MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Methanococcus maripaludis C5 chromosome

Total Repeats: 662

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009135	GCAATC	2	12	516	527	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	134045047
2	NC_009135	ATATTG	2	12	1602	1613	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	134045048
3	NC_009135	ACCTGC	2	12	9952	9963	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	134045061
4	NC_009135	CTGCAA	2	12	10823	10834	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	134045062
5	NC_009135	TGATCT	2	12	13473	13484	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	134045064
6	NC_009135	CCACCG	2	12	15119	15130	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	134045067
7	NC_009135	TTTTGT	2	12	23843	23854	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	134045075
8	NC_009135	TTTAAT	2	12	25216	25227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045078
9	NC_009135	CCTTTA	2	12	26171	26182	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	134045079
10	NC_009135	TTTTAA	2	12	28883	28894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045082
11	NC_009135	CTTTTT	2	12	29269	29280	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	134045082
12	NC_009135	ATTTTA	2	12	31570	31581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045086
13	NC_009135	AAATCA	2	12	36406	36417	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	134045092
14	NC_009135	TCAACA	2	12	40834	40845	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	134045096
15	NC_009135	AATTTC	2	12	43383	43394	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	134045098
16	NC_009135	ATTACC	2	12	45751	45762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134045102
17	NC_009135	AGAAAC	2	12	49899	49910	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	134045106
18	NC_009135	CTATCT	2	12	51455	51466	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	134045107
19	NC_009135	TTAAAG	2	12	52756	52767	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	134045108
20	NC_009135	TTGAAG	2	12	54190	54201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134045109
21	NC_009135	GCATTC	2	12	55514	55525	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	134045110
22	NC_009135	AAGTTA	2	12	61121	61132	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	134045118
23	NC_009135	AGATGT	2	12	61173	61184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134045118
24	NC_009135	TTGGTG	2	12	65931	65942	0 %	50 %	50 %	0 %	134045123
25	NC_009135	TTTTAT	2	12	67598	67609	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	134045125
26	NC_009135	CTTTTT	2	12	69553	69564	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	134045127
27	NC_009135	TAAATG	2	12	72308	72319	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	134045130
28	NC_009135	TTTTAT	2	12	75026	75037	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	134045133
29	NC_009135	ATTTCA	2	12	76111	76122	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	134045134
30	NC_009135	AAATAA	2	12	77162	77173	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	134045134
31	NC_009135	AATTCA	2	12	77607	77618	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	134045135
32	NC_009135	CGCTAC	2	12	82428	82439	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	134045139
33	NC_009135	AAGATA	2	12	83307	83318	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	134045140
34	NC_009135	TCAAAT	2	12	86654	86665	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	134045144
35	NC_009135	ATTTTC	2	12	86953	86964	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	134045144
36	NC_009135	CTGCAT	2	12	88792	88803	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	134045146
37	NC_009135	CATCTT	2	12	92737	92748	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	134045150
38	NC_009135	TAAATC	2	12	93278	93289	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	134045150
39	NC_009135	ACTTTT	2	12	94859	94870	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	134045151
40	NC_009135	AATTTG	2	12	96365	96376	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	134045153
41	NC_009135	TGCACC	2	12	97560	97571	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	134045154
42	NC_009135	GAAAAA	2	12	98763	98774	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	134045156
43	NC_009135	TAGATA	2	12	102093	102104	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	134045161
44	NC_009135	CTACCT	2	12	113958	113969	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	134045181
45	NC_009135	CAAACT	2	12	116457	116468	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	134045184
46	NC_009135	TCCAAT	2	12	118214	118225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134045186
47	NC_009135	TCTTTT	2	12	120277	120288	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	134045187
48	NC_009135	CAGTTG	2	12	121138	121149	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	134045188
49	NC_009135	ATTTTT	2	12	127333	127344	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	134045196
50	NC_009135	ATTGGA	2	12	133230	133241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134045201
51	NC_009135	TTCTTT	2	12	138112	138123	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	134045208
52	NC_009135	TTACTT	2	12	144859	144870	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	134045223
53	NC_009135	GTTTTT	2	12	145972	145983	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	134045226
54	NC_009135	ATATTG	2	12	157664	157675	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	134045233
55	NC_009135	ATCCAA	2	12	160806	160817	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	134045236
56	NC_009135	TCACGT	2	12	162238	162249	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	134045237
57	NC_009135	TCTTAG	2	12	164239	164250	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	134045240
58	NC_009135	TTTTCT	2	12	164316	164327	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	134045240
59	NC_009135	CATTTT	2	12	166893	166904	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	134045242
60	NC_009135	TTCCAA	2	12	167612	167623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134045243
61	NC_009135	GCAATT	2	12	168876	168887	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	134045244
