MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanocella arvoryzae MRE50 chromosome

Total Repeats: 53838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009464	CAGGTC	2	12	30535	30546	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	147918715
502	NC_009464	TA	3	6	30604	30609	50 %	50 %	0 %	0 %	147918715
503	NC_009464	GTA	2	6	30613	30618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918715
504	NC_009464	CGC	2	6	30621	30626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918715
505	NC_009464	AGGT	2	8	30690	30697	25 %	25 %	50 %	0 %	147918715
506	NC_009464	CGT	2	6	30712	30717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918715
507	NC_009464	CTG	2	6	30770	30775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918715
508	NC_009464	CTG	2	6	30870	30875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918715
509	NC_009464	CGC	2	6	30891	30896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918715
510	NC_009464	ATC	2	6	30983	30988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918715
511	NC_009464	TC	3	6	31027	31032	0 %	50 %	0 %	50 %	147918715
512	NC_009464	TGC	2	6	31035	31040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918715
513	NC_009464	GTCGGG	2	12	31154	31165	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	147918715
514	NC_009464	GCT	2	6	31235	31240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918715
515	NC_009464	GCCGTA	2	12	31255	31266	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	147918715
516	NC_009464	CGC	2	6	31281	31286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918715
517	NC_009464	CTT	2	6	31317	31322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918715
518	NC_009464	GCA	3	9	31356	31364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918715
519	NC_009464	GCG	2	6	31367	31372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918715
520	NC_009464	GAA	2	6	31442	31447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918715
521	NC_009464	CGA	2	6	31470	31475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918715
522	NC_009464	CGT	2	6	31515	31520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918715
523	NC_009464	CGGT	2	8	31562	31569	0 %	25 %	50 %	25 %	147918715
524	NC_009464	GCC	2	6	31643	31648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918715
525	NC_009464	CT	3	6	31677	31682	0 %	50 %	0 %	50 %	147918715
526	NC_009464	CGT	2	6	31689	31694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918715
527	NC_009464	ATG	2	6	31736	31741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918715
528	NC_009464	TGC	2	6	31791	31796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918715
529	NC_009464	GCG	2	6	31874	31879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918715
530	NC_009464	ATC	2	6	31924	31929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918715
531	NC_009464	GTC	2	6	31937	31942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918715
532	NC_009464	CGA	2	6	31968	31973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918715
533	NC_009464	TTG	2	6	31976	31981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147918715
534	NC_009464	GAT	2	6	32020	32025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918715
535	NC_009464	CTG	2	6	32116	32121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918715
536	NC_009464	TGA	2	6	32202	32207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918715
537	NC_009464	GAT	2	6	32221	32226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918715
538	NC_009464	TCT	2	6	32264	32269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918715
539	NC_009464	AGTAG	2	10	32317	32326	40 %	20 %	40 %	0 %	147918715
540	NC_009464	CGG	2	6	32328	32333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918715
541	NC_009464	CAG	2	6	32346	32351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918715
542	NC_009464	ATT	3	9	32517	32525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147918715
543	NC_009464	GA	3	6	33287	33292	50 %	0 %	50 %	0 %	147918716
544	NC_009464	TCG	2	6	33341	33346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918716
545	NC_009464	GGT	2	6	33352	33357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147918716
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552	NC_009464	TCA	2	6	33593	33598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918716
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554	NC_009464	TCG	2	6	33641	33646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918716
555	NC_009464	TCG	2	6	33674	33679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918716
556	NC_009464	GC	3	6	33711	33716	0 %	0 %	50 %	50 %	147918716
557	NC_009464	AGA	2	6	33732	33737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918716
558	NC_009464	AGC	3	9	33756	33764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918716
559	NC_009464	ACA	3	9	33785	33793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147918716
560	NC_009464	GCT	2	6	33795	33800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918716
561	NC_009464	TCA	2	6	33905	33910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918716
562	NC_009464	CGG	2	6	33948	33953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918716
563	NC_009464	GTA	2	6	34006	34011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918716
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580	NC_009464	GCAG	2	8	35203	35210	25 %	0 %	50 %	25 %	147918718
581	NC_009464	GACT	2	8	35256	35263	25 %	25 %	25 %	25 %	147918718
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589	NC_009464	CGG	2	6	35716	35721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918718
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592	NC_009464	GCT	2	6	35767	35772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918718
593	NC_009464	AAG	2	6	35774	35779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918718
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595	NC_009464	GCC	2	6	35936	35941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918718
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600	NC_009464	AC	3	6	36301	36306	50 %	0 %	0 %	50 %	147918718
601	NC_009464	GCTG	2	8	36336	36343	0 %	25 %	50 %	25 %	147918718
602	NC_009464	ATCG	2	8	36344	36351	25 %	25 %	25 %	25 %	147918718
603	NC_009464	CGA	2	6	36361	36366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918718
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605	NC_009464	TCG	2	6	36441	36446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918718
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607	NC_009464	CAT	2	6	36472	36477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918718
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610	NC_009464	CGC	2	6	36610	36615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918718
611	NC_009464	TCATGG	2	12	36697	36708	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	147918718
612	NC_009464	ATC	2	6	36710	36715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918718
613	NC_009464	GCAG	2	8	36754	36761	25 %	0 %	50 %	25 %	147918718
614	NC_009464	GGA	2	6	36809	36814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918718
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617	NC_009464	CGA	2	6	37691	37696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918719
618	NC_009464	A	7	7	37719	37725	100 %	0 %	0 %	0 %	147918719
619	NC_009464	AAG	2	6	37839	37844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918719
620	NC_009464	CTT	2	6	37880	37885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918719
621	NC_009464	GCC	2	6	37923	37928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918719
622	NC_009464	CGG	2	6	37946	37951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918719
623	NC_009464	GGCTG	2	10	37978	37987	0 %	20 %	60 %	20 %	147918719
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625	NC_009464	GCA	2	6	38011	38016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918719
626	NC_009464	GAT	2	6	38033	38038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918719
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657	NC_009464	ATC	2	6	39995	40000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918720
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1000	NC_009464	ACG	2	6	61601	61606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918738

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