MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methanococcus maripaludis C5 chromosome

Total Repeats: 1135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009135	GTTTA	2	10	11	20	20 %	60 %	20 %	0 %	134045047
2	NC_009135	TAAAA	2	10	1378	1387	80 %	20 %	0 %	0 %	134045048
3	NC_009135	CTTTT	2	10	2619	2628	0 %	80 %	0 %	20 %	134045050
4	NC_009135	GATTC	2	10	2725	2734	20 %	40 %	20 %	20 %	134045050
5	NC_009135	GAAAA	2	10	3356	3365	80 %	0 %	20 %	0 %	134045051
6	NC_009135	TTTAA	2	10	3539	3548	40 %	60 %	0 %	0 %	134045051
7	NC_009135	GATCT	2	10	5714	5723	20 %	40 %	20 %	20 %	134045055
8	NC_009135	TAATC	2	10	11904	11913	40 %	40 %	0 %	20 %	134045063
9	NC_009135	ATTTT	2	10	18004	18013	20 %	80 %	0 %	0 %	134045069
10	NC_009135	TAATT	2	10	19195	19204	40 %	60 %	0 %	0 %	134045070
11	NC_009135	AAAAT	2	10	19422	19431	80 %	20 %	0 %	0 %	134045070
12	NC_009135	TGAAA	2	10	20082	20091	60 %	20 %	20 %	0 %	134045071
13	NC_009135	TATTT	2	10	22093	22102	20 %	80 %	0 %	0 %	134045073
14	NC_009135	TAATT	2	10	23539	23548	40 %	60 %	0 %	0 %	134045075
15	NC_009135	CTTTT	2	10	24593	24602	0 %	80 %	0 %	20 %	134045076
16	NC_009135	AAAAT	2	10	27319	27328	80 %	20 %	0 %	0 %	134045080
17	NC_009135	TAGAA	2	10	27611	27620	60 %	20 %	20 %	0 %	134045080
18	NC_009135	ATTTA	2	10	32723	32732	40 %	60 %	0 %	0 %	134045087
19	NC_009135	ATTTA	2	10	35674	35683	40 %	60 %	0 %	0 %	134045090
20	NC_009135	AATTT	2	10	36895	36904	40 %	60 %	0 %	0 %	134045092
21	NC_009135	ATTTT	2	10	36963	36972	20 %	80 %	0 %	0 %	134045092
22	NC_009135	TACAT	2	10	38384	38393	40 %	40 %	0 %	20 %	134045094
23	NC_009135	TCCAA	2	10	38881	38890	40 %	20 %	0 %	40 %	134045094
24	NC_009135	TAATT	2	10	39298	39307	40 %	60 %	0 %	0 %	134045095
25	NC_009135	TTTCA	2	10	39347	39356	20 %	60 %	0 %	20 %	134045095
26	NC_009135	ATTTT	2	10	40909	40918	20 %	80 %	0 %	0 %	134045096
27	NC_009135	TTTCA	2	10	40932	40941	20 %	60 %	0 %	20 %	134045096
28	NC_009135	TAAAT	2	10	41050	41059	60 %	40 %	0 %	0 %	134045096
29	NC_009135	CTGAA	2	10	41198	41207	40 %	20 %	20 %	20 %	134045096
30	NC_009135	TCATT	2	10	43031	43040	20 %	60 %	0 %	20 %	134045098
31	NC_009135	CATGG	2	10	43965	43974	20 %	20 %	40 %	20 %	134045099
32	NC_009135	TACAA	2	10	45787	45796	60 %	20 %	0 %	20 %	134045102
33	NC_009135	GTATT	2	10	46534	46543	20 %	60 %	20 %	0 %	134045102
34	NC_009135	AAAAG	2	10	47511	47520	80 %	0 %	20 %	0 %	134045103
35	NC_009135	ACTCA	2	10	51013	51022	40 %	20 %	0 %	40 %	134045107
36	NC_009135	CTTTT	2	10	51940	51949	0 %	80 %	0 %	20 %	134045107
37	NC_009135	TACTG	2	10	53973	53982	20 %	40 %	20 %	20 %	134045109
38	NC_009135	TTCAA	2	10	54050	54059	40 %	40 %	0 %	20 %	134045109
39	NC_009135	GAAAT	2	10	57328	57337	60 %	20 %	20 %	0 %	134045111
40	NC_009135	AATTA	2	10	58392	58401	60 %	40 %	0 %	0 %	134045113
41	NC_009135	ATCAA	2	10	58985	58994	60 %	20 %	0 %	20 %	134045113
42	NC_009135	TTTTA	2	10	61620	61629	20 %	80 %	0 %	0 %	134045118
43	NC_009135	GAAAA	2	10	63070	63079	80 %	0 %	20 %	0 %	134045119
44	NC_009135	GTACA	2	10	66472	66481	40 %	20 %	20 %	20 %	134045124
45	NC_009135	AGATC	2	10	70007	70016	40 %	20 %	20 %	20 %	134045128
