MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 5456

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009051	ACGA	2	8	634	641	50 %	0 %	25 %	25 %	126177953
2	NC_009051	CCGA	2	8	886	893	25 %	0 %	25 %	50 %	126177953
3	NC_009051	GAGC	2	8	1843	1850	25 %	0 %	50 %	25 %	126177954
4	NC_009051	CCAT	2	8	4150	4157	25 %	25 %	0 %	50 %	126177957
5	NC_009051	GACG	2	8	4354	4361	25 %	0 %	50 %	25 %	126177957
6	NC_009051	GCGA	2	8	4402	4409	25 %	0 %	50 %	25 %	126177957
7	NC_009051	GCGG	2	8	5569	5576	0 %	0 %	75 %	25 %	126177959
8	NC_009051	CGTC	2	8	5646	5653	0 %	25 %	25 %	50 %	126177959
9	NC_009051	CTGG	2	8	5698	5705	0 %	25 %	50 %	25 %	126177959
10	NC_009051	CCCG	2	8	5901	5908	0 %	0 %	25 %	75 %	126177960
11	NC_009051	GGCG	2	8	6050	6057	0 %	0 %	75 %	25 %	126177960
12	NC_009051	CCAG	2	8	7240	7247	25 %	0 %	25 %	50 %	126177961
13	NC_009051	CGGG	2	8	7342	7349	0 %	0 %	75 %	25 %	126177961
14	NC_009051	CGGC	2	8	8073	8080	0 %	0 %	50 %	50 %	126177962
15	NC_009051	CTGC	2	8	9275	9282	0 %	25 %	25 %	50 %	126177964
16	NC_009051	GAAA	2	8	9315	9322	75 %	0 %	25 %	0 %	126177964
17	NC_009051	AGCC	2	8	9323	9330	25 %	0 %	25 %	50 %	126177964
18	NC_009051	GACG	2	8	10597	10604	25 %	0 %	50 %	25 %	126177966
19	NC_009051	GACG	2	8	10723	10730	25 %	0 %	50 %	25 %	126177966
20	NC_009051	GGCT	2	8	11238	11245	0 %	25 %	50 %	25 %	126177967
21	NC_009051	GGCC	2	8	11295	11302	0 %	0 %	50 %	50 %	126177967
22	NC_009051	CCGT	2	8	11362	11369	0 %	25 %	25 %	50 %	126177967
23	NC_009051	GAGC	2	8	11617	11624	25 %	0 %	50 %	25 %	126177967
24	NC_009051	CCTG	2	8	11881	11888	0 %	25 %	25 %	50 %	126177968
25	NC_009051	GACG	2	8	12242	12249	25 %	0 %	50 %	25 %	126177968
26	NC_009051	CCCG	2	8	12563	12570	0 %	0 %	25 %	75 %	126177968
27	NC_009051	CCGG	2	8	13345	13352	0 %	0 %	50 %	50 %	126177970
28	NC_009051	GAAG	2	8	13809	13816	50 %	0 %	50 %	0 %	126177972
29	NC_009051	CCTC	2	8	13841	13848	0 %	25 %	0 %	75 %	126177972
30	NC_009051	AGGC	2	8	13949	13956	25 %	0 %	50 %	25 %	126177972
31	NC_009051	CGGG	2	8	14211	14218	0 %	0 %	75 %	25 %	126177972
32	NC_009051	ACGG	2	8	15252	15259	25 %	0 %	50 %	25 %	126177973
33	NC_009051	CGAT	2	8	15349	15356	25 %	25 %	25 %	25 %	126177973
34	NC_009051	CCGG	2	8	15416	15423	0 %	0 %	50 %	50 %	126177973
35	NC_009051	GGCA	2	8	15876	15883	25 %	0 %	50 %	25 %	126177974
36	NC_009051	CGGG	2	8	16797	16804	0 %	0 %	75 %	25 %	126177975
37	NC_009051	GACC	2	8	17735	17742	25 %	0 %	25 %	50 %	126177976
38	NC_009051	GACC	2	8	17912	17919	25 %	0 %	25 %	50 %	126177976
39	NC_009051	TTCA	2	8	18111	18118	25 %	50 %	0 %	25 %	126177976
40	NC_009051	GCTC	2	8	18332	18339	0 %	25 %	25 %	50 %	126177977
41	NC_009051	CGGG	2	8	18587	18594	0 %	0 %	75 %	25 %	126177977
42	NC_009051	CCCG	2	8	18851	18858	0 %	0 %	25 %	75 %	126177978
43	NC_009051	ACGA	2	8	18885	18892	50 %	0 %	25 %	25 %	126177978
44	NC_009051	CCCG	2	8	19097	19104	0 %	0 %	25 %	75 %	126177978
45	NC_009051	CGCC	2	8	19282	19289	0 %	0 %	25 %	75 %	126177978
46	NC_009051	CGTG	2	8	19338	19345	0 %	25 %	50 %	25 %	126177978
