	491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918683
6	NC_009464	ATC	2	6	602	607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918683
7	NC_009464	GGT	2	6	619	624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147918683
8	NC_009464	AGT	2	6	688	693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918683
9	NC_009464	GGA	2	6	754	759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918683
10	NC_009464	GGC	2	6	824	829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918683
11	NC_009464	CAT	3	9	856	864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918683
12	NC_009464	GGA	2	6	946	951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918683
13	NC_009464	ACA	2	6	998	1003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147918683
14	NC_009464	ATC	2	6	1529	1534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918684
15	NC_009464	AGA	3	9	1551	1559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918684
16	NC_009464	GGA	2	6	1573	1578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918684
17	NC_009464	AGC	2	6	1692	1697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918684
18	NC_009464	TGA	2	6	1755	1760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918684
19	NC_009464	TCC	2	6	1842	1847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918684
20	NC_009464	CGG	2	6	1869	1874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918684
21	NC_009464	CAC	2	6	1985	1990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918684
22	NC_009464	ATG	2	6	2021	2026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918684
23	NC_009464	GTT	2	6	2086	2091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147918684
24	NC_009464	GAA	2	6	2120	2125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918684
25	NC_009464	CGT	2	6	2194	2199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918684
26	NC_009464	CGA	2	6	2229	2234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918684
27	NC_009464	CGG	2	6	2239	2244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918684
28	NC_009464	CCG	2	6	2352	2357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918684
29	NC_009464	ATC	2	6	2363	2368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918684
30	NC_009464	GAG	2	6	2529	2534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918685
31	NC_009464	TGC	2	6	2578	2583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918685
32	NC_009464	CGG	2	6	2888	2893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918685
33	NC_009464	CCA	2	6	2978	2983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918685
34	NC_009464	TAC	2	6	3105	3110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918685
35	NC_009464	AAG	2	6	3174	3179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918685
36	NC_009464	GTC	2	6	3285	3290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918685
37	NC_009464	TCG	2	6	3946	3951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918686
38	NC_009464	CTT	2	6	4027	4032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918686
39	NC_009464	GTC	2	6	4035	4040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918686
40	NC_009464	GCT	2	6	4101	4106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918686
41	NC_009464	TGC	2	6	4156	4161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918686
42	NC_009464	AGA	2	6	4249	4254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918686
43	NC_009464	CGG	2	6	4366	4371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918686
44	NC_009464	CAG	2	6	4418	4423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918686
45	NC_009464	TCT	2	6	4524	4529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918686
46	NC_009464	GAT	2	6	4679	4684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918686
47	NC_009464	AGC	2	6	4692	4697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918686
48	NC_009464	AGC	2	6	4878	4883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918686
49	NC_009464	AGC	2	6	5034	5039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918686
50	NC_009464	CGC	2	6	5053	5058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918686
51	NC_009464	TGC	2	6	5078	5083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918686
52	NC_009464	CAG	2	6	5156	5161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918686
53	NC_009464	TGA	2	6	5269	5274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918686
54	NC_009464	CAG	2	6	5354	5359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918686
55	NC_009464	CTT	2	6	5406	5411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918687
56	NC_009464	TTC	2	6	5462	5467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918687
57	NC_009464	CGG	2	6	5501	5506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918687
58	NC_009464	GAT	2	6	5524	5529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918687
59	NC_009464	TCG	2	6	5561	5566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918687
60	NC_009464	GAT	2	6	5716	5721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918687
61	NC_009464	TCC	2	6	5729	5734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918687
62	NC_009464	TGC	2	6	5744	5749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918687
63	NC_009464	CTC	2	6	5855	5860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918687
64	NC_009464	GTA	2	6	5892	5897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918687
65	NC_009464	CTT	2	6	5955	5960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918687
66	NC_009464	GCA	2	6	5967	5972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918687
67	NC_009464	TCC	2	6	6089	6094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918687
68	NC_009464	TCG	2	6	6150	6155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918687
69	NC_009464	GGT	2	6	6174	6179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147918687
70	NC_009464	TCG	2	6	6185	6190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918687
71	NC_009464	CTC	2	6	6280	6285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918687
72	NC_009464	CCA	2	6	6345	6350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918687
73	NC_009464	GCA	2	6	6435	6440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918687
74	NC_009464	CGT	2	6	6549	6554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918687
75	NC_009464	GCG	2	6	6878	6883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918688
76	NC_009464	ACC	2	6	6955	6960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918688
77	NC_009464	GAG	2	6	7075	7080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918688
78	NC_009464	AAG	2	6	7084	7089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918688
79	NC_009464	ATC	2	6	7192	7197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918688
80	NC_009464	CAT	2	6	7257	7262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918688
81	NC_009464	TCA	2	6	7280	7285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918688
82	NC_009464	TGG	2	6	7298	7303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147918688
83	NC_009464	GAT	2	6	7308	7313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918688
84	NC_009464	TCT	2	6	7316	7321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918688
85	NC_009464	CGA	2	6	7347	7352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918688
86	NC_009464	GCT	2	6	7353	7358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918688
87	NC_009464	GGT	2	6	7380	7385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147918688
88	NC_009464	GCC	2	6	7446	7451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918688
89	NC_009464	AAG	2	6	7484	7489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918688
