MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Metallosphaera sedula DSM 5348 chromosome

Total Repeats: 33575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009440	GA	3	6	29960	29965	50 %	0 %	50 %	0 %	146302818
502	NC_009440	GGA	2	6	29999	30004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302818
503	NC_009440	AGG	2	6	30065	30070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302818
504	NC_009440	GAA	2	6	30187	30192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302818
505	NC_009440	GA	3	6	30242	30247	50 %	0 %	50 %	0 %	146302818
506	NC_009440	GAC	2	6	30278	30283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146302818
507	NC_009440	AAG	2	6	30290	30295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302818
508	NC_009440	TAT	2	6	30371	30376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146302818
509	NC_009440	AG	4	8	30407	30414	50 %	0 %	50 %	0 %	146302818
510	NC_009440	AGA	2	6	30416	30421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302818
511	NC_009440	AAG	2	6	30511	30516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302818
512	NC_009440	GTT	2	6	30527	30532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146302818
513	NC_009440	GAA	2	6	30644	30649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302818
514	NC_009440	TA	3	6	30659	30664	50 %	50 %	0 %	0 %	146302818
515	NC_009440	ATT	2	6	30746	30751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146302818
516	NC_009440	GACA	2	8	30847	30854	50 %	0 %	25 %	25 %	146302818
517	NC_009440	GA	3	6	30929	30934	50 %	0 %	50 %	0 %	146302818
518	NC_009440	AAT	2	6	30944	30949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146302818
519	NC_009440	ACA	2	6	30981	30986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146302818
520	NC_009440	GTC	2	6	31012	31017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146302818
521	NC_009440	TTC	2	6	31046	31051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302818
522	NC_009440	CCG	2	6	31062	31067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146302818
523	NC_009440	AGG	2	6	31084	31089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302818
524	NC_009440	CTT	2	6	31106	31111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302818
525	NC_009440	GAG	2	6	31203	31208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302818
526	NC_009440	CCA	2	6	31232	31237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146302818
527	NC_009440	ATA	2	6	31295	31300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146302818
528	NC_009440	CTA	2	6	31422	31427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302818
529	NC_009440	ATA	2	6	31508	31513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146302818
530	NC_009440	AGC	2	6	31585	31590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146302818
531	NC_009440	ATG	2	6	31698	31703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302818
532	NC_009440	GA	3	6	31713	31718	50 %	0 %	50 %	0 %	146302818
533	NC_009440	GAA	2	6	31728	31733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302818
534	NC_009440	GAAG	2	8	31838	31845	50 %	0 %	50 %	0 %	146302818
535	NC_009440	AGG	2	6	31855	31860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302818
536	NC_009440	TA	3	6	32015	32020	50 %	50 %	0 %	0 %	146302818
537	NC_009440	GTT	2	6	32080	32085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146302818
538	NC_009440	AGTT	2	8	32121	32128	25 %	50 %	25 %	0 %	146302818
539	NC_009440	TGAG	2	8	32164	32171	25 %	25 %	50 %	0 %	146302818
540	NC_009440	ATA	2	6	32193	32198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146302819
541	NC_009440	ATA	2	6	32259	32264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146302819
542	NC_009440	GAAG	2	8	32301	32308	50 %	0 %	50 %	0 %	146302819
543	NC_009440	ATA	2	6	32331	32336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146302819
544	NC_009440	AGA	2	6	32545	32550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302819
545	NC_009440	A	7	7	32589	32595	100 %	0 %	0 %	0 %	146302819
546	NC_009440	AAC	2	6	32635	32640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146302819
547	NC_009440	GAG	2	6	32676	32681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302819
548	NC_009440	AGG	2	6	32686	32691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302819
549	NC_009440	CTCC	2	8	32707	32714	0 %	25 %	0 %	75 %	146302819
550	NC_009440	AGAA	2	8	32732	32739	75 %	0 %	25 %	0 %	146302819
551	NC_009440	TAC	2	6	32812	32817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302819
552	NC_009440	CCT	2	6	32823	32828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302819
553	NC_009440	AAT	2	6	32846	32851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146302819
554	NC_009440	AG	3	6	32855	32860	50 %	0 %	50 %	0 %	146302819
555	NC_009440	GA	3	6	32919	32924	50 %	0 %	50 %	0 %	146302819
556	NC_009440	ACG	2	6	33202	33207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146302819
557	NC_009440	AG	3	6	33254	33259	50 %	0 %	50 %	0 %	146302819
558	NC_009440	GCTG	2	8	33368	33375	0 %	25 %	50 %	25 %	146302819
559	NC_009440	ATG	2	6	33468	33473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302819
560	NC_009440	GT	3	6	33525	33530	0 %	50 %	50 %	0 %	146302819
561	NC_009440	GATGA	2	10	33558	33567	40 %	20 %	40 %	0 %	146302819
562	NC_009440	TCAG	2	8	33581	33588	25 %	25 %	25 %	25 %	146302819
563	NC_009440	AGG	2	6	33589	33594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302819
564	NC_009440	TGA	2	6	33616	33621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302819