47	NC_009051	GCCG	2	8	20001	20008	0 %	0 %	50 %	50 %	126177978
48	NC_009051	CGGC	2	8	20167	20174	0 %	0 %	50 %	50 %	126177978
49	NC_009051	GCCT	2	8	20734	20741	0 %	25 %	25 %	50 %	126177979
50	NC_009051	GGAG	2	8	21304	21311	25 %	0 %	75 %	0 %	126177979
51	NC_009051	TCCT	2	8	21573	21580	0 %	50 %	0 %	50 %	126177980
52	NC_009051	CCGA	2	8	21970	21977	25 %	0 %	25 %	50 %	126177980
53	NC_009051	CCGG	2	8	23742	23749	0 %	0 %	50 %	50 %	126177981
54	NC_009051	AGAC	2	8	24038	24045	50 %	0 %	25 %	25 %	126177982
55	NC_009051	GACG	2	8	24796	24803	25 %	0 %	50 %	25 %	126177982
56	NC_009051	GGAT	2	8	25199	25206	25 %	25 %	50 %	0 %	126177983
57	NC_009051	CCGG	2	8	25770	25777	0 %	0 %	50 %	50 %	126177983
58	NC_009051	GACC	2	8	25869	25876	25 %	0 %	25 %	50 %	126177983
59	NC_009051	CTCC	2	8	26231	26238	0 %	25 %	0 %	75 %	126177984
60	NC_009051	CGAC	2	8	27298	27305	25 %	0 %	25 %	50 %	126177985
61	NC_009051	TCAT	2	8	27459	27466	25 %	50 %	0 %	25 %	126177985
62	NC_009051	CCGC	2	8	27760	27767	0 %	0 %	25 %	75 %	126177985
63	NC_009051	GCAG	2	8	28226	28233	25 %	0 %	50 %	25 %	126177985
64	NC_009051	CATC	2	8	28768	28775	25 %	25 %	0 %	50 %	126177986
65	NC_009051	GCCG	2	8	29743	29750	0 %	0 %	50 %	50 %	126177987
66	NC_009051	GCAC	2	8	29856	29863	25 %	0 %	25 %	50 %	126177987
67	NC_009051	CGGG	2	8	30422	30429	0 %	0 %	75 %	25 %	126177988
68	NC_009051	GCCG	2	8	30746	30753	0 %	0 %	50 %	50 %	126177989
69	NC_009051	CGGG	2	8	30939	30946	0 %	0 %	75 %	25 %	126177989
70	NC_009051	CCGG	2	8	31086	31093	0 %	0 %	50 %	50 %	126177989
71	NC_009051	AGGT	2	8	31315	31322	25 %	25 %	50 %	0 %	126177990
72	NC_009051	AGCC	2	8	31462	31469	25 %	0 %	25 %	50 %	126177990
73	NC_009051	GGCC	2	8	31621	31628	0 %	0 %	50 %	50 %	126177990
74	NC_009051	GCCG	2	8	31861	31868	0 %	0 %	50 %	50 %	126177990
75	NC_009051	CGAC	2	8	32150	32157	25 %	0 %	25 %	50 %	126177990
76	NC_009051	GGCC	2	8	32969	32976	0 %	0 %	50 %	50 %	126177991
77	NC_009051	CCGC	2	8	33164	33171	0 %	0 %	25 %	75 %	126177991
78	NC_009051	CCGA	2	8	33222	33229	25 %	0 %	25 %	50 %	126177991
79	NC_009051	CGGC	2	8	33703	33710	0 %	0 %	50 %	50 %	126177991
80	NC_009051	CTCG	2	8	33764	33771	0 %	25 %	25 %	50 %	126177991
81	NC_009051	GGAA	2	8	34917	34924	50 %	0 %	50 %	0 %	126177992
82	NC_009051	CGAC	2	8	35087	35094	25 %	0 %	25 %	50 %	126177992
83	NC_009051	TCGA	2	8	36130	36137	25 %	25 %	25 %	25 %	126177992
84	NC_009051	GGGA	2	8	36327	36334	25 %	0 %	75 %	0 %	126177992
85	NC_009051	CATC	2	8	36953	36960	25 %	25 %	0 %	50 %	126177992
86	NC_009051	CCCT	2	8	37580	37587	0 %	25 %	0 %	75 %	126177992
87	NC_009051	CACC	2	8	37650	37657	25 %	0 %	0 %	75 %	126177992
88	NC_009051	ACGA	2	8	38069	38076	50 %	0 %	25 %	25 %	126177992
89	NC_009051	GGAT	2	8	38334	38341	25 %	25 %	50 %	0 %	126177992
90	NC_009051	TTCG	2	8	38550	38557	0 %	50 %	25 %	25 %	126177992
91	NC_009051	TCGT	2	8	39022	39029	0 %	50 %	25 %	25 %	126177992
92	NC_009051	GCCC	2	8	39287	39294	0 %	0 %	25 %	75 %	126177992
93	NC_009051	AGTT	2	8	39566	39573	25 %	50 %	25 %	0 %	126177993
94	NC_009051	CCTT	2	8	39698	39705	0 %	50 %	0 %	50 %	126177993