90	NC_009464	GAA	2	6	7521	7526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918688
91	NC_009464	TAT	2	6	7611	7616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147918689
92	NC_009464	GCA	2	6	7618	7623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918689
93	NC_009464	CGG	2	6	7709	7714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918689
94	NC_009464	GCA	2	6	7726	7731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918689
95	NC_009464	CTG	2	6	7889	7894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918689
96	NC_009464	TGC	2	6	7978	7983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918689
97	NC_009464	AGA	2	6	7984	7989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918689
98	NC_009464	GGC	2	6	7994	7999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918689
99	NC_009464	TTC	2	6	8354	8359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918690
100	NC_009464	GCC	2	6	8371	8376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918690
101	NC_009464	GAT	2	6	8416	8421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918690
102	NC_009464	ATA	2	6	8459	8464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147918690
103	NC_009464	TCA	2	6	8589	8594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918690
104	NC_009464	GGC	3	9	8646	8654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918690
105	NC_009464	CAT	2	6	8655	8660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918690
106	NC_009464	AGC	2	6	8771	8776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918690
107	NC_009464	GAT	2	6	8788	8793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918690
108	NC_009464	TCT	2	6	8815	8820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918690
109	NC_009464	CTG	2	6	8867	8872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918691
110	NC_009464	CTG	2	6	8956	8961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918691
111	NC_009464	TCG	2	6	8972	8977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918691
112	NC_009464	TGC	2	6	9207	9212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918691
113	NC_009464	GGT	2	6	9277	9282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147918691
114	NC_009464	TCC	2	6	9289	9294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918691
115	NC_009464	CAG	2	6	9367	9372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918691
116	NC_009464	TGA	2	6	9396	9401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918691
117	NC_009464	AAT	2	6	9508	9513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147918691
118	NC_009464	GAT	2	6	9535	9540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918691
119	NC_009464	GAC	2	6	9571	9576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918691
120	NC_009464	GAG	2	6	9604	9609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918691
121	NC_009464	GCG	2	6	9683	9688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918691
122	NC_009464	TGC	2	6	9714	9719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918691
123	NC_009464	CGA	2	6	9732	9737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918691
124	NC_009464	ATG	2	6	9773	9778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918691
125	NC_009464	GAA	2	6	9822	9827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918691
126	NC_009464	CAG	2	6	9837	9842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918691
127	NC_009464	CAC	2	6	10027	10032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918691
128	NC_009464	GCA	2	6	10055	10060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918691
129	NC_009464	AGC	2	6	10100	10105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918691
130	NC_009464	CAG	2	6	10150	10155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918691
131	NC_009464	CGC	2	6	10212	10217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918691
132	NC_009464	TGA	2	6	10630	10635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918692
133	NC_009464	TGA	2	6	10684	10689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918692
134	NC_009464	GAG	2	6	10692	10697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918692
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138	NC_009464	TGC	2	6	11024	11029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918692
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151	NC_009464	CAG	2	6	11797	11802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918692
152	NC_009464	CTG	2	6	11946	11951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918692
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252	NC_009464	CAT	2	6	20802	20807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918703
253	NC_009464	CTG	2	6	20816	20821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918703
254	NC_009464	CGA	2	6	20937	20942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918703
255	NC_009464	ATC	2	6	21004	21009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918703
256	NC_009464	CCA	2	6	21060	21065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918703
257	NC_009464	GCG	2	6	21121	21126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918703
258	NC_009464	CTG	2	6	21145	21150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918703
259	NC_009464	CAC	2	6	21202	21207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918703
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265	NC_009464	CCG	2	6	21524	21529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918703
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272	NC_009464	GTC	2	6	22387	22392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918704
273	NC_009464	GGC	2	6	22405	22410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918704
274	NC_009464	CTG	2	6	22489	22494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918704
275	NC_009464	TCA	2	6	22640	22645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918704
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281	NC_009464	GCT	2	6	22845	22850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918704
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283	NC_009464	CGG	2	6	22998	23003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918704
284	NC_009464	GCG	2	6	23033	23038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918704
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286	NC_009464	GCG	2	6	23135	23140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918704
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360	NC_009464	GCG	2	6	29608	29613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918713
361	NC_009464	GGC	2	6	29627	29632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918713
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369	NC_009464	CAT	2	6	30178	30183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918715
370	NC_009464	TCG	3	9	30224	30232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918715
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372	NC_009464	TCT	2	6	30348	30353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918715
373	NC_009464	GTA	2	6	30436	30441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918715
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496	NC_009464	TAT	2	6	40244	40249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147918721
497	NC_009464	GTC	2	6	40395	40400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918721
498	NC_009464	GAC	2	6	40401	40406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918721
499	NC_009464	CGG	2	6	40493	40498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918721
500	NC_009464	GCG	3	9	40528	40536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918721

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