46	NC_009135	AAAAT	2	10	73220	73229	80 %	20 %	0 %	0 %	134045131
47	NC_009135	TCGAT	2	10	73858	73867	20 %	40 %	20 %	20 %	134045132
48	NC_009135	TTTTA	2	10	74770	74779	20 %	80 %	0 %	0 %	134045133
49	NC_009135	ATTTT	2	10	75001	75010	20 %	80 %	0 %	0 %	134045133
50	NC_009135	AAATG	2	10	76431	76440	60 %	20 %	20 %	0 %	134045134
51	NC_009135	AATGT	2	10	76637	76646	40 %	40 %	20 %	0 %	134045134
52	NC_009135	GAAAT	2	10	76730	76739	60 %	20 %	20 %	0 %	134045134
53	NC_009135	TTCTA	2	10	78392	78401	20 %	60 %	0 %	20 %	134045135
54	NC_009135	TCTGC	2	10	80136	80145	0 %	40 %	20 %	40 %	134045136
55	NC_009135	TTAAT	2	10	83079	83088	40 %	60 %	0 %	0 %	134045140
56	NC_009135	AATTC	2	10	86570	86579	40 %	40 %	0 %	20 %	134045144
57	NC_009135	TTTTA	2	10	86698	86707	20 %	80 %	0 %	0 %	134045144
58	NC_009135	ATTTT	2	10	89014	89023	20 %	80 %	0 %	0 %	134045146
59	NC_009135	ACAAA	2	10	90530	90539	80 %	0 %	0 %	20 %	134045147
60	NC_009135	GAAAT	2	10	91014	91023	60 %	20 %	20 %	0 %	134045148
61	NC_009135	CATTA	2	10	98100	98109	40 %	40 %	0 %	20 %	134045155
62	NC_009135	AAAAC	2	10	98144	98153	80 %	0 %	0 %	20 %	134045155
63	NC_009135	ATTAA	2	10	98231	98240	60 %	40 %	0 %	0 %	134045155
64	NC_009135	ATCAA	2	10	100385	100394	60 %	20 %	0 %	20 %	134045158
65	NC_009135	CATAC	2	10	100700	100709	40 %	20 %	0 %	40 %	134045159
66	NC_009135	ATATC	2	10	101810	101819	40 %	40 %	0 %	20 %	134045160
67	NC_009135	ACAGG	2	10	102491	102500	40 %	0 %	40 %	20 %	134045161
68	NC_009135	CCGAT	2	10	105330	105339	20 %	20 %	20 %	40 %	134045165
69	NC_009135	GCGCT	2	10	106518	106527	0 %	20 %	40 %	40 %	134045167
70	NC_009135	AATAT	2	10	107352	107361	60 %	40 %	0 %	0 %	134045169
71	NC_009135	TCTTT	2	10	107840	107849	0 %	80 %	0 %	20 %	134045170
72	NC_009135	ATAGA	2	10	108045	108054	60 %	20 %	20 %	0 %	134045170
73	NC_009135	GTATA	2	10	108218	108227	40 %	40 %	20 %	0 %	134045171
74	NC_009135	AATGT	2	10	111154	111163	40 %	40 %	20 %	0 %	134045178
75	NC_009135	GAAAA	2	10	111528	111537	80 %	0 %	20 %	0 %	134045178
76	NC_009135	GAAAA	2	10	111580	111589	80 %	0 %	20 %	0 %	134045178
77	NC_009135	ATTTA	2	10	111743	111752	40 %	60 %	0 %	0 %	134045179
78	NC_009135	GAGTG	2	10	112735	112744	20 %	20 %	60 %	0 %	134045180
79	NC_009135	GTTAA	2	10	113766	113775	40 %	40 %	20 %	0 %	134045181
80	NC_009135	GGATT	2	10	115970	115979	20 %	40 %	40 %	0 %	134045184
81	NC_009135	GTAAT	2	10	116929	116938	40 %	40 %	20 %	0 %	134045185
82	NC_009135	ACTTA	2	10	118412	118421	40 %	40 %	0 %	20 %	134045186
83	NC_009135	CCTAC	2	10	123982	123991	20 %	20 %	0 %	60 %	134045192
84	NC_009135	ACTTT	2	10	125474	125483	20 %	60 %	0 %	20 %	134045194
85	NC_009135	AAAAG	2	10	127001	127010	80 %	0 %	20 %	0 %	134045195
86	NC_009135	TATTT	2	10	127471	127480	20 %	80 %	0 %	0 %	134045197
87	NC_009135	ACCTG	2	10	131483	131492	20 %	20 %	20 %	40 %	134045200
88	NC_009135	AATGA	2	10	131852	131861	60 %	20 %	20 %	0 %	134045200
89	NC_009135	AAAAT	2	10	132934	132943	80 %	20 %	0 %	0 %	134045201
90	NC_009135	AGTGT	2	10	136085	136094	20 %	40 %	40 %	0 %	134045204
91	NC_009135	CTTCT	2	10	137478	137487	0 %	60 %	0 %	40 %	134045206