95	NC_009051	CGCC	2	8	40527	40534	0 %	0 %	25 %	75 %	126177995
96	NC_009051	CCGC	2	8	40827	40834	0 %	0 %	25 %	75 %	126177995
97	NC_009051	GAAA	2	8	40878	40885	75 %	0 %	25 %	0 %	126177995
98	NC_009051	CGAA	2	8	43084	43091	50 %	0 %	25 %	25 %	126177996
99	NC_009051	CTGT	2	8	43289	43296	0 %	50 %	25 %	25 %	126177996
100	NC_009051	GATG	2	8	43604	43611	25 %	25 %	50 %	0 %	126177997
101	NC_009051	CGGT	2	8	43747	43754	0 %	25 %	50 %	25 %	126177997
102	NC_009051	GTTC	2	8	44123	44130	0 %	50 %	25 %	25 %	126177997
103	NC_009051	CCGG	2	8	44288	44295	0 %	0 %	50 %	50 %	126177997
104	NC_009051	CCGC	2	8	45218	45225	0 %	0 %	25 %	75 %	126177998
105	NC_009051	TGCG	2	8	46234	46241	0 %	25 %	50 %	25 %	126177999
106	NC_009051	CGAA	2	8	47797	47804	50 %	0 %	25 %	25 %	126178000
107	NC_009051	CGGG	2	8	48459	48466	0 %	0 %	75 %	25 %	126178000
108	NC_009051	CGGG	2	8	48474	48481	0 %	0 %	75 %	25 %	126178000
109	NC_009051	GTCG	2	8	48986	48993	0 %	25 %	50 %	25 %	126178001
110	NC_009051	TGGT	2	8	48999	49006	0 %	50 %	50 %	0 %	126178001
111	NC_009051	CGGT	2	8	49873	49880	0 %	25 %	50 %	25 %	126178003
112	NC_009051	GATG	2	8	50239	50246	25 %	25 %	50 %	0 %	126178004
113	NC_009051	CCCG	2	8	50359	50366	0 %	0 %	25 %	75 %	126178004
114	NC_009051	ATCG	2	8	50605	50612	25 %	25 %	25 %	25 %	126178004
115	NC_009051	ACGA	2	8	50675	50682	50 %	0 %	25 %	25 %	126178004
116	NC_009051	GCCG	2	8	51446	51453	0 %	0 %	50 %	50 %	126178005
117	NC_009051	GCCG	2	8	51727	51734	0 %	0 %	50 %	50 %	126178005
118	NC_009051	GCTC	2	8	51904	51911	0 %	25 %	25 %	50 %	126178005
119	NC_009051	CTTC	2	8	52067	52074	0 %	50 %	0 %	50 %	126178006
120	NC_009051	CGCC	2	8	53877	53884	0 %	0 %	25 %	75 %	126178008
121	NC_009051	CGGC	2	8	54182	54189	0 %	0 %	50 %	50 %	126178008
122	NC_009051	AACA	2	8	54489	54496	75 %	0 %	0 %	25 %	126178009
123	NC_009051	CTCC	2	8	55182	55189	0 %	25 %	0 %	75 %	126178011
124	NC_009051	GGCT	2	8	56204	56211	0 %	25 %	50 %	25 %	126178011
125	NC_009051	CCTT	2	8	56283	56290	0 %	50 %	0 %	50 %	126178012
126	NC_009051	GATC	2	8	56523	56530	25 %	25 %	25 %	25 %	126178012
127	NC_009051	CGCT	2	8	56691	56698	0 %	25 %	25 %	50 %	126178012
128	NC_009051	CTGA	2	8	56947	56954	25 %	25 %	25 %	25 %	126178012
129	NC_009051	GCGA	2	8	57062	57069	25 %	0 %	50 %	25 %	126178012
130	NC_009051	CGAG	2	8	57515	57522	25 %	0 %	50 %	25 %	126178012
131	NC_009051	GCCA	2	8	57722	57729	25 %	0 %	25 %	50 %	126178012
132	NC_009051	CGCC	2	8	58471	58478	0 %	0 %	25 %	75 %	126178013
133	NC_009051	ACCG	2	8	58646	58653	25 %	0 %	25 %	50 %	126178013
134	NC_009051	GATC	2	8	58749	58756	25 %	25 %	25 %	25 %	126178013
135	NC_009051	GACG	2	8	60416	60423	25 %	0 %	50 %	25 %	126178015
136	NC_009051	CGGT	2	8	60606	60613	0 %	25 %	50 %	25 %	126178015
137	NC_009051	CGAC	2	8	60718	60725	25 %	0 %	25 %	50 %	126178015
138	NC_009051	GCTC	2	8	61107	61114	0 %	25 %	25 %	50 %	126178016
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140	NC_009051	CGCC	2	8	61629	61636	0 %	0 %	25 %	75 %	126178017
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