62	NC_009135	TGAATC	2	12	169908	169919	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	134045246
63	NC_009135	CTAAAA	2	12	171340	171351	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	134045248
64	NC_009135	CTCTTT	2	12	176923	176934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134045253
65	NC_009135	CAGTTT	2	12	179005	179016	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	134045254
66	NC_009135	TTTTAA	2	12	180426	180437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045256
67	NC_009135	TCAGCT	2	12	184025	184036	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	134045260
68	NC_009135	TCTAAC	2	12	186312	186323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134045261
69	NC_009135	CAACTA	2	12	187169	187180	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	134045261
70	NC_009135	TTGAAG	2	12	190459	190470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134045264
71	NC_009135	AAAAGT	2	12	193923	193934	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	134045269
72	NC_009135	CATAAC	2	12	197248	197259	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	134045273
73	NC_009135	AAAAGA	2	12	198123	198134	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	134045273
74	NC_009135	TATCGG	2	12	200915	200926	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	134045277
75	NC_009135	ACAAAA	2	12	203345	203356	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	134045280
76	NC_009135	TAATTT	2	12	203997	204008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045281
77	NC_009135	TTCAGA	2	12	206520	206531	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	134045282
78	NC_009135	CTTTTT	2	12	206878	206889	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	134045282
79	NC_009135	TCATTT	2	12	207476	207487	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	134045283
80	NC_009135	ATTTAA	2	12	208953	208964	50 %	50 %	0 %	0 %	134045285
81	NC_009135	TGAATA	2	12	209319	209330	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	134045285
82	NC_009135	AACTTC	2	12	210342	210353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134045286
83	NC_009135	TGAATT	2	12	211577	211588	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	134045287
84	NC_009135	TTCAAA	2	12	213062	213073	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	134045288
85	NC_009135	CATCTG	2	12	223724	223735	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	134045303
86	NC_009135	TTCATC	2	12	224949	224960	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	134045304
87	NC_009135	ATCTTC	2	12	229751	229762	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	134045310
88	NC_009135	AATTTT	2	12	231452	231463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045314
89	NC_009135	AGCTTC	2	12	232405	232416	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	134045316
90	NC_009135	AAATCG	2	12	236360	236371	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	134045320
91	NC_009135	AGTTGT	2	12	240642	240653	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	134045324
92	NC_009135	GCAATG	2	12	241102	241113	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	134045324
93	NC_009135	TTCAAC	2	12	241360	241371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134045324
94	NC_009135	TTTAAT	2	12	242629	242640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045326
95	NC_009135	TTTTAG	2	12	246804	246815	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	134045332
96	NC_009135	GTGCAG	2	12	255032	255043	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	134045340
97	NC_009135	TCCAAA	2	12	256979	256990	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	134045341
98	NC_009135	TTCTTT	2	12	257561	257572	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	134045342
99	NC_009135	TCATAC	2	12	259147	259158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134045343
100	NC_009135	TTTTTC	2	12	259672	259683	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	134045343
101	NC_009135	TTTCTT	2	12	260015	260026	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	134045343
102	NC_009135	TTGCAA	2	12	261344	261355	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	134045344
103	NC_009135	AACCAC	2	12	265846	265857	50 %	0 %	0 %	50 %	134045347
104	NC_009135	TCGCCA	2	12	268470	268481	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	134045350
105	NC_009135	ATTTTA	2	12	271200	271211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045353
106	NC_009135	TTTGTA	2	12	272343	272354	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	134045354
107	NC_009135	ATTTTG	2	12	273142	273153	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	134045354
108	NC_009135	TAAAAA	2	12	273641	273652	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	134045354
109	NC_009135	TTCCAA	2	12	275533	275544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134045357
110	NC_009135	TGGCGG	2	12	276987	276998	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	134045360
111	NC_009135	AATAAA	2	12	277738	277749	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	134045360
112	NC_009135	GAAAAG	2	12	279066	279077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134045361
113	NC_009135	AAGATG	2	12	280730	280741	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	134045362
114	NC_009135	CAGGTC	2	12	281745	281756	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	134045364
115	NC_009135	CTTGGG	2	12	286776	286787	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	134045368
116	NC_009135	TTGCAA	2	12	286885	286896	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	134045368
117	NC_009135	GAAAAA	2	12	292015	292026	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	134045371
118	NC_009135	AAGGGG	2	12	292863	292874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134045372
119	NC_009135	AGAAAT	2	12	293283	293294	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	134045373
120	NC_009135	GTTCGA	2	12	300263	300274	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	134045381
121	NC_009135	TTCAAA	2	12	300381	300392	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	134045381
122	NC_009135	TTCCAG	2	12	304756	304767	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	134045384