565	NC_009440	AT	3	6	33634	33639	50 %	50 %	0 %	0 %	146302819
566	NC_009440	AGA	2	6	33731	33736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302819
567	NC_009440	AGTC	2	8	33833	33840	25 %	25 %	25 %	25 %	146302819
568	NC_009440	CTTC	2	8	33842	33849	0 %	50 %	0 %	50 %	146302819
569	NC_009440	GTG	2	6	33936	33941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146302819
570	NC_009440	AAG	2	6	33945	33950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302819
571	NC_009440	GGAG	2	8	33962	33969	25 %	0 %	75 %	0 %	146302819
572	NC_009440	CAG	2	6	33996	34001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146302819
573	NC_009440	ATG	2	6	34036	34041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302819
574	NC_009440	CT	3	6	34122	34127	0 %	50 %	0 %	50 %	146302819
575	NC_009440	GGA	2	6	34142	34147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302819
576	NC_009440	AGG	2	6	34177	34182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302819
577	NC_009440	AGA	2	6	34256	34261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302819
578	NC_009440	GA	3	6	34315	34320	50 %	0 %	50 %	0 %	146302819
579	NC_009440	TAA	2	6	34346	34351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146302819
580	NC_009440	CAA	2	6	34425	34430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146302819
581	NC_009440	TCAG	2	8	34431	34438	25 %	25 %	25 %	25 %	146302819
582	NC_009440	GA	4	8	34441	34448	50 %	0 %	50 %	0 %	146302819
583	NC_009440	CTT	2	6	34565	34570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302819
584	NC_009440	GGT	2	6	34581	34586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146302819
585	NC_009440	AG	3	6	34587	34592	50 %	0 %	50 %	0 %	146302819
586	NC_009440	AGG	2	6	34641	34646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302819
587	NC_009440	GA	3	6	34708	34713	50 %	0 %	50 %	0 %	146302819
588	NC_009440	CT	3	6	34723	34728	0 %	50 %	0 %	50 %	146302819
589	NC_009440	TCCA	2	8	34744	34751	25 %	25 %	0 %	50 %	146302819
590	NC_009440	TAGA	2	8	34783	34790	50 %	25 %	25 %	0 %	146302819
591	NC_009440	AG	4	8	34796	34803	50 %	0 %	50 %	0 %	146302819
592	NC_009440	GTTG	2	8	34806	34813	0 %	50 %	50 %	0 %	146302819
593	NC_009440	ATAA	2	8	34832	34839	75 %	25 %	0 %	0 %	146302820
594	NC_009440	A	6	6	34883	34888	100 %	0 %	0 %	0 %	146302820
595	NC_009440	ATA	2	6	34970	34975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146302820
596	NC_009440	CAAT	2	8	35045	35052	50 %	25 %	0 %	25 %	146302820
597	NC_009440	ATG	2	6	35180	35185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302820
598	NC_009440	GAG	2	6	35201	35206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302820
599	NC_009440	TGG	2	6	35274	35279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146302820
600	NC_009440	TGG	2	6	35299	35304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146302820
601	NC_009440	TCA	2	6	35379	35384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302820
602	NC_009440	ATT	2	6	35473	35478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146302820
603	NC_009440	AG	3	6	35486	35491	50 %	0 %	50 %	0 %	146302820
604	NC_009440	TTA	3	9	35568	35576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146302820
605	NC_009440	AAT	2	6	35642	35647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146302820
606	NC_009440	GCA	2	6	35681	35686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146302820
607	NC_009440	TAA	2	6	35694	35699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146302820
608	NC_009440	GA	4	8	35701	35708	50 %	0 %	50 %	0 %	146302820
609	NC_009440	GCC	2	6	35852	35857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146302820
610	NC_009440	GCT	2	6	35891	35896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146302820
611	NC_009440	ATT	2	6	35936	35941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146302820
612	NC_009440	CCAA	2	8	35947	35954	50 %	0 %	0 %	50 %	146302820
613	NC_009440	TGAA	2	8	36005	36012	50 %	25 %	25 %	0 %	146302820
614	NC_009440	CAAT	2	8	36021	36028	50 %	25 %	0 %	25 %	146302821
615	NC_009440	AGT	2	6	36203	36208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302821
616	NC_009440	TAT	2	6	36242	36247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146302821
617	NC_009440	CTG	2	6	36268	36273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146302821
618	NC_009440	AGA	2	6	36281	36286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302821
619	NC_009440	GAA	2	6	36363	36368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302822
620	NC_009440	AAT	2	6	36446	36451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146302822
621	NC_009440	TAG	2	6	36457	36462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302822
622	NC_009440	AGG	2	6	36494	36499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302822
623	NC_009440	A	6	6	36510	36515	100 %	0 %	0 %	0 %	146302822
624	NC_009440	AGA	2	6	36520	36525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302822
625	NC_009440	GTA	2	6	36546	36551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302822
626	NC_009440	GCAG	2	8	36696	36703	25 %	0 %	50 %	25 %	146302822
627	NC_009440	AAT	2	6	36722	36727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146302822
628	NC_009440	TAAT	2	8	36760	36767	50 %	50 %	0 %	0 %	146302822
629	NC_009440	AGA	2	6	36833	36838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302823
630	NC_009440	AGA	2	6	36891	36896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302823
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