MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanococcus maripaludis C5 chromosome

Total Repeats: 20034

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009135	GAA	2	6	78	83	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134045047
2	NC_009135	TTC	2	6	98	103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134045047
3	NC_009135	ATT	2	6	289	294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045047
4	NC_009135	AAT	2	6	350	355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045047
5	NC_009135	ACA	2	6	453	458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134045047
6	NC_009135	GAA	2	6	459	464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134045047
7	NC_009135	CAA	2	6	529	534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134045047
8	NC_009135	ATT	2	6	858	863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045048
9	NC_009135	AAT	2	6	878	883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045048
10	NC_009135	GAA	2	6	977	982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134045048
11	NC_009135	TTC	2	6	1024	1029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134045048
12	NC_009135	AAT	2	6	1166	1171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045048
13	NC_009135	GAA	2	6	1196	1201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134045048
14	NC_009135	GAT	2	6	1322	1327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134045048
15	NC_009135	ATT	2	6	1400	1405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045048
16	NC_009135	GAA	2	6	1463	1468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134045048
17	NC_009135	ATT	2	6	1476	1481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045048
18	NC_009135	TAA	2	6	1482	1487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045048
19	NC_009135	AAG	2	6	1495	1500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134045048
20	NC_009135	TCC	2	6	1522	1527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	134045048
21	NC_009135	CAG	2	6	1632	1637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134045048
22	NC_009135	GAA	2	6	1649	1654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134045048
23	NC_009135	AGA	2	6	1708	1713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134045048
24	NC_009135	GCA	2	6	2092	2097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134045049
25	NC_009135	ATT	2	6	2168	2173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045049
26	NC_009135	TTG	2	6	2177	2182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134045049
27	NC_009135	ATT	2	6	2219	2224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045049
28	NC_009135	AGA	2	6	2379	2384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134045049
29	NC_009135	TAC	2	6	2392	2397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134045049
30	NC_009135	AAT	2	6	2439	2444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045049
31	NC_009135	GAT	2	6	2464	2469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134045049
32	NC_009135	ATT	2	6	2513	2518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045050
33	NC_009135	TTC	2	6	2679	2684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134045050
34	NC_009135	ATT	2	6	2843	2848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045051
35	NC_009135	AGT	2	6	2962	2967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134045051
36	NC_009135	ATT	2	6	2991	2996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045051
37	NC_009135	AAT	2	6	3002	3007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045051
38	NC_009135	TTC	2	6	3079	3084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134045051
39	NC_009135	AAT	2	6	3268	3273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045051
40	NC_009135	TGA	2	6	3336	3341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134045051
41	NC_009135	TAA	3	9	3379	3387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045051
42	NC_009135	ATA	2	6	3390	3395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045051
43	NC_009135	AAG	2	6	3430	3435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134045051
44	NC_009135	ATA	2	6	3581	3586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045051
45	NC_009135	ATA	2	6	3761	3766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045051
46	NC_009135	AAT	2	6	3787	3792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045051
47	NC_009135	GAT	2	6	3850	3855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134045052
48	NC_009135	AGA	2	6	3985	3990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134045052
49	NC_009135	AGA	2	6	4203	4208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134045052
50	NC_009135	GTA	2	6	4222	4227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134045052
51	NC_009135	ATC	2	6	4382	4387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134045052
52	NC_009135	TGG	2	6	4427	4432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134045052
53	NC_009135	TAA	2	6	4490	4495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045052
54	NC_009135	GAA	2	6	4649	4654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134045053
55	NC_009135	ATA	2	6	4704	4709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045053
56	NC_009135	AGA	2	6	4855	4860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134045053
57	NC_009135	AAT	2	6	4861	4866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045053
58	NC_009135	ATA	2	6	5008	5013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045054
59	NC_009135	ACT	2	6	5376	5381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134045054
60	NC_009135	GAT	2	6	5576	5581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134045055
61	NC_009135	GTG	2	6	5696	5701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134045055
62	NC_009135	CTT	2	6	5728	5733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134045055
63	NC_009135	ATG	2	6	5833	5838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134045055
64	NC_009135	ACC	2	6	5951	5956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134045055
65	NC_009135	TCT	2	6	6063	6068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134045055
66	NC_009135	GCA	2	6	6069	6074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134045055
