MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 52982

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
47001	NC_009051	TCG	2	6	2205199	2205204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126180153
47002	NC_009051	GCG	2	6	2205212	2205217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126180153
47003	NC_009051	GAA	2	6	2205278	2205283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126180153
47004	NC_009051	TCC	2	6	2205289	2205294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126180153
47005	NC_009051	GAT	2	6	2205371	2205376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126180153
47006	NC_009051	CTC	2	6	2205435	2205440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126180153
47007	NC_009051	TCT	2	6	2205463	2205468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126180153
47008	NC_009051	TCCC	2	8	2205480	2205487	0 %	25 %	0 %	75 %	126180153
47009	NC_009051	CGGG	2	8	2205507	2205514	0 %	0 %	75 %	25 %	126180153
47010	NC_009051	CGG	2	6	2205526	2205531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126180153
47011	NC_009051	GAG	2	6	2205543	2205548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126180153
47012	NC_009051	CGA	2	6	2205566	2205571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126180153
47013	NC_009051	GCCG	2	8	2205583	2205590	0 %	0 %	50 %	50 %	126180153
47014	NC_009051	GAG	3	9	2205600	2205608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126180153
47015	NC_009051	GTCG	2	8	2205626	2205633	0 %	25 %	50 %	25 %	126180153
47016	NC_009051	CGC	2	6	2205638	2205643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126180153
47017	NC_009051	AGG	2	6	2205700	2205705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126180153
47018	NC_009051	ACGCCC	2	12	2205745	2205756	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	126180153
47019	NC_009051	GCA	2	6	2205763	2205768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126180153
47020	NC_009051	GACC	2	8	2205812	2205819	25 %	0 %	25 %	50 %	126180153
47021	NC_009051	GCC	2	6	2205858	2205863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126180153
47022	NC_009051	CCGC	2	8	2205887	2205894	0 %	0 %	25 %	75 %	126180153
47023	NC_009051	CCT	2	6	2205896	2205901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126180153
47024	NC_009051	GCC	2	6	2205991	2205996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126180153
47025	NC_009051	TCA	2	6	2206103	2206108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126180154
47026	NC_009051	CGG	2	6	2206121	2206126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126180154
47027	NC_009051	CAG	2	6	2206249	2206254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126180154
47028	NC_009051	CTG	2	6	2206263	2206268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126180154
47029	NC_009051	GGA	4	12	2206293	2206304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126180154
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47031	NC_009051	TCG	2	6	2206322	2206327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126180154
47032	NC_009051	AGA	2	6	2206346	2206351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126180154
47033	NC_009051	CCA	2	6	2206418	2206423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126180154
47034	NC_009051	CGGA	2	8	2206496	2206503	25 %	0 %	50 %	25 %	126180154
47035	NC_009051	ACG	2	6	2206507	2206512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126180154
47036	NC_009051	GCCG	2	8	2206619	2206626	0 %	0 %	50 %	50 %	126180154
47037	NC_009051	ACT	2	6	2206634	2206639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126180154
47038	NC_009051	CAC	2	6	2206695	2206700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126180154
47039	NC_009051	GGT	2	6	2206701	2206706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126180154
47040	NC_009051	CAT	2	6	2206896	2206901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126180154
47041	NC_009051	GTC	2	6	2206924	2206929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126180154
47042	NC_009051	GA	3	6	2206982	2206987	50 %	0 %	50 %	0 %	126180155
47043	NC_009051	CCGG	2	8	2207031	2207038	0 %	0 %	50 %	50 %	126180155
47044	NC_009051	CCGG	2	8	2207044	2207051	0 %	0 %	50 %	50 %	126180155
47045	NC_009051	ACCT	2	8	2207121	2207128	25 %	25 %	0 %	50 %	126180155
47046	NC_009051	CGA	2	6	2207141	2207146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126180155
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47049	NC_009051	CGG	2	6	2207237	2207242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126180155
47050	NC_009051	CCCG	2	8	2207248	2207255	0 %	0 %	25 %	75 %	126180155
47051	NC_009051	AGC	2	6	2207275	2207280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126180155
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47054	NC_009051	AAG	2	6	2207361	2207366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126180155
47055	NC_009051	CGA	2	6	2207381	2207386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126180155
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47069	NC_009051	TGA	2	6	2207896	2207901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126180155
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47100	NC_009051	GA	4	8	2209193	2209200	50 %	0 %	50 %	0 %	126180156
47101	NC_009051	GCG	2	6	2209250	2209255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126180156