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126	NC_009135	GCACAC	2	12	310248	310259	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	134045391
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224	NC_009135	CAAAAT	2	12	636350	636361	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	134045702
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226	NC_009135	ATGGCA	2	12	647464	647475	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	134045711
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229	NC_009135	ATTTTT	2	12	659303	659314	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	134045723
230	NC_009135	TAAAGT	2	12	659957	659968	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	134045723
231	NC_009135	TCCAAT	2	12	660864	660875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134045724
232	NC_009135	GTTATT	2	12	671891	671902	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	134045736
233	NC_009135	GGAATT	2	12	677165	677176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134045740
234	NC_009135	AGACAC	2	12	677951	677962	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	134045740
235	NC_009135	TTGAAT	2	12	679117	679128	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	134045741
236	NC_009135	ATCAAA	2	12	680456	680467	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	134045743
237	NC_009135	GCAATA	2	12	680700	680711	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	134045743
238	NC_009135	TGTATT	2	12	681077	681088	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	134045743
239	NC_009135	TGCAAC	2	12	685590	685601	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	134045749
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243	NC_009135	ATCTGT	2	12	695551	695562	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	134045764
244	NC_009135	GACTGC	2	12	710183	710194	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	134045780
245	NC_009135	AAGATA	2	12	712374	712385	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	134045783
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250	NC_009135	ATGCAA	2	12	718645	718656	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	134045790
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254	NC_009135	TCCATG	2	12	727785	727796	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	134045798
255	NC_009135	ATTCTG	2	12	733420	733431	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	134045805
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258	NC_009135	ATTTGT	2	12	738484	738495	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	134045809
259	NC_009135	CTACGG	2	12	741267	741278	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	134045811
260	NC_009135	AATGAA	2	12	741939	741950	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	134045813
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262	NC_009135	ATTTTA	2	12	747718	747729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045817
263	NC_009135	TTTCTT	2	12	747785	747796	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	134045817
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296	NC_009135	GTTGCA	2	12	827277	827288	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	134045889
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328	NC_009135	GTTTCT	2	12	901461	901472	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	134045957
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331	NC_009135	CAATAG	2	12	903730	903741	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	134045958
332	NC_009135	GACCAA	2	12	907133	907144	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	134045964
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341	NC_009135	TGCAAT	2	12	934811	934822	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	134045996
342	NC_009135	TCCAAT	2	12	937972	937983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134046001
343	NC_009135	GAATCA	2	12	940430	940441	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	134046003
344	NC_009135	CAGTTC	2	12	940860	940871	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	134046003
345	NC_009135	TTCAGC	2	12	944253	944264	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	134046007
346	NC_009135	ATTGAA	2	12	947767	947778	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	134046010
347	NC_009135	TAATTC	2	12	952211	952222	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	134046017
348	NC_009135	GTGCAA	2	12	952426	952437	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	134046017
349	NC_009135	TCAAAT	2	12	961464	961475	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	134046027
350	NC_009135	CAATTG	2	12	962868	962879	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	134046030
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440	NC_009135	GCAGAT	2	12	1210878	1210889	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	134046291
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443	NC_009135	TTAAAA	2	12	1217337	1217348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134046295
444	NC_009135	AGAATA	2	12	1217634	1217645	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	134046295
445	NC_009135	CTGAAA	2	12	1218466	1218477	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	134046296
446	NC_009135	CTTCAG	2	12	1219738	1219749	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	134046296
447	NC_009135	AAACCT	2	12	1220063	1220074	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	134046297
448	NC_009135	TCCTTT	2	12	1222231	1222242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134046298
449	NC_009135	ATAATC	2	12	1231110	1231121	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	134046308
450	NC_009135	GAATCG	2	12	1231577	1231588	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	134046308
451	NC_009135	TTTTTA	2	12	1239793	1239804	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	134046322
452	NC_009135	TGCAGT	2	12	1240331	1240342	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	134046323
453	NC_009135	TATCCA	2	12	1241281	1241292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134046323
454	NC_009135	TTAAAT	2	12	1242896	1242907	50 %	50 %	0 %	0 %	134046324
455	NC_009135	TTCCAC	2	12	1245560	1245571	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	134046326
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