92	NC_009135	CCATA	2	10	139744	139753	40 %	20 %	0 %	40 %	134045212
93	NC_009135	TTTTC	2	10	142231	142240	0 %	80 %	0 %	20 %	134045217
94	NC_009135	TTTAG	2	10	144286	144295	20 %	60 %	20 %	0 %	134045221
95	NC_009135	TTCAA	2	10	146155	146164	40 %	40 %	0 %	20 %	134045226
96	NC_009135	ATTGT	2	10	146809	146818	20 %	60 %	20 %	0 %	134045226
97	NC_009135	CTTTT	2	10	146892	146901	0 %	80 %	0 %	20 %	134045226
98	NC_009135	TTTTC	2	10	148099	148108	0 %	80 %	0 %	20 %	134045227
99	NC_009135	GCTGT	2	10	148198	148207	0 %	40 %	40 %	20 %	134045227
100	NC_009135	TTAAA	2	10	149263	149272	60 %	40 %	0 %	0 %	134045227
101	NC_009135	CTTTT	2	10	149909	149918	0 %	80 %	0 %	20 %	134045227
102	NC_009135	GTTTA	2	10	150275	150284	20 %	60 %	20 %	0 %	134045227
103	NC_009135	ACAAA	2	10	150450	150459	80 %	0 %	0 %	20 %	134045227
104	NC_009135	TTTTA	2	10	153722	153731	20 %	80 %	0 %	0 %	134045229
105	NC_009135	AAAAG	2	10	153861	153870	80 %	0 %	20 %	0 %	134045229
106	NC_009135	GAAAT	2	10	155005	155014	60 %	20 %	20 %	0 %	134045230
107	NC_009135	CAGGT	2	10	155305	155314	20 %	20 %	40 %	20 %	134045230
108	NC_009135	ATATA	2	10	156876	156885	60 %	40 %	0 %	0 %	134045232
109	NC_009135	CACAA	2	10	158410	158419	60 %	0 %	0 %	40 %	134045233
110	NC_009135	ATATT	2	10	160224	160233	40 %	60 %	0 %	0 %	134045235
111	NC_009135	ATATT	2	10	161419	161428	40 %	60 %	0 %	0 %	134045237
112	NC_009135	ACTGA	2	10	163277	163286	40 %	20 %	20 %	20 %	134045239
113	NC_009135	TTAAT	2	10	165402	165411	40 %	60 %	0 %	0 %	134045241
114	NC_009135	ATTAA	2	10	167328	167337	60 %	40 %	0 %	0 %	134045243
115	NC_009135	TATTT	2	10	167709	167718	20 %	80 %	0 %	0 %	134045243
116	NC_009135	TTATT	2	10	169175	169184	20 %	80 %	0 %	0 %	134045245
117	NC_009135	TCAAT	2	10	169970	169979	40 %	40 %	0 %	20 %	134045246
118	NC_009135	TAAAT	2	10	170541	170550	60 %	40 %	0 %	0 %	134045246
119	NC_009135	TTATT	2	10	170670	170679	20 %	80 %	0 %	0 %	134045247
120	NC_009135	GCTTT	2	10	172194	172203	0 %	60 %	20 %	20 %	134045249
121	NC_009135	ATTTT	2	10	174639	174648	20 %	80 %	0 %	0 %	134045251
122	NC_009135	TCAAT	2	10	175494	175503	40 %	40 %	0 %	20 %	134045252
123	NC_009135	TAATT	2	10	175771	175780	40 %	60 %	0 %	0 %	134045252
124	NC_009135	GGAGC	2	10	178666	178675	20 %	0 %	60 %	20 %	134045254
125	NC_009135	TTTCT	2	10	182744	182753	0 %	80 %	0 %	20 %	134045259
126	NC_009135	TTGAA	2	10	187765	187774	40 %	40 %	20 %	0 %	134045262
127	NC_009135	AATAA	2	10	188461	188470	80 %	20 %	0 %	0 %	134045262
128	NC_009135	AAAAG	2	10	191844	191853	80 %	0 %	20 %	0 %	134045267
129	NC_009135	ATTTT	2	10	192800	192809	20 %	80 %	0 %	0 %	134045268
130	NC_009135	ACCGT	2	10	194975	194984	20 %	20 %	20 %	40 %	134045270
131	NC_009135	TAAAT	2	10	195404	195413	60 %	40 %	0 %	0 %	134045270
132	NC_009135	AAAAG	2	10	197238	197247	80 %	0 %	20 %	0 %	134045273
133	NC_009135	GAACT	2	10	198218	198227	40 %	20 %	20 %	20 %	134045273
134	NC_009135	TTAAT	2	10	198478	198487	40 %	60 %	0 %	0 %	134045273
135	NC_009135	AGGAA	2	10	199161	199170	60 %	0 %	40 %	0 %	134045274
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