67	NC_009135	CTT	2	6	6223	6228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134045055
68	NC_009135	CCG	2	6	6234	6239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134045055
69	NC_009135	CAG	2	6	6307	6312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134045055
70	NC_009135	TCT	2	6	6342	6347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134045055
71	NC_009135	ATT	2	6	6468	6473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045055
72	NC_009135	TTA	2	6	6499	6504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045056
73	NC_009135	AAT	2	6	6510	6515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045056
74	NC_009135	ATT	2	6	6612	6617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045056
75	NC_009135	TTG	2	6	6685	6690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134045056
76	NC_009135	ACT	2	6	6696	6701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134045056
77	NC_009135	TCA	2	6	6845	6850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134045057
78	NC_009135	CCT	2	6	6940	6945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	134045057
79	NC_009135	CAG	3	9	6956	6964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134045057
80	NC_009135	TCT	2	6	6997	7002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134045057
81	NC_009135	CAA	2	6	7091	7096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134045057
82	NC_009135	GAT	2	6	7167	7172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134045057
83	NC_009135	ACC	2	6	7173	7178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134045057
84	NC_009135	CAA	2	6	7295	7300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134045057
85	NC_009135	CTG	3	9	7457	7465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134045057
86	NC_009135	CCT	3	9	7493	7501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	134045058
87	NC_009135	GTA	2	6	7567	7572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134045058
88	NC_009135	CAG	3	9	7692	7700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134045058
89	NC_009135	TCT	2	6	7733	7738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134045058
90	NC_009135	CAA	2	6	7827	7832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134045058
91	NC_009135	GAT	2	6	7903	7908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134045058
92	NC_009135	ACC	2	6	7909	7914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134045058
93	NC_009135	CAA	2	6	8031	8036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134045058
94	NC_009135	CTG	3	9	8193	8201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134045058
95	NC_009135	AGA	2	6	8668	8673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134045060
96	NC_009135	CTG	2	6	8683	8688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134045060
97	NC_009135	CTG	2	6	8824	8829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134045060
98	NC_009135	GTT	2	6	8855	8860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134045060
99	NC_009135	TAA	2	6	8872	8877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045060
100	NC_009135	CTG	2	6	8884	8889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134045060
101	NC_009135	AAT	2	6	8969	8974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045060
102	NC_009135	CAA	2	6	9025	9030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134045060
103	NC_009135	GCA	2	6	9045	9050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134045060
104	NC_009135	CTT	2	6	9186	9191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134045060
105	NC_009135	TAA	2	6	9227	9232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045060
106	NC_009135	CCA	2	6	9234	9239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134045060
107	NC_009135	ATA	2	6	9292	9297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045060
108	NC_009135	CTG	2	6	9337	9342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134045060
109	NC_009135	TCC	2	6	9347	9352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	134045060
110	NC_009135	CCA	2	6	9354	9359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134045060
111	NC_009135	GAA	2	6	9452	9457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134045061
112	NC_009135	ACC	2	6	9523	9528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134045061
113	NC_009135	TGT	2	6	9531	9536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134045061
114	NC_009135	AGA	2	6	9561	9566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134045061
115	NC_009135	CAC	2	6	9636	9641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134045061
116	NC_009135	ACC	2	6	9646	9651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134045061
117	NC_009135	TGC	2	6	9655	9660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134045061
118	NC_009135	TGT	2	6	9706	9711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134045061
119	NC_009135	CTG	2	6	9771	9776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134045061
120	NC_009135	TGT	2	6	9973	9978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134045061
121	NC_009135	GCT	2	6	10010	10015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134045061
122	NC_009135	CAC	2	6	10020	10025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134045061
123	NC_009135	ATA	2	6	10112	10117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045061
124	NC_009135	CTG	2	6	10199	10204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134045062
125	NC_009135	ACT	2	6	10213	10218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134045062
126	NC_009135	CTA	2	6	10226	10231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134045062
127	NC_009135	GAT	2	6	10269	10274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134045062
128	NC_009135	ACC	2	6	10341	10346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134045062
129	NC_009135	GAA	2	6	10366	10371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134045062
130	NC_009135	TGA	2	6	10497	10502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134045062
131	NC_009135	TGT	2	6	10572	10577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134045062
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255	NC_009135	CAA	2	6	21339	21344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134045072
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