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47117	NC_009051	GAG	2	6	2209900	2209905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126180156
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47127	NC_009051	GGGCC	2	10	2210374	2210383	0 %	0 %	60 %	40 %	126180156
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47222	NC_009051	GACGGA	2	12	2215185	2215196	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	126180162
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47227	NC_009051	TCG	2	6	2215495	2215500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126180162
47228	NC_009051	CGAC	2	8	2215511	2215518	25 %	0 %	25 %	50 %	126180162
47229	NC_009051	GCT	2	6	2216093	2216098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126180163
47230	NC_009051	CAT	2	6	2216105	2216110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126180163
47231	NC_009051	CGG	2	6	2216117	2216122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126180163
47232	NC_009051	GC	3	6	2216189	2216194	0 %	0 %	50 %	50 %	126180163
47233	NC_009051	ATG	2	6	2216211	2216216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126180163
47234	NC_009051	CCCG	2	8	2216225	2216232	0 %	0 %	25 %	75 %	126180163
47235	NC_009051	CTC	2	6	2216259	2216264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126180163
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47242	NC_009051	TCA	3	9	2216539	2216547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126180163
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47329	NC_009051	CGG	3	9	2220362	2220370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126180168
47330	NC_009051	ACG	2	6	2220393	2220398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126180168
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47332	NC_009051	CGA	2	6	2220424	2220429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126180168
47333	NC_009051	ACC	2	6	2220453	2220458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126180168
47334	NC_009051	CAC	2	6	2220502	2220507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126180168
47335	NC_009051	GAG	2	6	2220530	2220535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126180168
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47338	NC_009051	G	6	6	2220597	2220602	0 %	0 %	100 %	0 %	126180168
47339	NC_009051	CGG	2	6	2220607	2220612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126180168
47340	NC_009051	CGC	2	6	2220670	2220675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126180168
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47342	NC_009051	CTC	2	6	2220746	2220751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126180168
47343	NC_009051	GGC	2	6	2220790	2220795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126180168
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47345	NC_009051	GAA	2	6	2220903	2220908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126180168
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47462	NC_009051	CTC	2	6	2225861	2225866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126180173
47463	NC_009051	GCC	2	6	2225867	2225872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126180173
47464	NC_009051	GGT	2	6	2225893	2225898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126180173
47465	NC_009051	GTC	2	6	2226041	2226046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126180173
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47468	NC_009051	CGGG	2	8	2226167	2226174	0 %	0 %	75 %	25 %	126180173
47469	NC_009051	CGA	2	6	2226210	2226215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126180173
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47472	NC_009051	CGAC	2	8	2226249	2226256	25 %	0 %	25 %	50 %	126180173
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47475	NC_009051	GCCAGA	2	12	2226300	2226311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126180173
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47481	NC_009051	CGG	2	6	2226568	2226573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126180173
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47483	NC_009051	GC	3	6	2226640	2226645	0 %	0 %	50 %	50 %	126180173
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47485	NC_009051	CGG	2	6	2226702	2226707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126180173
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47488	NC_009051	CA	3	6	2226806	2226811	50 %	0 %	0 %	50 %	126180174
47489	NC_009051	CCA	2	6	2226821	2226826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126180174
47490	NC_009051	GAG	2	6	2226858	2226863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126180174
47491	NC_009051	CTT	2	6	2226930	2226935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126180174
47492	NC_009051	TCC	2	6	2226976	2226981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126180174
47493	NC_009051	ATC	2	6	2227026	2227031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126180174
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47497	NC_009051	GGT	2	6	2227118	2227123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126180174
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47499	NC_009051	TAC	2	6	2227164	2227169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126180174
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